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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
D28 D28 '4-{[4-(4-fluoro-3-methylphenyl)-1,3-' non-polymer 36 24 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_D28
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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D28 H21 H H 0.000 2.557 0.806 1.149
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D28 H16 H H 0.000 2.555 0.746 4.690
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D28 H19 H H 0.000 -1.786 1.292 2.372
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D28 N11 N NH1 0.000 0.604 0.997 6.310
D28 H11 H H 0.000 1.505 0.670 6.630
D28 C7 C CR5 0.000 -0.286 1.363 7.321
D28 N3 N NRD5 0.000 -0.209 1.042 8.598
D28 S8 S S2 0.000 -1.778 2.346 7.348
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D28 H10 H H 0.000 0.103 -1.647 12.694
D28 C12 C CR6 0.000 -0.586 0.208 13.513
D28 F15 F F 0.000 -0.414 -0.210 14.782
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D28 C13 C CH3 0.000 -1.411 2.406 14.396
D28 H133 H H 0.000 -0.521 2.688 14.897
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D28 H131 H H 0.000 -2.058 1.914 15.075
D28 C5 C CR16 0.000 -1.251 1.875 11.958
D28 H5 H H 0.000 -1.632 2.867 11.748
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
D28 O24 n/a C22 START
D28 C22 O24 C20 .
D28 O23 C22 . .
D28 C20 C22 C19 .
D28 C18 C20 C16 .
D28 O21 C18 H21 .
D28 H21 O21 . .
D28 C16 C18 H16 .
D28 H16 C16 . .
D28 C19 C20 C17 .
D28 H19 C19 . .
D28 C17 C19 C14 .
D28 H17 C17 . .
D28 C14 C17 N11 .
D28 N11 C14 C7 .
D28 H11 N11 . .
D28 C7 N11 S8 .
D28 N3 C7 . .
D28 S8 C7 C4 .
D28 C4 S8 C1 .
D28 H4 C4 . .
D28 C1 C4 C2 .
D28 C2 C1 C6 .
D28 C6 C2 C10 .
D28 H6 C6 . .
D28 C10 C6 C12 .
D28 H10 C10 . .
D28 C12 C10 C9 .
D28 F15 C12 . .
D28 C9 C12 C5 .
D28 C13 C9 H131 .
D28 H133 C13 . .
D28 H132 C13 . .
D28 H131 C13 . .
D28 C5 C9 H5 .
D28 H5 C5 . END
D28 C1 N3 . ADD
D28 C2 C5 . ADD
D28 C14 C16 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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D28 C1 N3 single 1.350 0.020
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D28 S8 C7 single 1.745 0.020
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D28 C13 C9 single 1.506 0.020
D28 C12 C10 double 1.390 0.020
D28 N11 C14 single 1.350 0.020
D28 F15 C12 single 1.345 0.020
D28 C14 C16 single 1.390 0.020
D28 C14 C17 double 1.390 0.020
D28 C16 C18 double 1.390 0.020
D28 C17 C19 single 1.390 0.020
D28 C18 C20 single 1.487 0.020
D28 O21 C18 single 1.362 0.020
D28 C19 C20 double 1.390 0.020
D28 C20 C22 single 1.500 0.020
D28 O23 C22 deloc 1.250 0.020
D28 C22 O24 deloc 1.250 0.020
D28 H4 C4 single 1.083 0.020
D28 H5 C5 single 1.083 0.020
D28 H6 C6 single 1.083 0.020
D28 H10 C10 single 1.083 0.020
D28 H11 N11 single 1.010 0.020
D28 H131 C13 single 1.059 0.020
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D28 H133 C13 single 1.059 0.020
D28 H16 C16 single 1.083 0.020
D28 H17 C17 single 1.083 0.020
D28 H19 C19 single 1.083 0.020
D28 H21 O21 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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D28 O23 C22 C20 120.000 3.000
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D28 N11 C7 N3 108.000 3.000
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D28 C7 S8 C4 98.663 3.000
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D28 S8 C4 C1 108.000 3.000
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D28 H133 C13 H131 109.470 3.000
D28 H132 C13 H131 109.470 3.000
D28 C9 C5 H5 120.000 3.000
D28 C9 C5 C2 120.000 3.000
D28 H5 C5 C2 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
D28 var_1 O24 C22 C20 C19 -78.437 20.000 1
D28 CONST_1 C22 C20 C18 C16 180.000 0.000 0
D28 var_2 C20 C18 O21 H21 3.698 20.000 1
D28 CONST_2 C20 C18 C16 C14 0.000 0.000 0
D28 CONST_3 C22 C20 C19 C17 180.000 0.000 0
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D28 var_3 C17 C14 N11 C7 -13.572 20.000 1
D28 var_4 C14 N11 C7 S8 -17.768 20.000 1
D28 CONST_7 N11 C7 N3 C1 180.000 0.000 0
D28 CONST_8 N11 C7 S8 C4 180.000 0.000 0
D28 CONST_9 C7 S8 C4 C1 0.000 0.000 0
D28 CONST_10 S8 C4 C1 C2 180.000 0.000 0
D28 CONST_11 C4 C1 N3 C7 0.000 0.000 0
D28 var_5 C4 C1 C2 C6 142.856 20.000 1
D28 CONST_12 C1 C2 C5 C9 180.000 0.000 0
D28 CONST_13 C1 C2 C6 C10 180.000 0.000 0
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D28 CONST_15 C6 C10 C12 C9 0.000 0.000 0
D28 CONST_16 C10 C12 C9 C5 0.000 0.000 0
D28 var_6 C12 C9 C13 H131 -52.335 20.000 1
D28 CONST_17 C12 C9 C5 C2 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
D28 plan-1 C1 0.020
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D28 plan-5 C22 0.020
D28 plan-5 C20 0.020
D28 plan-5 O23 0.020
D28 plan-5 O24 0.020
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