1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
IZD IZD 'ISOTHIAZOLIDINONE ANALOG ' non-polymer 60 34 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_IZD
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
IZD O70 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
IZD C67 C C 0.000 0.041 -0.550 -1.095
IZD C71 C CH3 0.000 0.091 -2.040 -1.168
IZD H713 H H 0.000 -0.777 -2.444 -0.717
IZD H712 H H 0.000 0.135 -2.341 -2.182
IZD H711 H H 0.000 0.950 -2.389 -0.658
IZD N51 N NH1 0.000 0.046 0.078 -2.328
IZD H51 H H 0.000 0.083 -0.495 -3.158
IZD C48 C CH1 0.000 0.001 1.510 -2.487
IZD H48 H H 0.000 0.505 1.981 -1.631
IZD C4 C CH2 0.000 0.680 1.971 -3.782
IZD H4C1 H H 0.000 0.304 2.969 -4.018
IZD H4C2 H H 0.000 0.391 1.278 -4.575
IZD C5 C CR6 0.000 2.184 2.011 -3.670
IZD C34 C CR16 0.000 2.920 0.884 -3.997
IZD H34 H H 0.000 2.420 -0.018 -4.329
IZD C33 C CR16 0.000 4.310 0.920 -3.894
IZD H33 H H 0.000 4.895 0.045 -4.148
IZD C6 C CR16 0.000 4.947 2.084 -3.465
IZD H6 H H 0.000 6.027 2.113 -3.385
IZD C31 C CR16 0.000 4.193 3.212 -3.139
IZD H31 H H 0.000 4.688 4.117 -2.807
IZD C30 C CR16 0.000 2.802 3.175 -3.242
IZD H30 H H 0.000 2.212 4.047 -2.990
IZD C47 C C 0.000 -1.468 1.919 -2.483
IZD O49 O O 0.000 -2.356 1.224 -2.971
IZD N45 N NH1 0.000 -1.670 3.124 -1.827
IZD H45 H H 0.000 -0.865 3.614 -1.464
IZD C22 C CH1 0.000 -2.976 3.715 -1.637
IZD H22 H H 0.000 -3.737 3.050 -2.069
IZD C25 C C 0.000 -2.984 5.036 -2.394
IZD N27 N NH2 0.000 -4.197 5.299 -2.996
IZD H272 H H 0.000 -4.975 4.647 -2.912
IZD H271 H H 0.000 -4.338 6.152 -3.535
IZD O26 O O 0.000 -2.004 5.769 -2.498
IZD C21 C CH2 0.000 -3.298 3.947 -0.157
IZD H211 H H 0.000 -4.088 4.699 -0.101
IZD H212 H H 0.000 -2.397 4.332 0.324
IZD C14 C CR6 0.000 -3.748 2.689 0.546
IZD C13 C CR16 0.000 -5.097 2.371 0.575
IZD H13 H H 0.000 -5.821 3.019 0.098
IZD C12 C CR16 0.000 -5.512 1.209 1.225
IZD H12 H H 0.000 -6.564 0.951 1.254
IZD C15 C CR16 0.000 -2.803 1.874 1.150
IZD H15 H H 0.000 -1.753 2.136 1.118
IZD C16 C CR16 0.000 -3.220 0.712 1.801
IZD H16 H H 0.000 -2.491 0.068 2.277
IZD C11 C CR6 0.000 -4.574 0.380 1.838
IZD C1 C CH1 0.000 -5.022 -0.873 2.540
IZD H1 H H 0.000 -6.021 -0.684 2.957
IZD S5 S ST 0.000 -5.175 -2.191 1.333
IZD O6 O OS 0.000 -6.518 -2.198 0.794
IZD O7 O OS 0.000 -3.998 -2.246 0.492
IZD N4 N NH1 0.000 -5.038 -3.395 2.568
IZD H4 H H 0.000 -5.256 -4.369 2.412
IZD C3 C C 0.000 -4.590 -2.889 3.829
IZD O9 O O 0.000 -4.564 -3.526 4.869
IZD C2 C CH2 0.000 -4.146 -1.449 3.669
IZD H2C2 H H 0.000 -3.094 -1.385 3.383
IZD H2C1 H H 0.000 -4.308 -0.877 4.585
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
IZD O70 n/a C67 START
IZD C67 O70 N51 .
