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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
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_chem_comp.three_letter_code
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_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
G34 G34 '"(3AS,4R,5S,6S,8R,9R,9AR,10R)-5-HYDR' non-polymer 83 36 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_G34
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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G34 H25 H H 0.000 -4.007 2.153 5.751
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G34 H21 H H 0.000 2.058 -8.028 -0.494
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
G34 O4 n/a C21 START
G34 C21 O4 O3 .
G34 C22 C21 S1 .
G34 H221 C22 . .
G34 H222 C22 . .
G34 S1 C22 C23 .
G34 C23 S1 C29 .
G34 H23 C23 . .
G34 C29 C23 C28 .
G34 H291 C29 . .
G34 H292 C29 . .
G34 C28 C29 N1 .
G34 H28 C28 . .
G34 C27 C28 C26 .
G34 H271 C27 . .
G34 H272 C27 . .
G34 C26 C27 C25 .
G34 H261 C26 . .
G34 H262 C26 . .
G34 C25 C26 C24 .
G34 H25 C25 . .
G34 C24 C25 H241 .
G34 H242 C24 . .
G34 H241 C24 . .
G34 N1 C28 C30 .
G34 C30 N1 H301 .
G34 H303 C30 . .
G34 H302 C30 . .
G34 H301 C30 . .
G34 O3 C21 C14 .
G34 C14 O3 C13 .
G34 H14 C14 . .
G34 C5 C14 C6 .
G34 C15 C5 H151 .
G34 H153 C15 . .
G34 H152 C15 . .
G34 H151 C15 . .
G34 C6 C5 C7 .
G34 H6 C6 . .
G34 C16 C6 H161 .
G34 H163 C16 . .
G34 H162 C16 . .
G34 H161 C16 . .
G34 C7 C6 H71 .
G34 H72 C7 . .
G34 H71 C7 . .
G34 C13 C14 C12 .
G34 H131 C13 . .
G34 H132 C13 . .
G34 C12 C13 C11 .
G34 C18 C12 H181 .
G34 H183 C18 . .
G34 H182 C18 . .
G34 H181 C18 . .
G34 C19 C12 C20 .
G34 H19 C19 . .
G34 C20 C19 H201 .
G34 H202 C20 . .
G34 H201 C20 . .
G34 C11 C12 C10 .
G34 H11 C11 . .
G34 O2 C11 HO2 .
G34 HO2 O2 . .
G34 C10 C11 C9 .
G34 H10 C10 . .
G34 C17 C10 H171 .
G34 H173 C17 . .
G34 H172 C17 . .
G34 H171 C17 . .
G34 C9 C10 C4 .
G34 C8 C9 H81 .
G34 H82 C8 . .
G34 H81 C8 . .
G34 C1 C9 H11A .
G34 H12 C1 . .
G34 H11A C1 . .
G34 C4 C9 C3 .
G34 H4 C4 . .
G34 C3 C4 C2 .
G34 O1 C3 . .
G34 C2 C3 H21 .
G34 H22 C2 . .
G34 H21 C2 . END
G34 C8 C7 . ADD
G34 C5 C4 . ADD
G34 N1 C25 . ADD
G34 C2 C1 . ADD
G34 C23 C24 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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G34 C8 C9 single 1.524 0.020
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G34 H82 C8 single 1.092 0.020
G34 C6 C5 single 1.524 0.020
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_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
G34 chir_01 C5 C6 C4 C14 positiv
G34 chir_02 C6 C5 C7 C16 negativ
G34 chir_03 N1 C25 C28 C30 negativ
G34 chir_04 C4 C5 C3 C9 positiv
G34 chir_05 C9 C8 C4 C1 positiv
G34 chir_06 C10 C9 C11 C17 positiv
G34 chir_07 C11 O2 C10 C12 negativ
G34 chir_08 C12 C11 C13 C18 positiv
G34 chir_09 C14 C5 C13 O3 negativ
G34 chir_10 C23 S1 C24 C29 negativ
G34 chir_11 C25 N1 C24 C26 positiv
G34 chir_12 C28 N1 C27 C29 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
G34 plan-1 C3 0.020
G34 plan-1 C2 0.020
G34 plan-1 C4 0.020
G34 plan-1 O1 0.020
G34 plan-2 C19 0.020
G34 plan-2 C12 0.020
G34 plan-2 C20 0.020
G34 plan-2 H19 0.020
G34 plan-2 H201 0.020
G34 plan-2 H202 0.020
G34 plan-3 C21 0.020
G34 plan-3 O3 0.020
G34 plan-3 O4 0.020
G34 plan-3 C22 0.020
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