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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
IPD IPD 'D-MYO-INOSITOL-1-PHOSPHATE ' non-polymer 27 16 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_IPD
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
IPD O9 O OP -0.666 0.000 0.000 0.000
IPD P1 P P 0.000 -0.969 -0.891 -0.745
IPD O7 O OP -0.666 -1.184 -2.168 0.038
IPD O8 O OP -0.666 -0.403 -1.223 -2.108
IPD O1 O O2 0.000 -2.375 -0.126 -0.921
IPD C1 C CH1 0.000 -2.800 0.264 0.387
IPD H1 H H 0.000 -2.056 -0.065 1.126
IPD C6 C CH1 0.000 -2.938 1.787 0.446
IPD H6 H H 0.000 -3.681 2.116 -0.294
IPD O6 O OH1 0.000 -1.676 2.392 0.154
IPD HO6 H H 0.000 -1.765 3.354 0.191
IPD C5 C CH1 0.000 -3.391 2.205 1.846
IPD H5 H H 0.000 -2.648 1.876 2.585
IPD O5 O OH1 0.000 -3.521 3.627 1.900
IPD HO5 H H 0.000 -3.808 3.891 2.785
IPD C4 C CH1 0.000 -4.742 1.558 2.158
IPD H4 H H 0.000 -5.069 1.858 3.164
IPD O4 O OH1 0.000 -5.709 1.986 1.196
IPD HO4 H H 0.000 -5.797 2.948 1.233
IPD C3 C CH1 0.000 -4.604 0.035 2.100
IPD H3 H H 0.000 -3.861 -0.294 2.839
IPD O3 O OH1 0.000 -5.866 -0.569 2.391
IPD HO3 H H 0.000 -6.153 -0.305 3.275
IPD C2 C CH1 0.000 -4.151 -0.383 0.699
IPD H2 H H 0.000 -4.051 -1.476 0.658
IPD O2 O OH1 0.000 -5.117 0.045 -0.262
IPD HO2 H H 0.000 -5.971 -0.364 -0.064
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
IPD O9 n/a P1 START
IPD P1 O9 O1 .
IPD O7 P1 . .
IPD O8 P1 . .
IPD O1 P1 C1 .
IPD C1 O1 C6 .
IPD H1 C1 . .
IPD C6 C1 C5 .
IPD H6 C6 . .
IPD O6 C6 HO6 .
IPD HO6 O6 . .
IPD C5 C6 C4 .
IPD H5 C5 . .
IPD O5 C5 HO5 .
IPD HO5 O5 . .
IPD C4 C5 C3 .
IPD H4 C4 . .
IPD O4 C4 HO4 .
IPD HO4 O4 . .
IPD C3 C4 C2 .
IPD H3 C3 . .
IPD O3 C3 HO3 .
IPD HO3 O3 . .
IPD C2 C3 O2 .
IPD H2 C2 . .
IPD O2 C2 HO2 .
