1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
L3P L3P '2,3-DI-O-PHYTANLY-3-SN-GLYCERO-1-PHO' non-polymer 152 59 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_L3P
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
L3P O6P O OP -0.666 0.000 0.000 0.000
L3P P2 P P 0.000 0.513 -0.961 1.050
L3P O4P O OP -0.666 1.535 -1.873 0.407
L3P O5P O OP -0.666 -0.679 -1.539 1.780
L3P O6 O O2 0.000 1.260 0.094 2.046
L3P C6 C CH2 0.000 2.421 0.780 1.588
L3P H62 H H 0.000 2.174 1.374 0.706
L3P H61 H H 0.000 3.199 0.057 1.333
L3P C5 C CH1 0.000 2.922 1.697 2.695
L3P H5 H H 0.000 3.174 1.099 3.582
L3P O5 O OH1 0.000 4.093 2.364 2.220
L3P H5O H H 0.000 4.821 2.218 2.841
L3P C4 C CH2 0.000 1.878 2.745 3.066
L3P H42 H H 0.000 2.270 3.377 3.865
L3P H41 H H 0.000 0.971 2.244 3.411
L3P O4 O O2 0.000 1.577 3.545 1.934
L3P P1 P P 0.000 0.477 4.748 2.075
L3P O1P O OP -0.500 0.779 5.540 3.292
L3P O2P O OP -0.500 0.352 5.420 0.758
L3P O3 O O2 0.000 -0.871 3.871 2.362
L3P C3 C CH2 0.000 -1.223 2.829 1.459
L3P H32 H H 0.000 -0.416 2.094 1.424
L3P H31 H H 0.000 -1.373 3.250 0.462
L3P C2 C CH1 0.000 -2.508 2.153 1.924
L3P H2 H H 0.000 -3.325 2.888 1.939
L3P O2 O O2 0.000 -2.829 1.099 1.013
L3P C41 C CH2 0.000 -3.019 1.596 -0.302
L3P H412 H H 0.000 -2.106 2.083 -0.649
L3P H411 H H 0.000 -3.841 2.315 -0.310
L3P C42 C CH2 0.000 -3.356 0.428 -1.221
L3P H422 H H 0.000 -4.248 -0.057 -0.821
L3P H421 H H 0.000 -2.516 -0.269 -1.185
L3P C43 C CH1 0.000 -3.611 0.851 -2.679
L3P H43 H H 0.000 -2.701 1.356 -3.033
L3P C45 C CH2 0.000 -3.837 -0.371 -3.597
L3P H452 H H 0.000 -2.944 -0.993 -3.509
L3P H451 H H 0.000 -3.909 0.017 -4.615
L3P C46 C CH2 0.000 -5.081 -1.210 -3.278
L3P H462 H H 0.000 -5.967 -0.583 -3.400
L3P H461 H H 0.000 -5.017 -1.549 -2.242
L3P C47 C CH2 0.000 -5.179 -2.424 -4.211
L3P H472 H H 0.000 -4.292 -3.037 -4.038
L3P H471 H H 0.000 -5.165 -2.046 -5.235
L3P C48 C CH1 0.000 -6.446 -3.275 -3.992
L3P H48 H H 0.000 -7.322 -2.621 -4.105
L3P C50 C CH2 0.000 -6.557 -4.413 -5.032
L3P H502 H H 0.000 -5.711 -5.077 -4.843
L3P H501 H H 0.000 -6.435 -3.940 -6.009
L3P C51 C CH2 0.000 -7.859 -5.222 -5.013
L3P H512 H H 0.000 -8.670 -4.498 -5.116
L3P H511 H H 0.000 -7.913 -5.690 -4.028
L3P C52 C CH2 0.000 -7.991 -6.296 -6.099
L3P H522 H H 0.000 -7.114 -6.939 -6.002
L3P H521 H H 0.000 -7.952 -5.770 -7.056
L3P C53 C CH1 0.000 -9.269 -7.157 -6.036
L3P H53 H H 0.000 -9.229 -7.856 -6.883
L3P C55 C CH2 0.000 -9.399 -8.005 -4.754
L3P H552 H H 0.000 -10.285 -8.630 -4.885
L3P H551 H H 0.000 -9.568 -7.303 -3.935
L3P C56 C CH2 0.000 -8.190 -8.891 -4.429
L3P H562 H H 0.000 -7.305 -8.257 -4.346
L3P H561 H H 0.000 -8.051 -9.605 -5.243
L3P C57 C CH2 0.000 -8.404 -9.648 -3.113
L3P H572 H H 0.000 -9.318 -10.236 -3.220
L3P H571 H H 0.000 -8.541 -8.903 -2.326
L3P C58 C CH1 0.000 -7.233 -10.578 -2.742
L3P H58 H H 0.000 -7.498 -11.115 -1.821
L3P C60 C CH3 0.000 -5.934 -9.811 -2.494
L3P H601 H H 0.000 -5.700 -9.225 -3.345
L3P H602 H H 0.000 -6.052 -9.179 -1.652
L3P H603 H H 0.000 -5.147 -10.497 -2.312
L3P C59 C CH3 0.000 -7.019 -11.609 -3.853
L3P H591 H H 0.000 -7.912 -12.161 -4.001
L3P H592 H H 0.000 -6.759 -11.113 -4.752
L3P H593 H H 0.000 -6.239 -12.271 -3.578
