1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
CF1 CF1 '2-{[2-chloro-5-(trifluoromethyl)phen' non-polymer 33 23 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_CF1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
CF1 F2 F F 0.000 0.000 0.000 0.000
CF1 C14 C CT 0.000 0.227 0.910 -1.039
CF1 F1 F F 0.000 0.545 0.212 -2.209
CF1 F3 F F 0.000 1.287 1.755 -0.696
CF1 C13 C CR6 0.000 -1.017 1.731 -1.267
CF1 C12 C CR16 0.000 -0.911 3.031 -1.725
CF1 H12 H H 0.000 0.065 3.456 -1.923
CF1 C11 C CR16 0.000 -2.048 3.790 -1.931
CF1 H11 H H 0.000 -1.961 4.808 -2.290
CF1 C10 C CR6 0.000 -3.296 3.251 -1.679
CF1 CL1 CL CL 0.000 -4.723 4.204 -1.937
CF1 C15 C CR16 0.000 -2.260 1.186 -1.007
CF1 H15 H H 0.000 -2.341 0.170 -0.641
CF1 C9 C CR6 0.000 -3.405 1.943 -1.217
CF1 N1 N NH1 0.000 -4.665 1.395 -0.961
CF1 HN1 H H 0.000 -5.499 1.915 -1.191
CF1 C7 C CR6 0.000 -4.768 0.131 -0.388
CF1 C21 C CR6 0.000 -4.627 -0.027 1.000
CF1 C23 C C 0.000 -4.368 1.144 1.856
CF1 O24 O OC -0.500 -4.224 2.275 1.342
CF1 O23 O OC -0.500 -4.292 1.006 3.097
CF1 C8 C CR16 0.000 -5.008 -0.978 -1.187
CF1 H8 H H 0.000 -5.108 -0.861 -2.259
CF1 C3 C CR16 0.000 -5.117 -2.231 -0.619
CF1 H3 H H 0.000 -5.308 -3.093 -1.246
CF1 C4 C CR6 0.000 -4.984 -2.393 0.755
CF1 C5 C CR16 0.000 -4.741 -1.300 1.565
CF1 H5 H H 0.000 -4.638 -1.430 2.635
CF1 O1 O O2 0.000 -5.094 -3.633 1.305
CF1 C2 C CH3 0.000 -5.345 -4.719 0.411
CF1 H2B H H 0.000 -4.556 -4.788 -0.292
CF1 H2A H H 0.000 -5.408 -5.622 0.961
CF1 H2 H H 0.000 -6.259 -4.553 -0.099
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
CF1 F2 n/a C14 START
CF1 C14 F2 C13 .
CF1 F1 C14 . .
CF1 F3 C14 . .
CF1 C13 C14 C15 .
CF1 C12 C13 C11 .
CF1 H12 C12 . .
CF1 C11 C12 C10 .
CF1 H11 C11 . .
CF1 C10 C11 CL1 .
CF1 CL1 C10 . .
CF1 C15 C13 C9 .
CF1 H15 C15 . .
CF1 C9 C15 N1 .
CF1 N1 C9 C7 .
CF1 HN1 N1 . .
CF1 C7 N1 C8 .
CF1 C21 C7 C23 .
CF1 C23 C21 O23 .
CF1 O24 C23 . .
CF1 O23 C23 . .
CF1 C8 C7 C3 .
CF1 H8 C8 . .
CF1 C3 C8 C4 .
CF1 H3 C3 . .
CF1 C4 C3 O1 .
CF1 C5 C4 H5 .
CF1 H5 C5 . .
CF1 O1 C4 C2 .
CF1 C2 O1 H2 .
CF1 H2B C2 . .
CF1 H2A C2 . .
CF1 H2 C2 . END
CF1 C21 C5 . ADD
CF1 C9 C10 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
CF1 O23 C23 deloc 1.250 0.020
CF1 O24 C23 deloc 1.250 0.020
CF1 C23 C21 single 1.500 0.020
CF1 C21 C5 double 1.390 0.020
CF1 C21 C7 single 1.487 0.020
CF1 C5 C4 single 1.390 0.020
CF1 H5 C5 single 1.083 0.020
CF1 O1 C4 single 1.370 0.020
CF1 C4 C3 double 1.390 0.020
CF1 C2 O1 single 1.426 0.020
CF1 H2 C2 single 1.059 0.020
CF1 H2A C2 single 1.059 0.020
CF1 H2B C2 single 1.059 0.020
CF1 C3 C8 single 1.390 0.020
CF1 H3 C3 single 1.083 0.020
CF1 C8 C7 double 1.390 0.020
CF1 H8 C8 single 1.083 0.020
CF1 C7 N1 single 1.350 0.020
CF1 N1 C9 single 1.350 0.020
CF1 HN1 N1 single 1.010 0.020
CF1 C9 C15 double 1.390 0.020
CF1 C9 C10 single 1.487 0.020
CF1 CL1 C10 single 1.795 0.020
CF1 C10 C11 double 1.390 0.020
CF1 C11 C12 single 1.390 0.020
CF1 H11 C11 single 1.083 0.020
CF1 C12 C13 double 1.390 0.020
CF1 H12 C12 single 1.083 0.020
CF1 C15 C13 single 1.390 0.020
CF1 H15 C15 single 1.083 0.020
CF1 C13 C14 single 1.500 0.020
CF1 F3 C14 single 1.320 0.020
CF1 C14 F2 single 1.320 0.020
CF1 F1 C14 single 1.320 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
