1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DIC DIC '3,4-DICHLOROISOCOUMARIN ' non-polymer 17 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DIC
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DIC CL2 CL CL 0.000 0.000 0.000 0.000
DIC C9 C CR6 0.000 -1.724 0.227 -0.004
DIC C8 C CR6 0.000 -2.585 -0.798 0.099
DIC CL1 CL CL 0.000 -2.049 -2.438 0.245
DIC C3 C CR66 0.000 -4.027 -0.507 0.088
DIC C2 C CR16 0.000 -5.015 -1.502 0.191
DIC H2 H H 0.000 -4.718 -2.539 0.284
DIC O1 O O2 -0.500 -2.258 1.596 -0.124
DIC C7 C CR6 0.000 -3.464 1.927 -0.143
DIC O7 O O -0.500 -3.821 3.121 -0.249
DIC C4 C CR66 0.000 -4.448 0.826 -0.031
DIC C5 C CR16 0.000 -5.812 1.153 -0.047
DIC H5 H H 0.000 -6.119 2.187 -0.139
DIC C6 C CR16 0.000 -6.773 0.150 0.056
DIC H6 H H 0.000 -7.826 0.402 0.043
DIC C1 C CR16 0.000 -6.374 -1.176 0.175
DIC H1 H H 0.000 -7.118 -1.958 0.257
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DIC CL2 n/a C9 START
DIC C9 CL2 O1 .
DIC C8 C9 C3 .
DIC CL1 C8 . .
DIC C3 C8 C2 .
DIC C2 C3 H2 .
DIC H2 C2 . .
DIC O1 C9 C7 .
DIC C7 O1 C4 .
DIC O7 C7 . .
DIC C4 C7 C5 .
DIC C5 C4 C6 .
DIC H5 C5 . .
DIC C6 C5 C1 .
DIC H6 C6 . .
DIC C1 C6 H1 .
DIC H1 C1 . END
DIC C1 C2 . ADD
DIC C3 C4 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DIC C1 C2 double 1.390 0.020
DIC C1 C6 single 1.390 0.020
DIC H1 C1 single 1.083 0.020
DIC C2 C3 single 1.390 0.020
DIC H2 C2 single 1.083 0.020
DIC C3 C4 double 1.490 0.020
DIC C3 C8 single 1.490 0.020
DIC C5 C4 single 1.390 0.020
DIC C4 C7 single 1.490 0.020
DIC C6 C5 double 1.390 0.020
DIC H5 C5 single 1.083 0.020
DIC H6 C6 single 1.083 0.020
DIC O7 C7 deloc 1.250 0.020
DIC C7 O1 deloc 1.370 0.020
DIC C8 C9 double 1.487 0.020
DIC CL1 C8 single 1.795 0.020
DIC O1 C9 single 1.370 0.020
DIC C9 CL2 single 1.795 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
DIC CL2 C9 C8 120.000 3.000
DIC CL2 C9 O1 120.000 3.000
DIC C8 C9 O1 120.000 3.000
DIC C9 C8 CL1 120.000 3.000
DIC C9 C8 C3 120.000 3.000
DIC CL1 C8 C3 120.000 3.000
DIC C8 C3 C2 120.000 3.000
DIC C8 C3 C4 120.000 3.000
DIC C2 C3 C4 120.000 3.000
DIC C3 C2 H2 120.000 3.000
DIC C3 C2 C1 120.000 3.000
DIC H2 C2 C1 120.000 3.000
DIC C9 O1 C7 120.000 3.000
DIC O1 C7 O7 120.000 3.000
DIC O1 C7 C4 120.000 3.000
DIC O7 C7 C4 120.000 3.000
DIC C7 C4 C5 120.000 3.000
DIC C7 C4 C3 120.000 3.000
DIC C5 C4 C3 120.000 3.000
DIC C4 C5 H5 120.000 3.000
DIC C4 C5 C6 120.000 3.000
DIC H5 C5 C6 120.000 3.000
DIC C5 C6 H6 120.000 3.000
DIC C5 C6 C1 120.000 3.000
DIC H6 C6 C1 120.000 3.000
DIC C6 C1 H1 120.000 3.000
DIC C6 C1 C2 120.000 3.000
DIC H1 C1 C2 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DIC CONST_1 CL2 C9 C8 C3 180.000 0.000 0
DIC CONST_2 C9 C8 C3 C2 180.000 0.000 0
DIC CONST_3 C8 C3 C4 C7 0.000 0.000 0
DIC CONST_4 C8 C3 C2 C1 180.000 0.000 0
DIC CONST_5 CL2 C9 O1 C7 180.000 0.000 0
DIC CONST_6 C9 O1 C7 C4 0.000 0.000 0
DIC CONST_7 O1 C7 C4 C5 180.000 0.000 0
DIC CONST_8 C7 C4 C5 C6 180.000 0.000 0
DIC CONST_9 C4 C5 C6 C1 0.000 0.000 0
DIC CONST_10 C5 C6 C1 C2 0.000 0.000 0
DIC CONST_11 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
DIC plan-1 C1 0.020
DIC plan-1 C2 0.020
DIC plan-1 C6 0.020
DIC plan-1 H1 0.020
DIC plan-1 C5 0.020
DIC plan-1 C3 0.020
DIC plan-1 H2 0.020
DIC plan-1 C4 0.020
DIC plan-1 C8 0.020
DIC plan-1 C7 0.020
DIC plan-1 C9 0.020
DIC plan-1 O1 0.020
DIC plan-1 H5 0.020
DIC plan-1 H6 0.020
DIC plan-1 O7 0.020
DIC plan-1 CL1 0.020
DIC plan-1 CL2 0.020
# ------------------------------------------------------
|