1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
IET IET '1-(4-CYANO-PHENYL)-3-[2-(2,6-DICHLOR' non-polymer 35 23 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_IET
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
IET N6 N NS 0.000 0.000 0.000 0.000
IET C17 C CSP 0.000 -1.058 0.399 0.111
IET C14 C CR6 0.000 -2.392 0.901 0.251
IET C13 C CR16 0.000 -3.178 1.129 -0.880
IET H13 H H 0.000 -2.779 0.926 -1.867
IET C12 C CR16 0.000 -4.460 1.611 -0.742
IET H12 H H 0.000 -5.069 1.788 -1.619
IET C15 C CR16 0.000 -2.911 1.164 1.523
IET H15 H H 0.000 -2.306 0.984 2.403
IET C16 C CR16 0.000 -4.193 1.652 1.654
IET H16 H H 0.000 -4.593 1.864 2.637
IET C11 C CR6 0.000 -4.973 1.872 0.525
IET N5 N NH1 0.000 -6.272 2.361 0.662
IET HN5 H H 0.000 -6.601 3.097 0.054
IET C9 C C 0.000 -7.087 1.850 1.605
IET S2 S S1 0.000 -6.514 0.637 2.667
IET N1 N NH1 0.000 -8.354 2.297 1.714
IET HN1 H H 0.000 -8.667 3.072 1.147
IET C8 C C 0.000 -9.221 1.696 2.597
IET N3 N N 0.000 -10.463 2.051 2.624
IET HN3 H H 0.000 -10.790 2.732 2.032
IET C7 C CH2 0.000 -8.723 0.626 3.531
IET H71 H H 0.000 -7.912 1.026 4.143
IET H72 H H 0.000 -8.354 -0.222 2.950
IET C1 C CR6 0.000 -9.851 0.173 4.423
IET C6 C CR6 0.000 -10.665 -0.874 4.031
IET CL6 CL CL 0.000 -10.393 -1.662 2.508
IET C5 C CR16 0.000 -11.700 -1.289 4.849
IET H5 H H 0.000 -12.341 -2.105 4.540
IET C4 C CR16 0.000 -11.917 -0.662 6.063
IET H4 H H 0.000 -12.727 -0.987 6.703
IET C3 C CR16 0.000 -11.099 0.380 6.457
IET H3 H H 0.000 -11.269 0.871 7.407
IET C2 C CR6 0.000 -10.064 0.796 5.639
IET CL2 CL CL 0.000 -9.038 2.105 6.135
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
IET N6 n/a C17 START
IET C17 N6 C14 .
IET C14 C17 C15 .
IET C13 C14 C12 .
IET H13 C13 . .
IET C12 C13 H12 .
IET H12 C12 . .
IET C15 C14 C16 .
IET H15 C15 . .
IET C16 C15 C11 .
IET H16 C16 . .
IET C11 C16 N5 .
IET N5 C11 C9 .
IET HN5 N5 . .
IET C9 N5 N1 .
IET S2 C9 . .
IET N1 C9 C8 .
IET HN1 N1 . .
IET C8 N1 C7 .
IET N3 C8 HN3 .
IET HN3 N3 . .
IET C7 C8 C1 .
IET H71 C7 . .
IET H72 C7 . .
IET C1 C7 C6 .
IET C6 C1 C5 .
IET CL6 C6 . .
IET C5 C6 C4 .
IET H5 C5 . .
IET C4 C5 C3 .
IET H4 C4 . .
IET C3 C4 C2 .
IET H3 C3 . .
IET C2 C3 CL2 .
IET CL2 C2 . END
IET C1 C2 . ADD
IET C11 C12 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
IET C1 C7 single 1.511 0.020
IET C1 C2 double 1.487 0.020
IET C6 C1 single 1.487 0.020
IET C7 C8 single 1.510 0.020
IET H71 C7 single 1.092 0.020
IET H72 C7 single 1.092 0.020
IET CL2 C2 single 1.795 0.020
IET C2 C3 single 1.390 0.020
IET C3 C4 double 1.390 0.020
IET H3 C3 single 1.083 0.020
IET C4 C5 single 1.390 0.020
IET H4 C4 single 1.083 0.020
IET C5 C6 double 1.390 0.020
IET H5 C5 single 1.083 0.020
IET CL6 C6 single 1.795 0.020
IET C8 N1 single 1.330 0.020
IET N3 C8 double 1.260 0.020
IET N1 C9 single 1.330 0.020
IET HN1 N1 single 1.010 0.020
IET C9 N5 single 1.330 0.020
IET S2 C9 double 1.565 0.020
IET N5 C11 single 1.350 0.020
IET HN5 N5 single 1.010 0.020
IET HN3 N3 single 0.954 0.020
IET C11 C12 double 1.390 0.020
IET C11 C16 single 1.390 0.020
IET C12 C13 single 1.390 0.020
IET H12 C12 single 1.083 0.020
IET C13 C14 double 1.390 0.020
IET H13 C13 single 1.083 0.020
IET C15 C14 single 1.390 0.020
IET C14 C17 single 1.285 0.020
IET C16 C15 double 1.390 0.020
IET H15 C15 single 1.083 0.020
IET H16 C16 single 1.083 0.020
IET C17 N6 triple 1.158 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
IET N6 C17 C14 180.000 3.000