IZD C71 C67 H711 .
IZD H713 C71 . .
IZD H712 C71 . .
IZD H711 C71 . .
IZD N51 C67 C48 .
IZD H51 N51 . .
IZD C48 N51 C47 .
IZD H48 C48 . .
IZD C4 C48 C5 .
IZD H4C1 C4 . .
IZD H4C2 C4 . .
IZD C5 C4 C34 .
IZD C34 C5 C33 .
IZD H34 C34 . .
IZD C33 C34 C6 .
IZD H33 C33 . .
IZD C6 C33 C31 .
IZD H6 C6 . .
IZD C31 C6 C30 .
IZD H31 C31 . .
IZD C30 C31 H30 .
IZD H30 C30 . .
IZD C47 C48 N45 .
IZD O49 C47 . .
IZD N45 C47 C22 .
IZD H45 N45 . .
IZD C22 N45 C21 .
IZD H22 C22 . .
IZD C25 C22 O26 .
IZD N27 C25 H271 .
IZD H272 N27 . .
IZD H271 N27 . .
IZD O26 C25 . .
IZD C21 C22 C14 .
IZD H211 C21 . .
IZD H212 C21 . .
IZD C14 C21 C15 .
IZD C13 C14 C12 .
IZD H13 C13 . .
IZD C12 C13 H12 .
IZD H12 C12 . .
IZD C15 C14 C16 .
IZD H15 C15 . .
IZD C16 C15 C11 .
IZD H16 C16 . .
IZD C11 C16 C1 .
IZD C1 C11 S5 .
IZD H1 C1 . .
IZD S5 C1 N4 .
IZD O6 S5 . .
IZD O7 S5 . .
IZD N4 S5 C3 .
IZD H4 N4 . .
IZD C3 N4 C2 .
IZD O9 C3 . .
IZD C2 C3 H2C1 .
IZD H2C2 C2 . .
IZD H2C1 C2 . END
IZD C1 C2 . ADD
IZD C11 C12 . ADD
IZD C5 C30 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
IZD C1 C2 single 1.524 0.020
IZD S5 C1 single 1.665 0.020
IZD C1 C11 single 1.480 0.020
IZD H1 C1 single 1.099 0.020
IZD C2 C3 single 1.510 0.020
IZD H2C1 C2 single 1.092 0.020
IZD H2C2 C2 single 1.092 0.020
IZD C3 N4 single 1.330 0.020
IZD O9 C3 double 1.220 0.020
IZD N4 S5 single 1.600 0.020
IZD H4 N4 single 1.010 0.020
IZD O6 S5 double 1.436 0.020
IZD O7 S5 double 1.436 0.020
IZD C11 C12 single 1.390 0.020
IZD C11 C16 double 1.390 0.020
IZD C12 C13 double 1.390 0.020
IZD H12 C12 single 1.083 0.020
IZD C13 C14 single 1.390 0.020
IZD H13 C13 single 1.083 0.020
IZD C15 C14 double 1.390 0.020
IZD C14 C21 single 1.511 0.020
IZD C16 C15 single 1.390 0.020
IZD H15 C15 single 1.083 0.020
IZD H16 C16 single 1.083 0.020
IZD C21 C22 single 1.524 0.020
IZD H211 C21 single 1.092 0.020
IZD H212 C21 single 1.092 0.020
IZD C25 C22 single 1.500 0.020
IZD C22 N45 single 1.450 0.020
IZD H22 C22 single 1.099 0.020
IZD O26 C25 double 1.220 0.020
IZD N27 C25 single 1.332 0.020
IZD H271 N27 single 1.010 0.020
IZD H272 N27 single 1.010 0.020
IZD N45 C47 single 1.330 0.020
IZD H45 N45 single 1.010 0.020
IZD C47 C48 single 1.500 0.020
IZD O49 C47 double 1.220 0.020
IZD C48 N51 single 1.450 0.020
