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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
JST JST 'BUT-3-ENYL-[5-(4-CHLORO-PHENYL)-3,6-' non-polymer 32 18 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_JST
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
JST CL1 CL CL 0.000 0.000 0.000 0.000
JST C3 C CR6 0.000 -1.577 0.024 0.687
JST C2 C CR16 0.000 -2.524 0.940 0.228
JST H2 H H 0.000 -2.266 1.636 -0.560
JST C4 C CR16 0.000 -1.910 -0.872 1.702
JST H4 H H 0.000 -1.176 -1.584 2.058
JST C5 C CR16 0.000 -3.189 -0.852 2.259
JST H5 H H 0.000 -3.449 -1.547 3.048
JST C6 C CR6 0.000 -4.129 0.064 1.797
JST C1 C CR16 0.000 -3.802 0.960 0.785
JST H1 H H 0.000 -4.539 1.671 0.430
JST C7 C C 0.000 -5.495 0.086 2.392
JST C8 C CH2 0.000 -6.642 0.524 1.508
JST H81 H H 0.000 -6.346 0.428 0.461
JST H82 H H 0.000 -6.884 1.567 1.722
JST N1 N N 0.000 -5.619 -0.221 3.649
JST N2 N NH1 0.000 -6.859 -0.217 4.193
JST HN2 H H 0.000 -6.897 -0.077 5.193
JST C9 C C 0.000 -8.072 -0.379 3.570
JST S1 S S2 0.000 -8.086 -0.506 1.821
JST N3 N N 0.000 -9.212 -0.461 4.178
JST C10 C CH2 0.000 -10.363 -0.642 3.290
JST H101 H H 0.000 -10.236 -1.564 2.719
JST H102 H H 0.000 -10.424 0.205 2.603
JST C11 C CH2 0.000 -11.644 -0.723 4.113
JST H111 H H 0.000 -12.483 -0.829 3.423
JST H112 H H 0.000 -11.748 0.210 4.670
JST C12 C C1 0.000 -11.631 -1.881 5.071
JST H12 H H 0.000 -11.535 -2.873 4.663
JST C13 C C2 0.000 -11.732 -1.754 6.398
JST H132 H H 0.000 -11.825 -0.775 6.847
JST H131 H H 0.000 -11.722 -2.628 7.033
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
JST CL1 n/a C3 START
JST C3 CL1 C4 .
JST C2 C3 H2 .
JST H2 C2 . .
JST C4 C3 C5 .
JST H4 C4 . .
JST C5 C4 C6 .
JST H5 C5 . .
JST C6 C5 C7 .
JST C1 C6 H1 .
JST H1 C1 . .
JST C7 C6 N1 .
JST C8 C7 H82 .
JST H81 C8 . .
JST H82 C8 . .
JST N1 C7 N2 .
JST N2 N1 C9 .
JST HN2 N2 . .
JST C9 N2 N3 .
JST S1 C9 . .
JST N3 C9 C10 .
JST C10 N3 C11 .
JST H101 C10 . .
JST H102 C10 . .
JST C11 C10 C12 .
JST H111 C11 . .
JST H112 C11 . .
JST C12 C11 C13 .
JST H12 C12 . .
JST C13 C12 H131 .
JST H132 C13 . .
JST H131 C13 . END
JST S1 C8 . ADD
JST C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
JST S1 C8 single 1.762 0.020
JST S1 C9 single 1.665 0.020
JST C3 CL1 single 1.795 0.020
JST N2 N1 single 1.320 0.020
JST N1 C7 double 1.260 0.020
JST C9 N2 single 1.330 0.020
JST HN2 N2 single 1.010 0.020
JST N3 C9 double 1.260 0.020
JST C10 N3 single 1.455 0.020
JST C1 C2 double 1.390 0.020
JST C1 C6 single 1.390 0.020
JST H1 C1 single 1.083 0.020
JST C2 C3 single 1.390 0.020
JST H2 C2 single 1.083 0.020
JST C4 C3 double 1.390 0.020
JST C5 C4 single 1.390 0.020
JST H4 C4 single 1.083 0.020
JST C6 C5 double 1.390 0.020
JST H5 C5 single 1.083 0.020
JST C7 C6 single 1.500 0.020
JST C8 C7 single 1.510 0.020
JST H82 C8 single 1.092 0.020
JST H81 C8 single 1.092 0.020
JST C11 C10 single 1.524 0.020
JST H101 C10 single 1.092 0.020
JST H102 C10 single 1.092 0.020
JST C12 C11 single 1.510 0.020
JST H111 C11 single 1.092 0.020
JST H112 C11 single 1.092 0.020
JST C13 C12 double 1.320 0.020
JST H12 C12 single 1.077 0.020
JST H131 C13 single 1.077 0.020
JST H132 C13 single 1.077 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
JST CL1 C3 C2 120.000 3.000
