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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
LO1 LO1 '[[4-(AMINOMETHYL)PHENYL]AMINO]OXO-AC' non-polymer 23 14 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_LO1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
LO1 O2 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
LO1 C2 C C 0.000 -0.678 0.158 -0.994
LO1 C1 C C 0.000 -0.022 0.296 -2.328
LO1 OXT O OC -0.500 1.224 0.248 -2.423
LO1 O1 O OC -0.500 -0.720 0.458 -3.354
LO1 N7 N NH1 0.000 -2.020 0.208 -0.893
LO1 H7 H H 0.000 -2.587 0.255 -1.727
LO1 "C1'" C CR6 0.000 -2.627 0.194 0.364
LO1 "C6'" C CR16 0.000 -2.001 0.800 1.446
LO1 "H6'" H H 0.000 -1.039 1.279 1.317
LO1 "C5'" C CR16 0.000 -2.607 0.790 2.686
LO1 "H5'" H H 0.000 -2.122 1.269 3.528
LO1 "C4'" C CR6 0.000 -3.831 0.169 2.856
LO1 C C CH2 0.000 -4.486 0.155 4.212
LO1 HC1 H H 0.000 -5.571 0.143 4.090
LO1 HC2 H H 0.000 -4.194 1.050 4.766
LO1 N1 N NH2 0.000 -4.060 -1.041 4.950
LO1 H1N2 H H 0.000 -3.418 -1.701 4.527
LO1 H1N1 H H 0.000 -4.406 -1.214 5.886
LO1 "C3'" C CR16 0.000 -4.457 -0.432 1.781
LO1 "H3'" H H 0.000 -5.418 -0.913 1.914
LO1 "C2'" C CR16 0.000 -3.859 -0.422 0.536
LO1 "H2'" H H 0.000 -4.351 -0.895 -0.306
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
LO1 O2 n/a C2 START
LO1 C2 O2 N7 .
LO1 C1 C2 O1 .
LO1 OXT C1 . .
LO1 O1 C1 . .
LO1 N7 C2 "C1'" .
LO1 H7 N7 . .
LO1 "C1'" N7 "C6'" .
LO1 "C6'" "C1'" "C5'" .
LO1 "H6'" "C6'" . .
LO1 "C5'" "C6'" "C4'" .
LO1 "H5'" "C5'" . .
LO1 "C4'" "C5'" "C3'" .
LO1 C "C4'" N1 .
LO1 HC1 C . .
LO1 HC2 C . .
LO1 N1 C H1N1 .
LO1 H1N2 N1 . .
LO1 H1N1 N1 . .
LO1 "C3'" "C4'" "C2'" .
LO1 "H3'" "C3'" . .
LO1 "C2'" "C3'" "H2'" .
LO1 "H2'" "C2'" . END
LO1 "C1'" "C2'" . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
LO1 O1 C1 deloc 1.250 0.020
LO1 OXT C1 deloc 1.250 0.020
LO1 C1 C2 single 1.460 0.020
LO1 C2 O2 double 1.220 0.020
LO1 N7 C2 single 1.330 0.020
LO1 "C1'" "C2'" double 1.390 0.020
LO1 "C6'" "C1'" single 1.390 0.020
LO1 "C1'" N7 single 1.350 0.020
LO1 "C2'" "C3'" single 1.390 0.020
LO1 "H2'" "C2'" single 1.083 0.020
LO1 "C3'" "C4'" double 1.390 0.020
LO1 "H3'" "C3'" single 1.083 0.020
LO1 "C4'" "C5'" single 1.390 0.020
LO1 C "C4'" single 1.511 0.020
LO1 "C5'" "C6'" double 1.390 0.020
LO1 "H5'" "C5'" single 1.083 0.020
LO1 "H6'" "C6'" single 1.083 0.020
LO1 N1 C single 1.450 0.020
LO1 HC1 C single 1.092 0.020
LO1 HC2 C single 1.092 0.020
LO1 H1N1 N1 single 1.010 0.020
LO1 H1N2 N1 single 1.010 0.020
LO1 H7 N7 single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