IZD C4 C48 single 1.524 0.020
IZD H48 C48 single 1.099 0.020
IZD N51 C67 single 1.330 0.020
IZD H51 N51 single 1.010 0.020
IZD C5 C4 single 1.511 0.020
IZD H4C1 C4 single 1.092 0.020
IZD H4C2 C4 single 1.092 0.020
IZD C5 C30 single 1.390 0.020
IZD C34 C5 double 1.390 0.020
IZD C30 C31 double 1.390 0.020
IZD H30 C30 single 1.083 0.020
IZD C31 C6 single 1.390 0.020
IZD H31 C31 single 1.083 0.020
IZD C6 C33 double 1.390 0.020
IZD H6 C6 single 1.083 0.020
IZD C33 C34 single 1.390 0.020
IZD H33 C33 single 1.083 0.020
IZD H34 C34 single 1.083 0.020
IZD C67 O70 double 1.220 0.020
IZD C71 C67 single 1.500 0.020
IZD H711 C71 single 1.059 0.020
IZD H712 C71 single 1.059 0.020
IZD H713 C71 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
IZD O70 C67 C71 123.000 3.000
IZD O70 C67 N51 123.000 3.000
IZD C71 C67 N51 116.500 3.000
IZD C67 C71 H713 109.470 3.000
IZD C67 C71 H712 109.470 3.000
IZD C67 C71 H711 109.470 3.000
IZD H713 C71 H712 109.470 3.000
IZD H713 C71 H711 109.470 3.000
IZD H712 C71 H711 109.470 3.000
IZD C67 N51 H51 120.000 3.000
IZD C67 N51 C48 121.500 3.000
IZD H51 N51 C48 118.500 3.000
IZD N51 C48 H48 108.550 3.000
IZD N51 C48 C4 110.000 3.000
IZD N51 C48 C47 111.600 3.000
IZD H48 C48 C4 108.340 3.000
IZD H48 C48 C47 108.810 3.000
IZD C4 C48 C47 109.470 3.000
IZD C48 C4 H4C1 109.470 3.000
IZD C48 C4 H4C2 109.470 3.000
IZD C48 C4 C5 109.470 3.000
IZD H4C1 C4 H4C2 107.900 3.000
IZD H4C1 C4 C5 109.470 3.000
IZD H4C2 C4 C5 109.470 3.000
IZD C4 C5 C34 120.000 3.000
IZD C4 C5 C30 120.000 3.000
IZD C34 C5 C30 120.000 3.000
IZD C5 C34 H34 120.000 3.000
IZD C5 C34 C33 120.000 3.000
IZD H34 C34 C33 120.000 3.000
IZD C34 C33 H33 120.000 3.000
IZD C34 C33 C6 120.000 3.000
IZD H33 C33 C6 120.000 3.000
IZD C33 C6 H6 120.000 3.000
IZD C33 C6 C31 120.000 3.000
IZD H6 C6 C31 120.000 3.000
IZD C6 C31 H31 120.000 3.000
IZD C6 C31 C30 120.000 3.000
IZD H31 C31 C30 120.000 3.000
IZD C31 C30 H30 120.000 3.000
IZD C31 C30 C5 120.000 3.000
IZD H30 C30 C5 120.000 3.000
IZD C48 C47 O49 120.500 3.000
IZD C48 C47 N45 116.500 3.000
IZD O49 C47 N45 123.000 3.000
IZD C47 N45 H45 120.000 3.000
IZD C47 N45 C22 121.500 3.000
IZD H45 N45 C22 118.500 3.000
IZD N45 C22 H22 108.550 3.000
IZD N45 C22 C25 111.600 3.000
IZD N45 C22 C21 110.000 3.000
