1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158
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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
CON CON 'COBALT TETRAAMMINE ION ' non-polymer 17 5 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_CON
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
CON N4 N NT3 0.000 0.000 0.000 0.000
CON HN41 H H 0.000 -0.590 0.100 0.843
CON HN42 H H 0.000 -0.590 0.100 -0.843
CON HN43 H H 0.000 0.441 -0.935 0.000
CON CO CO CO 3.000 1.415 1.409 0.000
CON N3 N NT3 0.000 2.501 1.169 1.651
CON HN33 H H 0.000 1.895 1.269 2.482
CON HN32 H H 0.000 2.930 0.229 1.650
CON HN31 H H 0.000 3.246 1.885 1.683
CON N2 N NT3 0.000 2.501 1.169 -1.651
CON HN23 H H 0.000 2.930 0.229 -1.650
CON HN22 H H 0.000 1.895 1.269 -2.482
CON HN21 H H 0.000 3.246 1.885 -1.683
CON N1 N NT3 0.000 0.470 3.164 0.000
CON HN13 H H 0.000 -0.123 3.239 -0.843
CON HN12 H H 0.000 -0.123 3.239 0.843
CON HN11 H H 0.000 1.163 3.931 -0.000
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
CON N4 n/a CO START
CON HN41 N4 . .
CON HN42 N4 . .
CON HN43 N4 . .
CON CO N4 N1 .
CON N3 CO HN31 .
CON HN33 N3 . .
CON HN32 N3 . .
CON HN31 N3 . .
CON N2 CO HN21 .
CON HN23 N2 . .
CON HN22 N2 . .
CON HN21 N2 . .
CON N1 CO HN11 .
CON HN13 N1 . .
CON HN12 N1 . .
CON HN11 N1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
CON N1 CO single 1.980 0.020
CON N2 CO single 1.980 0.020
CON N3 CO single 1.980 0.020
CON CO N4 single 1.980 0.020
CON HN11 N1 single 1.033 0.020
CON HN12 N1 single 1.033 0.020
CON HN13 N1 single 1.033 0.020
CON HN21 N2 single 1.033 0.020
CON HN22 N2 single 1.033 0.020
CON HN23 N2 single 1.033 0.020
CON HN31 N3 single 1.033 0.020
CON HN32 N3 single 1.033 0.020
CON HN33 N3 single 1.033 0.020
CON HN41 N4 single 1.033 0.020
CON HN42 N4 single 1.033 0.020
CON HN43 N4 single 1.033 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
CON HN41 N4 HN42 109.470 3.000
CON HN41 N4 HN43 109.470 3.000
CON HN42 N4 HN43 109.470 3.000
CON HN41 N4 CO 109.500 3.000
CON HN42 N4 CO 109.500 3.000
CON HN43 N4 CO 109.500 3.000
CON N4 CO N3 90.000 3.000
CON N4 CO N2 90.000 3.000
CON N4 CO N1 90.000 3.000
CON N3 CO N2 90.000 3.000
CON N3 CO N1 90.000 3.000
CON N2 CO N1 90.000 3.000
CON CO N3 HN33 109.500 3.000
CON CO N3 HN32 109.500 3.000
CON CO N3 HN31 109.500 3.000
CON HN33 N3 HN32 109.470 3.000
CON HN33 N3 HN31 109.470 3.000
CON HN32 N3 HN31 109.470 3.000
CON CO N2 HN23 109.500 3.000
CON CO N2 HN22 109.500 3.000
CON CO N2 HN21 109.500 3.000
CON HN23 N2 HN22 109.470 3.000
CON HN23 N2 HN21 109.470 3.000
CON HN22 N2 HN21 109.470 3.000
CON CO N1 HN13 109.500 3.000
CON CO N1 HN12 109.500 3.000
CON CO N1 HN11 109.500 3.000
CON HN13 N1 HN12 109.470 3.000
CON HN13 N1 HN11 109.470 3.000
CON HN12 N1 HN11 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
CON var_1 HN43 N4 CO N1 180.000 20.000 3
CON var_2 N4 CO N3 HN31 180.000 20.000 3
CON var_3 N4 CO N2 HN21 180.000 20.000 3
CON var_4 N4 CO N1 HN11 180.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
CON chir_01 CO N4 N3 N2 negativ
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