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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
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_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
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_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
DZ4 DZ4 '"2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hyd' non-polymer 45 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_DZ4
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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DZ4 HN6 H H 0.000 -12.020 -7.690 -1.443
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
DZ4 O3G n/a PG START
DZ4 PG O3G O3B .
DZ4 O1G PG . .
DZ4 O2G PG . .
DZ4 O3B PG PB .
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DZ4 O1B PB . .
DZ4 O2B PB HO2B .
DZ4 HO2B O2B . .
DZ4 N3A PB PA .
DZ4 HN3A N3A . .
DZ4 PA N3A "O5'" .
DZ4 O1A PA . .
DZ4 O2A PA HO2A .
DZ4 HO2A O2A . .
DZ4 "O5'" PA "C5'" .
DZ4 "C5'" "O5'" "C4'" .
DZ4 "H5'" "C5'" . .
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DZ4 "HO3'" "O3'" . .
DZ4 "C2'" "C3'" "H2'" .
DZ4 "H2'A" "C2'" . .
DZ4 "H2'" "C2'" . .
DZ4 "O4'" "C4'" "C1'" .
DZ4 "C1'" "O4'" N9 .
DZ4 "H1'" "C1'" . .
DZ4 N9 "C1'" C8 .
DZ4 C4 N9 N3 .
DZ4 N3 C4 C2 .
DZ4 C2 N3 H2 .
DZ4 H2 C2 . .
DZ4 C8 N9 N7 .
DZ4 H8 C8 . .
DZ4 N7 C8 C5 .
DZ4 C5 N7 C6 .
DZ4 C6 C5 N6 .
DZ4 N1 C6 . .
DZ4 N6 C6 HN6 .
DZ4 HN6A N6 . .
DZ4 HN6 N6 . END
DZ4 N1 C2 . ADD
DZ4 C4 C5 . ADD
DZ4 "C1'" "C2'" . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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DZ4 "H5'" "C5'" single 1.092 0.020
DZ4 "H5'A" "C5'" single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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DZ4 O1G PG O3B 108.200 3.000
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loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
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_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
DZ4 var_1 O3G PG O3B PB -75.014 20.000 1
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DZ4 var_3 O3B PB O2B HO2B -60.059 20.000 1
DZ4 var_4 O3B PB N3A PA 179.988 20.000 1
DZ4 var_5 PB N3A PA "O5'" -179.999 20.000 1
DZ4 var_6 N3A PA O2A HO2A 59.989 20.000 1
DZ4 var_7 N3A PA "O5'" "C5'" 75.022 20.000 1
DZ4 var_8 PA "O5'" "C5'" "C4'" 179.956 20.000 1
DZ4 var_9 "O5'" "C5'" "C4'" "O4'" 70.972 20.000 3
DZ4 var_10 "C5'" "C4'" "C3'" "C2'" -150.000 20.000 3
DZ4 var_11 "C4'" "C3'" "O3'" "HO3'" 174.165 20.000 1
DZ4 var_12 "C4'" "C3'" "C2'" "C1'" 30.000 20.000 3
DZ4 var_13 "C5'" "C4'" "O4'" "C1'" 150.000 20.000 1
DZ4 var_14 "C4'" "O4'" "C1'" N9 -150.000 20.000 1
DZ4 var_15 "O4'" "C1'" "C2'" "C3'" 0.000 20.000 3
DZ4 var_16 "O4'" "C1'" N9 C8 22.813 20.000 1
DZ4 CONST_1 "C1'" N9 C4 N3 0.000 0.000 0
DZ4 CONST_2 N9 C4 C5 N7 0.000 0.000 0
DZ4 CONST_3 N9 C4 N3 C2 180.000 0.000 0
DZ4 CONST_4 C4 N3 C2 N1 0.000 0.000 0
DZ4 CONST_5 "C1'" N9 C8 N7 180.000 0.000 0
DZ4 CONST_6 N9 C8 N7 C5 0.000 0.000 0
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DZ4 CONST_9 C5 C6 N1 C2 0.000 0.000 0
DZ4 CONST_10 C6 N1 C2 N3 0.000 0.000 0
DZ4 CONST_11 C5 C6 N6 HN6 -179.964 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
DZ4 chir_01 "C1'" N9 "C2'" "O4'" negativ
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DZ4 chir_03 "C4'" "C3'" "O4'" "C5'" positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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