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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
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loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
M11 M11 'N^6^-[(1R,2S)-1-({[(1R)-1-carboxy-2-' non-polymer 49 25 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_M11
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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M11 C10 C C 0.000 -7.011 -0.406 -0.265
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M11 N11 N NH1 0.000 -8.154 -0.279 0.438
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M11 H251 H H 0.000 -10.162 -1.943 2.215
M11 S17 S SH1 0.000 -8.272 -3.196 -0.682
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M11 O29 O O2 -0.500 -11.650 0.076 -0.125
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M11 O42 O OC -0.500 -13.279 3.258 0.432
M11 O43 O OC -0.500 -11.674 2.620 -0.876
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loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
M11 O19 n/a C1 START
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M11 O20 C1 . .
M11 C2 C1 C3 .
M11 H2 C2 . .
M11 N14 C2 H141 .
M11 H142 N14 . .
M11 H141 N14 . .
M11 C3 C2 C4 .
M11 H3C1 C3 . .
M11 H3C2 C3 . .
M11 C4 C3 C7 .
M11 H4C1 C4 . .
M11 H4C2 C4 . .
M11 C7 C4 C10 .
M11 H7C1 C7 . .
M11 H7C2 C7 . .
M11 C10 C7 N11 .
M11 O15 C10 . .
M11 N11 C10 C12 .
M11 H11 N11 . .
M11 C12 N11 C13 .
M11 H12 C12 . .
M11 CAV C12 S17 .
M11 HAV CAV . .
M11 C25 CAV H251 .
M11 H253 C25 . .
M11 H252 C25 . .
M11 H251 C25 . .
M11 S17 CAV H17 .
M11 H17 S17 . .
M11 C13 C12 O29 .
M11 O18 C13 . .
M11 O29 C13 C30 .
M11 C30 O29 C32 .
M11 H30 C30 . .
M11 C31 C30 O43 .
M11 O42 C31 . .
M11 O43 C31 . .
M11 C32 C30 C37 .
M11 H32 C32 . .
M11 C33 C32 H331 .
M11 H333 C33 . .
M11 H332 C33 . .
M11 H331 C33 . .
M11 C37 C32 H371 .
M11 H373 C37 . .
M11 H372 C37 . .
M11 H371 C37 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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M11 O42 C31 deloc 1.250 0.020
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M11 O29 C13 deloc 1.454 0.020
M11 O18 C13 deloc 1.220 0.020
M11 C13 C12 single 1.500 0.020
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M11 O15 C10 double 1.220 0.020
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M11 H333 C33 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
M11 O19 C1 O20 123.000 3.000
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M11 C2 C3 H3C1 109.470 3.000
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M11 H3C1 C3 C4 109.470 3.000
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M11 C4 C7 H7C2 109.470 3.000
M11 C4 C7 C10 109.470 3.000
M11 H7C1 C7 H7C2 107.900 3.000
M11 H7C1 C7 C10 109.470 3.000
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M11 CAV S17 H17 109.500 3.000
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M11 C30 C32 H32 108.340 3.000
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M11 C30 C32 C37 111.000 3.000
M11 H32 C32 C33 108.340 3.000
M11 H32 C32 C37 108.340 3.000
M11 C33 C32 C37 111.000 3.000
M11 C32 C33 H333 109.470 3.000
M11 C32 C33 H332 109.470 3.000
M11 C32 C33 H331 109.470 3.000
M11 H333 C33 H332 109.470 3.000
M11 H333 C33 H331 109.470 3.000
M11 H332 C33 H331 109.470 3.000
M11 C32 C37 H373 109.470 3.000
M11 C32 C37 H372 109.470 3.000
M11 C32 C37 H371 109.470 3.000
M11 H373 C37 H372 109.470 3.000
M11 H373 C37 H371 109.470 3.000
M11 H372 C37 H371 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
M11 var_1 O19 C1 C2 C3 99.964 20.000 3
M11 var_2 C1 C2 N14 H141 60.055 20.000 1
M11 var_3 C1 C2 C3 C4 175.025 20.000 3
M11 var_4 C2 C3 C4 C7 -179.993 20.000 3
M11 var_5 C3 C4 C7 C10 179.990 20.000 3
M11 var_6 C4 C7 C10 N11 179.965 20.000 3
M11 CONST_1 C7 C10 N11 C12 180.000 0.000 0
M11 var_7 C10 N11 C12 C13 -154.985 20.000 3
M11 var_8 N11 C12 CAV S17 -65.852 20.000 3
M11 var_9 C12 CAV C25 H251 60.026 20.000 3
M11 var_10 C12 CAV S17 H17 -58.162 20.000 1
M11 var_11 N11 C12 C13 O29 155.110 20.000 3
M11 var_12 C12 C13 O29 C30 -174.589 20.000 1
M11 var_13 C13 O29 C30 C32 -152.431 20.000 1
M11 var_14 O29 C30 C31 O43 8.340 20.000 3
M11 var_15 O29 C30 C32 C37 52.623 20.000 3
M11 var_16 C30 C32 C33 H331 60.005 20.000 3
M11 var_17 C30 C32 C37 H371 63.739 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
M11 chir_01 C30 C31 O29 C32 positiv
M11 chir_02 C12 C13 N11 CAV negativ
M11 chir_03 C2 C3 N14 C1 positiv
M11 chir_04 C32 C30 C37 C33 negativ
M11 chir_05 CAV C12 S17 C25 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
M11 plan-1 C31 0.020
M11 plan-1 O43 0.020
M11 plan-1 O42 0.020
M11 plan-1 C30 0.020
M11 plan-2 C13 0.020
M11 plan-2 O29 0.020
M11 plan-2 O18 0.020
M11 plan-2 C12 0.020
M11 plan-3 N11 0.020
M11 plan-3 C12 0.020
M11 plan-3 C10 0.020
M11 plan-3 H11 0.020
M11 plan-4 C10 0.020
M11 plan-4 N11 0.020
M11 plan-4 O15 0.020
M11 plan-4 C7 0.020
M11 plan-4 H11 0.020
M11 plan-5 N14 0.020
M11 plan-5 C2 0.020
M11 plan-5 H141 0.020
M11 plan-5 H142 0.020
M11 plan-6 C1 0.020
M11 plan-6 C2 0.020
M11 plan-6 O20 0.020
M11 plan-6 O19 0.020
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