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255
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DEM DEM 'DECYLOXY-METHANOL ' non-polymer 37 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DEM
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DEM O5 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
DEM HO5 H H 0.000 0.859 0.353 0.270
DEM CM C CH2 0.000 -0.750 1.025 -0.653
DEM HCM1 H H 0.000 -0.203 1.370 -1.534
DEM HCM2 H H 0.000 -0.897 1.861 0.033
DEM O1 O O2 0.000 -2.019 0.505 -1.052
DEM C1 C CH2 0.000 -2.919 0.730 0.034
DEM HC11 H H 0.000 -2.983 1.802 0.236
DEM HC12 H H 0.000 -2.551 0.215 0.923
DEM C2 C CH2 0.000 -4.305 0.195 -0.330
DEM HC21 H H 0.000 -4.238 -0.876 -0.533
DEM HC22 H H 0.000 -4.670 0.711 -1.220
DEM C3 C CH2 0.000 -5.268 0.436 0.833
DEM HC31 H H 0.000 -5.332 1.507 1.036
DEM HC32 H H 0.000 -4.899 -0.080 1.722
DEM C4 C CH2 0.000 -6.652 -0.099 0.469
DEM HC41 H H 0.000 -6.585 -1.170 0.266
DEM HC42 H H 0.000 -7.018 0.417 -0.421
DEM C5 C CH2 0.000 -7.616 0.141 1.632
DEM HC51 H H 0.000 -7.680 1.212 1.835
DEM HC52 H H 0.000 -7.247 -0.375 2.521
DEM C6 C CH2 0.000 -9.001 -0.394 1.268
DEM HC61 H H 0.000 -8.934 -1.465 1.065
DEM HC62 H H 0.000 -9.367 0.122 0.378
DEM C7 C CH2 0.000 -9.965 -0.153 2.431
DEM HC71 H H 0.000 -10.028 0.918 2.634
DEM HC72 H H 0.000 -9.596 -0.670 3.320
DEM C8 C CH2 0.000 -11.351 -0.689 2.067
DEM HC81 H H 0.000 -11.285 -1.759 1.863
DEM HC82 H H 0.000 -11.717 -0.172 1.177
DEM C9 C CH2 0.000 -12.314 -0.448 3.230
DEM HC91 H H 0.000 -12.377 0.623 3.432
DEM HC92 H H 0.000 -11.945 -0.964 4.118
DEM C10 C CH3 0.000 -13.700 -0.983 2.866
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DEM H102 H H 0.000 -13.640 -2.023 2.668
DEM H101 H H 0.000 -14.369 -0.818 3.672
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DEM O5 n/a CM START
DEM HO5 O5 . .
DEM CM O5 O1 .
DEM HCM1 CM . .
DEM HCM2 CM . .
DEM O1 CM C1 .
DEM C1 O1 C2 .
DEM HC11 C1 . .
DEM HC12 C1 . .
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DEM HC21 C2 . .
DEM HC22 C2 . .
DEM C3 C2 C4 .
DEM HC31 C3 . .
DEM HC32 C3 . .
DEM C4 C3 C5 .
DEM HC41 C4 . .
DEM HC42 C4 . .
DEM C5 C4 C6 .
DEM HC51 C5 . .
DEM HC52 C5 . .
DEM C6 C5 C7 .
DEM HC61 C6 . .
DEM HC62 C6 . .
DEM C7 C6 C8 .
DEM HC71 C7 . .
DEM HC72 C7 . .
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DEM HC81 C8 . .
DEM HC82 C8 . .
DEM C9 C8 C10 .
DEM HC91 C9 . .
DEM HC92 C9 . .
DEM C10 C9 H101 .
DEM H103 C10 . .
DEM H102 C10 . .