L3P C54 C CH3 0.000 -10.500 -6.267 -6.246
L3P H541 H H 0.000 -10.614 -5.618 -5.415
L3P H542 H H 0.000 -10.376 -5.691 -7.127
L3P H543 H H 0.000 -11.364 -6.873 -6.340
L3P C49 C CH3 0.000 -6.485 -3.888 -2.586
L3P H491 H H 0.000 -6.547 -3.115 -1.863
L3P H492 H H 0.000 -7.331 -4.520 -2.497
L3P H493 H H 0.000 -5.604 -4.454 -2.421
L3P C44 C CH3 0.000 -4.758 1.858 -2.793
L3P H441 H H 0.000 -5.623 1.464 -2.325
L3P H442 H H 0.000 -4.482 2.764 -2.318
L3P H443 H H 0.000 -4.965 2.045 -3.815
L3P C1 C CH2 0.000 -2.346 1.544 3.311
L3P H12 H H 0.000 -2.070 2.322 4.025
L3P H11 H H 0.000 -1.566 0.779 3.288
L3P O1 O O2 0.000 -3.578 0.954 3.702
L3P C11 C CH2 0.000 -3.482 0.349 4.985
L3P H112 H H 0.000 -3.213 1.101 5.730
L3P H111 H H 0.000 -2.721 -0.434 4.969
L3P C12 C CH2 0.000 -4.833 -0.261 5.341
L3P H122 H H 0.000 -5.086 -0.977 4.556
L3P H121 H H 0.000 -5.566 0.549 5.344
L3P C13 C CH1 0.000 -4.845 -0.969 6.707
L3P H13 H H 0.000 -4.560 -0.222 7.461
L3P C14 C CH3 0.000 -3.812 -2.097 6.778
L3P H141 H H 0.000 -3.961 -2.766 5.970
L3P H142 H H 0.000 -2.836 -1.688 6.721
L3P H143 H H 0.000 -3.921 -2.620 7.693
L3P C15 C CH2 0.000 -6.257 -1.473 7.078
L3P H152 H H 0.000 -6.909 -0.597 7.075
L3P H151 H H 0.000 -6.187 -1.870 8.093
L3P C16 C CH2 0.000 -6.836 -2.546 6.146
L3P H162 H H 0.000 -6.192 -3.427 6.184
L3P H161 H H 0.000 -6.854 -2.153 5.128
L3P C17 C CH2 0.000 -8.259 -2.933 6.572
L3P H172 H H 0.000 -8.876 -2.036 6.493
L3P H171 H H 0.000 -8.210 -3.249 7.616
L3P C18 C CH1 0.000 -8.877 -4.061 5.720
L3P H18 H H 0.000 -8.205 -4.929 5.760
L3P C19 C CH3 0.000 -9.033 -3.645 4.251
L3P H191 H H 0.000 -8.077 -3.476 3.827
L3P H192 H H 0.000 -9.524 -4.416 3.714
L3P H193 H H 0.000 -9.606 -2.756 4.193
L3P C20 C CH2 0.000 -10.257 -4.495 6.261
L3P H202 H H 0.000 -10.565 -5.348 5.652
L3P H201 H H 0.000 -10.930 -3.655 6.076
L3P C21 C CH2 0.000 -10.313 -4.878 7.745
L3P H212 H H 0.000 -11.364 -5.065 7.973
L3P H211 H H 0.000 -9.972 -4.002 8.300
L3P C22 C CH2 0.000 -9.477 -6.098 8.150
L3P H222 H H 0.000 -8.456 -5.890 7.822
L3P H221 H H 0.000 -9.875 -6.942 7.583
L3P C23 C CH1 0.000 -9.476 -6.441 9.653
L3P H23 H H 0.000 -9.049 -5.576 10.181
L3P C24 C CH3 0.000 -8.544 -7.629 9.910
L3P H241 H H 0.000 -8.953 -8.503 9.471
L3P H242 H H 0.000 -7.594 -7.434 9.483
L3P H243 H H 0.000 -8.436 -7.778 10.953
L3P C25 C CH2 0.000 -10.879 -6.685 10.247
L3P H252 H H 0.000 -10.741 -6.818 11.322
L3P H251 H H 0.000 -11.241 -7.618 9.810
L3P C26 C CH2 0.000 -11.901 -5.570 9.995
L3P H262 H H 0.000 -11.995 -5.418 8.918
L3P H261 H H 0.000 -11.539 -4.651 10.461
L3P C27 C CH2 0.000 -13.269 -5.938 10.582
L3P H272 H H 0.000 -13.127 -6.121 11.649
L3P H271 H H 0.000 -13.595 -6.860 10.096
L3P C28 C CH1 0.000 -14.336 -4.846 10.384
L3P H28 H H 0.000 -15.260 -5.173 10.880
L3P C30 C CH3 0.000 -14.649 -4.594 8.907
L3P H301 H H 0.000 -13.756 -4.351 8.392
L3P H302 H H 0.000 -15.075 -5.466 8.482
L3P H303 H H 0.000 -15.334 -3.790 8.822
L3P C29 C CH3 0.000 -13.873 -3.543 11.041
L3P H291 H H 0.000 -13.688 -3.713 12.071
L3P H292 H H 0.000 -12.984 -3.207 10.574
L3P H293 H H 0.000 -14.627 -2.806 10.936
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
L3P O6P n/a P2 START
L3P P2 O6P O6 .
