1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
IOA IOA '4-(AMINOSULFONYL)-N-[(2,5-DIFLUOROPH' non-polymer 34 22 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_IOA
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
IOA F22 F F 0.000 0.000 0.000 0.000
IOA C17 C CR6 0.000 -1.132 0.718 0.163
IOA C16 C CR16 0.000 -2.268 0.394 -0.559
IOA H161 H H 0.000 -2.248 -0.436 -1.254
IOA C18 C CR16 0.000 -1.158 1.778 1.052
IOA H181 H H 0.000 -0.269 2.032 1.618
IOA C19 C CR16 0.000 -2.316 2.512 1.220
IOA H191 H H 0.000 -2.337 3.339 1.919
IOA C20 C CR6 0.000 -3.450 2.191 0.493
IOA F21 F F 0.000 -4.583 2.910 0.655
IOA C15 C CR6 0.000 -3.426 1.127 -0.392
IOA C10 C CH2 0.000 -4.661 0.775 -1.180
IOA H101 H H 0.000 -4.449 -0.081 -1.824
IOA H102 H H 0.000 -4.956 1.628 -1.795
IOA N09 N NH1 0.000 -5.748 0.437 -0.258
IOA H091 H H 0.000 -5.591 0.466 0.739
IOA C07 C C 0.000 -6.957 0.087 -0.740
IOA O08 O O 0.000 -7.146 0.052 -1.940
IOA C06 C CR6 0.000 -8.053 -0.254 0.190
IOA C01 C CR16 0.000 -9.306 -0.617 -0.306
IOA H011 H H 0.000 -9.478 -0.649 -1.374
IOA C05 C CR16 0.000 -7.840 -0.216 1.568
IOA H051 H H 0.000 -6.869 0.061 1.960
IOA C04 C CR16 0.000 -8.869 -0.530 2.431
IOA H041 H H 0.000 -8.708 -0.492 3.502
IOA C03 C CR6 0.000 -10.108 -0.894 1.933
IOA C02 C CR16 0.000 -10.326 -0.934 0.568
IOA H021 H H 0.000 -11.298 -1.215 0.184
IOA S11 S ST 0.000 -11.415 -1.301 3.042
IOA O13 O OS 0.000 -12.617 -1.097 2.315
IOA O14 O OS 0.000 -11.083 -0.677 4.275
IOA NP2 N NH2 0.000 -11.333 -2.930 3.327
IOA HP22 H H 0.000 -10.613 -3.502 2.888
IOA HP21 H H 0.000 -12.002 -3.387 3.947
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
IOA F22 n/a C17 START
IOA C17 F22 C18 .
IOA C16 C17 H161 .
IOA H161 C16 . .
IOA C18 C17 C19 .
IOA H181 C18 . .
IOA C19 C18 C20 .
IOA H191 C19 . .
IOA C20 C19 C15 .
IOA F21 C20 . .
IOA C15 C20 C10 .
IOA C10 C15 N09 .
IOA H101 C10 . .
IOA H102 C10 . .
IOA N09 C10 C07 .
IOA H091 N09 . .
IOA C07 N09 C06 .
IOA O08 C07 . .
IOA C06 C07 C05 .
IOA C01 C06 H011 .
IOA H011 C01 . .
IOA C05 C06 C04 .
IOA H051 C05 . .
IOA C04 C05 C03 .
IOA H041 C04 . .
IOA C03 C04 S11 .
IOA C02 C03 H021 .
IOA H021 C02 . .
IOA S11 C03 NP2 .
IOA O13 S11 . .
IOA O14 S11 . .
IOA NP2 S11 HP21 .
IOA HP22 NP2 . .
IOA HP21 NP2 . END
IOA C01 C02 . ADD
IOA C15 C16 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
IOA C01 C02 double 1.390 0.020
IOA C01 C06 single 1.390 0.020
IOA H011 C01 single 1.083 0.020
IOA C02 C03 single 1.390 0.020
IOA H021 C02 single 1.083 0.020
IOA C03 C04 double 1.390 0.020
IOA S11 C03 single 1.595 0.020
IOA C04 C05 single 1.390 0.020
IOA H041 C04 single 1.083 0.020
IOA C05 C06 double 1.390 0.020
IOA H051 C05 single 1.083 0.020
IOA C06 C07 single 1.500 0.020
IOA O08 C07 double 1.220 0.020
IOA C07 N09 single 1.330 0.020
IOA N09 C10 single 1.450 0.020
IOA H091 N09 single 1.010 0.020
IOA C10 C15 single 1.511 0.020
IOA H101 C10 single 1.092 0.020
IOA H102 C10 single 1.092 0.020
IOA NP2 S11 single 1.600 0.020
IOA O13 S11 double 1.436 0.020
IOA O14 S11 double 1.436 0.020
IOA HP21 NP2 single 1.010 0.020
IOA HP22 NP2 single 1.010 0.020
IOA C15 C16 double 1.390 0.020
IOA C15 C20 single 1.487 0.020
IOA C16 C17 single 1.390 0.020
IOA H161 C16 single 1.083 0.020
IOA C18 C17 double 1.390 0.020
IOA C17 F22 single 1.345 0.020
IOA C19 C18 single 1.390 0.020
IOA H181 C18 single 1.083 0.020
IOA C20 C19 double 1.390 0.020
IOA H191 C19 single 1.083 0.020
IOA F21 C20 single 1.345 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
IOA F22 C17 C16 120.000 3.000
