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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DRB DRB '. ' non-polymer 116 59 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DRB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
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DRB N49 N NH1 0.000 0.671 -1.369 1.612
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DRB H52 H H 0.000 2.573 -0.688 3.389
DRB C51 C CH2 0.000 2.765 -2.807 3.004
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DRB H50 H H 0.000 3.136 -4.770 2.182
DRB C46 C CH2 0.000 -1.745 -1.059 1.186
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DRB C44 C CH2 0.000 -4.102 -0.550 0.530
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DRB C43 C CH2 0.000 -4.987 0.252 -0.426
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DRB H422 H H 0.000 -6.683 0.244 0.905
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DRB H23 H H 0.000 -11.251 -0.837 -2.697
DRB C24 C CR16 0.000 -13.087 -0.426 -1.758
DRB H24 H H 0.000 -13.572 -1.289 -2.198
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DRB H18 H H 0.000 -12.470 3.822 0.966
DRB C17 C CR6 0.000 -14.301 4.271 1.908
DRB C38 C CH3 0.000 -13.763 5.513 2.570
DRB H381 H H 0.000 -13.910 6.345 1.932
DRB H382 H H 0.000 -14.273 5.674 3.484
DRB H383 H H 0.000 -12.728 5.392 2.760
DRB C16 C CR16 0.000 -15.690 3.872 2.115
DRB H16 H H 0.000 -16.341 4.466 2.744
DRB C15 C CR16 0.000 -16.152 2.765 1.522
DRB H15 H H 0.000 -17.183 2.470 1.676
DRB N14 N NR6 0.000 -15.329 1.987 0.709
DRB RU RU RU 2.000 -15.747 0.271 -0.300
DRB N37 N NR6 0.000 -15.956 -1.526 -1.233
DRB C36 C CR16 0.000 -16.336 -1.806 -2.544
DRB H36 H H 0.000 -16.572 -0.990 -3.217
DRB C35 C CR16 0.000 -16.415 -3.067 -2.985
DRB H35 H H 0.000 -16.711 -3.271 -4.007
DRB C34 C CR16 0.000 -16.097 -4.166 -2.076
DRB H34 H H 0.000 -16.154 -5.191 -2.422
DRB C33 C CR16 0.000 -15.731 -3.900 -0.805
DRB H33 H H 0.000 -15.497 -4.716 -0.133
DRB C32 C CR6 0.000 -15.649 -2.547 -0.336
DRB C31 C CR6 0.000 -15.282 -2.213 0.953
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DRB H30 H H 0.000 -14.995 -4.238 1.718
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DRB H29 H H 0.000 -14.344 -3.532 3.949
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DRB H3 H H 0.000 -13.280 1.393 1.465
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DRB O47 n/a C48 START
DRB C48 O47 C46 .
DRB N49 C48 C53 .
DRB H49 N49 . .
DRB C53 N49 C54 .
DRB H53 C53 . .
DRB C54 C53 C58 .
DRB H54 C54 . .
DRB C55 C54 C56 .
DRB H552 C55 . .
DRB H551 C55 . .
DRB C56 C55 C59 .
DRB H56 C56 . .
DRB C57 C56 H572 .
DRB H571 C57 . .
DRB H572 C57 . .
DRB C59 C56 C52 .
DRB H592 C59 . .
DRB H591 C59 . .
DRB C52 C59 C51 .
DRB H52 C52 . .
DRB C51 C52 H512 .
DRB H511 C51 . .
DRB H512 C51 . .
DRB C58 C54 C50 .
DRB H582 C58 . .
DRB H581 C58 . .
DRB C50 C58 H50 .
DRB H50 C50 . .
DRB C46 C48 C45 .
DRB H462 C46 . .
DRB H461 C46 . .
DRB C45 C46 C44 .
DRB H452 C45 . .
DRB H451 C45 . .
DRB C44 C45 C43 .
DRB H442 C44 . .
DRB H441 C44 . .
DRB C43 C44 C42 .
DRB H432 C43 . .