L3P O4P P2 . .
L3P O5P P2 . .
L3P O6 P2 C6 .
L3P C6 O6 C5 .
L3P H62 C6 . .
L3P H61 C6 . .
L3P C5 C6 C4 .
L3P H5 C5 . .
L3P O5 C5 H5O .
L3P H5O O5 . .
L3P C4 C5 O4 .
L3P H42 C4 . .
L3P H41 C4 . .
L3P O4 C4 P1 .
L3P P1 O4 O3 .
L3P O1P P1 . .
L3P O2P P1 . .
L3P O3 P1 C3 .
L3P C3 O3 C2 .
L3P H32 C3 . .
L3P H31 C3 . .
L3P C2 C3 C1 .
L3P H2 C2 . .
L3P O2 C2 C41 .
L3P C41 O2 C42 .
L3P H412 C41 . .
L3P H411 C41 . .
L3P C42 C41 C43 .
L3P H422 C42 . .
L3P H421 C42 . .
L3P C43 C42 C44 .
L3P H43 C43 . .
L3P C45 C43 C46 .
L3P H452 C45 . .
L3P H451 C45 . .
L3P C46 C45 C47 .
L3P H462 C46 . .
L3P H461 C46 . .
L3P C47 C46 C48 .
L3P H472 C47 . .
L3P H471 C47 . .
L3P C48 C47 C49 .
L3P H48 C48 . .
L3P C50 C48 C51 .
L3P H502 C50 . .
L3P H501 C50 . .
L3P C51 C50 C52 .
L3P H512 C51 . .
L3P H511 C51 . .
L3P C52 C51 C53 .
L3P H522 C52 . .
L3P H521 C52 . .
L3P C53 C52 C54 .
L3P H53 C53 . .
L3P C55 C53 C56 .
L3P H552 C55 . .
L3P H551 C55 . .
L3P C56 C55 C57 .
L3P H562 C56 . .
L3P H561 C56 . .
L3P C57 C56 C58 .
L3P H572 C57 . .
L3P H571 C57 . .
L3P C58 C57 C59 .
L3P H58 C58 . .
L3P C60 C58 H603 .
L3P H601 C60 . .
L3P H602 C60 . .
L3P H603 C60 . .
L3P C59 C58 H593 .
L3P H591 C59 . .
L3P H592 C59 . .
L3P H593 C59 . .
L3P C54 C53 H543 .
L3P H541 C54 . .
L3P H542 C54 . .
L3P H543 C54 . .
L3P C49 C48 H493 .
L3P H491 C49 . .
L3P H492 C49 . .
L3P H493 C49 . .
L3P C44 C43 H443 .
L3P H441 C44 . .
L3P H442 C44 . .
L3P H443 C44 . .
L3P C1 C2 O1 .
L3P H12 C1 . .
L3P H11 C1 . .
L3P O1 C1 C11 .
L3P C11 O1 C12 .
L3P H112 C11 . .
L3P H111 C11 . .
L3P C12 C11 C13 .
L3P H122 C12 . .
L3P H121 C12 . .
L3P C13 C12 C15 .
L3P H13 C13 . .
L3P C14 C13 H143 .
L3P H141 C14 . .
L3P H142 C14 . .
L3P H143 C14 . .
L3P C15 C13 C16 .
L3P H152 C15 . .
L3P H151 C15 . .
L3P C16 C15 C17 .
L3P H162 C16 . .
L3P H161 C16 . .
L3P C17 C16 C18 .
L3P H172 C17 . .
L3P H171 C17 . .
L3P C18 C17 C20 .
L3P H18 C18 . .
L3P C19 C18 H193 .
L3P H191 C19 . .
L3P H192 C19 . .
L3P H193 C19 . .
L3P C20 C18 C21 .
L3P H202 C20 . .
L3P H201 C20 . .
L3P C21 C20 C22 .
L3P H212 C21 . .
L3P H211 C21 . .
L3P C22 C21 C23 .
L3P H222 C22 . .
L3P H221 C22 . .
L3P C23 C22 C25 .
L3P H23 C23 . .
L3P C24 C23 H243 .
L3P H241 C24 . .
L3P H242 C24 . .
L3P H243 C24 . .
L3P C25 C23 C26 .
L3P H252 C25 . .
L3P H251 C25 . .
L3P C26 C25 C27 .
L3P H262 C26 . .
L3P H261 C26 . .
L3P C27 C26 C28 .
L3P H272 C27 . .
L3P H271 C27 . .
L3P C28 C27 C29 .
L3P H28 C28 . .
L3P C30 C28 H303 .
L3P H301 C30 . .
L3P H302 C30 . .
L3P H303 C30 . .
L3P C29 C28 H293 .
L3P H291 C29 . .
L3P H292 C29 . .
