File: CON_CON.cif

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refmac-dictionary 5.41-3
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global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
CON      CON 'COBALT TETRAAMMINE ION              ' non-polymer        17   5 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_CON
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 CON           N4     N    NT3       0.000      0.000    0.000    0.000
 CON           HN41   H    H         0.000     -0.590    0.100    0.843
 CON           HN42   H    H         0.000     -0.590    0.100   -0.843
 CON           HN43   H    H         0.000      0.441   -0.935    0.000
 CON           CO     CO   CO        3.000      1.415    1.409    0.000
 CON           N3     N    NT3       0.000      2.501    1.169    1.651
 CON           HN33   H    H         0.000      1.895    1.269    2.482
 CON           HN32   H    H         0.000      2.930    0.229    1.650
 CON           HN31   H    H         0.000      3.246    1.885    1.683
 CON           N2     N    NT3       0.000      2.501    1.169   -1.651
 CON           HN23   H    H         0.000      2.930    0.229   -1.650
 CON           HN22   H    H         0.000      1.895    1.269   -2.482
 CON           HN21   H    H         0.000      3.246    1.885   -1.683
 CON           N1     N    NT3       0.000      0.470    3.164    0.000
 CON           HN13   H    H         0.000     -0.123    3.239   -0.843
 CON           HN12   H    H         0.000     -0.123    3.239    0.843
 CON           HN11   H    H         0.000      1.163    3.931   -0.000
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 CON      N4     n/a    CO     START
 CON      HN41   N4     .      .
 CON      HN42   N4     .      .
 CON      HN43   N4     .      .
 CON      CO     N4     N1     .
 CON      N3     CO     HN31   .
 CON      HN33   N3     .      .
 CON      HN32   N3     .      .
 CON      HN31   N3     .      .
 CON      N2     CO     HN21   .
 CON      HN23   N2     .      .
 CON      HN22   N2     .      .
 CON      HN21   N2     .      .
 CON      N1     CO     HN11   .
 CON      HN13   N1     .      .
 CON      HN12   N1     .      .
 CON      HN11   N1     .      END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
 CON      N1     CO        single      1.980    0.020
 CON      N2     CO        single      1.980    0.020
 CON      N3     CO        single      1.980    0.020
 CON      CO     N4        single      1.980    0.020
 CON      HN11   N1        single      1.033    0.020
 CON      HN12   N1        single      1.033    0.020
 CON      HN13   N1        single      1.033    0.020
 CON      HN21   N2        single      1.033    0.020
 CON      HN22   N2        single      1.033    0.020
 CON      HN23   N2        single      1.033    0.020
 CON      HN31   N3        single      1.033    0.020
 CON      HN32   N3        single      1.033    0.020
 CON      HN33   N3        single      1.033    0.020
 CON      HN41   N4        single      1.033    0.020
 CON      HN42   N4        single      1.033    0.020
 CON      HN43   N4        single      1.033    0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 CON      HN41   N4     HN42    109.470    3.000
 CON      HN41   N4     HN43    109.470    3.000
 CON      HN42   N4     HN43    109.470    3.000
 CON      HN41   N4     CO      109.500    3.000
 CON      HN42   N4     CO      109.500    3.000
 CON      HN43   N4     CO      109.500    3.000
 CON      N4     CO     N3       90.000    3.000
 CON      N4     CO     N2       90.000    3.000
 CON      N4     CO     N1       90.000    3.000
 CON      N3     CO     N2       90.000    3.000
 CON      N3     CO     N1       90.000    3.000
 CON      N2     CO     N1       90.000    3.000
 CON      CO     N3     HN33    109.500    3.000
 CON      CO     N3     HN32    109.500    3.000
 CON      CO     N3     HN31    109.500    3.000
 CON      HN33   N3     HN32    109.470    3.000
 CON      HN33   N3     HN31    109.470    3.000
 CON      HN32   N3     HN31    109.470    3.000
 CON      CO     N2     HN23    109.500    3.000
 CON      CO     N2     HN22    109.500    3.000
 CON      CO     N2     HN21    109.500    3.000
 CON      HN23   N2     HN22    109.470    3.000
 CON      HN23   N2     HN21    109.470    3.000
 CON      HN22   N2     HN21    109.470    3.000
 CON      CO     N1     HN13    109.500    3.000
 CON      CO     N1     HN12    109.500    3.000
 CON      CO     N1     HN11    109.500    3.000
 CON      HN13   N1     HN12    109.470    3.000
 CON      HN13   N1     HN11    109.470    3.000
 CON      HN12   N1     HN11    109.470    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 CON      var_1    HN43   N4     CO     N1       180.000   20.000   3
 CON      var_2    N4     CO     N3     HN31     180.000   20.000   3
 CON      var_3    N4     CO     N2     HN21     180.000   20.000   3
 CON      var_4    N4     CO     N1     HN11     180.000   20.000   3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 CON      chir_01  CO     N4     N3     N2        negativ
# ------------------------------------------------------