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302
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
IHP IHP 'INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE ' non-polymer 42 36 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_IHP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
IHP O46 O OP -0.666 0.000 0.000 0.000
IHP P6 P P 0.000 -0.838 0.453 -1.176
IHP O26 O OP -0.666 -1.196 -0.744 -2.029
IHP O36 O OP -0.666 -0.052 1.446 -2.003
IHP O16 O O2 0.000 -2.185 1.150 -0.637
IHP C6 C CH1 0.000 -2.881 0.167 0.133
IHP H6 H H 0.000 -2.306 -0.769 0.137
IHP C1 C CH1 0.000 -3.049 0.669 1.567
IHP H1 H H 0.000 -2.059 0.849 2.011
IHP O11 O O2 0.000 -3.797 1.885 1.562
IHP P1 P P 0.000 -2.854 3.015 2.218
IHP O41 O OP -0.666 -1.592 3.157 1.396
IHP O31 O OP -0.666 -3.591 4.336 2.242
IHP O21 O OP -0.666 -2.494 2.612 3.631
IHP C5 C CH1 0.000 -4.258 -0.083 -0.484
IHP H5 H H 0.000 -4.136 -0.444 -1.515
IHP O15 O O2 0.000 -5.006 1.133 -0.490
IHP P5 P P 0.000 -5.356 1.458 -2.028
IHP O45 O OP -0.666 -4.073 1.612 -2.815
IHP O35 O OP -0.666 -6.151 2.742 -2.104
IHP O25 O OP -0.666 -6.170 0.323 -2.611
IHP C4 C CH1 0.000 -5.001 -1.135 0.339
IHP H4 H H 0.000 -4.425 -2.071 0.344
IHP O14 O O2 0.000 -6.288 -1.370 -0.236
IHP P4 P P 0.000 -6.341 -2.928 -0.638
IHP O44 O OP -0.666 -5.244 -3.230 -1.634
IHP O34 O OP -0.666 -7.685 -3.243 -1.258
IHP O24 O OP -0.666 -6.146 -3.775 0.601
IHP C3 C CH1 0.000 -5.170 -0.633 1.774
IHP H3 H H 0.000 -5.705 -1.389 2.366
IHP O13 O O2 0.000 -5.918 0.583 1.769
IHP P3 P P 0.000 -7.242 0.320 2.646
IHP O43 O OP -0.666 -8.041 -0.805 2.026
IHP O33 O OP -0.666 -8.083 1.577 2.680
IHP O23 O OP -0.666 -6.846 -0.062 4.055
IHP C2 C CH1 0.000 -3.793 -0.383 2.391
IHP H2 H H 0.000 -3.218 -1.319 2.395
IHP O12 O O2 0.000 -3.949 0.086 3.732
IHP P2 P P 0.000 -3.204 -0.975 4.687
IHP O22 O OP -0.666 -1.740 -1.050 4.312
IHP O32 O OP -0.666 -3.334 -0.534 6.128
IHP O42 O OP -0.666 -3.838 -2.338 4.516
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
IHP O46 n/a P6 START
IHP P6 O46 O16 .
IHP O26 P6 . .
IHP O36 P6 . .
IHP O16 P6 C6 .
IHP C6 O16 C5 .
IHP H6 C6 . .
IHP C1 C6 O11 .
IHP H1 C1 . .
IHP O11 C1 P1 .
IHP P1 O11 O21 .
IHP O41 P1 . .
IHP O31 P1 . .
IHP O21 P1 . .
IHP C5 C6 C4 .
IHP H5 C5 . .
IHP O15 C5 P5 .
IHP P5 O15 O25 .
IHP O45 P5 . .
IHP O35 P5 . .
IHP O25 P5 . .
IHP C4 C5 C3 .
IHP H4 C4 . .
IHP O14 C4 P4 .
IHP P4 O14 O24 .
IHP O44 P4 . .
IHP O34 P4 . .
IHP O24 P4 . .
IHP C3 C4 C2 .
IHP H3 C3 . .
IHP O13 C3 P3 .
