File: HO2.cif

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global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
HO2      HO2 '(9E,11E,13S)-13-hydroxyoctadeca-9,11' non-polymer        52  21 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_HO2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 HO2           O19    O    OC       -0.500      0.000    0.000    0.000
 HO2           C01    C    C         0.000     -1.191    0.132    0.358
 HO2           O20    O    OC       -0.500     -1.496    0.991    1.215
 HO2           C02    C    CH2       0.000     -2.260   -0.743   -0.244
 HO2           H02    H    H         0.000     -2.035   -1.790   -0.033
 HO2           H02A   H    H         0.000     -2.289   -0.589   -1.325
 HO2           C03    C    CH2       0.000     -3.618   -0.379    0.361
 HO2           H03    H    H         0.000     -3.841    0.669    0.149
 HO2           H03A   H    H         0.000     -3.586   -0.532    1.442
 HO2           C04    C    CH2       0.000     -4.703   -1.268   -0.251
 HO2           H04    H    H         0.000     -4.478   -2.315   -0.038
 HO2           H04A   H    H         0.000     -4.731   -1.115   -1.332
 HO2           C05    C    CH2       0.000     -6.060   -0.903    0.353
 HO2           H05    H    H         0.000     -6.283    0.144    0.140
 HO2           H05A   H    H         0.000     -6.029   -1.055    1.434
 HO2           C06    C    CH2       0.000     -7.145   -1.792   -0.257
 HO2           H06    H    H         0.000     -6.920   -2.839   -0.044
 HO2           H06A   H    H         0.000     -7.174   -1.639   -1.338
 HO2           C07    C    CH2       0.000     -8.503   -1.428    0.347
 HO2           H07    H    H         0.000     -8.726   -0.380    0.134
 HO2           H07A   H    H         0.000     -8.471   -1.580    1.428
 HO2           C08    C    CH2       0.000     -9.589   -2.317   -0.264
 HO2           H08    H    H         0.000     -9.364   -3.364   -0.050
 HO2           H08A   H    H         0.000     -9.618   -2.164   -1.345
 HO2           C09    C    C1        0.000    -10.926   -1.957    0.331
 HO2           H09    H    H         0.000    -11.060   -1.969    1.400
 HO2           C10    C    C1        0.000    -11.939   -1.627   -0.462
 HO2           H10    H    H         0.000    -11.805   -1.615   -1.530
 HO2           C11    C    C1        0.000    -13.244   -1.277    0.120
 HO2           H11    H    H         0.000    -13.378   -1.287    1.188
 HO2           C12    C    C1        0.000    -14.258   -0.947   -0.674
 HO2           H12    H    H         0.000    -14.123   -0.936   -1.742
 HO2           C13    C    CH1       0.000    -15.595   -0.588   -0.078
 HO2           H13    H    H         0.000    -16.342   -1.336   -0.378
 HO2           O21    O    OH1       0.000    -15.490   -0.563    1.347
 HO2           HO21   H    H         0.000    -14.833    0.095    1.610
 HO2           C14    C    CH2       0.000    -16.024    0.792   -0.582
 HO2           H14    H    H         0.000    -16.016    0.798   -1.674
 HO2           H14A   H    H         0.000    -15.328    1.547   -0.210
 HO2           C15    C    CH2       0.000    -17.435    1.103   -0.078
 HO2           H15    H    H         0.000    -17.441    1.095    1.014
 HO2           H15A   H    H         0.000    -18.129    0.346   -0.451
 HO2           C16    C    CH2       0.000    -17.865    2.482   -0.582
 HO2           H16    H    H         0.000    -17.857    2.489   -1.674
 HO2           H16A   H    H         0.000    -17.170    3.238   -0.210
 HO2           C17    C    CH2       0.000    -19.275    2.792   -0.079
 HO2           H17    H    H         0.000    -19.281    2.784    1.013
 HO2           H17A   H    H         0.000    -19.969    2.035   -0.451
 HO2           C18    C    CH3       0.000    -19.705    4.171   -0.582
 HO2           H18B   H    H         0.000    -19.033    4.908   -0.222
 HO2           H18A   H    H         0.000    -19.700    4.182   -1.643
 HO2           H18    H    H         0.000    -20.682    4.390   -0.235
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 HO2      O19    n/a    C01    START
 HO2      C01    O19    C02    .
 HO2      O20    C01    .      .
 HO2      C02    C01    C03    .
 HO2      H02    C02    .      .
 HO2      H02A   C02    .      .
 HO2      C03    C02    C04    .
 HO2      H03    C03    .      .
 HO2      H03A   C03    .      .
 HO2      C04    C03    C05    .
 HO2      H04    C04    .      .
 HO2      H04A   C04    .      .
 HO2      C05    C04    C06    .
 HO2      H05    C05    .      .
 HO2      H05A   C05    .      .
 HO2      C06    C05    C07    .
 HO2      H06    C06    .      .
 HO2      H06A   C06    .      .
 HO2      C07    C06    C08    .
 HO2      H07    C07    .      .
 HO2      H07A   C07    .      .
 HO2      C08    C07    C09    .
 HO2      H08    C08    .      .
 HO2      H08A   C08    .      .
 HO2      C09    C08    C10    .
 HO2      H09    C09    .      .
 HO2      C10    C09    C11    .
 HO2      H10    C10    .      .
 HO2      C11    C10    C12    .
 HO2      H11    C11    .      .
 HO2      C12    C11    C13    .
 HO2      H12    C12    .      .
 HO2      C13    C12    C14    .
 HO2      H13    C13    .      .
 HO2      O21    C13    HO21   .
 HO2      HO21   O21    .      .
 HO2      C14    C13    C15    .
 HO2      H14    C14    .      .
 HO2      H14A   C14    .      .
