1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
COU COU 'COUMARIN ' non-polymer 17 11 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_COU
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
COU O1 O O -0.500 0.000 0.000 0.000
COU C1 C CR6 0.000 -1.247 -0.101 0.001
COU O2 O O2 -0.500 -1.942 0.938 0.001
COU C9 C CR66 0.000 -3.343 0.960 0.001
COU C4 C CR66 0.000 -3.992 -0.286 0.002
COU C3 C CR16 0.000 -3.185 -1.510 0.001
COU H3 H H 0.000 -3.654 -2.486 0.005
COU C2 C CR16 0.000 -1.834 -1.385 -0.004
COU H2 H H 0.000 -1.207 -2.269 -0.013
COU C8 C CR16 0.000 -4.101 2.123 0.000
COU H8 H H 0.000 -3.613 3.090 -0.001
COU C7 C CR16 0.000 -5.477 2.045 0.001
COU H7 H H 0.000 -6.066 2.953 0.000
COU C6 C CR16 0.000 -6.116 0.813 0.002
COU H6 H H 0.000 -7.198 0.769 0.002
COU C5 C CR16 0.000 -5.390 -0.345 0.002
COU H5 H H 0.000 -5.894 -1.303 0.003
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
COU O1 n/a C1 START
COU C1 O1 O2 .
COU O2 C1 C9 .
COU C9 O2 C8 .
COU C4 C9 C3 .
COU C3 C4 C2 .
COU H3 C3 . .
COU C2 C3 H2 .
COU H2 C2 . .
COU C8 C9 C7 .
COU H8 C8 . .
COU C7 C8 C6 .
COU H7 C7 . .
COU C6 C7 C5 .
COU H6 C6 . .
COU C5 C6 H5 .
COU H5 C5 . END
COU C1 C2 . ADD
COU C4 C5 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
COU C1 C2 single 1.390 0.020
COU C1 O1 deloc 1.250 0.020
COU O2 C1 deloc 1.370 0.020
COU C2 C3 double 1.390 0.020
COU H2 C2 single 1.083 0.020
COU C3 C4 single 1.390 0.020
COU H3 C3 single 1.083 0.020
COU C4 C5 double 1.390 0.020
COU C4 C9 single 1.490 0.020
COU C5 C6 single 1.390 0.020
COU H5 C5 single 1.083 0.020
COU C6 C7 double 1.390 0.020
COU H6 C6 single 1.083 0.020
COU C7 C8 single 1.390 0.020
COU H7 C7 single 1.083 0.020
COU C8 C9 double 1.390 0.020
COU H8 C8 single 1.083 0.020
COU C9 O2 single 1.370 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
COU O1 C1 O2 120.000 3.000
COU O1 C1 C2 120.000 3.000
COU O2 C1 C2 120.000 3.000
COU C1 O2 C9 120.000 3.000
COU O2 C9 C4 120.000 3.000
COU O2 C9 C8 120.000 3.000
COU C4 C9 C8 120.000 3.000
COU C9 C4 C3 120.000 3.000
COU C9 C4 C5 120.000 3.000
COU C3 C4 C5 120.000 3.000
COU C4 C3 H3 120.000 3.000
COU C4 C3 C2 120.000 3.000
COU H3 C3 C2 120.000 3.000
COU C3 C2 H2 120.000 3.000
COU C3 C2 C1 120.000 3.000
COU H2 C2 C1 120.000 3.000
COU C9 C8 H8 120.000 3.000
COU C9 C8 C7 120.000 3.000
COU H8 C8 C7 120.000 3.000
COU C8 C7 H7 120.000 3.000
COU C8 C7 C6 120.000 3.000
COU H7 C7 C6 120.000 3.000
COU C7 C6 H6 120.000 3.000
COU C7 C6 C5 120.000 3.000
COU H6 C6 C5 120.000 3.000
COU C6 C5 H5 120.000 3.000
COU C6 C5 C4 120.000 3.000
COU H5 C5 C4 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
COU CONST_1 O1 C1 C2 C3 180.000 0.000 0
COU CONST_2 O1 C1 O2 C9 180.000 0.000 0
COU CONST_3 C1 O2 C9 C8 180.000 0.000 0
COU CONST_4 O2 C9 C4 C3 0.000 0.000 0
COU CONST_5 C9 C4 C5 C6 0.000 0.000 0
COU CONST_6 C9 C4 C3 C2 0.000 0.000 0
COU CONST_7 C4 C3 C2 C1 0.000 0.000 0
COU CONST_8 O2 C9 C8 C7 180.000 0.000 0
COU CONST_9 C9 C8 C7 C6 0.000 0.000 0
COU CONST_10 C8 C7 C6 C5 0.000 0.000 0
COU CONST_11 C7 C6 C5 C4 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
COU plan-1 C1 0.020
COU plan-1 C2 0.020
COU plan-1 O1 0.020
COU plan-1 O2 0.020
COU plan-1 C3 0.020
COU plan-1 H2 0.020
COU plan-1 C4 0.020
COU plan-1 H3 0.020
COU plan-1 C5 0.020
COU plan-1 C9 0.020
COU plan-1 C6 0.020
COU plan-1 C7 0.020
COU plan-1 C8 0.020
COU plan-1 H5 0.020
COU plan-1 H6 0.020
COU plan-1 H7 0.020
COU plan-1 H8 0.020
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