IET C17 C14 C13 120.000 3.000
IET C17 C14 C15 120.000 3.000
IET C13 C14 C15 120.000 3.000
IET C14 C13 H13 120.000 3.000
IET C14 C13 C12 120.000 3.000
IET H13 C13 C12 120.000 3.000
IET C13 C12 H12 120.000 3.000
IET C13 C12 C11 120.000 3.000
IET H12 C12 C11 120.000 3.000
IET C14 C15 H15 120.000 3.000
IET C14 C15 C16 120.000 3.000
IET H15 C15 C16 120.000 3.000
IET C15 C16 H16 120.000 3.000
IET C15 C16 C11 120.000 3.000
IET H16 C16 C11 120.000 3.000
IET C16 C11 N5 120.000 3.000
IET C16 C11 C12 120.000 3.000
IET N5 C11 C12 120.000 3.000
IET C11 N5 HN5 120.000 3.000
IET C11 N5 C9 120.000 3.000
IET HN5 N5 C9 120.000 3.000
IET N5 C9 S2 120.000 3.000
IET N5 C9 N1 120.000 3.000
IET S2 C9 N1 120.000 3.000
IET C9 N1 HN1 120.000 3.000
IET C9 N1 C8 120.000 3.000
IET HN1 N1 C8 120.000 3.000
IET N1 C8 N3 120.000 3.000
IET N1 C8 C7 116.500 3.000
IET N3 C8 C7 116.500 3.000
IET C8 N3 HN3 120.000 3.000
IET C8 C7 H71 109.470 3.000
IET C8 C7 H72 109.470 3.000
IET C8 C7 C1 109.470 3.000
IET H71 C7 H72 107.900 3.000
IET H71 C7 C1 109.470 3.000
IET H72 C7 C1 109.470 3.000
IET C7 C1 C6 120.000 3.000
IET C7 C1 C2 120.000 3.000
IET C6 C1 C2 120.000 3.000
IET C1 C6 CL6 120.000 3.000
IET C1 C6 C5 120.000 3.000
IET CL6 C6 C5 120.000 3.000
IET C6 C5 H5 120.000 3.000
IET C6 C5 C4 120.000 3.000
IET H5 C5 C4 120.000 3.000
IET C5 C4 H4 120.000 3.000
IET C5 C4 C3 120.000 3.000
IET H4 C4 C3 120.000 3.000
IET C4 C3 H3 120.000 3.000
IET C4 C3 C2 120.000 3.000
IET H3 C3 C2 120.000 3.000
IET C3 C2 CL2 120.000 3.000
IET C3 C2 C1 120.000 3.000
IET CL2 C2 C1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
IET var_1 N6 C17 C14 C15 66.370 20.000 1
IET CONST_1 C17 C14 C13 C12 180.000 0.000 0
IET CONST_2 C14 C13 C12 C11 0.000 0.000 0
IET CONST_3 C17 C14 C15 C16 180.000 0.000 0
IET CONST_4 C14 C15 C16 C11 0.000 0.000 0
IET CONST_5 C15 C16 C11 N5 180.000 0.000 0
IET CONST_6 C16 C11 C12 C13 0.000 0.000 0
IET var_2 C16 C11 N5 C9 -44.195 20.000 1
IET CONST_7 C11 N5 C9 N1 180.000 0.000 0
IET CONST_8 N5 C9 N1 C8 180.000 0.000 0
IET CONST_9 C9 N1 C8 C7 0.000 0.000 0
IET CONST_10 N1 C8 N3 HN3 0.000 0.000 0
IET var_3 N1 C8 C7 C1 177.829 20.000 3
IET var_4 C8 C7 C1 C6 90.057 20.000 2
IET CONST_11 C7 C1 C2 C3 180.000 0.000 0
IET CONST_12 C7 C1 C6 C5 180.000 0.000 0
IET CONST_13 C1 C6 C5 C4 0.000 0.000 0
IET CONST_14 C6 C5 C4 C3 0.000 0.000 0
IET CONST_15 C5 C4 C3 C2 0.000 0.000 0
IET CONST_16 C4 C3 C2 CL2 180.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
IET plan-1 C1 0.020
IET plan-1 C7 0.020
IET plan-1 C2 0.020
IET plan-1 C6 0.020
IET plan-1 C3 0.020
IET plan-1 C4 0.020
IET plan-1 C5 0.020
IET plan-1 CL2 0.020
IET plan-1 H3 0.020
IET plan-1 H4 0.020
IET plan-1 H5 0.020
IET plan-1 CL6 0.020
IET plan-2 C8 0.020
IET plan-2 C7 0.020
IET plan-2 N1 0.020
IET plan-2 N3 0.020
IET plan-2 HN3 0.020
IET plan-2 HN1 0.020
IET plan-3 N1 0.020
IET plan-3 C8 0.020
IET plan-3 C9 0.020
IET plan-3 HN1 0.020
IET plan-4 C9 0.020
IET plan-4 N1 0.020
IET plan-4 N5 0.020
IET plan-4 S2 0.020
IET plan-4 HN1 0.020
IET plan-4 HN5 0.020
IET plan-5 N5 0.020
IET plan-5 C9 0.020
IET plan-5 C11 0.020
IET plan-5 HN5 0.020
IET plan-6 C11 0.020
IET plan-6 N5 0.020
IET plan-6 C12 0.020
IET plan-6 C16 0.020
IET plan-6 C13 0.020
IET plan-6 C14 0.020
IET plan-6 C15 0.020
IET plan-6 H12 0.020
IET plan-6 H13 0.020
IET plan-6 C17 0.020
IET plan-6 H15 0.020
IET plan-6 H16 0.020
IET plan-6 HN5 0.020
# ------------------------------------------------------
|