L3P H293 C29 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
L3P C1 C2 single 1.524 0.020
L3P O1 C1 single 1.426 0.020
L3P H12 C1 single 1.092 0.020
L3P H11 C1 single 1.092 0.020
L3P C2 C3 single 1.524 0.020
L3P O2 C2 single 1.426 0.020
L3P H2 C2 single 1.099 0.020
L3P C3 O3 single 1.426 0.020
L3P H32 C3 single 1.092 0.020
L3P H31 C3 single 1.092 0.020
L3P C4 C5 single 1.524 0.020
L3P O4 C4 single 1.426 0.020
L3P H42 C4 single 1.092 0.020
L3P H41 C4 single 1.092 0.020
L3P C5 C6 single 1.524 0.020
L3P O5 C5 single 1.432 0.020
L3P H5 C5 single 1.099 0.020
L3P C6 O6 single 1.426 0.020
L3P H62 C6 single 1.092 0.020
L3P H61 C6 single 1.092 0.020
L3P C11 O1 single 1.426 0.020
L3P C41 O2 single 1.426 0.020
L3P O3 P1 single 1.610 0.020
L3P P1 O4 single 1.610 0.020
L3P H5O O5 single 0.967 0.020
L3P O6 P2 single 1.610 0.020
L3P O1P P1 deloc 1.510 0.020
L3P O2P P1 deloc 1.510 0.020
L3P O4P P2 deloc 1.510 0.020
L3P O5P P2 deloc 1.510 0.020
L3P P2 O6P deloc 1.510 0.020
L3P C12 C11 single 1.524 0.020
L3P H112 C11 single 1.092 0.020
L3P H111 C11 single 1.092 0.020
L3P C13 C12 single 1.524 0.020
L3P H122 C12 single 1.092 0.020
L3P H121 C12 single 1.092 0.020
L3P C14 C13 single 1.524 0.020
L3P C15 C13 single 1.524 0.020
L3P H13 C13 single 1.099 0.020
L3P H143 C14 single 1.059 0.020
L3P H142 C14 single 1.059 0.020
L3P H141 C14 single 1.059 0.020
L3P C16 C15 single 1.524 0.020
L3P H152 C15 single 1.092 0.020
L3P H151 C15 single 1.092 0.020
L3P C17 C16 single 1.524 0.020
L3P H162 C16 single 1.092 0.020
L3P H161 C16 single 1.092 0.020
L3P C18 C17 single 1.524 0.020
L3P H172 C17 single 1.092 0.020
L3P H171 C17 single 1.092 0.020
L3P C19 C18 single 1.524 0.020
L3P C20 C18 single 1.524 0.020
L3P H18 C18 single 1.099 0.020
L3P H193 C19 single 1.059 0.020
L3P H192 C19 single 1.059 0.020
L3P H191 C19 single 1.059 0.020
L3P C21 C20 single 1.524 0.020
L3P H202 C20 single 1.092 0.020
L3P H201 C20 single 1.092 0.020
L3P C22 C21 single 1.524 0.020
L3P H212 C21 single 1.092 0.020
L3P H211 C21 single 1.092 0.020
L3P C23 C22 single 1.524 0.020
L3P H222 C22 single 1.092 0.020
L3P H221 C22 single 1.092 0.020
L3P C24 C23 single 1.524 0.020
L3P C25 C23 single 1.524 0.020
L3P H23 C23 single 1.099 0.020
L3P H243 C24 single 1.059 0.020
L3P H242 C24 single 1.059 0.020
L3P H241 C24 single 1.059 0.020
L3P C26 C25 single 1.524 0.020
L3P H252 C25 single 1.092 0.020
L3P H251 C25 single 1.092 0.020
L3P C27 C26 single 1.524 0.020
L3P H262 C26 single 1.092 0.020
L3P H261 C26 single 1.092 0.020
L3P C28 C27 single 1.524 0.020
L3P H272 C27 single 1.092 0.020
L3P H271 C27 single 1.092 0.020
L3P C29 C28 single 1.524 0.020
L3P C30 C28 single 1.524 0.020
L3P H28 C28 single 1.099 0.020
L3P H293 C29 single 1.059 0.020
L3P H292 C29 single 1.059 0.020
L3P H291 C29 single 1.059 0.020
L3P H303 C30 single 1.059 0.020
L3P H302 C30 single 1.059 0.020
L3P H301 C30 single 1.059 0.020
L3P C42 C41 single 1.524 0.020
L3P H412 C41 single 1.092 0.020
L3P H411 C41 single 1.092 0.020
L3P C43 C42 single 1.524 0.020
L3P H422 C42 single 1.092 0.020
L3P H421 C42 single 1.092 0.020
L3P C44 C43 single 1.524 0.020
L3P C45 C43 single 1.524 0.020
L3P H43 C43 single 1.099 0.020
L3P H443 C44 single 1.059 0.020
L3P H442 C44 single 1.059 0.020
L3P H441 C44 single 1.059 0.020
L3P C46 C45 single 1.524 0.020
L3P H452 C45 single 1.092 0.020
