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291
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
LGD LGD '6-[BIS(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)AMINO]-4' non-polymer 35 26 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_LGD
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
LGD O21 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
LGD C2 C CR6 0.000 -0.992 0.727 -0.027
LGD C3 C CR16 0.000 -0.829 2.202 -0.084
LGD H3 H H 0.000 0.171 2.618 -0.100
LGD C4 C CR6 0.000 -1.879 3.040 -0.116
LGD C11 C CT 0.000 -1.674 4.527 -0.171
LGD F3 F F 0.000 -0.985 4.879 -1.274
LGD F2 F F 0.000 -0.987 4.958 0.904
LGD F1 F F 0.000 -2.857 5.172 -0.196
LGD C5 C CR66 0.000 -3.250 2.486 -0.096
LGD C10 C CR66 0.000 -3.413 1.094 -0.043
LGD N1 N NR16 0.000 -2.285 0.256 -0.011
LGD HN1 H H 0.000 -2.436 -0.772 0.028
LGD C9 C CR16 0.000 -4.686 0.514 -0.022
LGD H9 H H 0.000 -4.792 -0.563 0.019
LGD C8 C CR16 0.000 -5.817 1.326 -0.055
LGD H8 H H 0.000 -6.805 0.883 -0.040
LGD C7 C CR6 0.000 -5.673 2.711 -0.107
LGD C6 C CR16 0.000 -4.400 3.288 -0.127
LGD H6 H H 0.000 -4.301 4.366 -0.168
LGD N13 N N 0.000 -6.819 3.534 -0.139
LGD C12 C CH2 0.000 -7.778 3.415 -1.219
LGD H122 H H 0.000 -8.735 3.812 -0.873
LGD H121 H H 0.000 -7.892 2.356 -1.462
LGD C15 C CT 0.000 -7.332 4.169 -2.445
LGD F6 F F 0.000 -6.153 3.703 -2.909
LGD F5 F F 0.000 -7.191 5.488 -2.190
LGD F4 F F 0.000 -8.241 4.040 -3.437
LGD C14 C CH2 0.000 -7.057 4.501 0.915
LGD H142 H H 0.000 -7.722 5.275 0.528
LGD H141 H H 0.000 -6.100 4.949 1.192
LGD C16 C CT 0.000 -7.683 3.858 2.128
LGD F7 F F 0.000 -7.892 4.779 3.095
LGD F8 F F 0.000 -8.876 3.301 1.829
LGD F9 F F 0.000 -6.888 2.896 2.643
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
LGD O21 n/a C2 START
LGD C2 O21 C3 .
LGD C3 C2 C4 .
LGD H3 C3 . .
LGD C4 C3 C5 .
LGD C11 C4 F1 .
LGD F3 C11 . .
LGD F2 C11 . .
LGD F1 C11 . .
LGD C5 C4 C10 .
LGD C10 C5 C9 .
LGD N1 C10 HN1 .
LGD HN1 N1 . .
LGD C9 C10 C8 .
LGD H9 C9 . .
LGD C8 C9 C7 .
LGD H8 C8 . .
LGD C7 C8 N13 .
LGD C6 C7 H6 .
LGD H6 C6 . .
LGD N13 C7 C14 .
LGD C12 N13 C15 .
LGD H122 C12 . .
LGD H121 C12 . .
LGD C15 C12 F4 .
LGD F6 C15 . .
LGD F5 C15 . .
LGD F4 C15 . .
LGD C14 N13 C16 .
LGD H142 C14 . .
LGD H141 C14 . .
LGD C16 C14 F9 .
LGD F7 C16 . .
LGD F8 C16 . .
LGD F9 C16 . END
LGD N1 C2 . ADD
LGD C5 C6 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
LGD HN1 N1 single 1.040 0.020
LGD N1 C2 single 1.337 0.020
LGD N1 C10 single 1.337 0.020
LGD C2 O21 double 1.250 0.020
LGD C3 C2 single 1.390 0.020
LGD H3 C3 single 1.083 0.020
LGD C4 C3 double 1.390 0.020
LGD C5 C4 single 1.490 0.020
LGD C11 C4 single 1.500 0.020
LGD F1 C11 single 1.320 0.020
LGD F2 C11 single 1.320 0.020
LGD F3 C11 single 1.320 0.020
LGD C10 C5 double 1.490 0.020
LGD C5 C6 single 1.390 0.020
LGD C6 C7 double 1.390 0.020
LGD H6 C6 single 1.083 0.020
LGD C7 C8 single 1.390 0.020
LGD N13 C7 single 1.400 0.020
LGD C8 C9 double 1.390 0.020
LGD H8 C8 single 1.083 0.020
LGD C9 C10 single 1.390 0.020
LGD H9 C9 single 1.083 0.020
LGD C12 N13 single 1.455 0.020
LGD H121 C12 single 1.092 0.020
LGD H122 C12 single 1.092 0.020
LGD C15 C12 single 1.524 0.020
LGD C14 N13 single 1.455 0.020
LGD H141 C14 single 1.092 0.020
LGD H142 C14 single 1.092 0.020
LGD C16 C14 single 1.524 0.020
LGD F4 C15 single 1.320 0.020
LGD F5 C15 single 1.320 0.020
LGD F6 C15 single 1.320 0.020
LGD F7 C16 single 1.320 0.020
