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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
D10 D10 'DECANE ' non-polymer 32 10 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_D10
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
D10 C10 C CH3 0.000 0.000 0.000 0.000
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D10 H103 H H 0.000 0.156 -0.865 0.593
D10 C9 C CH2 0.000 -1.430 0.000 -0.544
D10 H91 H H 0.000 -1.586 -0.891 -1.155
D10 H92 H H 0.000 -1.586 0.891 -1.155
D10 C8 C CH2 0.000 -2.420 0.000 0.622
D10 H81 H H 0.000 -2.261 0.891 1.233
D10 H82 H H 0.000 -2.261 -0.891 1.233
D10 C7 C CH2 0.000 -3.850 0.000 0.080
D10 H71 H H 0.000 -4.006 -0.891 -0.532
D10 H72 H H 0.000 -4.006 0.891 -0.532
D10 C6 C CH2 0.000 -4.839 0.000 1.245
D10 H61 H H 0.000 -4.680 0.891 1.856
D10 H62 H H 0.000 -4.680 -0.891 1.856
D10 C5 C CH2 0.000 -6.268 0.000 0.703
D10 H51 H H 0.000 -6.425 -0.891 0.091
D10 H52 H H 0.000 -6.425 0.891 0.091
D10 C4 C CH2 0.000 -7.257 0.000 1.869
D10 H41 H H 0.000 -7.099 0.891 2.479
D10 H42 H H 0.000 -7.099 -0.891 2.479
D10 C3 C CH2 0.000 -8.687 0.000 1.326
D10 H31 H H 0.000 -8.843 -0.891 0.714
D10 H32 H H 0.000 -8.843 0.891 0.714
D10 C2 C CH2 0.000 -9.677 0.000 2.492
D10 H21 H H 0.000 -9.519 0.891 3.103
D10 H22 H H 0.000 -9.519 -0.891 3.103
D10 C1 C CH3 0.000 -11.107 0.000 1.948
D10 H13 H H 0.000 -11.263 0.865 1.355
D10 H12 H H 0.000 -11.263 -0.865 1.355
D10 H11 H H 0.000 -11.796 0.000 2.755
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
D10 C10 n/a C9 START
D10 H101 C10 . .
D10 H102 C10 . .
D10 H103 C10 . .
D10 C9 C10 C8 .
D10 H91 C9 . .
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D10 H22 C2 . .
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D10 H13 C1 . .
D10 H12 C1 . .
D10 H11 C1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
D10 C1 C2 single 1.513 0.020
D10 H11 C1 single 1.059 0.020
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D10 C7 C8 single 1.524 0.020
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D10 C9 C10 single 1.513 0.020
D10 H91 C9 single 1.092 0.020
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D10 H101 C10 single 1.059 0.020
D10 H102 C10 single 1.059 0.020
D10 H103 C10 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
D10 H101 C10 H102 109.470 3.000
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D10 H101 C10 C9 109.470 3.000
D10 H102 C10 C9 109.470 3.000
D10 H103 C10 C9 109.470 3.000
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D10 H92 C9 C8 109.470 3.000
D10 C9 C8 H81 109.470 3.000
D10 C9 C8 H82 109.470 3.000
D10 C9 C8 C7 111.000 3.000
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D10 H81 C8 C7 109.470 3.000
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D10 C7 C6 H61 109.470 3.000
D10 C7 C6 H62 109.470 3.000
D10 C7 C6 C5 111.000 3.000
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D10 H61 C6 C5 109.470 3.000
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D10 C6 C5 C4 111.000 3.000
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D10 H51 C5 C4 109.470 3.000
D10 H52 C5 C4 109.470 3.000
D10 C5 C4 H41 109.470 3.000
D10 C5 C4 H42 109.470 3.000
D10 C5 C4 C3 111.000 3.000
D10 H41 C4 H42 107.900 3.000
D10 H41 C4 C3 109.470 3.000
D10 H42 C4 C3 109.470 3.000
D10 C4 C3 H31 109.470 3.000
D10 C4 C3 H32 109.470 3.000
D10 C4 C3 C2 111.000 3.000
D10 H31 C3 H32 107.900 3.000
D10 H31 C3 C2 109.470 3.000
D10 H32 C3 C2 109.470 3.000
D10 C3 C2 H21 109.470 3.000
D10 C3 C2 H22 109.470 3.000
D10 C3 C2 C1 111.000 3.000
D10 H21 C2 H22 107.900 3.000
D10 H21 C2 C1 109.470 3.000
D10 H22 C2 C1 109.470 3.000
D10 C2 C1 H13 109.470 3.000
D10 C2 C1 H12 109.470 3.000
D10 C2 C1 H11 109.470 3.000
D10 H13 C1 H12 109.470 3.000
D10 H13 C1 H11 109.470 3.000
D10 H12 C1 H11 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
D10 var_1 H103 C10 C9 C8 60.002 20.000 3
D10 var_2 C10 C9 C8 C7 180.000 20.000 3
D10 var_3 C9 C8 C7 C6 180.000 20.000 3
D10 var_4 C8 C7 C6 C5 180.000 20.000 3
D10 var_5 C7 C6 C5 C4 180.000 20.000 3
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D10 var_8 C4 C3 C2 C1 180.000 20.000 3
D10 var_9 C3 C2 C1 H11 180.000 20.000 3
# ------------------------------------------------------
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