1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DQR DQR 'ALPHA-D-FRUCTOFURANOSYL-ALPHA-D-FRUC' pyranose 66 34 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DQR
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DQR C1 C CH1 0.000 0.000 0.000 0.000
DQR H1 H H 0.000 -0.728 -0.059 -0.821
DQR O1 O O2 0.000 -0.671 0.375 1.204
DQR C20 C CT 0.000 -1.856 1.074 0.815
DQR O20 O O2 0.000 -1.551 2.003 -0.232
DQR C50 C CH1 0.000 -1.895 3.335 0.180
DQR H50 H H 0.000 -2.905 3.593 -0.168
DQR C60 C CH2 0.000 -0.875 4.338 -0.363
DQR H601 H H 0.000 0.128 4.046 -0.043
DQR H602 H H 0.000 -1.103 5.334 0.023
DQR O60 O OH1 0.000 -0.935 4.354 -1.791
DQR H60 H H 0.000 -0.238 4.928 -2.136
DQR C40 C CH1 0.000 -1.850 3.306 1.728
DQR H40 H H 0.000 -0.820 3.409 2.096
DQR O40 O OH1 0.000 -2.699 4.310 2.287
DQR H2 H H 0.000 -2.394 5.182 2.005
DQR C30 C CH1 0.000 -2.405 1.880 2.012
DQR H30 H H 0.000 -3.504 1.881 2.012
DQR O30 O OH1 0.000 -1.898 1.374 3.249
DQR H3 H H 0.000 -2.182 1.949 3.972
DQR C10 C CH2 0.000 -2.912 0.077 0.333
DQR H101 H H 0.000 -3.816 0.616 0.044
DQR H102 H H 0.000 -3.148 -0.620 1.140
DQR O10 O O2 0.000 -2.405 -0.646 -0.791
DQR C21 C CT 0.000 -3.481 -1.448 -1.284
DQR C11 C CH2 0.000 -3.046 -2.170 -2.560
DQR H111 H H 0.000 -3.897 -2.710 -2.980
DQR H112 H H 0.000 -2.249 -2.877 -2.323
DQR O11 O OH1 0.000 -2.570 -1.214 -3.510
DQR H11 H H 0.000 -2.295 -1.672 -4.316
DQR O21 O O2 0.000 -4.618 -0.620 -1.557
DQR C51 C CH1 0.000 -5.742 -1.061 -0.780
DQR H51 H H 0.000 -6.364 -1.752 -1.366
DQR C61 C CH2 0.000 -6.572 0.139 -0.320
DQR H611 H H 0.000 -5.926 0.853 0.194
DQR H612 H H 0.000 -7.354 -0.200 0.363
DQR O61 O OH1 0.000 -7.170 0.768 -1.456
DQR H61 H H 0.000 -7.695 1.526 -1.165
DQR C41 C CH1 0.000 -5.130 -1.792 0.441
DQR H41 H H 0.000 -4.818 -1.077 1.214
DQR O41 O OH1 0.000 -6.038 -2.760 0.972
DQR H4 H H 0.000 -6.842 -2.315 1.273
DQR C31 C CH1 0.000 -3.898 -2.480 -0.214
DQR H31 H H 0.000 -4.185 -3.433 -0.682
DQR O31 O OH1 0.000 -2.857 -2.678 0.743
DQR H6 H H 0.000 -3.174 -3.257 1.449
DQR O5 O O2 0.000 0.991 0.976 -0.314
DQR C5 C CH1 0.000 1.807 1.152 0.842
DQR H5 H H 0.000 1.167 1.363 1.711
DQR C4 C CH1 0.000 2.616 -0.120 1.104
DQR H9 H H 0.000 3.238 -0.347 0.227
DQR O4 O OH1 0.000 3.451 0.071 2.246
DQR HO4 H H 0.000 3.956 -0.736 2.414
DQR C3 C CH1 0.000 1.650 -1.282 1.363
DQR H8 H H 0.000 1.101 -1.105 2.298
DQR O3 O OH1 0.000 2.383 -2.505 1.460
DQR HO3 H H 0.000 1.769 -3.236 1.611
DQR C2 C CH1 0.000 0.663 -1.367 0.193
DQR H7 H H 0.000 1.200 -1.648 -0.723
DQR O2 O OH1 0.000 -0.338 -2.346 0.480
DQR HO2 H H 0.000 -0.911 -2.457 -0.291
DQR C6 C CH2 0.000 2.762 2.326 0.618
DQR H61A H H 0.000 3.332 2.161 -0.299
DQR H62 H H 0.000 3.448 2.403 1.463
DQR O6 O OH1 0.000 2.010 3.536 0.501
DQR HO6 H H 0.000 2.650 4.258 0.440
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DQR C1 n/a O5 START
DQR H1 C1 . .
