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292
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
CLP CLP 'FE-S CLUSTER ' non-polymer 22 16 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_CLP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
CLP HS4B H H 0.000 0.000 0.000 0.000
CLP S4B S ST 0.000 -1.208 -0.088 0.235
CLP FE5 FE FE 0.000 -2.757 1.210 -0.608
CLP FE7 FE FE 0.000 -2.128 0.099 2.213
CLP S2B S ST 0.000 -3.677 1.397 1.371
CLP HS2B H H 0.000 -4.076 2.450 1.874
CLP FE8 FE FE 0.000 -2.452 -1.841 -0.178
CLP S3B S ST 0.000 -3.372 -1.654 1.800
CLP HS3B H H 0.000 -3.573 -2.586 2.584
CLP FE6 FE FE 0.000 -4.921 -0.357 0.957
CLP S1B S ST 0.000 -4.001 -0.544 -1.021
CLP S1A S ST 0.000 -5.459 0.677 -1.814
CLP FE4 FE FE 0.000 -4.749 2.334 -0.573
CLP S4A S ST 0.000 -3.375 2.939 -2.168
CLP HS4A H H 0.000 -2.193 3.253 -2.009
CLP FE2 FE FE 0.000 -4.086 1.281 -3.409
CLP S3A S ST 0.000 -6.298 3.630 -1.417
CLP HS3A H H 0.000 -7.017 4.395 -0.769
CLP FE1 FE FE 0.000 -7.009 1.973 -2.658
CLP FE3 FE FE 0.000 -4.924 4.235 -3.012
CLP S2A S ST 0.000 -5.635 2.577 -4.253
CLP HS2A H H 0.000 -5.924 2.656 -5.449
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
CLP HS4B n/a S4B START
CLP S4B HS4B FE8 .
CLP FE5 S4B . .
CLP FE7 S4B S2B .
CLP S2B FE7 HS2B .
CLP HS2B S2B . .
CLP FE8 S4B S1B .
CLP S3B FE8 FE6 .
CLP HS3B S3B . .
CLP FE6 S3B . .
CLP S1B FE8 S1A .
CLP S1A S1B FE4 .
CLP FE4 S1A S3A .
CLP S4A FE4 FE2 .
CLP HS4A S4A . .
CLP FE2 S4A . .
CLP S3A FE4 FE3 .
CLP HS3A S3A . .
CLP FE1 S3A . .
CLP FE3 S3A S2A .
CLP S2A FE3 HS2A .
CLP HS2A S2A . END
CLP FE1 S1A . ADD
CLP FE1 S2A . ADD
CLP FE2 S1A . ADD
CLP FE2 S2A . ADD
CLP FE3 S4A . ADD
CLP FE5 S1B . ADD
CLP FE5 S2B . ADD
CLP FE6 S1B . ADD
CLP FE6 S2B . ADD
CLP FE7 S3B . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
CLP FE1 S1A single 2.135 0.020
CLP FE1 S2A single 2.135 0.020
CLP FE1 S3A single 2.135 0.020
CLP FE2 S1A single 2.135 0.020
CLP FE2 S2A single 2.135 0.020
CLP FE2 S4A single 2.135 0.020
CLP S2A FE3 single 2.135 0.020
CLP FE3 S4A single 2.135 0.020
CLP FE3 S3A single 2.135 0.020
CLP FE4 S1A single 2.135 0.020
CLP S4A FE4 single 2.135 0.020
CLP S3A FE4 single 2.135 0.020
CLP S1A S1B single 1.800 0.020
CLP FE5 S1B single 2.135 0.020
CLP FE5 S2B single 2.135 0.020
CLP FE5 S4B single 2.135 0.020
CLP FE6 S1B single 2.135 0.020