IZD H22 C22 C25 108.810 3.000
IZD H22 C22 C21 108.340 3.000
IZD C25 C22 C21 109.470 3.000
IZD C22 C25 N27 120.000 3.000
IZD C22 C25 O26 120.500 3.000
IZD N27 C25 O26 123.000 3.000
IZD C25 N27 H272 120.000 3.000
IZD C25 N27 H271 120.000 3.000
IZD H272 N27 H271 120.000 3.000
IZD C22 C21 H211 109.470 3.000
IZD C22 C21 H212 109.470 3.000
IZD C22 C21 C14 109.470 3.000
IZD H211 C21 H212 107.900 3.000
IZD H211 C21 C14 109.470 3.000
IZD H212 C21 C14 109.470 3.000
IZD C21 C14 C13 120.000 3.000
IZD C21 C14 C15 120.000 3.000
IZD C13 C14 C15 120.000 3.000
IZD C14 C13 H13 120.000 3.000
IZD C14 C13 C12 120.000 3.000
IZD H13 C13 C12 120.000 3.000
IZD C13 C12 H12 120.000 3.000
IZD C13 C12 C11 120.000 3.000
IZD H12 C12 C11 120.000 3.000
IZD C14 C15 H15 120.000 3.000
IZD C14 C15 C16 120.000 3.000
IZD H15 C15 C16 120.000 3.000
IZD C15 C16 H16 120.000 3.000
IZD C15 C16 C11 120.000 3.000
IZD H16 C16 C11 120.000 3.000
IZD C16 C11 C1 120.000 3.000
IZD C16 C11 C12 120.000 3.000
IZD C1 C11 C12 120.000 3.000
IZD C11 C1 H1 109.470 3.000
IZD C11 C1 S5 109.500 3.000
IZD C11 C1 C2 109.470 3.000
IZD H1 C1 S5 109.500 3.000
IZD H1 C1 C2 108.340 3.000
IZD S5 C1 C2 109.500 3.000
IZD C1 S5 O6 109.500 3.000
IZD C1 S5 O7 109.500 3.000
IZD C1 S5 N4 109.500 3.000
IZD O6 S5 O7 109.500 3.000
IZD O6 S5 N4 109.500 3.000
IZD O7 S5 N4 109.500 3.000
IZD S5 N4 H4 120.000 3.000
IZD S5 N4 C3 120.000 3.000
IZD H4 N4 C3 120.000 3.000
IZD N4 C3 O9 123.000 3.000
IZD N4 C3 C2 116.500 3.000
IZD O9 C3 C2 120.500 3.000
IZD C3 C2 H2C2 109.470 3.000
IZD C3 C2 H2C1 109.470 3.000
IZD C3 C2 C1 109.470 3.000
IZD H2C2 C2 H2C1 107.900 3.000
IZD H2C2 C2 C1 109.470 3.000
IZD H2C1 C2 C1 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
IZD var_1 O70 C67 C71 H711 -59.278 20.000 1
IZD CONST_1 O70 C67 N51 C48 0.000 0.000 0
IZD var_2 C67 N51 C48 C47 -86.667 20.000 3
IZD var_3 N51 C48 C4 C5 -79.262 20.000 3
IZD var_4 C48 C4 C5 C34 90.002 20.000 2
IZD CONST_2 C4 C5 C30 C31 180.000 0.000 0
IZD CONST_3 C4 C5 C34 C33 180.000 0.000 0
IZD CONST_4 C5 C34 C33 C6 0.000 0.000 0
IZD CONST_5 C34 C33 C6 C31 0.000 0.000 0
IZD CONST_6 C33 C6 C31 C30 0.000 0.000 0
IZD CONST_7 C6 C31 C30 C5 0.000 0.000 0
IZD var_5 N51 C48 C47 N45 142.746 20.000 3
IZD CONST_8 C48 C47 N45 C22 180.000 0.000 0