DQR O1 C1 C20 .
DQR C20 O1 C10 .
DQR O20 C20 C50 .
DQR C50 O20 C40 .
DQR H50 C50 . .
DQR C60 C50 O60 .
DQR H601 C60 . .
DQR H602 C60 . .
DQR O60 C60 H60 .
DQR H60 O60 . .
DQR C40 C50 C30 .
DQR H40 C40 . .
DQR O40 C40 H2 .
DQR H2 O40 . .
DQR C30 C40 O30 .
DQR H30 C30 . .
DQR O30 C30 H3 .
DQR H3 O30 . .
DQR C10 C20 O10 .
DQR H101 C10 . .
DQR H102 C10 . .
DQR O10 C10 C21 .
DQR C21 O10 O21 .
DQR C11 C21 O11 .
DQR H111 C11 . .
DQR H112 C11 . .
DQR O11 C11 H11 .
DQR H11 O11 . .
DQR O21 C21 C51 .
DQR C51 O21 C41 .
DQR H51 C51 . .
DQR C61 C51 O61 .
DQR H611 C61 . .
DQR H612 C61 . .
DQR O61 C61 H61 .
DQR H61 O61 . .
DQR C41 C51 C31 .
DQR H41 C41 . .
DQR O41 C41 H4 .
DQR H4 O41 . .
DQR C31 C41 O31 .
DQR H31 C31 . .
DQR O31 C31 H6 .
DQR H6 O31 . .
DQR O5 C1 . END
DQR C5 O5 C6 .
DQR H5 C5 . .
DQR C4 C5 C3 .
DQR H9 C4 . .
DQR O4 C4 HO4 .
DQR HO4 O4 . .
DQR C3 C4 C2 .
DQR H8 C3 . .
DQR O3 C3 HO3 .
DQR HO3 O3 . .
DQR C2 C3 O2 .
DQR H7 C2 . .
DQR O2 C2 HO2 .
DQR HO2 O2 . .
DQR C6 C5 O6 .
DQR H61A C6 . .
DQR H62 C6 . .
DQR O6 C6 . .
DQR HO6 O6 . .
