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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
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_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
GPR GPR '(9R,10R)-9-(S-GLUTATHIONYL)-10-HYDRO' non-polymer 60 35 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_GPR
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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GPR HA32 H H 0.000 -1.623 -1.818 -1.183
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GPR OE1 O O 0.000 -6.205 -2.255 2.282
GPR CG1 C CH2 0.000 -6.618 0.030 2.701
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GPR HA1 H H 0.000 -8.110 1.202 4.663
GPR C1 C C 0.000 -7.410 0.236 6.442
GPR O12 O OC -0.500 -8.552 -0.115 6.813
GPR O11 O OC -0.500 -6.449 0.184 7.241
GPR N1 N NH2 0.000 -6.091 1.695 5.014
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GPR SG2 S S2 0.000 -7.983 -1.569 -1.763
GPR CA4 C CH1 0.000 -8.280 -1.270 -3.527
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GPR CA5 C CH1 0.000 -9.773 -1.056 -3.757
GPR HA5 H H 0.000 -10.333 -1.880 -3.294
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GPR HO5 H H 0.000 -10.980 -0.905 -5.311
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GPR CD5 C CR16 0.000 -11.892 1.564 -2.054
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GPR CZ5 C CR16 0.000 -9.799 2.566 -2.643
GPR HZ5 H H 0.000 -9.145 3.429 -2.668
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GPR CB4 C CR6 0.000 -7.498 -0.060 -3.962
GPR CZ4 C CR16 0.000 -7.280 2.335 -4.122
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GPR CE4 C CR16 0.000 -6.033 2.177 -4.695
GPR HE4 H H 0.000 -5.453 3.047 -4.977
GPR CD4 C CR16 0.000 -5.524 0.909 -4.908
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GPR CG4 C CR16 0.000 -6.252 -0.208 -4.539
GPR HG4 H H 0.000 -5.844 -1.198 -4.702
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
GPR O32 n/a C3 START
GPR C3 O32 CA3 .
GPR O31 C3 . .
GPR CA3 C3 N3 .
GPR HA31 CA3 . .
GPR HA32 CA3 . .
GPR N3 CA3 C2 .
GPR HN3 N3 . .
GPR C2 N3 CA2 .
GPR O2 C2 . .
GPR CA2 C2 CB2 .
GPR HA2 CA2 . .
GPR N2 CA2 CD1 .
GPR HN2 N2 . .
GPR CD1 N2 CG1 .
GPR OE1 CD1 . .
GPR CG1 CD1 CB1 .
GPR HG11 CG1 . .
GPR HG12 CG1 . .
GPR CB1 CG1 CA1 .
GPR HB11 CB1 . .
GPR HB12 CB1 . .
GPR CA1 CB1 N1 .
GPR HA1 CA1 . .
GPR C1 CA1 O11 .
GPR O12 C1 . .
GPR O11 C1 . .
GPR N1 CA1 HN11 .
GPR HN12 N1 . .
GPR HN11 N1 . .
GPR CB2 CA2 SG2 .
GPR HB21 CB2 . .
GPR HB22 CB2 . .
GPR SG2 CB2 CA4 .
GPR CA4 SG2 CA5 .
GPR HA4 CA4 . .
GPR CA5 CA4 CB5 .
GPR HA5 CA5 . .
GPR O5 CA5 HO5 .
GPR HO5 O5 . .
GPR CB5 CA5 CH5 .
GPR CG5 CB5 CD5 .
GPR HG5 CG5 . .
GPR CD5 CG5 CE5 .
GPR HD5 CD5 . .
GPR CE5 CD5 CZ5 .
GPR HE5 CE5 . .
GPR CZ5 CE5 HZ5 .
GPR HZ5 CZ5 . .
GPR CH5 CB5 CH4 .
GPR CH4 CH5 CZ4 .
GPR CB4 CH4 . .
GPR CZ4 CH4 CE4 .
GPR HZ4 CZ4 . .
GPR CE4 CZ4 CD4 .
GPR HE4 CE4 . .
GPR CD4 CE4 CG4 .
GPR HD4 CD4 . .
GPR CG4 CD4 HG4 .