CLP FE6 S2B single 2.135 0.020
CLP FE6 S3B single 2.135 0.020
CLP S2B FE7 single 2.135 0.020
CLP FE7 S3B single 2.135 0.020
CLP FE7 S4B single 2.135 0.020
CLP S1B FE8 single 2.135 0.020
CLP S3B FE8 single 2.135 0.020
CLP FE8 S4B single 2.135 0.020
CLP HS2A S2A single 1.234 0.020
CLP HS4A S4A single 1.234 0.020
CLP HS3A S3A single 1.234 0.020
CLP HS2B S2B single 1.234 0.020
CLP HS3B S3B single 1.234 0.020
CLP S4B HS4B single 1.234 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
CLP HS4B S4B FE5 109.500 3.000
CLP HS4B S4B FE7 109.500 3.000
CLP HS4B S4B FE8 109.500 3.000
CLP FE5 S4B FE7 109.500 3.000
CLP FE5 S4B FE8 109.500 3.000
CLP FE7 S4B FE8 109.500 3.000
CLP S4B FE5 S1B 90.000 3.000
CLP S4B FE5 S2B 90.000 3.000
CLP S1B FE5 S2B 90.000 3.000
CLP S4B FE7 S2B 90.000 3.000
CLP S4B FE7 S3B 90.000 3.000
CLP S2B FE7 S3B 90.000 3.000
CLP FE7 S2B HS2B 109.500 3.000
CLP FE7 S2B FE5 109.500 3.000
CLP FE7 S2B FE6 109.500 3.000
CLP FE5 S2B FE6 109.500 3.000
CLP HS2B S2B FE5 109.500 3.000
CLP HS2B S2B FE6 109.500 3.000
CLP S4B FE8 S3B 90.000 3.000
CLP S4B FE8 S1B 90.000 3.000
CLP S3B FE8 S1B 90.000 3.000
CLP FE8 S3B HS3B 109.500 3.000
CLP FE8 S3B FE6 109.500 3.000
CLP FE8 S3B FE7 109.500 3.000
CLP HS3B S3B FE6 109.500 3.000
CLP HS3B S3B FE7 109.500 3.000
CLP FE6 S3B FE7 109.500 3.000
CLP S3B FE6 S1B 90.000 3.000
CLP S3B FE6 S2B 90.000 3.000
CLP S1B FE6 S2B 90.000 3.000
CLP FE8 S1B S1A 109.500 3.000
CLP FE8 S1B FE5 109.500 3.000
CLP FE8 S1B FE6 109.500 3.000
CLP FE5 S1B FE6 109.500 3.000
CLP S1A S1B FE5 109.500 3.000
CLP S1A S1B FE6 109.500 3.000
CLP S1B S1A FE4 109.500 3.000
CLP S1B S1A FE1 109.500 3.000
CLP S1B S1A FE2 109.500 3.000
CLP FE1 S1A FE2 109.500 3.000
CLP FE4 S1A FE1 109.500 3.000
CLP FE4 S1A FE2 109.500 3.000
CLP S1A FE4 S4A 90.000 3.000
CLP S1A FE4 S3A 90.000 3.000
CLP S4A FE4 S3A 90.000 3.000
CLP FE4 S4A HS4A 109.500 3.000
CLP FE4 S4A FE2 109.500 3.000
CLP FE4 S4A FE3 109.500 3.000
CLP HS4A S4A FE2 109.500 3.000
CLP HS4A S4A FE3 109.500 3.000
CLP FE2 S4A FE3 109.500 3.000
CLP S4A FE2 S1A 90.000 3.000
CLP S4A FE2 S2A 90.000 3.000
CLP S1A FE2 S2A 90.000 3.000
CLP FE4 S3A HS3A 109.500 3.000
CLP FE4 S3A FE1 109.500 3.000
CLP FE4 S3A FE3 109.500 3.000
CLP HS3A S3A FE1 109.500 3.000
CLP HS3A S3A FE3 109.500 3.000
CLP FE1 S3A FE3 109.500 3.000
CLP S3A FE1 S1A 90.000 3.000
CLP S3A FE1 S2A 90.000 3.000