JST CL1 C3 C4 120.000 3.000
JST C2 C3 C4 120.000 3.000
JST C3 C2 H2 120.000 3.000
JST C3 C2 C1 120.000 3.000
JST H2 C2 C1 120.000 3.000
JST C3 C4 H4 120.000 3.000
JST C3 C4 C5 120.000 3.000
JST H4 C4 C5 120.000 3.000
JST C4 C5 H5 120.000 3.000
JST C4 C5 C6 120.000 3.000
JST H5 C5 C6 120.000 3.000
JST C5 C6 C1 120.000 3.000
JST C5 C6 C7 120.000 3.000
JST C1 C6 C7 120.000 3.000
JST C6 C1 H1 120.000 3.000
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JST C6 C7 C8 120.000 3.000
JST C6 C7 N1 120.000 3.000
JST C8 C7 N1 116.500 3.000
JST C7 C8 H81 109.470 3.000
JST C7 C8 H82 109.470 3.000
JST C7 C8 S1 109.500 3.000
JST H81 C8 H82 107.900 3.000
JST H81 C8 S1 109.500 3.000
JST H82 C8 S1 109.500 3.000
JST C7 N1 N2 120.000 3.000
JST N1 N2 HN2 120.000 3.000
JST N1 N2 C9 120.000 3.000
JST HN2 N2 C9 120.000 3.000
JST N2 C9 S1 120.000 3.000
JST N2 C9 N3 120.000 3.000
JST S1 C9 N3 120.000 3.000
JST C9 S1 C8 97.218 3.000
JST C9 N3 C10 127.000 3.000
JST N3 C10 H101 109.470 3.000
JST N3 C10 H102 109.470 3.000
JST N3 C10 C11 105.000 3.000
JST H101 C10 H102 107.900 3.000
JST H101 C10 C11 109.470 3.000
JST H102 C10 C11 109.470 3.000
JST C10 C11 H111 109.470 3.000
JST C10 C11 H112 109.470 3.000
JST C10 C11 C12 109.470 3.000
JST H111 C11 H112 107.900 3.000
JST H111 C11 C12 109.470 3.000
JST H112 C11 C12 109.470 3.000
JST C11 C12 H12 120.000 3.000
JST C11 C12 C13 120.000 3.000
JST H12 C12 C13 120.000 3.000
JST C12 C13 H132 120.000 3.000
JST C12 C13 H131 120.000 3.000
JST H132 C13 H131 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
JST CONST_1 CL1 C3 C2 C1 180.000 0.000 0
JST CONST_2 CL1 C3 C4 C5 180.000 0.000 0
JST CONST_3 C3 C4 C5 C6 0.000 0.000 0
JST CONST_4 C4 C5 C6 C7 180.000 0.000 0
JST CONST_5 C5 C6 C1 C2 0.000 0.000 0
JST CONST_6 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
JST var_1 C5 C6 C7 N1 32.634 20.000 1
JST var_2 C6 C7 C8 S1 150.000 20.000 3
JST CONST_7 C6 C7 N1 N2 180.000 0.000 0
JST var_3 C7 N1 N2 C9 30.000 20.000 1
JST CONST_8 N1 N2 C9 N3 180.000 0.000 0
JST var_4 N2 C9 S1 C8 -30.000 20.000 1
JST var_5 C9 S1 C8 C7 60.000 20.000 1
JST CONST_9 N2 C9 N3 C10 180.000 0.000 0
JST var_6 C9 N3 C10 C11 -179.948 20.000 1
JST var_7 N3 C10 C11 C12 -60.679 20.000 3
JST var_8 C10 C11 C12 C13 119.919 20.000 1
JST CONST_10 C11 C12 C13 H131 179.669 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
JST plan-1 N1 0.020
JST plan-1 N2 0.020
JST plan-1 C7 0.020
JST plan-1 HN2 0.020
JST plan-2 N2 0.020
JST plan-2 N1 0.020
JST plan-2 C9 0.020
JST plan-2 HN2 0.020
JST plan-3 N3 0.020
JST plan-3 C9 0.020
JST plan-3 C10 0.020
JST plan-3 S1 0.020
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JST plan-3 HN2 0.020
JST plan-4 C1 0.020
JST plan-4 C2 0.020
JST plan-4 C6 0.020
JST plan-4 H1 0.020
JST plan-4 C3 0.020
JST plan-4 C4 0.020
JST plan-4 C5 0.020
JST plan-4 H2 0.020
JST plan-4 CL1 0.020
JST plan-4 H4 0.020
JST plan-4 H5 0.020
JST plan-4 C7 0.020
JST plan-5 C7 0.020
JST plan-5 N1 0.020
JST plan-5 C6 0.020
JST plan-5 C8 0.020
JST plan-6 C12 0.020
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JST plan-6 H12 0.020
JST plan-6 H131 0.020
JST plan-6 H132 0.020
# ------------------------------------------------------
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