DQR C1 C2 . ADD
DQR C20 C30 . ADD
DQR C21 C31 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DQR C1 C2 single 1.524 0.020
DQR O1 C1 single 1.426 0.020
DQR O5 C1 single 1.426 0.020
DQR H1 C1 single 1.099 0.020
DQR C10 C20 single 1.524 0.020
DQR O10 C10 single 1.426 0.020
DQR H101 C10 single 1.092 0.020
DQR H102 C10 single 1.092 0.020
DQR C11 C21 single 1.524 0.020
DQR O11 C11 single 1.432 0.020
DQR H111 C11 single 1.092 0.020
DQR H112 C11 single 1.092 0.020
DQR C2 C3 single 1.524 0.020
DQR O2 C2 single 1.432 0.020
DQR H7 C2 single 1.099 0.020
DQR C20 C30 single 1.524 0.020
DQR C20 O1 single 1.426 0.020
DQR O20 C20 single 1.426 0.020
DQR C21 C31 single 1.524 0.020
DQR C21 O10 single 1.426 0.020
DQR O21 C21 single 1.426 0.020
DQR C3 C4 single 1.524 0.020
DQR O3 C3 single 1.432 0.020
DQR H8 C3 single 1.099 0.020
DQR C30 C40 single 1.524 0.020
DQR O30 C30 single 1.432 0.020
DQR H30 C30 single 1.099 0.020
DQR C31 C41 single 1.524 0.020
DQR O31 C31 single 1.432 0.020
DQR H31 C31 single 1.099 0.020
DQR C4 C5 single 1.524 0.020
DQR O4 C4 single 1.432 0.020
DQR H9 C4 single 1.099 0.020
DQR C40 C50 single 1.524 0.020
DQR O40 C40 single 1.432 0.020
DQR H40 C40 single 1.099 0.020
DQR C41 C51 single 1.524 0.020
DQR O41 C41 single 1.432 0.020
DQR H41 C41 single 1.099 0.020
DQR C6 C5 single 1.524 0.020
DQR C5 O5 single 1.426 0.020
DQR H5 C5 single 1.099 0.020
DQR C60 C50 single 1.524 0.020
DQR C50 O20 single 1.426 0.020
DQR H50 C50 single 1.099 0.020
DQR C61 C51 single 1.524 0.020
DQR C51 O21 single 1.426 0.020
DQR H51 C51 single 1.099 0.020
DQR O6 C6 single 1.432 0.020
DQR H61A C6 single 1.092 0.020
DQR H62 C6 single 1.092 0.020
DQR O60 C60 single 1.432 0.020
DQR H601 C60 single 1.092 0.020
DQR H602 C60 single 1.092 0.020
DQR O61 C61 single 1.432 0.020
DQR H611 C61 single 1.092 0.020
DQR H612 C61 single 1.092 0.020
DQR H11 O11 single 0.967 0.020
DQR HO2 O2 single 0.967 0.020
DQR HO3 O3 single 0.967 0.020
DQR H3 O30 single 0.967 0.020
DQR H6 O31 single 0.967 0.020
DQR HO4 O4 single 0.967 0.020
DQR H2 O40 single 0.967 0.020
DQR H4 O41 single 0.967 0.020
DQR H60 O60 single 0.967 0.020
DQR H61 O61 single 0.967 0.020
DQR HO6 O6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
DQR H1 C1 O1 109.470 3.000
DQR H1 C1 O5 109.470 3.000
DQR O1 C1 O5 109.470 3.000
DQR H1 C1 C2 108.340 3.000
DQR O1 C1 C2 109.470 3.000
DQR O5 C1 C2 109.470 3.000
DQR C1 O1 C20 111.800 3.000
DQR O1 C20 O20 109.500 3.000
DQR O1 C20 C10 109.470 3.000
DQR O1 C20 C30 109.470 3.000
DQR O20 C20 C10 109.470 3.000
DQR O20 C20 C30 109.470 3.000
DQR C10 C20 C30 111.000 3.000
DQR C20 O20 C50 111.800 3.000
DQR O20 C50 H50 109.470 3.000