IHP P3 O13 O23 .
IHP O43 P3 . .
IHP O33 P3 . .
IHP O23 P3 . .
IHP C2 C3 O12 .
IHP H2 C2 . .
IHP O12 C2 P2 .
IHP P2 O12 O42 .
IHP O22 P2 . .
IHP O32 P2 . .
IHP O42 P2 . END
IHP C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
IHP C1 C2 single 1.524 0.020
IHP C1 C6 single 1.524 0.020
IHP O11 C1 single 1.426 0.020
IHP H1 C1 single 1.099 0.020
IHP C2 C3 single 1.524 0.020
IHP O12 C2 single 1.426 0.020
IHP H2 C2 single 1.099 0.020
IHP C3 C4 single 1.524 0.020
IHP O13 C3 single 1.426 0.020
IHP H3 C3 single 1.099 0.020
IHP C4 C5 single 1.524 0.020
IHP O14 C4 single 1.426 0.020
IHP H4 C4 single 1.099 0.020
IHP C5 C6 single 1.524 0.020
IHP O15 C5 single 1.426 0.020
IHP H5 C5 single 1.099 0.020
IHP C6 O16 single 1.426 0.020
IHP H6 C6 single 1.099 0.020
IHP P1 O11 single 1.610 0.020
IHP O21 P1 deloc 1.510 0.020
IHP O31 P1 deloc 1.510 0.020
IHP O41 P1 deloc 1.510 0.020
IHP P2 O12 single 1.610 0.020
IHP O22 P2 deloc 1.510 0.020
IHP O32 P2 deloc 1.510 0.020
IHP O42 P2 deloc 1.510 0.020
IHP P3 O13 single 1.610 0.020
IHP O23 P3 deloc 1.510 0.020
IHP O33 P3 deloc 1.510 0.020
IHP O43 P3 deloc 1.510 0.020
IHP P4 O14 single 1.610 0.020
IHP O24 P4 deloc 1.510 0.020
IHP O34 P4 deloc 1.510 0.020
IHP O44 P4 deloc 1.510 0.020
IHP P5 O15 single 1.610 0.020
IHP O25 P5 deloc 1.510 0.020
IHP O35 P5 deloc 1.510 0.020
IHP O45 P5 deloc 1.510 0.020
IHP O16 P6 single 1.610 0.020
IHP O26 P6 deloc 1.510 0.020
IHP O36 P6 deloc 1.510 0.020
IHP P6 O46 deloc 1.510 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
IHP O46 P6 O26 119.900 3.000
IHP O46 P6 O36 119.900 3.000
IHP O46 P6 O16 108.200 3.000
IHP O26 P6 O36 119.900 3.000
IHP O26 P6 O16 108.200 3.000
IHP O36 P6 O16 108.200 3.000
IHP P6 O16 C6 120.500 3.000
IHP O16 C6 H6 109.470 3.000
IHP O16 C6 C1 109.470 3.000
IHP O16 C6 C5 109.470 3.000
IHP H6 C6 C1 108.340 3.000
IHP H6 C6 C5 108.340 3.000
IHP C1 C6 C5 111.000 3.000
IHP C6 C1 H1 108.340 3.000
IHP C6 C1 O11 109.470 3.000
IHP C6 C1 C2 111.000 3.000
IHP H1 C1 O11 109.470 3.000
IHP H1 C1 C2 108.340 3.000
IHP O11 C1 C2 109.470 3.000
IHP C1 O11 P1 120.500 3.000
IHP O11 P1 O41 108.200 3.000
IHP O11 P1 O31 108.200 3.000
IHP O11 P1 O21 108.200 3.000
IHP O41 P1 O31 119.900 3.000
IHP O41 P1 O21 119.900 3.000
IHP O31 P1 O21 119.900 3.000
IHP C6 C5 H5 108.340 3.000
IHP C6 C5 O15 109.470 3.000
IHP C6 C5 C4 111.000 3.000
IHP H5 C5 O15 109.470 3.000
IHP H5 C5 C4 108.340 3.000
IHP O15 C5 C4 109.470 3.000