L3P H451 C45 single 1.092 0.020
L3P C47 C46 single 1.524 0.020
L3P H462 C46 single 1.092 0.020
L3P H461 C46 single 1.092 0.020
L3P C48 C47 single 1.524 0.020
L3P H472 C47 single 1.092 0.020
L3P H471 C47 single 1.092 0.020
L3P C49 C48 single 1.524 0.020
L3P C50 C48 single 1.524 0.020
L3P H48 C48 single 1.099 0.020
L3P H493 C49 single 1.059 0.020
L3P H492 C49 single 1.059 0.020
L3P H491 C49 single 1.059 0.020
L3P C51 C50 single 1.524 0.020
L3P H502 C50 single 1.092 0.020
L3P H501 C50 single 1.092 0.020
L3P C52 C51 single 1.524 0.020
L3P H512 C51 single 1.092 0.020
L3P H511 C51 single 1.092 0.020
L3P C53 C52 single 1.524 0.020
L3P H522 C52 single 1.092 0.020
L3P H521 C52 single 1.092 0.020
L3P C54 C53 single 1.524 0.020
L3P C55 C53 single 1.524 0.020
L3P H53 C53 single 1.099 0.020
L3P H543 C54 single 1.059 0.020
L3P H542 C54 single 1.059 0.020
L3P H541 C54 single 1.059 0.020
L3P C56 C55 single 1.524 0.020
L3P H552 C55 single 1.092 0.020
L3P H551 C55 single 1.092 0.020
L3P C57 C56 single 1.524 0.020
L3P H562 C56 single 1.092 0.020
L3P H561 C56 single 1.092 0.020
L3P C58 C57 single 1.524 0.020
L3P H572 C57 single 1.092 0.020
L3P H571 C57 single 1.092 0.020
L3P C59 C58 single 1.524 0.020
L3P C60 C58 single 1.524 0.020
L3P H58 C58 single 1.099 0.020
L3P H593 C59 single 1.059 0.020
L3P H592 C59 single 1.059 0.020
L3P H591 C59 single 1.059 0.020
L3P H603 C60 single 1.059 0.020
L3P H602 C60 single 1.059 0.020
L3P H601 C60 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
L3P O6P P2 O4P 119.900 3.000
L3P O6P P2 O5P 119.900 3.000
L3P O6P P2 O6 108.200 3.000
L3P O4P P2 O5P 119.900 3.000
L3P O4P P2 O6 108.200 3.000
L3P O5P P2 O6 108.200 3.000
L3P P2 O6 C6 120.500 3.000
L3P O6 C6 H62 109.470 3.000
L3P O6 C6 H61 109.470 3.000
L3P O6 C6 C5 109.470 3.000
L3P H62 C6 H61 107.900 3.000
L3P H62 C6 C5 109.470 3.000
L3P H61 C6 C5 109.470 3.000
L3P C6 C5 H5 108.340 3.000
L3P C6 C5 O5 109.470 3.000
L3P C6 C5 C4 109.470 3.000
L3P H5 C5 O5 109.470 3.000
L3P H5 C5 C4 108.340 3.000
L3P O5 C5 C4 109.470 3.000
L3P C5 O5 H5O 109.470 3.000
L3P C5 C4 H42 109.470 3.000
L3P C5 C4 H41 109.470 3.000
L3P C5 C4 O4 109.470 3.000
L3P H42 C4 H41 107.900 3.000
L3P H42 C4 O4 109.470 3.000
L3P H41 C4 O4 109.470 3.000
L3P C4 O4 P1 120.500 3.000
L3P O4 P1 O1P 108.200 3.000
L3P O4 P1 O2P 108.200 3.000
L3P O4 P1 O3 102.600 3.000
L3P O1P P1 O2P 119.900 3.000
L3P O1P P1 O3 108.200 3.000
L3P O2P P1 O3 108.200 3.000
L3P P1 O3 C3 120.500 3.000
L3P O3 C3 H32 109.470 3.000
L3P O3 C3 H31 109.470 3.000
L3P O3 C3 C2 109.470 3.000
L3P H32 C3 H31 107.900 3.000
L3P H32 C3 C2 109.470 3.000
L3P H31 C3 C2 109.470 3.000
L3P C3 C2 H2 108.340 3.000
L3P C3 C2 O2 109.470 3.000
L3P C3 C2 C1 109.470 3.000
L3P H2 C2 O2 109.470 3.000
L3P H2 C2 C1 108.340 3.000
L3P O2 C2 C1 109.470 3.000
L3P C2 O2 C41 111.800 3.000
L3P O2 C41 H412 109.470 3.000
L3P O2 C41 H411 109.470 3.000
L3P O2 C41 C42 109.470 3.000
L3P H412 C41 H411 107.900 3.000
L3P H412 C41 C42 109.470 3.000
L3P H411 C41 C42 109.470 3.000
L3P C41 C42 H422 109.470 3.000
L3P C41 C42 H421 109.470 3.000
L3P C41 C42 C43 111.000 3.000
L3P H422 C42 H421 107.900 3.000
L3P H422 C42 C43 109.470 3.000
L3P H421 C42 C43 109.470 3.000
L3P C42 C43 H43 108.340 3.000
L3P C42 C43 C45 109.470 3.000
L3P C42 C43 C44 111.000 3.000
L3P H43 C43 C45 108.340 3.000
