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320
321
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
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_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
G27 G27 '(3R,4R,5R)-5-(HYDROXYMETHYL)-1-(3-PH' non-polymer 42 19 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_G27
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
G27 O6 n/a C6 START
G27 HO6 O6 . .
G27 C6 O6 C5 .
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G27 H62 C6 . .
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G27 H5 C5 . .
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G27 H72 C7 . .
G27 H71 C7 . .
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G27 H4 C4 . .
G27 O4 C4 HO4 .
G27 HO4 O4 . .
G27 C3 C4 C2 .
G27 H3 C3 . .
G27 O3 C3 HO3 .
G27 HO3 O3 . .
G27 C2 C3 N1 .
G27 H21 C2 . .
G27 H22 C2 . .
G27 N1 C2 C8 .
G27 C8 N1 C9 .
G27 H81 C8 . .
G27 H82 C8 . .
G27 C9 C8 C10 .
G27 H91 C9 . .
G27 H92 C9 . .
G27 C10 C9 C11 .
G27 H101 C10 . .
G27 H102 C10 . .
G27 C11 C10 C16 .
G27 C12 C11 H12 .
G27 H12 C12 . .
G27 C16 C11 C15 .
G27 H16 C16 . .
G27 C15 C16 C14 .
G27 H15 C15 . .
G27 C14 C15 C13 .
G27 H14 C14 . .
G27 C13 C14 H13 .
G27 H13 C13 . END
G27 C12 C13 . ADD
G27 N1 C7 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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G27 H5 C5 single 1.099 0.020
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G27 HO6 O6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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G27 O6 C6 H61 109.470 3.000
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G27 O6 C6 C5 109.470 3.000
G27 H61 C6 H62 107.900 3.000
G27 H61 C6 C5 109.470 3.000
G27 H62 C6 C5 109.470 3.000
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G27 C6 C5 C7 109.470 3.000
G27 C6 C5 C4 111.000 3.000
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G27 H5 C5 C4 108.340 3.000
G27 C7 C5 C4 111.000 3.000
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G27 H72 C7 N1 109.470 3.000
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G27 C5 C4 C3 111.000 3.000
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G27 H4 C4 C3 108.340 3.000
G27 O4 C4 C3 109.470 3.000
G27 C4 O4 HO4 109.470 3.000
G27 C4 C3 H3 108.340 3.000
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G27 C4 C3 C2 111.000 3.000
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G27 H3 C3 C2 108.340 3.000
G27 O3 C3 C2 109.470 3.000
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G27 H12 C12 C13 120.000 3.000
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G27 H13 C13 C12 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
G27 var_1 HO6 O6 C6 C5 179.944 20.000 1
G27 var_2 O6 C6 C5 C4 -175.106 20.000 3
G27 var_3 C6 C5 C7 N1 180.000 20.000 3
G27 var_4 C6 C5 C4 C3 180.000 20.000 3
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G27 var_7 C4 C3 O3 HO3 -179.797 20.000 1
G27 var_8 C4 C3 C2 N1 -60.000 20.000 3
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G27 var_13 C8 C9 C10 C11 -179.953 20.000 3
G27 var_14 C9 C10 C11 C16 -90.348 20.000 2
G27 CONST_1 C10 C11 C12 C13 180.000 0.000 0
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G27 CONST_4 C11 C16 C15 C14 0.000 0.000 0
G27 CONST_5 C16 C15 C14 C13 0.000 0.000 0
G27 CONST_6 C15 C14 C13 C12 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
G27 chir_01 N1 C8 C7 C2 positiv
G27 chir_02 C3 C2 O3 C4 negativ
G27 chir_03 C4 C3 O4 C5 positiv
G27 chir_04 C5 C7 C4 C6 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
G27 plan-1 C12 0.020
G27 plan-1 C13 0.020
G27 plan-1 C11 0.020
G27 plan-1 H12 0.020
G27 plan-1 C14 0.020
G27 plan-1 C15 0.020
G27 plan-1 C16 0.020
G27 plan-1 H13 0.020
G27 plan-1 H14 0.020
G27 plan-1 H15 0.020
G27 plan-1 H16 0.020
G27 plan-1 C10 0.020
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