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306
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
D2M D2M '4-(2,6-dimethoxyphenoxy)-2,6-dimetho' non-polymer 40 22 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_D2M
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
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D2M O31 O O2 0.000 -1.639 -0.250 2.196
D2M C33 C CH3 0.000 -2.548 -0.373 3.291
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D2M H33 H H 0.000 -3.160 -1.226 3.148
D2M C22 C CR16 0.000 -3.558 -0.080 0.801
D2M H22 H H 0.000 -4.202 -0.170 1.667
D2M C21 C CR6 0.000 -4.110 0.061 -0.464
D2M C23 C CR16 0.000 -3.286 0.181 -1.573
D2M H23 H H 0.000 -3.719 0.291 -2.560
D2M C26 C CR6 0.000 -1.909 0.161 -1.418
D2M O32 O O2 0.000 -1.101 0.280 -2.506
D2M C34 C CH3 0.000 -1.740 0.421 -3.777
D2M H34B H H 0.000 -2.343 1.292 -3.775
D2M H34A H H 0.000 -1.005 0.503 -4.536
D2M H34 H H 0.000 -2.347 -0.426 -3.964
D2M O20 O O2 0.000 -5.461 0.080 -0.615
D2M C3 C CR6 0.000 -6.231 -0.041 0.500
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D2M O15 O O2 0.000 -6.237 2.324 0.778
D2M C16 C CH3 0.000 -6.677 3.445 1.550
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D2M H1 H H 0.000 -7.725 1.846 2.880
D2M C6 C CR16 0.000 -7.801 -0.288 2.772
D2M H6 H H 0.000 -8.413 -0.385 3.660
D2M C5 C CR16 0.000 -7.409 -1.419 2.078
D2M H5 H H 0.000 -7.716 -2.399 2.423
D2M C4 C CR6 0.000 -6.624 -1.299 0.941
D2M O10 O O2 0.000 -6.239 -2.411 0.261
D2M C11 C CH3 0.000 -6.680 -3.671 0.772
D2M H11B H H 0.000 -7.739 -3.697 0.785
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D2M H11 H H 0.000 -6.313 -3.800 1.758
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
D2M O29 n/a C28 START
D2M HO29 O29 . .
D2M C28 O29 C24 .
D2M C24 C28 C22 .
D2M O31 C24 C33 .
D2M C33 O31 H33 .
D2M H33B C33 . .
D2M H33A C33 . .
D2M H33 C33 . .
D2M C22 C24 C21 .
D2M H22 C22 . .
D2M C21 C22 O20 .
D2M C23 C21 C26 .
D2M H23 C23 . .
D2M C26 C23 O32 .
D2M O32 C26 C34 .
D2M C34 O32 H34 .
D2M H34B C34 . .
D2M H34A C34 . .
D2M H34 C34 . .
D2M O20 C21 C3 .
D2M C3 O20 C2 .
D2M C2 C3 C1 .
D2M O15 C2 C16 .
D2M C16 O15 H16 .
D2M H16B C16 . .
D2M H16A C16 . .
D2M H16 C16 . .
D2M C1 C2 C6 .
D2M H1 C1 . .
D2M C6 C1 C5 .
D2M H6 C6 . .
D2M C5 C6 C4 .
D2M H5 C5 . .
D2M C4 C5 O10 .
D2M O10 C4 C11 .
D2M C11 O10 H11 .
D2M H11B C11 . .
D2M H11A C11 . .
D2M H11 C11 . END
D2M C28 C26 . ADD
D2M C3 C4 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
D2M C28 O29 single 1.362 0.020
D2M HO29 O29 single 0.967 0.020
D2M C28 C26 double 1.487 0.020
D2M C24 C28 single 1.487 0.020
D2M O32 C26 single 1.370 0.020
D2M C26 C23 single 1.390 0.020
D2M C34 O32 single 1.426 0.020
D2M H34 C34 single 1.059 0.020
D2M H34A C34 single 1.059 0.020
D2M H34B C34 single 1.059 0.020
D2M C23 C21 double 1.390 0.020
D2M H23 C23 single 1.083 0.020
D2M O20 C21 single 1.370 0.020
D2M C21 C22 single 1.390 0.020
D2M C22 C24 double 1.390 0.020
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D2M O31 C24 single 1.370 0.020
D2M C33 O31 single 1.426 0.020
D2M H33 C33 single 1.059 0.020
D2M H33A C33 single 1.059 0.020
D2M H33B C33 single 1.059 0.020
D2M C3 O20 single 1.370 0.020
D2M C3 C4 double 1.487 0.020
D2M C2 C3 single 1.487 0.020
D2M O10 C4 single 1.370 0.020
D2M C4 C5 single 1.390 0.020
D2M C11 O10 single 1.426 0.020
D2M H11 C11 single 1.059 0.020
D2M H11A C11 single 1.059 0.020
D2M H11B C11 single 1.059 0.020
D2M C5 C6 double 1.390 0.020
D2M H5 C5 single 1.083 0.020
D2M C6 C1 single 1.390 0.020
D2M H6 C6 single 1.083 0.020
D2M C1 C2 double 1.390 0.020
D2M H1 C1 single 1.083 0.020