L3P H43 C43 C44 108.340 3.000
L3P C45 C43 C44 111.000 3.000
L3P C43 C45 H452 109.470 3.000
L3P C43 C45 H451 109.470 3.000
L3P C43 C45 C46 111.000 3.000
L3P H452 C45 H451 107.900 3.000
L3P H452 C45 C46 109.470 3.000
L3P H451 C45 C46 109.470 3.000
L3P C45 C46 H462 109.470 3.000
L3P C45 C46 H461 109.470 3.000
L3P C45 C46 C47 111.000 3.000
L3P H462 C46 H461 107.900 3.000
L3P H462 C46 C47 109.470 3.000
L3P H461 C46 C47 109.470 3.000
L3P C46 C47 H472 109.470 3.000
L3P C46 C47 H471 109.470 3.000
L3P C46 C47 C48 111.000 3.000
L3P H472 C47 H471 107.900 3.000
L3P H472 C47 C48 109.470 3.000
L3P H471 C47 C48 109.470 3.000
L3P C47 C48 H48 108.340 3.000
L3P C47 C48 C50 109.470 3.000
L3P C47 C48 C49 111.000 3.000
L3P H48 C48 C50 108.340 3.000
L3P H48 C48 C49 108.340 3.000
L3P C50 C48 C49 111.000 3.000
L3P C48 C50 H502 109.470 3.000
L3P C48 C50 H501 109.470 3.000
L3P C48 C50 C51 111.000 3.000
L3P H502 C50 H501 107.900 3.000
L3P H502 C50 C51 109.470 3.000
L3P H501 C50 C51 109.470 3.000
L3P C50 C51 H512 109.470 3.000
L3P C50 C51 H511 109.470 3.000
L3P C50 C51 C52 111.000 3.000
L3P H512 C51 H511 107.900 3.000
L3P H512 C51 C52 109.470 3.000
L3P H511 C51 C52 109.470 3.000
L3P C51 C52 H522 109.470 3.000
L3P C51 C52 H521 109.470 3.000
L3P C51 C52 C53 111.000 3.000
L3P H522 C52 H521 107.900 3.000
L3P H522 C52 C53 109.470 3.000
L3P H521 C52 C53 109.470 3.000
L3P C52 C53 H53 108.340 3.000
L3P C52 C53 C55 109.470 3.000
L3P C52 C53 C54 111.000 3.000
L3P H53 C53 C55 108.340 3.000
L3P H53 C53 C54 108.340 3.000
L3P C55 C53 C54 111.000 3.000
L3P C53 C55 H552 109.470 3.000
L3P C53 C55 H551 109.470 3.000
L3P C53 C55 C56 111.000 3.000
L3P H552 C55 H551 107.900 3.000
L3P H552 C55 C56 109.470 3.000
L3P H551 C55 C56 109.470 3.000
L3P C55 C56 H562 109.470 3.000
L3P C55 C56 H561 109.470 3.000
L3P C55 C56 C57 111.000 3.000
L3P H562 C56 H561 107.900 3.000
L3P H562 C56 C57 109.470 3.000
L3P H561 C56 C57 109.470 3.000
L3P C56 C57 H572 109.470 3.000
L3P C56 C57 H571 109.470 3.000
L3P C56 C57 C58 111.000 3.000
L3P H572 C57 H571 107.900 3.000
L3P H572 C57 C58 109.470 3.000
L3P H571 C57 C58 109.470 3.000
L3P C57 C58 H58 108.340 3.000
L3P C57 C58 C60 111.000 3.000
L3P C57 C58 C59 111.000 3.000
L3P H58 C58 C60 108.340 3.000
L3P H58 C58 C59 108.340 3.000
L3P C60 C58 C59 111.000 3.000
L3P C58 C60 H601 109.470 3.000
L3P C58 C60 H602 109.470 3.000
L3P C58 C60 H603 109.470 3.000
L3P H601 C60 H602 109.470 3.000
L3P H601 C60 H603 109.470 3.000
L3P H602 C60 H603 109.470 3.000
L3P C58 C59 H591 109.470 3.000
L3P C58 C59 H592 109.470 3.000
L3P C58 C59 H593 109.470 3.000
L3P H591 C59 H592 109.470 3.000
L3P H591 C59 H593 109.470 3.000
L3P H592 C59 H593 109.470 3.000
L3P C53 C54 H541 109.470 3.000
L3P C53 C54 H542 109.470 3.000
L3P C53 C54 H543 109.470 3.000
L3P H541 C54 H542 109.470 3.000
L3P H541 C54 H543 109.470 3.000
L3P H542 C54 H543 109.470 3.000
L3P C48 C49 H491 109.470 3.000
L3P C48 C49 H492 109.470 3.000
L3P C48 C49 H493 109.470 3.000
L3P H491 C49 H492 109.470 3.000
L3P H491 C49 H493 109.470 3.000
L3P H492 C49 H493 109.470 3.000
L3P C43 C44 H441 109.470 3.000
L3P C43 C44 H442 109.470 3.000
L3P C43 C44 H443 109.470 3.000
L3P H441 C44 H442 109.470 3.000
L3P H441 C44 H443 109.470 3.000
L3P H442 C44 H443 109.470 3.000
L3P C2 C1 H12 109.470 3.000
L3P C2 C1 H11 109.470 3.000
L3P C2 C1 O1 109.470 3.000
