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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
D11 D11 'D-PHOSPHOTHREONINE ' peptide 19 12 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_D11
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
D11 N N NH2 0.000 0.000 0.000 0.000
D11 HN1 H H 0.000 0.144 -0.701 0.717
D11 HN2 H H 0.000 0.491 0.884 0.064
D11 CA C CH1 0.000 -0.911 -0.263 -1.121
D11 HA H H 0.000 -0.376 -0.115 -2.070
D11 CB C CH1 0.000 -2.099 0.699 -1.049
D11 HB H H 0.000 -2.782 0.502 -1.888
D11 CG2 C CH3 0.000 -1.594 2.141 -1.131
D11 HG23 H H 0.000 -2.416 2.807 -1.082
D11 HG22 H H 0.000 -0.937 2.332 -0.323
D11 HG21 H H 0.000 -1.079 2.284 -2.045
D11 OG1 O O2 0.000 -2.794 0.507 0.185
D11 P P P 0.000 -4.341 0.068 0.261
D11 O1P O OP -0.666 -5.181 1.041 -0.536
D11 O2P O OP -0.666 -4.499 -1.323 -0.313
D11 O3P O OP -0.666 -4.796 0.073 1.704
D11 C C C 0.000 -1.409 -1.683 -1.042
D11 O O OC -0.500 -1.351 -2.306 0.041
D11 OXT O OC -0.500 -1.881 -2.238 -2.058
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
D11 N n/a CA START
D11 HN1 N . .
D11 HN2 N . .
D11 CA N C .
D11 HA CA . .
D11 CB CA OG1 .
D11 HB CB . .
D11 CG2 CB HG21 .
D11 HG23 CG2 . .
D11 HG22 CG2 . .
D11 HG21 CG2 . .
D11 OG1 CB P .
D11 P OG1 O3P .
D11 O1P P . .
D11 O2P P . .
D11 O3P P . .
D11 C CA . END
D11 O C . .
D11 OXT C . .
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
D11 CA N single 1.450 0.020
D11 CB CA single 1.524 0.020
D11 C CA single 1.500 0.020
D11 HA CA single 1.099 0.020
D11 CG2 CB single 1.524 0.020
D11 OG1 CB single 1.426 0.020
D11 HB CB single 1.099 0.020
D11 HG21 CG2 single 1.059 0.020
D11 HG22 CG2 single 1.059 0.020
D11 HG23 CG2 single 1.059 0.020
D11 P OG1 single 1.610 0.020
D11 O1P P deloc 1.510 0.020
D11 O2P P deloc 1.510 0.020
D11 O3P P deloc 1.510 0.020
D11 O C deloc 1.250 0.020
D11 OXT C deloc 1.250 0.020
D11 HN1 N single 1.010 0.020
D11 HN2 N single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
D11 HN1 N HN2 120.000 3.000
D11 HN1 N CA 120.000 3.000
D11 HN2 N CA 120.000 3.000
D11 N CA HA 109.470 3.000
D11 N CA CB 109.470 3.000
D11 N CA C 109.470 3.000
D11 HA CA CB 108.340 3.000
D11 HA CA C 108.810 3.000
D11 CB CA C 109.470 3.000
D11 CA CB HB 108.340 3.000
D11 CA CB CG2 111.000 3.000
D11 CA CB OG1 109.470 3.000
D11 HB CB CG2 108.340 3.000
D11 HB CB OG1 109.470 3.000
D11 CG2 CB OG1 109.470 3.000
D11 CB CG2 HG23 109.470 3.000
D11 CB CG2 HG22 109.470 3.000
D11 CB CG2 HG21 109.470 3.000
D11 HG23 CG2 HG22 109.470 3.000
D11 HG23 CG2 HG21 109.470 3.000
D11 HG22 CG2 HG21 109.470 3.000
D11 CB OG1 P 120.500 3.000
D11 OG1 P O1P 108.200 3.000
D11 OG1 P O2P 108.200 3.000
D11 OG1 P O3P 108.200 3.000
D11 O1P P O2P 119.900 3.000
D11 O1P P O3P 119.900 3.000
D11 O2P P O3P 119.900 3.000
D11 CA C O 118.500 3.000
D11 CA C OXT 118.500 3.000
D11 O C OXT 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
D11 var_1 HN2 N CA C 175.000 20.000 1
D11 var_2 N CA CB OG1 -59.953 20.000 3
D11 var_3 CA CB CG2 HG21 59.964 20.000 3
D11 var_4 CA CB OG1 P -120.002 20.000 1
D11 var_5 CB OG1 P O3P -175.005 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
D11 chir_01 CA N CB C positiv
D11 chir_02 CB CA CG2 OG1 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
D11 plan-1 N 0.020
D11 plan-1 CA 0.020
D11 plan-1 HN1 0.020
D11 plan-1 HN2 0.020
D11 plan-2 C 0.020
D11 plan-2 CA 0.020
D11 plan-2 O 0.020
D11 plan-2 OXT 0.020
# ------------------------------------------------------
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