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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DG2 DG2 '2,3-DIPHOSPHOGLYCERIC ACID ' non-polymer 18 15 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DG2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DG2 O13 O OP -0.666 0.000 0.000 0.000
DG2 P6 P P 0.000 -0.356 -0.450 1.400
DG2 O15 O OP -0.666 0.121 0.582 2.399
DG2 O14 O OP -0.666 0.312 -1.776 1.688
DG2 O5 O O2 0.000 -1.952 -0.616 1.520
DG2 C4 C CH2 0.000 -2.523 0.662 1.239
DG2 H41 H H 0.000 -2.240 0.973 0.231
DG2 H42 H H 0.000 -2.152 1.393 1.961
DG2 C3 C CH1 0.000 -4.047 0.573 1.338
DG2 H3 H H 0.000 -4.486 1.557 1.121
DG2 C7 C C 0.000 -4.436 0.146 2.729
DG2 O8 O OC -0.500 -5.085 -0.910 2.899
DG2 O7 O OC -0.500 -4.110 0.845 3.714
DG2 O2 O O2 0.000 -4.530 -0.382 0.392
DG2 P1 P P 0.000 -5.525 0.405 -0.598
DG2 O9 O OP -0.666 -6.075 -0.555 -1.630
DG2 O10 O OP -0.666 -6.667 0.997 0.198
DG2 O11 O OP -0.666 -4.769 1.515 -1.295
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DG2 O13 n/a P6 START
DG2 P6 O13 O5 .
DG2 O15 P6 . .
DG2 O14 P6 . .
DG2 O5 P6 C4 .
DG2 C4 O5 C3 .
DG2 H41 C4 . .
DG2 H42 C4 . .
DG2 C3 C4 O2 .
DG2 H3 C3 . .
DG2 C7 C3 O7 .
DG2 O8 C7 . .
DG2 O7 C7 . .
DG2 O2 C3 P1 .
DG2 P1 O2 O11 .
DG2 O9 P1 . .
DG2 O10 P1 . .
DG2 O11 P1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DG2 C3 C4 single 1.524 0.020
DG2 O2 C3 single 1.426 0.020
DG2 C7 C3 single 1.500 0.020
DG2 H3 C3 single 1.099 0.020
DG2 C4 O5 single 1.426 0.020
DG2 H41 C4 single 1.092 0.020
DG2 H42 C4 single 1.092 0.020
DG2 P1 O2 single 1.610 0.020
DG2 O5 P6 single 1.610 0.020
DG2 O7 C7 deloc 1.250 0.020
DG2 O8 C7 deloc 1.250 0.020
DG2 O9 P1 deloc 1.510 0.020
DG2 O10 P1 deloc 1.510 0.020
DG2 O11 P1 deloc 1.510 0.020
DG2 O15 P6 deloc 1.510 0.020
DG2 O14 P6 deloc 1.510 0.020
DG2 P6 O13 deloc 1.510 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
DG2 O13 P6 O15 119.900 3.000
DG2 O13 P6 O14 119.900 3.000
DG2 O13 P6 O5 108.200 3.000
DG2 O15 P6 O14 119.900 3.000
DG2 O15 P6 O5 108.200 3.000
DG2 O14 P6 O5 108.200 3.000
DG2 P6 O5 C4 120.500 3.000
DG2 O5 C4 H41 109.470 3.000
DG2 O5 C4 H42 109.470 3.000
DG2 O5 C4 C3 109.470 3.000
DG2 H41 C4 H42 107.900 3.000
DG2 H41 C4 C3 109.470 3.000
DG2 H42 C4 C3 109.470 3.000
DG2 C4 C3 H3 108.340 3.000
DG2 C4 C3 C7 109.470 3.000
DG2 C4 C3 O2 109.470 3.000
DG2 H3 C3 C7 108.810 3.000
DG2 H3 C3 O2 109.470 3.000
DG2 C7 C3 O2 109.470 3.000
DG2 C3 C7 O8 118.500 3.000
DG2 C3 C7 O7 118.500 3.000
DG2 O8 C7 O7 123.000 3.000
DG2 C3 O2 P1 120.500 3.000
DG2 O2 P1 O9 108.200 3.000
DG2 O2 P1 O10 108.200 3.000
DG2 O2 P1 O11 108.200 3.000
DG2 O9 P1 O10 119.900 3.000
DG2 O9 P1 O11 119.900 3.000
DG2 O10 P1 O11 119.900 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DG2 var_1 O13 P6 O5 C4 -60.052 20.000 1
DG2 var_2 P6 O5 C4 C3 -179.947 20.000 1
DG2 var_3 O5 C4 C3 O2 -60.020 20.000 3
DG2 var_4 C4 C3 C7 O7 59.917 20.000 3
DG2 var_5 C4 C3 O2 P1 -120.008 20.000 1
DG2 var_6 C3 O2 P1 O11 60.022 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
DG2 chir_01 C3 C4 O2 C7 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
DG2 plan-1 C7 0.020
DG2 plan-1 C3 0.000
DG2 plan-1 O7 0.000
DG2 plan-1 O8 0.000
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