L3P H12 C1 H11 107.900 3.000
L3P H12 C1 O1 109.470 3.000
L3P H11 C1 O1 109.470 3.000
L3P C1 O1 C11 111.800 3.000
L3P O1 C11 H112 109.470 3.000
L3P O1 C11 H111 109.470 3.000
L3P O1 C11 C12 109.470 3.000
L3P H112 C11 H111 107.900 3.000
L3P H112 C11 C12 109.470 3.000
L3P H111 C11 C12 109.470 3.000
L3P C11 C12 H122 109.470 3.000
L3P C11 C12 H121 109.470 3.000
L3P C11 C12 C13 111.000 3.000
L3P H122 C12 H121 107.900 3.000
L3P H122 C12 C13 109.470 3.000
L3P H121 C12 C13 109.470 3.000
L3P C12 C13 H13 108.340 3.000
L3P C12 C13 C14 111.000 3.000
L3P C12 C13 C15 109.470 3.000
L3P H13 C13 C14 108.340 3.000
L3P H13 C13 C15 108.340 3.000
L3P C14 C13 C15 111.000 3.000
L3P C13 C14 H141 109.470 3.000
L3P C13 C14 H142 109.470 3.000
L3P C13 C14 H143 109.470 3.000
L3P H141 C14 H142 109.470 3.000
L3P H141 C14 H143 109.470 3.000
L3P H142 C14 H143 109.470 3.000
L3P C13 C15 H152 109.470 3.000
L3P C13 C15 H151 109.470 3.000
L3P C13 C15 C16 111.000 3.000
L3P H152 C15 H151 107.900 3.000
L3P H152 C15 C16 109.470 3.000
L3P H151 C15 C16 109.470 3.000
L3P C15 C16 H162 109.470 3.000
L3P C15 C16 H161 109.470 3.000
L3P C15 C16 C17 111.000 3.000
L3P H162 C16 H161 107.900 3.000
L3P H162 C16 C17 109.470 3.000
L3P H161 C16 C17 109.470 3.000
L3P C16 C17 H172 109.470 3.000
L3P C16 C17 H171 109.470 3.000
L3P C16 C17 C18 111.000 3.000
L3P H172 C17 H171 107.900 3.000
L3P H172 C17 C18 109.470 3.000
L3P H171 C17 C18 109.470 3.000
L3P C17 C18 H18 108.340 3.000
L3P C17 C18 C19 111.000 3.000
L3P C17 C18 C20 109.470 3.000
L3P H18 C18 C19 108.340 3.000
L3P H18 C18 C20 108.340 3.000
L3P C19 C18 C20 111.000 3.000
L3P C18 C19 H191 109.470 3.000
L3P C18 C19 H192 109.470 3.000
L3P C18 C19 H193 109.470 3.000
L3P H191 C19 H192 109.470 3.000
L3P H191 C19 H193 109.470 3.000
L3P H192 C19 H193 109.470 3.000
L3P C18 C20 H202 109.470 3.000
L3P C18 C20 H201 109.470 3.000
L3P C18 C20 C21 111.000 3.000
L3P H202 C20 H201 107.900 3.000
L3P H202 C20 C21 109.470 3.000
L3P H201 C20 C21 109.470 3.000
L3P C20 C21 H212 109.470 3.000
L3P C20 C21 H211 109.470 3.000
L3P C20 C21 C22 111.000 3.000
L3P H212 C21 H211 107.900 3.000
L3P H212 C21 C22 109.470 3.000
L3P H211 C21 C22 109.470 3.000
L3P C21 C22 H222 109.470 3.000
L3P C21 C22 H221 109.470 3.000
L3P C21 C22 C23 111.000 3.000
L3P H222 C22 H221 107.900 3.000
L3P H222 C22 C23 109.470 3.000
L3P H221 C22 C23 109.470 3.000
L3P C22 C23 H23 108.340 3.000
L3P C22 C23 C24 111.000 3.000
L3P C22 C23 C25 109.470 3.000
L3P H23 C23 C24 108.340 3.000
L3P H23 C23 C25 108.340 3.000
L3P C24 C23 C25 111.000 3.000
L3P C23 C24 H241 109.470 3.000
L3P C23 C24 H242 109.470 3.000
L3P C23 C24 H243 109.470 3.000
L3P H241 C24 H242 109.470 3.000
L3P H241 C24 H243 109.470 3.000
L3P H242 C24 H243 109.470 3.000
L3P C23 C25 H252 109.470 3.000
L3P C23 C25 H251 109.470 3.000
L3P C23 C25 C26 111.000 3.000
L3P H252 C25 H251 107.900 3.000
L3P H252 C25 C26 109.470 3.000
L3P H251 C25 C26 109.470 3.000
L3P C25 C26 H262 109.470 3.000
L3P C25 C26 H261 109.470 3.000
L3P C25 C26 C27 111.000 3.000
L3P H262 C26 H261 107.900 3.000
L3P H262 C26 C27 109.470 3.000
L3P H261 C26 C27 109.470 3.000
L3P C26 C27 H272 109.470 3.000
L3P C26 C27 H271 109.470 3.000
L3P C26 C27 C28 111.000 3.000
L3P H272 C27 H271 107.900 3.000
L3P H272 C27 C28 109.470 3.000
L3P H271 C27 C28 109.470 3.000
L3P C27 C28 H28 108.340 3.000