CLP S1A FE1 S2A 90.000 3.000
CLP S3A FE3 S2A 90.000 3.000
CLP S3A FE3 S4A 90.000 3.000
CLP S2A FE3 S4A 90.000 3.000
CLP FE3 S2A HS2A 109.500 3.000
CLP FE3 S2A FE1 109.500 3.000
CLP FE3 S2A FE2 109.500 3.000
CLP FE1 S2A FE2 109.500 3.000
CLP HS2A S2A FE1 109.500 3.000
CLP HS2A S2A FE2 109.500 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
CLP var_1 FE7 S4B FE5 S1B 0.000 20.000 1
CLP var_2 FE6 S1B FE5 S4B 0.000 20.000 1
CLP var_3 FE7 S2B FE5 S4B 0.000 20.000 1
CLP var_4 FE5 S4B FE7 S2B 0.000 20.000 1
CLP var_5 FE8 S3B FE7 S4B 0.000 20.000 1
CLP var_6 FE5 S2B FE7 S4B 0.000 20.000 1
CLP var_7 FE7 S4B FE8 S3B 0.000 20.000 1
CLP var_8 FE7 S3B FE8 S4B 0.000 20.000 1
CLP var_9 FE8 S3B FE6 S1B 0.000 20.000 1
CLP var_10 FE8 S1B FE6 S3B 0.000 20.000 1
CLP var_11 FE7 S2B FE6 S1B 0.000 20.000 1
CLP var_12 FE6 S1B FE8 S3B 0.000 20.000 1
CLP var_13 FE8 S1B S1A FE4 179.974 20.000 1
CLP var_14 FE2 S1A FE4 S4A 0.000 20.000 1
CLP var_15 FE2 S4A FE4 S1A 0.000 20.000 1
CLP var_16 FE4 S4A FE2 S1A 0.000 20.000 1
CLP var_17 FE4 S1A FE2 S4A 0.000 20.000 1
CLP var_18 FE3 S2A FE2 S4A 0.000 20.000 1
CLP var_19 FE1 S3A FE4 S1A 0.000 20.000 1
CLP var_20 FE4 S3A FE1 S1A 0.000 20.000 1
CLP var_21 FE4 S1A FE1 S3A 0.000 20.000 1
CLP var_22 FE3 S2A FE1 S3A 0.000 20.000 1
CLP var_23 FE1 S3A FE3 S2A 0.000 20.000 1
CLP var_24 FE4 S4A FE3 S3A 0.000 20.000 1
CLP var_25 FE1 S2A FE3 S3A 0.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
_chem_comp_chir.atom_id_4
_chem_comp_chir.atom_id_5
_chem_comp_chir.atom_id_6
_chem_comp_chir.atom_id_7
_chem_comp_chir.atom_id_8
CLP chir_01 S1A FE1 FE2 FE4 negativ
. . . . .
CLP chir_02 S2A FE1 FE2 FE3 positiv
. . . . .
CLP chir_03 S4A FE2 FE3 FE4 negativ
. . . . .
CLP chir_04 S3A FE1 FE3 FE4 positiv
. . . . .
CLP chir_05 S1B S1A FE5 FE6 negativ
. . . . .
CLP chir_06 S2B FE5 FE6 FE7 negativ
. . . . .
CLP chir_07 S3B FE6 FE7 FE8 positiv
. . . . .
CLP chir_08 S4B FE5 FE7 FE8 negativ
. . . . .
CLP chir_09 FE1 S3A . S1A cross4
S2A . . . .
CLP chir_10 FE2 S4A . S1A cross4
S2A . . . .
CLP chir_11 FE3 S3A . S2A cross4
S4A . . . .
CLP chir_12 FE4 S1A . S4A cross4
S3A . . . .
CLP chir_13 FE5 S4B . S1B cross4
S2B . . . .
CLP chir_14 FE6 S3B . S1B cross4
S2B . . . .
CLP chir_15 FE7 S4B . S2B cross4
S3B . . . .
CLP chir_16 FE8 S4B . S3B cross4
S1B . . . .
# ------------------------------------------------------
|
