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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DA3 DA3 '. ' non-polymer 22 14 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DA3
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DA3 O5 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
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DA3 C6 C C 0.000 -2.229 0.029 0.787
DA3 N2 N N 0.000 -2.832 0.171 -0.345
DA3 C5 C CH2 0.000 -3.279 -0.032 1.879
DA3 H51 H H 0.000 -3.042 0.611 2.729
DA3 H52 H H 0.000 -3.464 -1.048 2.232
DA3 C4 C CH1 0.000 -4.541 0.504 1.162
DA3 H4 H H 0.000 -4.655 1.585 1.324
DA3 O3 O O2 0.000 -4.239 0.219 -0.218
DA3 C3 C CH2 0.000 -5.791 -0.250 1.616
DA3 H31 H H 0.000 -5.949 -0.081 2.683
DA3 H32 H H 0.000 -5.656 -1.318 1.435
DA3 C2 C CH1 0.000 -7.004 0.253 0.833
DA3 H2 H H 0.000 -6.843 0.082 -0.240
DA3 N1 N NH2 0.000 -7.183 1.690 1.079
DA3 HN12 H H 0.000 -8.075 2.046 1.403
DA3 HN11 H H 0.000 -6.417 2.334 0.926
DA3 C1 C C 0.000 -8.236 -0.490 1.280
DA3 O1 O OC -0.500 -8.926 -0.048 2.225
DA3 O2 O OC -0.500 -8.569 -1.551 0.707
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DA3 O5 n/a C7 START
DA3 C7 O5 C6 .
DA3 O4 C7 . .
DA3 C6 C7 C5 .
DA3 N2 C6 . .
DA3 C5 C6 C4 .
DA3 H51 C5 . .
DA3 H52 C5 . .
DA3 C4 C5 C3 .
DA3 H4 C4 . .
DA3 O3 C4 . .
DA3 C3 C4 C2 .
DA3 H31 C3 . .
DA3 H32 C3 . .
DA3 C2 C3 C1 .
DA3 H2 C2 . .
DA3 N1 C2 HN11 .
DA3 HN12 N1 . .
DA3 HN11 N1 . .
DA3 C1 C2 O2 .
DA3 O1 C1 . .
DA3 O2 C1 . END
DA3 O3 N2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DA3 N1 C2 single 1.450 0.020
DA3 HN11 N1 single 1.010 0.020
DA3 HN12 N1 single 1.010 0.020
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DA3 O2 C1 deloc 1.250 0.020
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DA3 N2 C6 double 1.260 0.020
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DA3 H52 C5 single 1.092 0.020
DA3 C6 C7 single 1.460 0.020
DA3 C7 O5 deloc 1.250 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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DA3 H51 C5 C4 109.470 3.000
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DA3 C5 C4 C3 109.470 3.000
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DA3 H4 C4 C3 108.340 3.000
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DA3 C4 C3 C2 111.000 3.000
DA3 H31 C3 H32 107.900 3.000
DA3 H31 C3 C2 109.470 3.000
DA3 H32 C3 C2 109.470 3.000
DA3 C3 C2 H2 108.340 3.000
DA3 C3 C2 N1 109.470 3.000
DA3 C3 C2 C1 109.470 3.000
DA3 H2 C2 N1 109.470 3.000
DA3 H2 C2 C1 108.810 3.000
DA3 N1 C2 C1 109.470 3.000
DA3 C2 N1 HN12 120.000 3.000
DA3 C2 N1 HN11 120.000 3.000
DA3 HN12 N1 HN11 120.000 3.000
DA3 C2 C1 O1 118.500 3.000
DA3 C2 C1 O2 118.500 3.000
DA3 O1 C1 O2 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DA3 var_1 O5 C7 C6 C5 179.984 20.000 1
DA3 CONST_1 C7 C6 N2 O3 180.000 0.000 0
DA3 var_2 C7 C6 C5 C4 150.000 20.000 3
DA3 var_3 C6 C5 C4 C3 150.000 20.000 3
DA3 var_4 C5 C4 O3 N2 -30.000 20.000 1
DA3 var_5 C4 O3 N2 C6 30.000 20.000 1
DA3 var_6 C5 C4 C3 C2 -176.941 20.000 3
DA3 var_7 C4 C3 C2 C1 179.970 20.000 3
DA3 var_8 C3 C2 N1 HN11 53.701 20.000 1
DA3 var_9 C3 C2 C1 O2 -89.960 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
DA3 chir_01 C2 N1 C1 C3 positiv
DA3 chir_02 C4 O3 C3 C5 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
DA3 plan-1 N1 0.020
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DA3 plan-1 HN12 0.020
DA3 plan-2 C1 0.020
DA3 plan-2 C2 0.020
DA3 plan-2 O1 0.020
DA3 plan-2 O2 0.020
DA3 plan-3 N2 0.020
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DA3 plan-4 C6 0.020
DA3 plan-4 N2 0.020
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DA3 plan-5 O4 0.020
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DA3 plan-5 O5 0.020
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