DEM H101 C10 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DEM O1 CM single 1.426 0.020
DEM CM O5 single 1.432 0.020
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DEM HC22 C2 single 1.092 0.020
DEM C4 C3 single 1.524 0.020
DEM HC31 C3 single 1.092 0.020
DEM HC32 C3 single 1.092 0.020
DEM C5 C4 single 1.524 0.020
DEM HC41 C4 single 1.092 0.020
DEM HC42 C4 single 1.092 0.020
DEM C6 C5 single 1.524 0.020
DEM HC51 C5 single 1.092 0.020
DEM HC52 C5 single 1.092 0.020
DEM C7 C6 single 1.524 0.020
DEM HC61 C6 single 1.092 0.020
DEM HC62 C6 single 1.092 0.020
DEM C8 C7 single 1.524 0.020
DEM HC71 C7 single 1.092 0.020
DEM HC72 C7 single 1.092 0.020
DEM C9 C8 single 1.524 0.020
DEM HC81 C8 single 1.092 0.020
DEM HC82 C8 single 1.092 0.020
DEM C10 C9 single 1.513 0.020
DEM HC91 C9 single 1.092 0.020
DEM HC92 C9 single 1.092 0.020
DEM H101 C10 single 1.059 0.020
DEM H102 C10 single 1.059 0.020
DEM H103 C10 single 1.059 0.020
DEM HO5 O5 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
DEM HO5 O5 CM 109.470 3.000
DEM O5 CM HCM1 109.470 3.000
DEM O5 CM HCM2 109.470 3.000
DEM O5 CM O1 109.500 3.000
DEM HCM1 CM HCM2 107.900 3.000
DEM HCM1 CM O1 109.470 3.000
DEM HCM2 CM O1 109.470 3.000
DEM CM O1 C1 111.800 3.000
DEM O1 C1 HC11 109.470 3.000
DEM O1 C1 HC12 109.470 3.000
DEM O1 C1 C2 109.470 3.000
DEM HC11 C1 HC12 107.900 3.000
DEM HC11 C1 C2 109.470 3.000
DEM HC12 C1 C2 109.470 3.000
DEM C1 C2 HC21 109.470 3.000
DEM C1 C2 HC22 109.470 3.000
DEM C1 C2 C3 111.000 3.000
DEM HC21 C2 HC22 107.900 3.000
DEM HC21 C2 C3 109.470 3.000
DEM HC22 C2 C3 109.470 3.000
DEM C2 C3 HC31 109.470 3.000
DEM C2 C3 HC32 109.470 3.000
DEM C2 C3 C4 111.000 3.000
DEM HC31 C3 HC32 107.900 3.000
DEM HC31 C3 C4 109.470 3.000
DEM HC32 C3 C4 109.470 3.000
DEM C3 C4 HC41 109.470 3.000
DEM C3 C4 HC42 109.470 3.000
DEM C3 C4 C5 111.000 3.000
DEM HC41 C4 HC42 107.900 3.000
DEM HC41 C4 C5 109.470 3.000
DEM HC42 C4 C5 109.470 3.000
DEM C4 C5 HC51 109.470 3.000
DEM C4 C5 HC52 109.470 3.000
DEM C4 C5 C6 111.000 3.000
DEM HC51 C5 HC52 107.900 3.000
DEM HC51 C5 C6 109.470 3.000
DEM HC52 C5 C6 109.470 3.000
DEM C5 C6 HC61 109.470 3.000
DEM C5 C6 HC62 109.470 3.000
DEM C5 C6 C7 111.000 3.000
DEM HC61 C6 HC62 107.900 3.000
DEM HC61 C6 C7 109.470 3.000
DEM HC62 C6 C7 109.470 3.000
DEM C6 C7 HC71 109.470 3.000
DEM C6 C7 HC72 109.470 3.000
DEM C6 C7 C8 111.000 3.000
DEM HC71 C7 HC72 107.900 3.000
DEM HC71 C7 C8 109.470 3.000
DEM HC72 C7 C8 109.470 3.000
DEM C7 C8 HC81 109.470 3.000
DEM C7 C8 HC82 109.470 3.000
DEM C7 C8 C9 111.000 3.000
DEM HC81 C8 HC82 107.900 3.000
DEM HC81 C8 C9 109.470 3.000
DEM HC82 C8 C9 109.470 3.000
DEM C8 C9 HC91 109.470 3.000
DEM C8 C9 HC92 109.470 3.000
DEM C8 C9 C10 111.000 3.000
DEM HC91 C9 HC92 107.900 3.000
DEM HC91 C9 C10 109.470 3.000
DEM HC92 C9 C10 109.470 3.000
DEM C9 C10 H103 109.470 3.000
DEM C9 C10 H102 109.470 3.000
DEM C9 C10 H101 109.470 3.000
DEM H103 C10 H102 109.470 3.000
DEM H103 C10 H101 109.470 3.000
DEM H102 C10 H101 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DEM var_1 HO5 O5 CM O1 -179.983 20.000 1
DEM var_2 O5 CM O1 C1 89.952 20.000 1
DEM var_3 CM O1 C1 C2 179.967 20.000 1
DEM var_4 O1 C1 C2 C3 179.979 20.000 3
DEM var_5 C1 C2 C3 C4 -179.999 20.000 3
DEM var_6 C2 C3 C4 C5 180.000 20.000 3
DEM var_7 C3 C4 C5 C6 179.999 20.000 3
DEM var_8 C4 C5 C6 C7 180.000 20.000 3
DEM var_9 C5 C6 C7 C8 179.982 20.000 3
DEM var_10 C6 C7 C8 C9 179.999 20.000 3
DEM var_11 C7 C8 C9 C10 -179.984 20.000 3
DEM var_12 C8 C9 C10 H101 179.972 20.000 3
# ------------------------------------------------------
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