IOA F22 C17 C18 120.000 3.000
IOA C16 C17 C18 120.000 3.000
IOA C17 C16 H161 120.000 3.000
IOA C17 C16 C15 120.000 3.000
IOA H161 C16 C15 120.000 3.000
IOA C17 C18 H181 120.000 3.000
IOA C17 C18 C19 120.000 3.000
IOA H181 C18 C19 120.000 3.000
IOA C18 C19 H191 120.000 3.000
IOA C18 C19 C20 120.000 3.000
IOA H191 C19 C20 120.000 3.000
IOA C19 C20 F21 120.000 3.000
IOA C19 C20 C15 120.000 3.000
IOA F21 C20 C15 120.000 3.000
IOA C20 C15 C10 120.000 3.000
IOA C20 C15 C16 120.000 3.000
IOA C10 C15 C16 120.000 3.000
IOA C15 C10 H101 109.470 3.000
IOA C15 C10 H102 109.470 3.000
IOA C15 C10 N09 109.500 3.000
IOA H101 C10 H102 107.900 3.000
IOA H101 C10 N09 109.470 3.000
IOA H102 C10 N09 109.470 3.000
IOA C10 N09 H091 118.500 3.000
IOA C10 N09 C07 121.500 3.000
IOA H091 N09 C07 120.000 3.000
IOA N09 C07 O08 123.000 3.000
IOA N09 C07 C06 120.000 3.000
IOA O08 C07 C06 120.500 3.000
IOA C07 C06 C01 120.000 3.000
IOA C07 C06 C05 120.000 3.000
IOA C01 C06 C05 120.000 3.000
IOA C06 C01 H011 120.000 3.000
IOA C06 C01 C02 120.000 3.000
IOA H011 C01 C02 120.000 3.000
IOA C06 C05 H051 120.000 3.000
IOA C06 C05 C04 120.000 3.000
IOA H051 C05 C04 120.000 3.000
IOA C05 C04 H041 120.000 3.000
IOA C05 C04 C03 120.000 3.000
IOA H041 C04 C03 120.000 3.000
IOA C04 C03 C02 120.000 3.000
IOA C04 C03 S11 120.000 3.000
IOA C02 C03 S11 120.000 3.000
IOA C03 C02 H021 120.000 3.000
IOA C03 C02 C01 120.000 3.000
IOA H021 C02 C01 120.000 3.000
IOA C03 S11 O13 109.500 3.000
IOA C03 S11 O14 109.500 3.000
IOA C03 S11 NP2 109.500 3.000
IOA O13 S11 O14 109.500 3.000
IOA O13 S11 NP2 109.500 3.000
IOA O14 S11 NP2 109.500 3.000
IOA S11 NP2 HP22 120.000 3.000
IOA S11 NP2 HP21 120.000 3.000
IOA HP22 NP2 HP21 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
IOA CONST_1 F22 C17 C16 C15 180.000 0.000 0
IOA CONST_2 F22 C17 C18 C19 180.000 0.000 0
IOA CONST_3 C17 C18 C19 C20 0.000 0.000 0
IOA CONST_4 C18 C19 C20 C15 0.000 0.000 0
IOA CONST_5 C19 C20 C15 C10 180.000 0.000 0
IOA CONST_6 C20 C15 C16 C17 0.000 0.000 0
IOA var_1 C20 C15 C10 N09 -60.325 20.000 2
IOA var_2 C15 C10 N09 C07 179.968 20.000 3
IOA CONST_7 C10 N09 C07 C06 180.000 0.000 0
IOA var_3 N09 C07 C06 C05 0.038 20.000 1
IOA CONST_8 C07 C06 C01 C02 180.000 0.000 0
IOA CONST_9 C06 C01 C02 C03 0.000 0.000 0
IOA CONST_10 C07 C06 C05 C04 180.000 0.000 0
IOA CONST_11 C06 C05 C04 C03 0.000 0.000 0
IOA CONST_12 C05 C04 C03 S11 180.000 0.000 0
IOA CONST_13 C04 C03 C02 C01 0.000 0.000 0
IOA var_4 C04 C03 S11 NP2 -90.238 20.000 1
IOA var_5 C03 S11 NP2 HP21 -179.948 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
IOA chir_01 S11 C03 NP2 O13 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
IOA plan-1 C01 0.020
IOA plan-1 C02 0.020
IOA plan-1 C06 0.020
IOA plan-1 H011 0.020
IOA plan-1 C03 0.020
IOA plan-1 C04 0.020
IOA plan-1 C05 0.020
IOA plan-1 H021 0.020
IOA plan-1 S11 0.020
IOA plan-1 H041 0.020
IOA plan-1 H051 0.020
IOA plan-1 C07 0.020
IOA plan-2 C07 0.020
IOA plan-2 C06 0.020
IOA plan-2 O08 0.020
IOA plan-2 N09 0.020
IOA plan-2 H091 0.020
IOA plan-3 N09 0.020
IOA plan-3 C07 0.020
IOA plan-3 C10 0.020
IOA plan-3 H091 0.020
IOA plan-4 NP2 0.020
IOA plan-4 S11 0.020
IOA plan-4 HP21 0.020
IOA plan-4 HP22 0.020
IOA plan-5 C15 0.020
IOA plan-5 C10 0.020
IOA plan-5 C16 0.020
IOA plan-5 C20 0.020
IOA plan-5 C17 0.020
IOA plan-5 C18 0.020
IOA plan-5 C19 0.020
IOA plan-5 H161 0.020
IOA plan-5 F22 0.020
IOA plan-5 H181 0.020
IOA plan-5 H191 0.020
IOA plan-5 F21 0.020
# ------------------------------------------------------
|