DQR O20 C50 C60 109.470 3.000
DQR O20 C50 C40 109.470 3.000
DQR H50 C50 C60 108.340 3.000
DQR H50 C50 C40 108.340 3.000
DQR C60 C50 C40 111.000 3.000
DQR C50 C60 H601 109.470 3.000
DQR C50 C60 H602 109.470 3.000
DQR C50 C60 O60 109.470 3.000
DQR H601 C60 H602 107.900 3.000
DQR H601 C60 O60 109.470 3.000
DQR H602 C60 O60 109.470 3.000
DQR C60 O60 H60 109.470 3.000
DQR C50 C40 H40 108.340 3.000
DQR C50 C40 O40 109.470 3.000
DQR C50 C40 C30 111.000 3.000
DQR H40 C40 O40 109.470 3.000
DQR H40 C40 C30 108.340 3.000
DQR O40 C40 C30 109.470 3.000
DQR C40 O40 H2 109.470 3.000
DQR C40 C30 H30 108.340 3.000
DQR C40 C30 O30 109.470 3.000
DQR C40 C30 C20 111.000 3.000
DQR H30 C30 O30 109.470 3.000
DQR H30 C30 C20 108.340 3.000
DQR O30 C30 C20 109.470 3.000
DQR C30 O30 H3 109.470 3.000
DQR C20 C10 H101 109.470 3.000
DQR C20 C10 H102 109.470 3.000
DQR C20 C10 O10 109.500 3.000
DQR H101 C10 H102 107.900 3.000
DQR H101 C10 O10 109.470 3.000
DQR H102 C10 O10 109.470 3.000
DQR C10 O10 C21 111.800 3.000
DQR O10 C21 C11 109.470 3.000
DQR O10 C21 O21 109.500 3.000
DQR O10 C21 C31 109.470 3.000
DQR C11 C21 O21 109.470 3.000
DQR C11 C21 C31 111.000 3.000
DQR O21 C21 C31 109.470 3.000
DQR C21 C11 H111 109.470 3.000
DQR C21 C11 H112 109.470 3.000
DQR C21 C11 O11 109.470 3.000
DQR H111 C11 H112 107.900 3.000
DQR H111 C11 O11 109.470 3.000
DQR H112 C11 O11 109.470 3.000
DQR C11 O11 H11 109.470 3.000
DQR C21 O21 C51 111.800 3.000
DQR O21 C51 H51 109.470 3.000
DQR O21 C51 C61 109.470 3.000
DQR O21 C51 C41 109.470 3.000
DQR H51 C51 C61 108.340 3.000
DQR H51 C51 C41 108.340 3.000
DQR C61 C51 C41 111.000 3.000
DQR C51 C61 H611 109.470 3.000
DQR C51 C61 H612 109.470 3.000
DQR C51 C61 O61 109.470 3.000
DQR H611 C61 H612 107.900 3.000
DQR H611 C61 O61 109.470 3.000
DQR H612 C61 O61 109.470 3.000
DQR C61 O61 H61 109.470 3.000
DQR C51 C41 H41 108.340 3.000
DQR C51 C41 O41 109.470 3.000
DQR C51 C41 C31 111.000 3.000
DQR H41 C41 O41 109.470 3.000
DQR H41 C41 C31 108.340 3.000
DQR O41 C41 C31 109.470 3.000
DQR C41 O41 H4 109.470 3.000
DQR C41 C31 H31 108.340 3.000
DQR C41 C31 O31 109.470 3.000
DQR C41 C31 C21 111.000 3.000
DQR H31 C31 O31 109.470 3.000
DQR H31 C31 C21 108.340 3.000
DQR O31 C31 C21 109.470 3.000
DQR C31 O31 H6 109.470 3.000
DQR C1 O5 C5 111.800 3.000
DQR O5 C5 H5 109.470 3.000
DQR O5 C5 C4 109.470 3.000
DQR O5 C5 C6 109.470 3.000
DQR H5 C5 C4 108.340 3.000
DQR H5 C5 C6 108.340 3.000
DQR C4 C5 C6 111.000 3.000
DQR C5 C4 H9 108.340 3.000
DQR C5 C4 O4 109.470 3.000
DQR C5 C4 C3 111.000 3.000
DQR H9 C4 O4 109.470 3.000
DQR H9 C4 C3 108.340 3.000
DQR O4 C4 C3 109.470 3.000
DQR C4 O4 HO4 109.470 3.000
