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333
334
335
336
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
COR COR '2,4-DIAMINO-1,5-DIPHENYL-3-HYDROXYPE' non-polymer 42 20 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_COR
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
COR O3 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
COR HO3 H H 0.000 -0.004 0.967 -0.009
COR C3 C CH1 0.000 -1.346 -0.480 0.008
COR H3 H H 0.000 -1.343 -1.579 0.018
COR C4 C CH1 0.000 -2.065 0.040 1.255
COR H4 H H 0.000 -2.068 1.139 1.245
COR C5 C CH2 0.000 -1.337 -0.456 2.507
COR H51 H H 0.000 -0.308 -0.090 2.499
COR H52 H H 0.000 -1.333 -1.548 2.516
COR C1B C CR6 0.000 -2.045 0.056 3.734
COR C6B C CR16 0.000 -1.678 1.266 4.289
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COR C5B C CR16 0.000 -2.330 1.738 5.413
COR H5B H H 0.000 -2.047 2.691 5.843
COR C4B C CR16 0.000 -3.342 0.994 5.988
COR H4B H H 0.000 -3.849 1.361 6.871
COR C3B C CR16 0.000 -3.707 -0.219 5.436
COR H3B H H 0.000 -4.501 -0.801 5.885
COR C2B C CR16 0.000 -3.057 -0.689 4.309
COR H2B H H 0.000 -3.341 -1.641 3.877
COR N4 N NH2 0.000 -3.447 -0.453 1.264
COR HN42 H H 0.000 -4.223 0.198 1.259
COR HN41 H H 0.000 -3.635 -1.449 1.274
COR C2 C CH1 0.000 -2.072 0.016 -1.243
COR H2 H H 0.000 -3.108 -0.353 -1.236
COR N2 N NH2 0.000 -2.076 1.484 -1.256
COR HN22 H H 0.000 -2.952 1.993 -1.257
COR HN21 H H 0.000 -1.203 1.998 -1.264
COR C1 C CH2 0.000 -1.354 -0.503 -2.489
COR H11 H H 0.000 -1.349 -1.595 -2.478
COR H12 H H 0.000 -0.325 -0.136 -2.495
COR C1A C CR6 0.000 -2.070 -0.015 -3.722
COR C6A C CR16 0.000 -3.081 -0.773 -4.279
COR H6A H H 0.000 -3.357 -1.720 -3.832
COR C5A C CR16 0.000 -3.742 -0.322 -5.408
COR H5A H H 0.000 -4.541 -0.912 -5.839
COR C4A C CR16 0.000 -3.382 0.881 -5.984
COR H4A H H 0.000 -3.896 1.232 -6.870
COR C3A C CR16 0.000 -2.366 1.636 -5.430
COR H3A H H 0.000 -2.085 2.580 -5.882
COR C2A C CR16 0.000 -1.709 1.188 -4.299
COR H2A H H 0.000 -0.913 1.780 -3.865
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
COR O3 n/a C3 START
COR HO3 O3 . .
COR C3 O3 C2 .
COR H3 C3 . .
COR C4 C3 N4 .
COR H4 C4 . .
COR C5 C4 C1B .
COR H51 C5 . .
COR H52 C5 . .
COR C1B C5 C6B .
COR C6B C1B C5B .
COR H6B C6B . .
COR C5B C6B C4B .
COR H5B C5B . .
COR C4B C5B C3B .
COR H4B C4B . .
COR C3B C4B C2B .
COR H3B C3B . .
COR C2B C3B H2B .
COR H2B C2B . .
COR N4 C4 HN41 .
COR HN42 N4 . .
COR HN41 N4 . .
COR C2 C3 C1 .
COR H2 C2 . .
COR N2 C2 HN21 .
COR HN22 N2 . .
COR HN21 N2 . .
COR C1 C2 C1A .
COR H11 C1 . .
COR H12 C1 . .
COR C1A C1 C6A .
COR C6A C1A C5A .
COR H6A C6A . .
COR C5A C6A C4A .
COR H5A C5A . .
COR C4A C5A C3A .
COR H4A C4A . .
COR C3A C4A C2A .
COR H3A C3A . .
COR C2A C3A H2A .