IPD HO2 O2 . END
IPD C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
IPD C1 C2 single 1.524 0.020
IPD C6 C1 single 1.524 0.020
IPD C1 O1 single 1.426 0.020
IPD H1 C1 single 1.099 0.020
IPD C2 C3 single 1.524 0.020
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IPD H2 C2 single 1.099 0.020
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IPD O3 C3 single 1.432 0.020
IPD H3 C3 single 1.099 0.020
IPD C4 C5 single 1.524 0.020
IPD O4 C4 single 1.432 0.020
IPD H4 C4 single 1.099 0.020
IPD C5 C6 single 1.524 0.020
IPD O5 C5 single 1.432 0.020
IPD H5 C5 single 1.099 0.020
IPD O6 C6 single 1.432 0.020
IPD H6 C6 single 1.099 0.020
IPD O1 P1 single 1.610 0.020
IPD O7 P1 deloc 1.510 0.020
IPD O8 P1 deloc 1.510 0.020
IPD P1 O9 deloc 1.510 0.020
IPD HO2 O2 single 0.967 0.020
IPD HO3 O3 single 0.967 0.020
IPD HO4 O4 single 0.967 0.020
IPD HO5 O5 single 0.967 0.020
IPD HO6 O6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
IPD O9 P1 O7 119.900 3.000
IPD O9 P1 O8 119.900 3.000
IPD O9 P1 O1 108.200 3.000
IPD O7 P1 O8 119.900 3.000
IPD O7 P1 O1 108.200 3.000
IPD O8 P1 O1 108.200 3.000
IPD P1 O1 C1 120.500 3.000
IPD O1 C1 H1 109.470 3.000
IPD O1 C1 C6 109.470 3.000
IPD O1 C1 C2 109.470 3.000
IPD H1 C1 C6 108.340 3.000
IPD H1 C1 C2 108.340 3.000
IPD C6 C1 C2 111.000 3.000
IPD C1 C6 H6 108.340 3.000
IPD C1 C6 O6 109.470 3.000
IPD C1 C6 C5 111.000 3.000
IPD H6 C6 O6 109.470 3.000
IPD H6 C6 C5 108.340 3.000
IPD O6 C6 C5 109.470 3.000
IPD C6 O6 HO6 109.470 3.000
IPD C6 C5 H5 108.340 3.000
IPD C6 C5 O5 109.470 3.000
IPD C6 C5 C4 111.000 3.000
IPD H5 C5 O5 109.470 3.000
IPD H5 C5 C4 108.340 3.000
IPD O5 C5 C4 109.470 3.000
IPD C5 O5 HO5 109.470 3.000
IPD C5 C4 H4 108.340 3.000
IPD C5 C4 O4 109.470 3.000
IPD C5 C4 C3 111.000 3.000
IPD H4 C4 O4 109.470 3.000
IPD H4 C4 C3 108.340 3.000
IPD O4 C4 C3 109.470 3.000
IPD C4 O4 HO4 109.470 3.000
IPD C4 C3 H3 108.340 3.000
IPD C4 C3 O3 109.470 3.000
IPD C4 C3 C2 111.000 3.000
IPD H3 C3 O3 109.470 3.000
IPD H3 C3 C2 108.340 3.000
IPD O3 C3 C2 109.470 3.000
IPD C3 O3 HO3 109.470 3.000
IPD C3 C2 H2 108.340 3.000
IPD C3 C2 O2 109.470 3.000
IPD C3 C2 C1 111.000 3.000
IPD H2 C2 O2 109.470 3.000
IPD H2 C2 C1 108.340 3.000
IPD O2 C2 C1 109.470 3.000
IPD C2 O2 HO2 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
IPD var_1 O9 P1 O1 C1 -54.994 20.000 1
IPD var_2 P1 O1 C1 C6 119.981 20.000 1
IPD var_3 O1 C1 C2 C3 180.000 20.000 3
IPD var_4 O1 C1 C6 C5 180.000 20.000 3
IPD var_5 C1 C6 O6 HO6 -179.999 20.000 1
IPD var_6 C1 C6 C5 C4 -60.000 20.000 3
IPD var_7 C6 C5 O5 HO5 179.995 20.000 1
IPD var_8 C6 C5 C4 C3 60.000 20.000 3
IPD var_9 C5 C4 O4 HO4 -60.037 20.000 1
IPD var_10 C5 C4 C3 C2 -60.000 20.000 3
IPD var_11 C4 C3 O3 HO3 -59.998 20.000 1
IPD var_12 C4 C3 C2 O2 -60.000 20.000 3
IPD var_13 C3 C2 O2 HO2 -60.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
IPD chir_01 C1 C2 C6 O1 positiv
IPD chir_02 C2 C1 C3 O2 negativ
IPD chir_03 C3 C2 C4 O3 negativ
IPD chir_04 C4 C3 C5 O4 negativ
IPD chir_05 C5 C4 C6 O5 negativ
IPD chir_06 C6 C1 C5 O6 negativ
# ------------------------------------------------------
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