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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
LOS LOS '. ' non-polymer 71 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_LOS
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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LOS CG C CH2 0.000 1.261 -2.462 -1.162
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LOS H31 H H 0.000 1.949 -5.931 -3.850
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
LOS HE21 n/a NE2 START
LOS NE2 HE21 CE1 .
LOS CD2 NE2 HD21 .
LOS HD22 CD2 . .
LOS HD21 CD2 . .
LOS CE1 NE2 ND1 .
LOS HE11 CE1 . .
LOS HE12 CE1 . .
LOS ND1 CE1 OS .
LOS CG ND1 HG1 .
LOS HG2 CG . .
LOS HG1 CG . .
LOS OS ND1 N13 .
LOS N37 OS C32 .
LOS C36 N37 C35 .
LOS H361 C36 . .
LOS H362 C36 . .
LOS C35 C36 C34 .
LOS H351 C35 . .
LOS H352 C35 . .
LOS C34 C35 C33 .
LOS H341 C34 . .
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LOS C33 C34 H33A .
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LOS H332 C32 . .
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LOS C30 C31 C29 .
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LOS H302 C30 . .
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LOS H291 C29 . .
LOS H292 C29 . .
LOS C28 C29 C27 .
LOS H281 C28 . .
LOS H282 C28 . .
LOS C27 C28 H271 .
LOS H272 C27 . .
LOS H271 C27 . .
LOS N26 C31 . .
LOS N13 OS C8 .
LOS C12 N13 C11 .
LOS H121 C12 . .
LOS H122 C12 . .
LOS C11 C12 C10 .
LOS H111 C11 . .
LOS H112 C11 . .
LOS C10 C11 C9 .
LOS H101 C10 . .
LOS H102 C10 . .
LOS C9 C10 H91 .
LOS H92 C9 . .
LOS H91 C9 . .
LOS C8 N13 C7 .
LOS H88 C8 . .
LOS C7 C8 C6 .
LOS H77 C7 . .
LOS N2 C7 . .
LOS C6 C7 C5 .
LOS H61 C6 . .
LOS C5 C6 C4 .
LOS H51 C5 . .
LOS C4 C5 C3 .
LOS H41 C4 . .
LOS H42 C4 . .
LOS C3 C4 H31 .
LOS H32 C3 . .
LOS H31 C3 . END
LOS OS N2 . ADD
LOS OS N26 . ADD
LOS N2 C3 . ADD
LOS C8 C9 . ADD
LOS N26 C27 . ADD
LOS C32 C33 . ADD
LOS CG CD2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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LOS N13 OS single 2.071 0.020
LOS OS N26 single 2.090 0.020
LOS N37 OS single 2.112 0.020
LOS OS ND1 single 2.063 0.020
LOS N2 C3 single 1.455 0.020
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LOS H362 C36 single 1.092 0.020
LOS CG CD2 single 1.524 0.020
LOS CG ND1 single 1.455 0.020
LOS HG1 CG single 1.092 0.020
LOS HG2 CG single 1.092 0.020
LOS CD2 NE2 single 1.450 0.020
LOS HD21 CD2 single 1.092 0.020
LOS HD22 CD2 single 1.092 0.020
LOS ND1 CE1 single 1.455 0.020
LOS CE1 NE2 single 1.450 0.020
LOS HE11 CE1 single 1.092 0.020
LOS HE12 CE1 single 1.092 0.020
LOS NE2 HE21 single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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LOS NE2 CD2 HD21 109.470 3.000
LOS NE2 CD2 CG 112.000 3.000
LOS HD22 CD2 HD21 107.900 3.000
LOS HD22 CD2 CG 109.470 3.000
LOS HD21 CD2 CG 109.470 3.000
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LOS ND1 CG HG1 109.470 3.000
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LOS HG1 CG CD2 109.470 3.000
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LOS N37 OS N2 180.000 3.000
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LOS N13 OS N26 90.000 3.000
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LOS H361 C36 C35 109.470 3.000
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LOS H351 C35 C34 109.470 3.000
LOS H352 C35 C34 109.470 3.000
LOS C35 C34 H341 109.470 3.000
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LOS C35 C34 C33 111.000 3.000
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LOS H341 C34 C33 109.470 3.000
LOS H342 C34 C33 109.470 3.000
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LOS N37 C32 C33 105.000 3.000
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LOS H332 C32 C33 108.340 3.000
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LOS C32 C31 H331 108.340 3.000
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LOS H291 C29 C28 109.470 3.000
LOS H292 C29 C28 109.470 3.000
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LOS H281 C28 C27 109.470 3.000
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LOS C5 C4 C3 109.470 3.000
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LOS H41 C4 C3 109.470 3.000
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LOS C4 C3 N2 105.000 3.000
LOS H32 C3 H31 107.900 3.000
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LOS H31 C3 N2 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
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_chem_comp_chir.volume_sign
_chem_comp_chir.atom_id_4
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_chem_comp_chir.atom_id_7
_chem_comp_chir.atom_id_8
LOS chir_01 C7 N2 C6 C8 positiv
. . . . .
LOS chir_02 C8 C7 C9 N13 negativ
. . . . .
LOS chir_03 C31 N26 C30 C32 negativ
. . . . .
LOS chir_04 C32 C31 C33 N37 positiv
. . . . .
LOS chir_05 OS ND1 N26 N13 cross4
N37 . N2 . .
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
LOS plan-1 N2 0.020
LOS plan-1 OS 0.020
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LOS plan-1 C7 0.020
LOS plan-2 C5 0.020
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LOS plan-2 C6 0.020
LOS plan-2 H51 0.020
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LOS plan-3 C6 0.020
LOS plan-3 C5 0.020
LOS plan-3 C7 0.020
LOS plan-3 H61 0.020
LOS plan-3 H51 0.020
LOS plan-4 N13 0.020
LOS plan-4 OS 0.020
LOS plan-4 C8 0.020
LOS plan-4 C12 0.020
LOS plan-5 N26 0.020
LOS plan-5 OS 0.020
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LOS plan-6 N37 0.020
LOS plan-6 OS 0.020
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LOS plan-7 ND1 0.020
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LOS plan-8 NE2 0.020
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LOS plan-8 CE1 0.020
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