DQR C4 C3 H8 108.340 3.000
DQR C4 C3 O3 109.470 3.000
DQR C4 C3 C2 111.000 3.000
DQR H8 C3 O3 109.470 3.000
DQR H8 C3 C2 108.340 3.000
DQR O3 C3 C2 109.470 3.000
DQR C3 O3 HO3 109.470 3.000
DQR C3 C2 H7 108.340 3.000
DQR C3 C2 O2 109.470 3.000
DQR C3 C2 C1 111.000 3.000
DQR H7 C2 O2 109.470 3.000
DQR H7 C2 C1 108.340 3.000
DQR O2 C2 C1 109.470 3.000
DQR C2 O2 HO2 109.470 3.000
DQR C5 C6 H61A 109.470 3.000
DQR C5 C6 H62 109.470 3.000
DQR C5 C6 O6 109.470 3.000
DQR H61A C6 H62 107.900 3.000
DQR H61A C6 O6 109.470 3.000
DQR H62 C6 O6 109.470 3.000
DQR C6 O6 HO6 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DQR var_1 O5 C1 O1 C20 95.451 20.000 1
DQR var_2 C1 O1 C20 C10 76.509 20.000 1
DQR var_3 O1 C20 C30 C40 90.000 20.000 1
DQR var_4 O1 C20 O20 C50 -120.000 20.000 1
DQR var_5 C20 O20 C50 C40 30.000 20.000 1
DQR var_6 O20 C50 C60 O60 64.447 20.000 3
DQR var_7 C50 C60 O60 H60 -175.006 20.000 1
DQR var_8 O20 C50 C40 C30 -30.000 20.000 3
DQR var_9 C50 C40 O40 H2 -61.504 20.000 1
DQR var_10 C50 C40 C30 O30 150.000 20.000 3
DQR var_11 C40 C30 O30 H3 61.446 20.000 1
DQR var_12 O1 C20 C10 O10 -60.292 20.000 1
DQR var_13 C20 C10 O10 C21 -173.721 20.000 1
DQR var_14 C10 O10 C21 O21 54.645 20.000 1
DQR var_15 O10 C21 C31 C41 90.000 20.000 1
DQR var_16 O10 C21 C11 O11 -54.942 20.000 1
DQR var_17 C21 C11 O11 H11 179.997 20.000 1
DQR var_18 O10 C21 O21 C51 -120.000 20.000 1
DQR var_19 C21 O21 C51 C41 30.000 20.000 1
DQR var_20 O21 C51 C61 O61 66.439 20.000 3
DQR var_21 C51 C61 O61 H61 179.996 20.000 1
DQR var_22 O21 C51 C41 C31 -30.000 20.000 3
DQR var_23 C51 C41 O41 H4 -61.389 20.000 1
DQR var_24 C51 C41 C31 O31 150.000 20.000 3
DQR var_25 C41 C31 O31 H6 61.433 20.000 1
DQR var_26 C1 O5 C5 C6 180.000 20.000 1
DQR var_27 O5 C5 C4 C3 -60.000 20.000 3
DQR var_28 C5 C4 O4 HO4 179.535 20.000 1
DQR var_29 C5 C4 C3 C2 60.000 20.000 3
DQR var_30 C4 C3 O3 HO3 -179.181 20.000 1
DQR var_31 C4 C3 C2 O2 180.000 20.000 3
DQR var_32 C3 C2 C1 O5 60.000 20.000 3
DQR var_33 C3 C2 O2 HO2 -174.783 20.000 1
DQR var_34 O5 C5 C6 O6 65.164 20.000 3
DQR var_1 C5 O5 C1 C2 -60.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
DQR chir_01 C1 C2 O1 O5 negativ
DQR chir_02 C2 C1 C3 O2 negativ
DQR chir_03 C20 C10 C30 O1 negativ
DQR chir_04 C21 C11 C31 O10 negativ
DQR chir_05 C3 C2 C4 O3 positiv
DQR chir_06 C30 C20 C40 O30 positiv
DQR chir_07 C31 C21 C41 O31 positiv
DQR chir_08 C4 C3 C5 O4 negativ
DQR chir_09 C40 C30 C50 O40 negativ
DQR chir_10 C41 C31 C51 O41 negativ
DQR chir_11 C5 C4 C6 O5 negativ
DQR chir_12 C50 C40 C60 O20 negativ
DQR chir_13 C51 C41 C61 O21 negativ
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