D2M O15 C2 single 1.370 0.020
D2M C16 O15 single 1.426 0.020
D2M H16 C16 single 1.059 0.020
D2M H16A C16 single 1.059 0.020
D2M H16B C16 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
D2M HO29 O29 C28 109.470 3.000
D2M O29 C28 C24 120.000 3.000
D2M O29 C28 C26 120.000 3.000
D2M C24 C28 C26 120.000 3.000
D2M C28 C24 O31 120.000 3.000
D2M C28 C24 C22 120.000 3.000
D2M O31 C24 C22 120.000 3.000
D2M C24 O31 C33 120.000 3.000
D2M O31 C33 H33B 109.470 3.000
D2M O31 C33 H33A 109.470 3.000
D2M O31 C33 H33 109.470 3.000
D2M H33B C33 H33A 109.470 3.000
D2M H33B C33 H33 109.470 3.000
D2M H33A C33 H33 109.470 3.000
D2M C24 C22 H22 120.000 3.000
D2M C24 C22 C21 120.000 3.000
D2M H22 C22 C21 120.000 3.000
D2M C22 C21 C23 120.000 3.000
D2M C22 C21 O20 120.000 3.000
D2M C23 C21 O20 120.000 3.000
D2M C21 C23 H23 120.000 3.000
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D2M H23 C23 C26 120.000 3.000
D2M C23 C26 O32 120.000 3.000
D2M C23 C26 C28 120.000 3.000
D2M O32 C26 C28 120.000 3.000
D2M C26 O32 C34 120.000 3.000
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D2M O32 C34 H34A 109.470 3.000
D2M O32 C34 H34 109.470 3.000
D2M H34B C34 H34A 109.470 3.000
D2M H34B C34 H34 109.470 3.000
D2M H34A C34 H34 109.470 3.000
D2M C21 O20 C3 120.000 3.000
D2M O20 C3 C2 120.000 3.000
D2M O20 C3 C4 120.000 3.000
D2M C2 C3 C4 120.000 3.000
D2M C3 C2 O15 120.000 3.000
D2M C3 C2 C1 120.000 3.000
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D2M C2 O15 C16 120.000 3.000
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D2M O15 C16 H16 109.470 3.000
D2M H16B C16 H16A 109.470 3.000
D2M H16B C16 H16 109.470 3.000
D2M H16A C16 H16 109.470 3.000
D2M C2 C1 H1 120.000 3.000
D2M C2 C1 C6 120.000 3.000
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D2M H5 C5 C4 120.000 3.000
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D2M C4 O10 C11 120.000 3.000
D2M O10 C11 H11B 109.470 3.000
D2M O10 C11 H11A 109.470 3.000
D2M O10 C11 H11 109.470 3.000
D2M H11B C11 H11A 109.470 3.000
D2M H11B C11 H11 109.470 3.000
D2M H11A C11 H11 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
D2M var_1 HO29 O29 C28 C24 89.984 20.000 1
D2M CONST_1 O29 C28 C26 C23 180.000 0.000 0
D2M CONST_2 O29 C28 C24 C22 180.000 0.000 0
D2M var_2 C28 C24 O31 C33 179.942 20.000 1
D2M var_3 C24 O31 C33 H33 60.009 20.000 1
D2M CONST_3 C28 C24 C22 C21 0.000 0.000 0
D2M CONST_4 C24 C22 C21 O20 180.000 0.000 0
D2M CONST_5 C22 C21 C23 C26 0.000 0.000 0
D2M CONST_6 C21 C23 C26 O32 180.000 0.000 0
D2M var_4 C23 C26 O32 C34 -0.028 20.000 1
D2M var_5 C26 O32 C34 H34 -59.958 20.000 1
D2M var_6 C22 C21 O20 C3 0.029 20.000 1
D2M var_7 C21 O20 C3 C2 89.993 20.000 1
D2M CONST_7 O20 C3 C4 C5 180.000 0.000 0
D2M CONST_8 O20 C3 C2 C1 180.000 0.000 0
D2M var_8 C3 C2 O15 C16 -179.985 20.000 1
D2M var_9 C2 O15 C16 H16 -179.974 20.000 1
D2M CONST_9 C3 C2 C1 C6 0.000 0.000 0
D2M CONST_10 C2 C1 C6 C5 0.000 0.000 0
D2M CONST_11 C1 C6 C5 C4 0.000 0.000 0
D2M CONST_12 C6 C5 C4 O10 180.000 0.000 0
D2M var_10 C5 C4 O10 C11 0.008 20.000 1
D2M var_11 C4 O10 C11 H11 -60.035 20.000 1
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
D2M plan-1 C28 0.020
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D2M plan-1 O20 0.020
D2M plan-1 H22 0.020
D2M plan-1 O31 0.020
D2M plan-2 C3 0.020
D2M plan-2 O20 0.020
D2M plan-2 C4 0.020
D2M plan-2 C2 0.020
D2M plan-2 C5 0.020
D2M plan-2 C6 0.020
D2M plan-2 C1 0.020
D2M plan-2 O10 0.020
D2M plan-2 H5 0.020
D2M plan-2 H6 0.020
D2M plan-2 H1 0.020
D2M plan-2 O15 0.020
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