CF1 F2 C14 F1 109.470 3.000
CF1 F2 C14 F3 109.470 3.000
CF1 F2 C14 C13 109.470 3.000
CF1 F1 C14 F3 109.470 3.000
CF1 F1 C14 C13 109.470 3.000
CF1 F3 C14 C13 109.470 3.000
CF1 C14 C13 C12 120.000 3.000
CF1 C14 C13 C15 120.000 3.000
CF1 C12 C13 C15 120.000 3.000
CF1 C13 C12 H12 120.000 3.000
CF1 C13 C12 C11 120.000 3.000
CF1 H12 C12 C11 120.000 3.000
CF1 C12 C11 H11 120.000 3.000
CF1 C12 C11 C10 120.000 3.000
CF1 H11 C11 C10 120.000 3.000
CF1 C11 C10 CL1 120.000 3.000
CF1 C11 C10 C9 120.000 3.000
CF1 CL1 C10 C9 120.000 3.000
CF1 C13 C15 H15 120.000 3.000
CF1 C13 C15 C9 120.000 3.000
CF1 H15 C15 C9 120.000 3.000
CF1 C15 C9 N1 120.000 3.000
CF1 C15 C9 C10 120.000 3.000
CF1 N1 C9 C10 120.000 3.000
CF1 C9 N1 HN1 120.000 3.000
CF1 C9 N1 C7 120.000 3.000
CF1 HN1 N1 C7 120.000 3.000
CF1 N1 C7 C21 120.000 3.000
CF1 N1 C7 C8 120.000 3.000
CF1 C21 C7 C8 120.000 3.000
CF1 C7 C21 C23 120.000 3.000
CF1 C7 C21 C5 120.000 3.000
CF1 C23 C21 C5 120.000 3.000
CF1 C21 C23 O24 120.000 3.000
CF1 C21 C23 O23 120.000 3.000
CF1 O24 C23 O23 123.000 3.000
CF1 C7 C8 H8 120.000 3.000
CF1 C7 C8 C3 120.000 3.000
CF1 H8 C8 C3 120.000 3.000
CF1 C8 C3 H3 120.000 3.000
CF1 C8 C3 C4 120.000 3.000
CF1 H3 C3 C4 120.000 3.000
CF1 C3 C4 C5 120.000 3.000
CF1 C3 C4 O1 120.000 3.000
CF1 C5 C4 O1 120.000 3.000
CF1 C4 C5 H5 120.000 3.000
CF1 C4 C5 C21 120.000 3.000
CF1 H5 C5 C21 120.000 3.000
CF1 C4 O1 C2 120.000 3.000
CF1 O1 C2 H2B 109.470 3.000
CF1 O1 C2 H2A 109.470 3.000
CF1 O1 C2 H2 109.470 3.000
CF1 H2B C2 H2A 109.470 3.000
CF1 H2B C2 H2 109.470 3.000
CF1 H2A C2 H2 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
CF1 var_1 F2 C14 C13 C15 -30.050 20.000 1
CF1 CONST_1 C14 C13 C12 C11 180.000 0.000 0
CF1 CONST_2 C13 C12 C11 C10 0.000 0.000 0
CF1 CONST_3 C12 C11 C10 CL1 180.000 0.000 0
CF1 CONST_4 C14 C13 C15 C9 180.000 0.000 0
CF1 CONST_5 C13 C15 C9 N1 180.000 0.000 0
CF1 CONST_6 C15 C9 C10 C11 0.000 0.000 0
CF1 var_2 C15 C9 N1 C7 5.478 20.000 1
CF1 var_3 C9 N1 C7 C8 -98.668 20.000 1
CF1 CONST_7 N1 C7 C21 C23 0.000 0.000 0
CF1 CONST_8 C7 C21 C5 C4 0.000 0.000 0
CF1 var_4 C7 C21 C23 O23 177.359 20.000 1
CF1 CONST_9 N1 C7 C8 C3 180.000 0.000 0
CF1 CONST_10 C7 C8 C3 C4 0.000 0.000 0
CF1 CONST_11 C8 C3 C4 O1 180.000 0.000 0
CF1 CONST_12 C3 C4 C5 C21 0.000 0.000 0
CF1 var_5 C3 C4 O1 C2 0.076 20.000 1
CF1 var_6 C4 O1 C2 H2 -60.073 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
CF1 chir_01 C14 C13 F1 F3 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
CF1 plan-1 C23 0.020
CF1 plan-1 O23 0.020
CF1 plan-1 O24 0.020
CF1 plan-1 C21 0.020
CF1 plan-2 C21 0.020
CF1 plan-2 C23 0.020
CF1 plan-2 C5 0.020
CF1 plan-2 C7 0.020
CF1 plan-2 C4 0.020
CF1 plan-2 C3 0.020
CF1 plan-2 C8 0.020
CF1 plan-2 H5 0.020
CF1 plan-2 O1 0.020
CF1 plan-2 H3 0.020
CF1 plan-2 H8 0.020
CF1 plan-2 N1 0.020
CF1 plan-2 HN1 0.020
CF1 plan-3 N1 0.020
CF1 plan-3 C7 0.020
CF1 plan-3 C9 0.020
CF1 plan-3 HN1 0.020
CF1 plan-4 C9 0.020
CF1 plan-4 N1 0.020
CF1 plan-4 C10 0.020
CF1 plan-4 C15 0.020
CF1 plan-4 C11 0.020
CF1 plan-4 C12 0.020
CF1 plan-4 C13 0.020
CF1 plan-4 CL1 0.020
CF1 plan-4 H11 0.020
CF1 plan-4 H12 0.020
CF1 plan-4 H15 0.020
CF1 plan-4 C14 0.020
CF1 plan-4 HN1 0.020
# ------------------------------------------------------
|