L3P C27 C28 C30 111.000 3.000
L3P C27 C28 C29 111.000 3.000
L3P H28 C28 C30 108.340 3.000
L3P H28 C28 C29 108.340 3.000
L3P C30 C28 C29 111.000 3.000
L3P C28 C30 H301 109.470 3.000
L3P C28 C30 H302 109.470 3.000
L3P C28 C30 H303 109.470 3.000
L3P H301 C30 H302 109.470 3.000
L3P H301 C30 H303 109.470 3.000
L3P H302 C30 H303 109.470 3.000
L3P C28 C29 H291 109.470 3.000
L3P C28 C29 H292 109.470 3.000
L3P C28 C29 H293 109.470 3.000
L3P H291 C29 H292 109.470 3.000
L3P H291 C29 H293 109.470 3.000
L3P H292 C29 H293 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
L3P var_1 O6P P2 O6 C6 -67.136 20.000 1
L3P var_2 P2 O6 C6 C5 -179.985 20.000 1
L3P var_3 O6 C6 C5 C4 -61.228 20.000 3
L3P var_4 C6 C5 O5 H5O -125.447 20.000 1
L3P var_5 C6 C5 C4 O4 -60.242 20.000 3
L3P var_6 C5 C4 O4 P1 179.988 20.000 1
L3P var_7 C4 O4 P1 O3 -65.739 20.000 1
L3P var_8 O4 P1 O3 C3 -53.471 20.000 1
L3P var_9 P1 O3 C3 C2 179.981 20.000 1
L3P var_10 O3 C3 C2 C1 -60.229 20.000 3
L3P var_11 C3 C2 O2 C41 -59.994 20.000 1
L3P var_12 C2 O2 C41 C42 179.958 20.000 1
L3P var_13 O2 C41 C42 C43 178.978 20.000 3
L3P var_14 C41 C42 C43 C44 -58.596 20.000 3
L3P var_15 C42 C43 C45 C46 63.764 20.000 3
L3P var_16 C43 C45 C46 C47 -177.766 20.000 3
L3P var_17 C45 C46 C47 C48 -177.125 20.000 3
L3P var_18 C46 C47 C48 C49 -62.731 20.000 3
L3P var_19 C47 C48 C50 C51 -173.101 20.000 3
L3P var_20 C48 C50 C51 C52 176.731 20.000 3
L3P var_21 C50 C51 C52 C53 177.047 20.000 3
L3P var_22 C51 C52 C53 C54 62.917 20.000 3
L3P var_23 C52 C53 C55 C56 -52.847 20.000 3
L3P var_24 C53 C55 C56 C57 177.920 20.000 3
L3P var_25 C55 C56 C57 C58 178.913 20.000 3
L3P var_26 C56 C57 C58 C59 -58.994 20.000 3
L3P var_27 C57 C58 C60 H603 -175.962 20.000 3
L3P var_28 C57 C58 C59 H593 -177.802 20.000 3
L3P var_29 C52 C53 C54 H543 172.013 20.000 3
L3P var_30 C47 C48 C49 H493 -55.902 20.000 3
L3P var_31 C42 C43 C44 H443 -174.232 20.000 3
L3P var_32 C3 C2 C1 O1 178.818 20.000 3
L3P var_33 C2 C1 O1 C11 179.106 20.000 1
L3P var_34 C1 O1 C11 C12 179.993 20.000 1
L3P var_35 O1 C11 C12 C13 179.038 20.000 3
L3P var_36 C11 C12 C13 C15 175.469 20.000 3
L3P var_37 C12 C13 C14 H143 -174.214 20.000 3
L3P var_38 C12 C13 C15 C16 63.695 20.000 3
L3P var_39 C13 C15 C16 C17 -177.744 20.000 3
L3P var_40 C15 C16 C17 C18 -177.105 20.000 3
L3P var_41 C16 C17 C18 C20 175.159 20.000 3
L3P var_42 C17 C18 C19 H193 -55.873 20.000 3
L3P var_43 C17 C18 C20 C21 -53.092 20.000 3
L3P var_44 C18 C20 C21 C22 -63.291 20.000 3
L3P var_45 C20 C21 C22 C23 177.031 20.000 3
L3P var_46 C21 C22 C23 C25 57.106 20.000 3
L3P var_47 C22 C23 C24 H243 172.065 20.000 3
L3P var_48 C22 C23 C25 C26 -52.924 20.000 3
L3P var_49 C23 C25 C26 C27 177.958 20.000 3
L3P var_50 C25 C26 C27 C28 178.987 20.000 3
L3P var_51 C26 C27 C28 C29 -58.985 20.000 3
L3P var_52 C27 C28 C30 H303 -175.968 20.000 3
L3P var_53 C27 C28 C29 H293 -177.769 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
L3P chir_01 C2 C1 C3 O2 negativ
L3P chir_02 C5 C4 C6 O5 negativ
L3P chir_03 C13 C12 C14 C15 positiv
L3P chir_04 C18 C17 C19 C20 positiv
L3P chir_05 C23 C22 C24 C25 positiv
L3P chir_06 C28 C27 C29 C30 negativ
L3P chir_07 C43 C42 C44 C45 positiv
L3P chir_08 C48 C47 C49 C50 positiv
L3P chir_09 C53 C52 C54 C55 positiv
L3P chir_10 C58 C57 C59 C60 negativ
# ------------------------------------------------------
|