GPR HG4 CG4 . END
GPR CA4 CB4 . ADD
GPR CB4 CG4 . ADD
GPR CH5 CZ5 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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GPR C1 CA1 single 1.500 0.020
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GPR O12 C1 deloc 1.250 0.020
GPR CB1 CG1 single 1.524 0.020
GPR HB11 CB1 single 1.092 0.020
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GPR CG1 CD1 single 1.510 0.020
GPR HG11 CG1 single 1.092 0.020
GPR HG12 CG1 single 1.092 0.020
GPR OE1 CD1 double 1.220 0.020
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GPR N2 CA2 single 1.450 0.020
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GPR SG2 CB2 single 1.762 0.020
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GPR O31 C3 deloc 1.250 0.020
GPR C3 O32 deloc 1.250 0.020
GPR CA4 CB4 single 1.480 0.020
GPR CA5 CA4 single 1.524 0.020
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GPR CZ4 CH4 double 1.390 0.020
GPR HZ4 CZ4 single 1.083 0.020
GPR CH4 CH5 single 1.487 0.020
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GPR CH5 CB5 double 1.487 0.020
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GPR HE5 CE5 single 1.083 0.020
GPR CD5 CG5 double 1.390 0.020
GPR HD5 CD5 single 1.083 0.020
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GPR HG5 CG5 single 1.083 0.020
GPR CB5 CA5 single 1.480 0.020
GPR O5 CA5 single 1.432 0.020
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GPR HO5 O5 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
GPR O32 C3 O31 123.000 3.000
GPR O32 C3 CA3 118.500 3.000
GPR O31 C3 CA3 118.500 3.000
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GPR C3 CA3 N3 111.600 3.000
GPR HA31 CA3 HA32 107.900 3.000
GPR HA31 CA3 N3 109.470 3.000
GPR HA32 CA3 N3 109.470 3.000
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GPR CD1 CG1 CB1 109.470 3.000
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GPR CA1 N1 HN11 120.000 3.000
GPR HN12 N1 HN11 120.000 3.000
GPR CA2 CB2 HB21 109.470 3.000
GPR CA2 CB2 HB22 109.470 3.000
GPR CA2 CB2 SG2 109.500 3.000
GPR HB21 CB2 HB22 107.900 3.000
GPR HB21 CB2 SG2 109.500 3.000
GPR HB22 CB2 SG2 109.500 3.000
GPR CB2 SG2 CA4 100.040 3.000
GPR SG2 CA4 HA4 109.500 3.000
GPR SG2 CA4 CA5 109.500 3.000
GPR SG2 CA4 CB4 109.500 3.000
GPR HA4 CA4 CA5 108.340 3.000
GPR HA4 CA4 CB4 109.470 3.000
GPR CA5 CA4 CB4 109.470 3.000
GPR CA4 CA5 HA5 108.340 3.000
GPR CA4 CA5 O5 109.470 3.000
GPR CA4 CA5 CB5 109.470 3.000
GPR HA5 CA5 O5 109.470 3.000
GPR HA5 CA5 CB5 109.470 3.000
GPR O5 CA5 CB5 109.470 3.000
GPR CA5 O5 HO5 109.470 3.000
GPR CA5 CB5 CG5 120.000 3.000
GPR CA5 CB5 CH5 120.000 3.000
GPR CG5 CB5 CH5 120.000 3.000
GPR CB5 CG5 HG5 120.000 3.000
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GPR HG5 CG5 CD5 120.000 3.000
GPR CG5 CD5 HD5 120.000 3.000
GPR CG5 CD5 CE5 120.000 3.000
GPR HD5 CD5 CE5 120.000 3.000
GPR CD5 CE5 HE5 120.000 3.000
GPR CD5 CE5 CZ5 120.000 3.000
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GPR CE5 CZ5 CH5 120.000 3.000
GPR HZ5 CZ5 CH5 120.000 3.000
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GPR CB5 CH5 CZ5 120.000 3.000