LO1 O2 C2 C1 120.500 3.000
LO1 O2 C2 N7 123.000 3.000
LO1 C1 C2 N7 120.000 3.000
LO1 C2 C1 OXT 120.000 3.000
LO1 C2 C1 O1 120.000 3.000
LO1 OXT C1 O1 123.000 3.000
LO1 C2 N7 H7 120.000 3.000
LO1 C2 N7 "C1'" 120.000 3.000
LO1 H7 N7 "C1'" 120.000 3.000
LO1 N7 "C1'" "C6'" 120.000 3.000
LO1 N7 "C1'" "C2'" 120.000 3.000
LO1 "C6'" "C1'" "C2'" 120.000 3.000
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LO1 "C1'" "C6'" "C5'" 120.000 3.000
LO1 "H6'" "C6'" "C5'" 120.000 3.000
LO1 "C6'" "C5'" "H5'" 120.000 3.000
LO1 "C6'" "C5'" "C4'" 120.000 3.000
LO1 "H5'" "C5'" "C4'" 120.000 3.000
LO1 "C5'" "C4'" C 120.000 3.000
LO1 "C5'" "C4'" "C3'" 120.000 3.000
LO1 C "C4'" "C3'" 120.000 3.000
LO1 "C4'" C HC1 109.470 3.000
LO1 "C4'" C HC2 109.470 3.000
LO1 "C4'" C N1 109.500 3.000
LO1 HC1 C HC2 107.900 3.000
LO1 HC1 C N1 109.470 3.000
LO1 HC2 C N1 109.470 3.000
LO1 C N1 H1N2 120.000 3.000
LO1 C N1 H1N1 120.000 3.000
LO1 H1N2 N1 H1N1 120.000 3.000
LO1 "C4'" "C3'" "H3'" 120.000 3.000
LO1 "C4'" "C3'" "C2'" 120.000 3.000
LO1 "H3'" "C3'" "C2'" 120.000 3.000
LO1 "C3'" "C2'" "H2'" 120.000 3.000
LO1 "C3'" "C2'" "C1'" 120.000 3.000
LO1 "H2'" "C2'" "C1'" 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
LO1 var_1 O2 C2 C1 O1 179.959 20.000 1
LO1 CONST_1 O2 C2 N7 "C1'" 0.000 0.000 0
LO1 var_2 C2 N7 "C1'" "C6'" 33.390 20.000 1
LO1 CONST_2 N7 "C1'" "C2'" "C3'" 180.000 0.000 0
LO1 CONST_3 N7 "C1'" "C6'" "C5'" 180.000 0.000 0
LO1 CONST_4 "C1'" "C6'" "C5'" "C4'" 0.000 0.000 0
LO1 CONST_5 "C6'" "C5'" "C4'" "C3'" 0.000 0.000 0
LO1 var_3 "C5'" "C4'" C N1 -90.269 20.000 2
LO1 var_4 "C4'" C N1 H1N1 -179.960 20.000 1
LO1 CONST_6 "C5'" "C4'" "C3'" "C2'" 0.000 0.000 0
LO1 CONST_7 "C4'" "C3'" "C2'" "C1'" 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
LO1 plan-1 C1 0.020
LO1 plan-1 O1 0.020
LO1 plan-1 OXT 0.020
LO1 plan-1 C2 0.020
LO1 plan-2 C2 0.020
LO1 plan-2 C1 0.020
LO1 plan-2 O2 0.020
LO1 plan-2 N7 0.020
LO1 plan-2 H7 0.020
LO1 plan-3 "C1'" 0.020
LO1 plan-3 "C2'" 0.020
LO1 plan-3 "C6'" 0.020
LO1 plan-3 N7 0.020
LO1 plan-3 "C3'" 0.020
LO1 plan-3 "C4'" 0.020
LO1 plan-3 "C5'" 0.020
LO1 plan-3 "H2'" 0.020
LO1 plan-3 "H3'" 0.020
LO1 plan-3 C 0.020
LO1 plan-3 "H5'" 0.020
LO1 plan-3 "H6'" 0.020
LO1 plan-3 H7 0.020
LO1 plan-4 N1 0.020
LO1 plan-4 C 0.020
LO1 plan-4 H1N1 0.020
LO1 plan-4 H1N2 0.020
LO1 plan-5 N7 0.020
LO1 plan-5 C2 0.020
LO1 plan-5 "C1'" 0.020
LO1 plan-5 H7 0.020
# ------------------------------------------------------
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