1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
D25 D25 '3-phenyl-5-(1H-pyrazol-3-yl)isoxazol' non-polymer 25 16 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_D25
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
D25 H17 H H 0.000 0.001 -0.003 0.002
D25 C17 C CR16 0.000 -0.174 0.909 -0.555
D25 C16 C CR16 0.000 -0.832 0.845 -1.772
D25 H16 H H 0.000 -1.165 -0.111 -2.157
D25 C15 C CR16 0.000 -1.066 1.999 -2.496
D25 H15 H H 0.000 -1.582 1.953 -3.447
D25 C14 C CR16 0.000 -0.632 3.213 -1.993
D25 H14 H H 0.000 -0.810 4.120 -2.558
D25 C18 C CR16 0.000 0.264 2.116 -0.036
D25 H18 H H 0.000 0.778 2.152 0.917
D25 C13 C CR6 0.000 0.033 3.283 -0.762
D25 C12 C CR5 0.000 0.485 4.606 -0.254
D25 C4 C CR15 0.000 0.619 5.041 1.095
D25 H4 H H 0.000 0.421 4.483 2.002
D25 N11 N NRD5 0.000 0.834 5.620 -1.004
D25 O10 O O2 0.000 1.152 6.580 -0.348
D25 C3 C CR5 0.000 1.059 6.333 0.973
D25 C2 C CR5 0.000 1.386 7.295 2.049
D25 N6 N NRD5 0.000 1.213 7.120 3.344
D25 N10 N NR15 0.000 1.659 8.277 4.004
D25 H10 H H 0.000 1.651 8.433 5.033
D25 C6 C CR15 0.000 2.102 9.154 3.073
D25 H6 H H 0.000 2.506 10.140 3.265
D25 C1 C CR15 0.000 1.950 8.576 1.860
D25 H1 H H 0.000 2.215 9.019 0.907
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
D25 H17 n/a C17 START
D25 C17 H17 C18 .
D25 C16 C17 C15 .
D25 H16 C16 . .
D25 C15 C16 C14 .
D25 H15 C15 . .
D25 C14 C15 H14 .
D25 H14 C14 . .
D25 C18 C17 C13 .
D25 H18 C18 . .
D25 C13 C18 C12 .
D25 C12 C13 N11 .
D25 C4 C12 H4 .
D25 H4 C4 . .
D25 N11 C12 O10 .
D25 O10 N11 C3 .
D25 C3 O10 C2 .
D25 C2 C3 N6 .
D25 N6 C2 N10 .
D25 N10 N6 C6 .
D25 H10 N10 . .
D25 C6 N10 C1 .
D25 H6 C6 . .
D25 C1 C6 H1 .
D25 H1 C1 . END
D25 C1 C2 . ADD
D25 C3 C4 . ADD
D25 C13 C14 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
D25 C1 C2 single 1.387 0.020
D25 C1 C6 double 1.380 0.020
D25 C2 C3 single 1.490 0.020
D25 N6 C2 double 1.350 0.020
D25 C3 C4 double 1.387 0.020
D25 C3 O10 single 1.370 0.020
D25 C4 C12 single 1.387 0.020
D25 C6 N10 single 1.350 0.020
D25 O10 N11 single 1.337 0.020
D25 N11 C12 double 1.350 0.020
D25 C12 C13 single 1.490 0.020
D25 C13 C14 single 1.390 0.020
D25 C13 C18 double 1.390 0.020
D25 C14 C15 double 1.390 0.020
D25 C15 C16 single 1.390 0.020
D25 C16 C17 double 1.390 0.020
D25 C18 C17 single 1.390 0.020
D25 N10 N6 single 1.402 0.020
D25 H1 C1 single 1.083 0.020
D25 H6 C6 single 1.083 0.020
D25 H4 C4 single 1.083 0.020
D25 H10 N10 single 1.040 0.020
D25 H14 C14 single 1.083 0.020
D25 H18 C18 single 1.083 0.020
D25 H15 C15 single 1.083 0.020
D25 H16 C16 single 1.083 0.020
D25 C17 H17 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
D25 H17 C17 C16 120.000 3.000
D25 H17 C17 C18 120.000 3.000
D25 C16 C17 C18 120.000 3.000
D25 C17 C16 H16 120.000 3.000