GPR CH4 CH5 CZ5 120.000 3.000
GPR CH5 CH4 CB4 120.000 3.000
GPR CH5 CH4 CZ4 120.000 3.000
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GPR CH4 CB4 CA4 120.000 3.000
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GPR CH4 CZ4 HZ4 120.000 3.000
GPR CH4 CZ4 CE4 120.000 3.000
GPR HZ4 CZ4 CE4 120.000 3.000
GPR CZ4 CE4 HE4 120.000 3.000
GPR CZ4 CE4 CD4 120.000 3.000
GPR HE4 CE4 CD4 120.000 3.000
GPR CE4 CD4 HD4 120.000 3.000
GPR CE4 CD4 CG4 120.000 3.000
GPR HD4 CD4 CG4 120.000 3.000
GPR CD4 CG4 HG4 120.000 3.000
GPR CD4 CG4 CB4 120.000 3.000
GPR HG4 CG4 CB4 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
GPR var_1 O32 C3 CA3 N3 179.989 20.000 3
GPR var_2 C3 CA3 N3 C2 179.995 20.000 3
GPR CONST_1 CA3 N3 C2 CA2 180.000 0.000 0
GPR var_3 N3 C2 CA2 CB2 90.003 20.000 3
GPR var_4 C2 CA2 N2 CD1 -89.992 20.000 3
GPR CONST_2 CA2 N2 CD1 CG1 180.000 0.000 0
GPR var_5 N2 CD1 CG1 CB1 179.972 20.000 3
GPR var_6 CD1 CG1 CB1 CA1 179.993 20.000 3
GPR var_7 CG1 CB1 CA1 N1 -60.049 20.000 3
GPR var_8 CB1 CA1 C1 O11 89.964 20.000 3
GPR var_9 CB1 CA1 N1 HN11 53.845 20.000 1
GPR var_10 C2 CA2 CB2 SG2 -179.992 20.000 3
GPR var_11 CA2 CB2 SG2 CA4 -179.963 20.000 1
GPR var_12 CB2 SG2 CA4 CA5 179.450 20.000 1
GPR var_13 SG2 CA4 CB4 CH4 -90.000 20.000 1
GPR var_14 SG2 CA4 CA5 CB5 60.000 20.000 3
GPR var_15 CA4 CA5 O5 HO5 -179.987 20.000 1
GPR var_16 CA4 CA5 CB5 CH5 30.000 20.000 1
GPR CONST_3 CA5 CB5 CG5 CD5 180.000 0.000 0
GPR CONST_4 CB5 CG5 CD5 CE5 0.000 0.000 0
GPR CONST_5 CG5 CD5 CE5 CZ5 0.000 0.000 0
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GPR CONST_7 CA5 CB5 CH5 CH4 0.000 0.000 0
GPR CONST_8 CB5 CH5 CZ5 CE5 0.000 0.000 0
GPR CONST_9 CB5 CH5 CH4 CZ4 150.000 0.000 0
GPR CONST_10 CH5 CH4 CB4 CA4 0.000 0.000 0
GPR CONST_11 CH4 CB4 CG4 CD4 0.000 0.000 0
GPR CONST_12 CH5 CH4 CZ4 CE4 180.000 0.000 0
GPR CONST_13 CH4 CZ4 CE4 CD4 0.000 0.000 0
GPR CONST_14 CZ4 CE4 CD4 CG4 0.000 0.000 0
GPR CONST_15 CE4 CD4 CG4 CB4 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
GPR chir_01 CA1 N1 C1 CB1 positiv
GPR chir_02 CA2 N2 C2 CB2 positiv
GPR chir_03 CA4 SG2 CB4 CA5 positiv
GPR chir_04 CA5 CA4 CB5 O5 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
GPR plan-1 N1 0.020
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GPR plan-1 HN12 0.020
GPR plan-2 C1 0.020
GPR plan-2 CA1 0.020
GPR plan-2 O11 0.020
GPR plan-2 O12 0.020
GPR plan-3 CD1 0.020
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GPR plan-3 OE1 0.020
GPR plan-3 N2 0.020
GPR plan-3 HN2 0.020
GPR plan-4 N2 0.020
GPR plan-4 CD1 0.020
GPR plan-4 CA2 0.020
GPR plan-4 HN2 0.020
GPR plan-5 C2 0.020
GPR plan-5 CA2 0.020
GPR plan-5 O2 0.020
GPR plan-5 N3 0.020
GPR plan-5 HN3 0.020
GPR plan-6 N3 0.020
GPR plan-6 C2 0.020
GPR plan-6 CA3 0.020
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GPR plan-7 C3 0.020
GPR plan-7 CA3 0.020
GPR plan-7 O31 0.020
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GPR plan-8 CB4 0.020
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GPR plan-8 HE4 0.020
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