COR H2A C2A . END
COR C1A C2A . ADD
COR C1B C2B . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
COR C1 C2 single 1.524 0.020
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COR H11 C1 single 1.092 0.020
COR H12 C1 single 1.092 0.020
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COR C2 C3 single 1.524 0.020
COR H2 C2 single 1.099 0.020
COR HN21 N2 single 1.010 0.020
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COR C3 O3 single 1.432 0.020
COR C4 C3 single 1.524 0.020
COR H3 C3 single 1.099 0.020
COR HO3 O3 single 0.967 0.020
COR N4 C4 single 1.450 0.020
COR C5 C4 single 1.524 0.020
COR H4 C4 single 1.099 0.020
COR HN41 N4 single 1.010 0.020
COR HN42 N4 single 1.010 0.020
COR C1B C5 single 1.511 0.020
COR H51 C5 single 1.092 0.020
COR H52 C5 single 1.092 0.020
COR C1A C2A double 1.390 0.020
COR C6A C1A single 1.390 0.020
COR C2A C3A single 1.390 0.020
COR H2A C2A single 1.083 0.020
COR C3A C4A double 1.390 0.020
COR H3A C3A single 1.083 0.020
COR C4A C5A single 1.390 0.020
COR H4A C4A single 1.083 0.020
COR C5A C6A double 1.390 0.020
COR H5A C5A single 1.083 0.020
COR H6A C6A single 1.083 0.020
COR C1B C2B double 1.390 0.020
COR C6B C1B single 1.390 0.020
COR C2B C3B single 1.390 0.020
COR H2B C2B single 1.083 0.020
COR C3B C4B double 1.390 0.020
COR H3B C3B single 1.083 0.020
COR C4B C5B single 1.390 0.020
COR H4B C4B single 1.083 0.020
COR C5B C6B double 1.390 0.020
COR H5B C5B single 1.083 0.020
COR H6B C6B single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
COR HO3 O3 C3 109.470 3.000
COR O3 C3 H3 109.470 3.000
COR O3 C3 C4 109.470 3.000
COR O3 C3 C2 109.470 3.000
COR H3 C3 C4 108.340 3.000
COR H3 C3 C2 108.340 3.000
COR C4 C3 C2 111.000 3.000
COR C3 C4 H4 108.340 3.000
COR C3 C4 C5 111.000 3.000
COR C3 C4 N4 109.470 3.000
COR H4 C4 C5 108.340 3.000
COR H4 C4 N4 109.470 3.000
COR C5 C4 N4 109.470 3.000
COR C4 C5 H51 109.470 3.000
COR C4 C5 H52 109.470 3.000
COR C4 C5 C1B 109.470 3.000
COR H51 C5 H52 107.900 3.000
COR H51 C5 C1B 109.470 3.000
COR H52 C5 C1B 109.470 3.000
COR C5 C1B C6B 120.000 3.000
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COR C6B C1B C2B 120.000 3.000
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COR H5B C5B C4B 120.000 3.000
COR C5B C4B H4B 120.000 3.000
COR C5B C4B C3B 120.000 3.000
COR H4B C4B C3B 120.000 3.000
COR C4B C3B H3B 120.000 3.000
COR C4B C3B C2B 120.000 3.000
COR H3B C3B C2B 120.000 3.000
COR C3B C2B H2B 120.000 3.000
COR C3B C2B C1B 120.000 3.000
COR H2B C2B C1B 120.000 3.000
COR C4 N4 HN42 120.000 3.000
COR C4 N4 HN41 120.000 3.000
COR HN42 N4 HN41 120.000 3.000
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COR C3 C2 N2 109.470 3.000
COR C3 C2 C1 111.000 3.000
COR H2 C2 N2 109.470 3.000
COR H2 C2 C1 108.340 3.000
COR N2 C2 C1 109.470 3.000
COR C2 N2 HN22 120.000 3.000
COR C2 N2 HN21 120.000 3.000
COR HN22 N2 HN21 120.000 3.000
COR C2 C1 H11 109.470 3.000
COR C2 C1 H12 109.470 3.000
COR C2 C1 C1A 109.470 3.000
COR H11 C1 H12 107.900 3.000
COR H11 C1 C1A 109.470 3.000
COR H12 C1 C1A 109.470 3.000
COR C1 C1A C6A 120.000 3.000
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COR C6A C1A C2A 120.000 3.000
COR C1A C6A H6A 120.000 3.000
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COR C6A C5A H5A 120.000 3.000
COR C6A C5A C4A 120.000 3.000
COR H5A C5A C4A 120.000 3.000
COR C5A C4A H4A 120.000 3.000
COR C5A C4A C3A 120.000 3.000
COR H4A C4A C3A 120.000 3.000
COR C4A C3A H3A 120.000 3.000
COR C4A C3A C2A 120.000 3.000
COR H3A C3A C2A 120.000 3.000
COR C3A C2A H2A 120.000 3.000
COR C3A C2A C1A 120.000 3.000
COR H2A C2A C1A 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
COR var_1 HO3 O3 C3 C2 59.932 20.000 1
COR var_2 O3 C3 C4 N4 -179.983 20.000 3
COR var_3 C3 C4 C5 C1B -179.978 20.000 3
COR var_4 C4 C5 C1B C6B -90.333 20.000 2
COR CONST_1 C5 C1B C2B C3B 180.000 0.000 0
COR CONST_2 C5 C1B C6B C5B 180.000 0.000 0
COR CONST_3 C1B C6B C5B C4B 0.000 0.000 0
COR CONST_4 C6B C5B C4B C3B 0.000 0.000 0
COR CONST_5 C5B C4B C3B C2B 0.000 0.000 0
COR CONST_6 C4B C3B C2B C1B 0.000 0.000 0
COR var_5 C3 C4 N4 HN41 60.037 20.000 1
COR var_6 O3 C3 C2 C1 60.044 20.000 3
COR var_7 C3 C2 N2 HN21 60.019 20.000 1
COR var_8 C3 C2 C1 C1A 179.958 20.000 3
COR var_9 C2 C1 C1A C6A -90.292 20.000 2
COR CONST_7 C1 C1A C2A C3A 180.000 0.000 0
COR CONST_8 C1 C1A C6A C5A 180.000 0.000 0
COR CONST_9 C1A C6A C5A C4A 0.000 0.000 0
COR CONST_10 C6A C5A C4A C3A 0.000 0.000 0
COR CONST_11 C5A C4A C3A C2A 0.000 0.000 0
COR CONST_12 C4A C3A C2A C1A 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
COR chir_01 C2 C1 N2 C3 positiv
COR chir_02 C3 C2 O3 C4 negativ
COR chir_03 C4 C3 N4 C5 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
COR plan-1 N2 0.020
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COR plan-1 HN21 0.020
COR plan-1 HN22 0.020
COR plan-2 N4 0.020
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COR plan-3 C1A 0.020
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