LGD F8 C16 single 1.320 0.020
LGD F9 C16 single 1.320 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
LGD O21 C2 C3 120.000 3.000
LGD O21 C2 N1 120.000 3.000
LGD C3 C2 N1 120.000 3.000
LGD C2 C3 H3 120.000 3.000
LGD C2 C3 C4 120.000 3.000
LGD H3 C3 C4 120.000 3.000
LGD C3 C4 C11 120.000 3.000
LGD C3 C4 C5 120.000 3.000
LGD C11 C4 C5 120.000 3.000
LGD C4 C11 F3 109.470 3.000
LGD C4 C11 F2 109.470 3.000
LGD C4 C11 F1 109.470 3.000
LGD F3 C11 F2 109.470 3.000
LGD F3 C11 F1 109.470 3.000
LGD F2 C11 F1 109.470 3.000
LGD C4 C5 C10 120.000 3.000
LGD C4 C5 C6 120.000 3.000
LGD C10 C5 C6 120.000 3.000
LGD C5 C10 N1 120.000 3.000
LGD C5 C10 C9 120.000 3.000
LGD N1 C10 C9 120.000 3.000
LGD C10 N1 HN1 120.000 3.000
LGD C10 N1 C2 120.000 3.000
LGD HN1 N1 C2 120.000 3.000
LGD C10 C9 H9 120.000 3.000
LGD C10 C9 C8 120.000 3.000
LGD H9 C9 C8 120.000 3.000
LGD C9 C8 H8 120.000 3.000
LGD C9 C8 C7 120.000 3.000
LGD H8 C8 C7 120.000 3.000
LGD C8 C7 C6 120.000 3.000
LGD C8 C7 N13 120.000 3.000
LGD C6 C7 N13 120.000 3.000
LGD C7 C6 H6 120.000 3.000
LGD C7 C6 C5 120.000 3.000
LGD H6 C6 C5 120.000 3.000
LGD C7 N13 C12 120.000 3.000
LGD C7 N13 C14 120.000 3.000
LGD C12 N13 C14 120.000 3.000
LGD N13 C12 H122 109.470 3.000
LGD N13 C12 H121 109.470 3.000
LGD N13 C12 C15 109.500 3.000
LGD H122 C12 H121 107.900 3.000
LGD H122 C12 C15 109.470 3.000
LGD H121 C12 C15 109.470 3.000
LGD C12 C15 F6 109.470 3.000
LGD C12 C15 F5 109.470 3.000
LGD C12 C15 F4 109.470 3.000
LGD F6 C15 F5 109.470 3.000
LGD F6 C15 F4 109.470 3.000
LGD F5 C15 F4 109.470 3.000
LGD N13 C14 H142 109.470 3.000
LGD N13 C14 H141 109.470 3.000
LGD N13 C14 C16 109.500 3.000
LGD H142 C14 H141 107.900 3.000
LGD H142 C14 C16 109.470 3.000
LGD H141 C14 C16 109.470 3.000
LGD C14 C16 F7 109.470 3.000
LGD C14 C16 F8 109.470 3.000
LGD C14 C16 F9 109.470 3.000
LGD F7 C16 F8 109.470 3.000
LGD F7 C16 F9 109.470 3.000
LGD F8 C16 F9 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
LGD CONST_1 O21 C2 C3 C4 180.000 0.000 0
LGD CONST_2 C2 C3 C4 C5 0.000 0.000 0
LGD var_1 C3 C4 C11 F1 -179.996 20.000 1
LGD CONST_3 C3 C4 C5 C10 0.000 0.000 0
LGD CONST_4 C4 C5 C6 C7 180.000 0.000 0
LGD CONST_5 C4 C5 C10 C9 180.000 0.000 0
LGD CONST_6 C5 C10 N1 C2 0.000 0.000 0
LGD CONST_7 C10 N1 C2 O21 180.000 0.000 0
LGD CONST_8 C5 C10 C9 C8 0.000 0.000 0
LGD CONST_9 C10 C9 C8 C7 0.000 0.000 0
LGD CONST_10 C9 C8 C7 N13 180.000 0.000 0
LGD CONST_11 C8 C7 C6 C5 0.000 0.000 0
LGD var_2 C8 C7 N13 C14 119.372 20.000 1
LGD var_3 C7 N13 C12 C15 -81.655 20.000 1
LGD var_4 N13 C12 C15 F4 179.853 20.000 1
LGD var_5 C7 N13 C14 C16 -81.661 20.000 1
LGD var_6 N13 C14 C16 F9 60.282 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
LGD chir_01 C11 C4 F1 F2 negativ
LGD chir_02 C15 C12 F4 F5 negativ
LGD chir_03 C16 C14 F7 F8 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
LGD plan-1 N1 0.020
LGD plan-1 C2 0.020
LGD plan-1 C10 0.020
LGD plan-1 HN1 0.020
LGD plan-1 C3 0.020
LGD plan-1 C4 0.020
LGD plan-1 O21 0.020
LGD plan-1 H3 0.020
LGD plan-1 C5 0.020
LGD plan-1 C11 0.020
LGD plan-1 C6 0.020
LGD plan-1 C7 0.020
LGD plan-1 C8 0.020
LGD plan-1 C9 0.020
LGD plan-1 H6 0.020
LGD plan-1 N13 0.020
LGD plan-1 H8 0.020
LGD plan-1 H9 0.020
LGD plan-2 N13 0.020
LGD plan-2 C7 0.020
LGD plan-2 C12 0.020
LGD plan-2 C14 0.020
# ------------------------------------------------------
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