IHP C5 O15 P5 120.500 3.000
IHP O15 P5 O45 108.200 3.000
IHP O15 P5 O35 108.200 3.000
IHP O15 P5 O25 108.200 3.000
IHP O45 P5 O35 119.900 3.000
IHP O45 P5 O25 119.900 3.000
IHP O35 P5 O25 119.900 3.000
IHP C5 C4 H4 108.340 3.000
IHP C5 C4 O14 109.470 3.000
IHP C5 C4 C3 111.000 3.000
IHP H4 C4 O14 109.470 3.000
IHP H4 C4 C3 108.340 3.000
IHP O14 C4 C3 109.470 3.000
IHP C4 O14 P4 120.500 3.000
IHP O14 P4 O44 108.200 3.000
IHP O14 P4 O34 108.200 3.000
IHP O14 P4 O24 108.200 3.000
IHP O44 P4 O34 119.900 3.000
IHP O44 P4 O24 119.900 3.000
IHP O34 P4 O24 119.900 3.000
IHP C4 C3 H3 108.340 3.000
IHP C4 C3 O13 109.470 3.000
IHP C4 C3 C2 111.000 3.000
IHP H3 C3 O13 109.470 3.000
IHP H3 C3 C2 108.340 3.000
IHP O13 C3 C2 109.470 3.000
IHP C3 O13 P3 120.500 3.000
IHP O13 P3 O43 108.200 3.000
IHP O13 P3 O33 108.200 3.000
IHP O13 P3 O23 108.200 3.000
IHP O43 P3 O33 119.900 3.000
IHP O43 P3 O23 119.900 3.000
IHP O33 P3 O23 119.900 3.000
IHP C3 C2 H2 108.340 3.000
IHP C3 C2 O12 109.470 3.000
IHP C3 C2 C1 111.000 3.000
IHP H2 C2 O12 109.470 3.000
IHP H2 C2 C1 108.340 3.000
IHP O12 C2 C1 109.470 3.000
IHP C2 O12 P2 120.500 3.000
IHP O12 P2 O22 108.200 3.000
IHP O12 P2 O32 108.200 3.000
IHP O12 P2 O42 108.200 3.000
IHP O22 P2 O32 119.900 3.000
IHP O22 P2 O42 119.900 3.000
IHP O32 P2 O42 119.900 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
IHP var_1 O46 P6 O16 C6 -59.985 20.000 1
IHP var_2 P6 O16 C6 C5 -119.992 20.000 1
IHP var_3 O16 C6 C1 O11 60.000 20.000 3
IHP var_4 C6 C1 C2 C3 -60.000 20.000 3
IHP var_5 C6 C1 O11 P1 -119.989 20.000 1
IHP var_6 C1 O11 P1 O21 -60.014 20.000 1
IHP var_7 O16 C6 C5 C4 180.000 20.000 3
IHP var_8 C6 C5 O15 P5 120.034 20.000 1
IHP var_9 C5 O15 P5 O25 59.937 20.000 1
IHP var_10 C6 C5 C4 C3 60.000 20.000 3
IHP var_11 C5 C4 O14 P4 120.008 20.000 1
IHP var_12 C4 O14 P4 O24 60.031 20.000 1
IHP var_13 C5 C4 C3 C2 -60.000 20.000 3
IHP var_14 C4 C3 O13 P3 120.042 20.000 1
IHP var_15 C3 O13 P3 O23 59.976 20.000 1
IHP var_16 C4 C3 C2 O12 180.000 20.000 3
IHP var_17 C3 C2 O12 P2 120.002 20.000 1
IHP var_18 C2 O12 P2 O42 -59.967 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
IHP chir_01 C1 C2 C6 O11 negativ
IHP chir_02 C2 C1 C3 O12 positiv
IHP chir_03 C3 C2 C4 O13 positiv
IHP chir_04 C4 C3 C5 O14 positiv
IHP chir_05 C5 C4 C6 O15 positiv
IHP chir_06 C6 C1 C5 O16 negativ
# ------------------------------------------------------
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