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205
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DST DST 'DIMETHYLALLYL S-THIOLODIPHOSPHATE ' non-polymer 26 14 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DST
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
DST O7 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
DST P3 P P 0.000 -1.224 -0.830 -0.055
DST O8 O OH1 0.000 -0.967 -2.219 0.714
DST HO8 H H 0.000 -1.672 -2.878 0.770
DST O2 O O2 0.000 -1.600 -1.127 -1.592
DST P1 P P 0.000 -0.350 -1.912 -2.234
DST O5 O OP -0.666 -0.122 -3.202 -1.477
DST O6 O OP -0.666 0.888 -1.049 -2.143
DST O4 O OP -0.666 -0.642 -2.225 -3.685
DST S9 S S2 0.000 -2.821 0.208 0.874
DST C10 C CH2 0.000 -2.140 0.404 2.544
DST H101 H H 0.000 -1.209 0.974 2.492
DST H102 H H 0.000 -1.939 -0.580 2.972
DST C11 C CH2 0.000 -3.147 1.149 3.423
DST H111 H H 0.000 -4.077 0.578 3.473
DST H112 H H 0.000 -3.348 2.132 2.992
DST C12 C CH1 0.000 -2.573 1.315 4.830
DST H12 H H 0.000 -1.637 1.890 4.778
DST C14 C CH3 0.000 -2.292 -0.063 5.431
DST H143 H H 0.000 -1.594 -0.579 4.824
DST H142 H H 0.000 -1.893 0.051 6.406
DST H141 H H 0.000 -3.193 -0.617 5.481
DST C13 C CH3 0.000 -3.580 2.059 5.708
DST H133 H H 0.000 -3.775 3.014 5.292
DST H132 H H 0.000 -4.482 1.506 5.759
DST H131 H H 0.000 -3.182 2.174 6.683
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DST O7 n/a P3 START
DST P3 O7 S9 .
DST O8 P3 HO8 .
DST HO8 O8 . .
DST O2 P3 P1 .
DST P1 O2 O4 .
DST O5 P1 . .
DST O6 P1 . .
DST O4 P1 . .
DST S9 P3 C10 .
DST C10 S9 C11 .
DST H101 C10 . .
DST H102 C10 . .
DST C11 C10 C12 .
DST H111 C11 . .
DST H112 C11 . .
DST C12 C11 C13 .
DST H12 C12 . .
DST C14 C12 H141 .
DST H143 C14 . .
DST H142 C14 . .
DST H141 C14 . .
DST C13 C12 H131 .
DST H133 C13 . .
DST H132 C13 . .
DST H131 C13 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
DST O4 P1 deloc 1.510 0.020
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DST O5 P1 deloc 1.510 0.020
DST P1 O2 single 1.610 0.020
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DST O8 P3 single 1.610 0.020
DST P3 O7 double 1.480 0.020
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DST H12 C12 single 1.099 0.020
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DST H142 C14 single 1.059 0.020
DST H143 C14 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
DST O7 P3 O2 109.500 3.000
DST O7 P3 O8 109.500 3.000
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DST P3 O2 P1 120.500 3.000
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DST P3 O8 HO8 120.000 3.000
DST P3 S9 C10 99.986 3.000
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DST H101 C10 C11 109.470 3.000
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DST C14 C12 C13 111.000 3.000
DST C12 C14 H143 109.470 3.000
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DST H143 C14 H141 109.470 3.000
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DST C12 C13 H133 109.470 3.000
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loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_tor.value_angle_esd
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loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
DST chir_01 C12 C11 C13 C14 negativ
# ------------------------------------------------------
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