DRB H431 C43 . .
DRB C42 C43 C41 .
DRB H422 C42 . .
DRB H421 C42 . .
DRB C41 C42 C40 .
DRB H412 C41 . .
DRB H411 C41 . .
DRB C40 C41 C39 .
DRB H402 C40 . .
DRB H401 C40 . .
DRB C39 C40 C22 .
DRB H392 C39 . .
DRB H391 C39 . .
DRB C22 C39 C23 .
DRB C21 C22 H21 .
DRB H21 C21 . .
DRB C23 C22 C24 .
DRB H23 C23 . .
DRB C24 C23 N25 .
DRB H24 C24 . .
DRB N25 C24 RU .
DRB C20 N25 C19 .
DRB C19 C20 N14 .
DRB C18 C19 C17 .
DRB H18 C18 . .
DRB C17 C18 C16 .
DRB C38 C17 H383 .
DRB H381 C38 . .
DRB H382 C38 . .
DRB H383 C38 . .
DRB C16 C17 C15 .
DRB H16 C16 . .
DRB C15 C16 H15 .
DRB H15 C15 . .
DRB N14 C19 . .
DRB RU N25 N13 .
DRB N37 RU C32 .
DRB C36 N37 C35 .
DRB H36 C36 . .
DRB C35 C36 C34 .
DRB H35 C35 . .
DRB C34 C35 C33 .
DRB H34 C34 . .
DRB C33 C34 H33 .
DRB H33 C33 . .
DRB C32 N37 C31 .
DRB C31 C32 N26 .
DRB C30 C31 C29 .
DRB H30 C30 . .
DRB C29 C30 C28 .
DRB H29 C29 . .
DRB C28 C29 C27 .
DRB H28 C28 . .
DRB C27 C28 H27 .
DRB H27 C27 . .
DRB N26 C31 . .
DRB N13 RU C8 .
DRB C12 N13 C11 .
DRB H12 C12 . .
DRB C11 C12 C10 .
DRB H11 C11 . .
DRB C10 C11 C9 .
DRB H10 C10 . .
DRB C9 C10 H9 .
DRB H9 C9 . .
DRB C8 N13 C7 .
DRB C7 C8 C6 .
DRB N2 C7 . .
DRB C6 C7 C5 .
DRB H6 C6 . .
DRB C5 C6 C4 .
DRB H5 C5 . .
DRB C4 C5 C3 .
DRB H4 C4 . .
DRB C3 C4 H3 .
DRB H3 C3 . END
DRB RU N2 . ADD
DRB RU N14 . ADD
DRB RU N26 . ADD
DRB N2 C3 . ADD
DRB C8 C9 . ADD
DRB N14 C15 . ADD
DRB C20 C21 . ADD
DRB N26 C27 . ADD
DRB C32 C33 . ADD
DRB C50 C51 . ADD
DRB C50 C57 . ADD
DRB C52 C53 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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DRB H5 C5 single 1.083 0.020
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_chem_comp_angle.comp_id
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_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
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_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
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_chem_comp_chir.volume_sign
_chem_comp_chir.atom_id_4
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_chem_comp_chir.atom_id_8
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. . . . .
DRB chir_02 C52 C51 C53 C59 positiv
. . . . .
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. . . . .
DRB chir_04 C54 C53 C55 C58 negativ
. . . . .
DRB chir_05 C56 C55 C57 C59 positiv
. . . . .
DRB chir_06 RU N25 N13 N37 cross4
N2 N14 N26 . .
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
DRB plan-1 N2 0.020
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DRB plan-3 H34 0.020
DRB plan-3 H35 0.020
DRB plan-3 H36 0.020
DRB plan-4 C48 0.020
DRB plan-4 C46 0.020
DRB plan-4 O47 0.020
DRB plan-4 N49 0.020
DRB plan-4 H49 0.020
DRB plan-5 N49 0.020
DRB plan-5 C48 0.020
DRB plan-5 C53 0.020
DRB plan-5 H49 0.020
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