D25 C17 C16 C15 120.000 3.000
D25 H16 C16 C15 120.000 3.000
D25 C16 C15 H15 120.000 3.000
D25 C16 C15 C14 120.000 3.000
D25 H15 C15 C14 120.000 3.000
D25 C15 C14 H14 120.000 3.000
D25 C15 C14 C13 120.000 3.000
D25 H14 C14 C13 120.000 3.000
D25 C17 C18 H18 120.000 3.000
D25 C17 C18 C13 120.000 3.000
D25 H18 C18 C13 120.000 3.000
D25 C18 C13 C12 120.000 3.000
D25 C18 C13 C14 120.000 3.000
D25 C12 C13 C14 120.000 3.000
D25 C13 C12 C4 126.000 3.000
D25 C13 C12 N11 126.000 3.000
D25 C4 C12 N11 108.000 3.000
D25 C12 C4 H4 126.000 3.000
D25 C12 C4 C3 108.000 3.000
D25 H4 C4 C3 126.000 3.000
D25 C12 N11 O10 108.000 3.000
D25 N11 O10 C3 120.000 3.000
D25 O10 C3 C2 108.000 3.000
D25 O10 C3 C4 108.000 3.000
D25 C2 C3 C4 108.000 3.000
D25 C3 C2 N6 108.000 3.000
D25 C3 C2 C1 108.000 3.000
D25 N6 C2 C1 108.000 3.000
D25 C2 N6 N10 108.000 3.000
D25 N6 N10 H10 108.000 3.000
D25 N6 N10 C6 108.000 3.000
D25 H10 N10 C6 126.000 3.000
D25 N10 C6 H6 126.000 3.000
D25 N10 C6 C1 108.000 3.000
D25 H6 C6 C1 126.000 3.000
D25 C6 C1 H1 126.000 3.000
D25 C6 C1 C2 108.000 3.000
D25 H1 C1 C2 126.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
D25 CONST_1 H17 C17 C16 C15 180.000 0.000 0
D25 CONST_2 C17 C16 C15 C14 0.000 0.000 0
D25 CONST_3 C16 C15 C14 C13 0.000 0.000 0
D25 CONST_4 H17 C17 C18 C13 180.000 0.000 0
D25 CONST_5 C17 C18 C13 C12 180.000 0.000 0
D25 CONST_6 C18 C13 C14 C15 0.000 0.000 0
D25 var_1 C18 C13 C12 N11 149.889 20.000 1
D25 CONST_7 C13 C12 C4 C3 180.000 0.000 0
D25 CONST_8 C13 C12 N11 O10 180.000 0.000 0
D25 CONST_9 C12 N11 O10 C3 0.000 0.000 0
D25 CONST_10 N11 O10 C3 C2 180.000 0.000 0
D25 CONST_11 O10 C3 C4 C12 0.000 0.000 0
D25 CONST_12 O10 C3 C2 N6 180.000 0.000 0
D25 CONST_13 C3 C2 N6 N10 180.000 0.000 0
D25 CONST_14 C2 N6 N10 C6 0.000 0.000 0
D25 CONST_15 N6 N10 C6 C1 0.000 0.000 0
D25 CONST_16 N10 C6 C1 C2 0.000 0.000 0
D25 CONST_17 C6 C1 C2 C3 180.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
D25 plan-1 C1 0.020
D25 plan-1 C2 0.020
D25 plan-1 C6 0.020
D25 plan-1 H1 0.020
D25 plan-1 N6 0.020
D25 plan-1 N10 0.020
D25 plan-1 C3 0.020
D25 plan-1 H6 0.020
D25 plan-1 H10 0.020
D25 plan-2 C3 0.020
D25 plan-2 C2 0.020
D25 plan-2 C4 0.020
D25 plan-2 O10 0.020
D25 plan-2 N11 0.020
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D25 plan-2 H4 0.020
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D25 plan-3 C13 0.020
D25 plan-3 C12 0.020
D25 plan-3 C14 0.020
D25 plan-3 C18 0.020
D25 plan-3 C15 0.020
D25 plan-3 C16 0.020
D25 plan-3 C17 0.020
D25 plan-3 H14 0.020
D25 plan-3 H15 0.020
D25 plan-3 H16 0.020
D25 plan-3 H17 0.020
D25 plan-3 H18 0.020
# ------------------------------------------------------
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