IZD var_6 C47 N45 C22 C21 122.082 20.000 3
IZD var_7 N45 C22 C25 O26 -35.002 20.000 3
IZD CONST_9 C22 C25 N27 H271 180.000 0.000 0
IZD var_8 N45 C22 C21 C14 -79.423 20.000 3
IZD var_9 C22 C21 C14 C15 90.013 20.000 2
IZD CONST_10 C21 C14 C13 C12 180.000 0.000 0
IZD CONST_11 C14 C13 C12 C11 0.000 0.000 0
IZD CONST_12 C21 C14 C15 C16 180.000 0.000 0
IZD CONST_13 C14 C15 C16 C11 0.000 0.000 0
IZD CONST_14 C15 C16 C11 C1 180.000 0.000 0
IZD CONST_15 C16 C11 C12 C13 0.000 0.000 0
IZD var_10 C16 C11 C1 S5 -95.485 20.000 1
IZD var_11 C11 C1 C2 C3 -150.000 20.000 3
IZD var_12 C11 C1 S5 N4 150.000 20.000 1
IZD var_13 C1 S5 N4 C3 0.000 20.000 1
IZD CONST_16 S5 N4 C3 C2 0.000 0.000 0
IZD var_14 N4 C3 C2 C1 30.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
IZD chir_01 C1 C2 S5 C11 positiv
IZD chir_02 S5 C1 N4 O6 negativ
IZD chir_03 C22 C21 C25 N45 negativ
IZD chir_04 C48 C47 N51 C4 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
IZD plan-1 C3 0.020
IZD plan-1 C2 0.020
IZD plan-1 N4 0.020
IZD plan-1 O9 0.020
IZD plan-1 H4 0.020
IZD plan-2 N4 0.020
IZD plan-2 C3 0.020
IZD plan-2 S5 0.020
IZD plan-2 H4 0.020
IZD plan-3 C11 0.020
IZD plan-3 C1 0.020
IZD plan-3 C12 0.020
IZD plan-3 C16 0.020
IZD plan-3 C13 0.020
IZD plan-3 C14 0.020
IZD plan-3 C15 0.020
IZD plan-3 H12 0.020
IZD plan-3 H13 0.020
IZD plan-3 C21 0.020
IZD plan-3 H15 0.020
IZD plan-3 H16 0.020
IZD plan-4 C25 0.020
IZD plan-4 C22 0.020
IZD plan-4 O26 0.020
IZD plan-4 N27 0.020
IZD plan-4 H272 0.020
IZD plan-4 H271 0.020
IZD plan-5 N27 0.020
IZD plan-5 C25 0.020
IZD plan-5 H271 0.020
IZD plan-5 H272 0.020
IZD plan-6 N45 0.020
IZD plan-6 C22 0.020
IZD plan-6 C47 0.020
IZD plan-6 H45 0.020
IZD plan-7 C47 0.020
IZD plan-7 N45 0.020
IZD plan-7 C48 0.020
IZD plan-7 O49 0.020
IZD plan-7 H45 0.020
IZD plan-8 N51 0.020
IZD plan-8 C48 0.020
IZD plan-8 C67 0.020
IZD plan-8 H51 0.020
IZD plan-9 C5 0.020
IZD plan-9 C4 0.020
IZD plan-9 C30 0.020
IZD plan-9 C34 0.020
IZD plan-9 C31 0.020
IZD plan-9 C6 0.020
IZD plan-9 C33 0.020
IZD plan-9 H30 0.020
IZD plan-9 H31 0.020
IZD plan-9 H6 0.020
IZD plan-9 H33 0.020
IZD plan-9 H34 0.020
IZD plan-10 C67 0.020
IZD plan-10 N51 0.020
IZD plan-10 O70 0.020
IZD plan-10 C71 0.020
IZD plan-10 H51 0.020
# ------------------------------------------------------
|