 HO2      C15    C14    C16    .
 HO2      H15    C15    .      .
 HO2      H15A   C15    .      .
 HO2      C16    C15    C17    .
 HO2      H16    C16    .      .
 HO2      H16A   C16    .      .
 HO2      C17    C16    C18    .
 HO2      H17    C17    .      .
 HO2      H17A   C17    .      .
 HO2      C18    C17    H18    .
 HO2      H18B   C18    .      .
 HO2      H18A   C18    .      .
 HO2      H18    C18    .      END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
 HO2      C18    C17       single      1.513    0.020
 HO2      H18    C18       single      1.059    0.020
 HO2      H18A   C18       single      1.059    0.020
 HO2      H18B   C18       single      1.059    0.020
 HO2      C17    C16       single      1.524    0.020
 HO2      H17    C17       single      1.092    0.020
 HO2      H17A   C17       single      1.092    0.020
 HO2      C16    C15       single      1.524    0.020
 HO2      H16    C16       single      1.092    0.020
 HO2      H16A   C16       single      1.092    0.020
 HO2      C15    C14       single      1.524    0.020
 HO2      H15    C15       single      1.092    0.020
 HO2      H15A   C15       single      1.092    0.020
 HO2      C14    C13       single      1.524    0.020
 HO2      H14    C14       single      1.092    0.020
 HO2      H14A   C14       single      1.092    0.020
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loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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 HO2      H02    C02    C03     109.470    3.000
 HO2      H02A   C02    C03     109.470    3.000
 HO2      C02    C03    H03     109.470    3.000
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 HO2      C04    C05    H05     109.470    3.000
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 HO2      C04    C05    C06     111.000    3.000
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 HO2      H05    C05    C06     109.470    3.000
 HO2      H05A   C05    C06     109.470    3.000
 HO2      C05    C06    H06     109.470    3.000
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 HO2      C05    C06    C07     111.000    3.000
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 HO2      H06    C06    C07     109.470    3.000
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 HO2      C06    C07    H07     109.470    3.000
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 HO2      C08    C09    H09     120.000    3.000
 HO2      C08    C09    C10     120.000    3.000
 HO2      H09    C09    C10     120.000    3.000
 HO2      C09    C10    H10     120.000    3.000
 HO2      C09    C10    C11     120.000    3.000
 HO2      H10    C10    C11     120.000    3.000
 HO2      C10    C11    H11     120.000    3.000
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 HO2      C11    C12    C13     120.000    3.000
 HO2      H12    C12    C13     120.000    3.000
 HO2      C12    C13    H13     108.810    3.000
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 HO2      C13    O21    HO21    109.470    3.000
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 HO2      H14    C14    C15     109.470    3.000
 HO2      H14A   C14    C15     109.470    3.000
 HO2      C14    C15    H15     109.470    3.000
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 HO2      H15    C15    C16     109.470    3.000
 HO2      H15A   C15    C16     109.470    3.000
 HO2      C15    C16    H16     109.470    3.000
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 HO2      C15    C16    C17     111.000    3.000
 HO2      H16    C16    H16A    107.900    3.000
 HO2      H16    C16    C17     109.470    3.000
 HO2      H16A   C16    C17     109.470    3.000
 HO2      C16    C17    H17     109.470    3.000
 HO2      C16    C17    H17A    109.470    3.000
 HO2      C16    C17    C18     111.000    3.000
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 HO2      H17    C17    C18     109.470    3.000
 HO2      H17A   C17    C18     109.470    3.000
 HO2      C17    C18    H18B    109.470    3.000
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 HO2      C17    C18    H18     109.470    3.000
 HO2      H18B   C18    H18A    109.470    3.000
 HO2      H18B   C18    H18     109.470    3.000
 HO2      H18A   C18    H18     109.470    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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 HO2      var_3    C02    C03    C04    C05     -179.946   20.000   3
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 HO2      var_6    C05    C06    C07    C08      179.990   20.000   3
 HO2      var_7    C06    C07    C08    C09     -179.969   20.000   3
 HO2      var_8    C07    C08    C09    C10      124.986   20.000   1
 HO2      CONST_1  C08    C09    C10    C11      179.984    0.000   0
 HO2      var_9    C09    C10    C11    C12     -179.949   20.000   1
 HO2      CONST_2  C10    C11    C12    C13     -179.989    0.000   0
 HO2      var_10   C11    C12    C13    C14      124.925   20.000   1
 HO2      var_11   C12    C13    O21    HO21      60.015   20.000   1
 HO2      var_12   C12    C13    C14    C15      174.982   20.000   3
 HO2      var_13   C13    C14    C15    C16     -179.986   20.000   3
 HO2      var_14   C14    C15    C16    C17      179.996   20.000   3
 HO2      var_15   C15    C16    C17    C18      180.000   20.000   3
 HO2      var_16   C16    C17    C18    H18      179.999   20.000   3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 HO2      chir_01  C13    C14    O21    C12       positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 HO2      plan-1    C12       0.020
 HO2      plan-1    C13       0.020
 HO2      plan-1    C11       0.020
 HO2      plan-1    H12       0.020
 HO2      plan-1    C10       0.020
 HO2      plan-1    H11       0.020
 HO2      plan-1    H10       0.020
 HO2      plan-2    C10       0.020
 HO2      plan-2    C11       0.020
 HO2      plan-2    C09       0.020
 HO2      plan-2    H10       0.020
 HO2      plan-2    C08       0.020
 HO2      plan-2    H09       0.020
 HO2      plan-2    H11       0.020
 HO2      plan-3    C01       0.020
 HO2      plan-3    C02       0.020
 HO2      plan-3    O20       0.020
 HO2      plan-3    O19       0.020
# ------------------------------------------------------