1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
MA5 MA5 '2-(6-(2-CYCLOHEXYLETHOXY)-TETRAHYDRO' non-polymer 67 31 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_MA5
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
MA5 O2 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
MA5 HO2 H H 0.000 0.075 -0.912 -0.313
MA5 C2 C CH1 0.000 -0.634 0.796 -1.003
MA5 H4 H H 0.000 -0.032 0.776 -1.922
MA5 C3 C CH1 0.000 -0.766 2.240 -0.508
MA5 H6 H H 0.000 -1.277 2.252 0.465
MA5 O3 O OH1 0.000 0.532 2.822 -0.375
MA5 HO3 H H 0.000 1.050 2.310 0.261
MA5 C4 C CH1 0.000 -1.587 3.035 -1.530
MA5 H7 H H 0.000 -1.027 3.113 -2.472
MA5 O4 O OH1 0.000 -1.848 4.344 -1.020
MA5 HO4 H H 0.000 -1.011 4.798 -0.856
MA5 C5 C CH1 0.000 -2.911 2.309 -1.778
MA5 H5 H H 0.000 -3.458 2.212 -0.830
MA5 C6 C CH2 0.000 -3.753 3.112 -2.771
MA5 H61 H H 0.000 -3.249 3.135 -3.739
MA5 H62 H H 0.000 -3.874 4.133 -2.401
MA5 O6 O OH1 0.000 -5.037 2.500 -2.913
MA5 HO6 H H 0.000 -5.568 3.009 -3.540
MA5 O5 O O2 0.000 -2.656 1.011 -2.314
MA5 C1 C CH1 0.000 -2.029 0.238 -1.293
MA5 H1 H H 0.000 -1.943 -0.806 -1.625
MA5 O1 O O2 0.000 -2.818 0.294 -0.103
MA5 C40 C CH1 0.000 -3.954 -0.545 -0.320
MA5 H40 H H 0.000 -4.258 -0.487 -1.375
MA5 C30 C CH1 0.000 -3.595 -1.994 0.031
MA5 H30 H H 0.000 -3.189 -2.036 1.051
MA5 O30 O OH1 0.000 -2.622 -2.484 -0.893
MA5 H2 H H 0.000 -2.398 -3.397 -0.669
MA5 C20 C CH1 0.000 -4.865 -2.848 -0.054
MA5 H20 H H 0.000 -5.211 -2.891 -1.096
MA5 O20 O OH1 0.000 -4.584 -4.169 0.412
MA5 H3 H H 0.000 -5.386 -4.706 0.357
MA5 C50 C CH1 0.000 -5.109 -0.085 0.572
MA5 H50 H H 0.000 -4.809 -0.164 1.626
MA5 C60 C CH2 0.000 -5.454 1.370 0.251
MA5 H601 H H 0.000 -5.812 1.440 -0.779
MA5 H602 H H 0.000 -4.561 1.989 0.367
MA5 O60 O OH1 0.000 -6.472 1.828 1.143
MA5 H60 H H 0.000 -6.689 2.747 0.939
MA5 O50 O O2 0.000 -6.253 -0.905 0.343
MA5 C10 C CH1 0.000 -5.951 -2.215 0.820
MA5 H10 H H 0.000 -5.594 -2.152 1.858
MA5 O10 O O2 0.000 -7.129 -3.021 0.771
MA5 C11 C CH2 0.000 -8.060 -2.448 1.692
MA5 H111 H H 0.000 -8.279 -1.420 1.396
MA5 H112 H H 0.000 -7.628 -2.452 2.695
MA5 C61 C CH2 0.000 -9.352 -3.268 1.689
MA5 H611 H H 0.000 -9.132 -4.296 1.985
MA5 H612 H H 0.000 -9.783 -3.265 0.685
MA5 C52 C CH1 0.000 -10.348 -2.655 2.675
MA5 H52 H H 0.000 -10.501 -1.595 2.429
MA5 C42 C CH2 0.000 -11.683 -3.398 2.580
MA5 H422 H H 0.000 -11.530 -4.451 2.823
MA5 H421 H H 0.000 -12.075 -3.312 1.565
MA5 C62 C CH2 0.000 -9.797 -2.774 4.097
MA5 H621 H H 0.000 -8.844 -2.245 4.163
MA5 H622 H H 0.000 -9.645 -3.828 4.340
MA5 C12 C CH2 0.000 -10.793 -2.160 5.082
MA5 H121 H H 0.000 -10.945 -1.107 4.838
MA5 H122 H H 0.000 -10.399 -2.244 6.097
MA5 C22 C CH2 0.000 -12.127 -2.904 4.989
MA5 H221 H H 0.000 -12.837 -2.467 5.694
MA5 H222 H H 0.000 -11.974 -3.957 5.235
MA5 C32 C CH2 0.000 -12.679 -2.785 3.567
MA5 H322 H H 0.000 -12.833 -1.732 3.323
MA5 H321 H H 0.000 -13.631 -3.316 3.501
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
MA5 O2 n/a C2 START
MA5 HO2 O2 . .
MA5 C2 O2 C1 .
MA5 H4 C2 . .
MA5 C3 C2 C4 .
MA5 H6 C3 . .
MA5 O3 C3 HO3 .
MA5 HO3 O3 . .
MA5 C4 C3 C5 .
MA5 H7 C4 . .
MA5 O4 C4 HO4 .
MA5 HO4 O4 . .
MA5 C5 C4 O5 .
MA5 H5 C5 . .
MA5 C6 C5 O6 .
MA5 H61 C6 . .
MA5 H62 C6 . .
MA5 O6 C6 HO6 .
MA5 HO6 O6 . .
MA5 O5 C5 . .
MA5 C1 C2 O1 .
MA5 H1 C1 . .
MA5 O1 C1 C40 .
MA5 C40 O1 C50 .
MA5 H40 C40 . .
MA5 C30 C40 C20 .
MA5 H30 C30 . .
MA5 O30 C30 H2 .
MA5 H2 O30 . .
MA5 C20 C30 O20 .
MA5 H20 C20 . .
MA5 O20 C20 H3 .
MA5 H3 O20 . .
MA5 C50 C40 O50 .
MA5 H50 C50 . .
MA5 C60 C50 O60 .
MA5 H601 C60 . .
MA5 H602 C60 . .
MA5 O60 C60 H60 .
MA5 H60 O60 . .
MA5 O50 C50 C10 .
MA5 C10 O50 O10 .
MA5 H10 C10 . .
MA5 O10 C10 C11 .
MA5 C11 O10 C61 .
MA5 H111 C11 . .
MA5 H112 C11 . .
MA5 C61 C11 C52 .
MA5 H611 C61 . .
MA5 H612 C61 . .
MA5 C52 C61 C62 .
MA5 H52 C52 . .
MA5 C42 C52 H421 .
MA5 H422 C42 . .
MA5 H421 C42 . .
MA5 C62 C52 C12 .
MA5 H621 C62 . .
MA5 H622 C62 . .
MA5 C12 C62 C22 .
MA5 H121 C12 . .
MA5 H122 C12 . .
MA5 C22 C12 C32 .
MA5 H221 C22 . .
MA5 H222 C22 . .
MA5 C32 C22 H321 .
MA5 H322 C32 . .
MA5 H321 C32 . END
MA5 C42 C32 . ADD
MA5 C10 C20 . ADD
MA5 C1 O5 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
MA5 C42 C32 single 1.524 0.020
MA5 C42 C52 single 1.524 0.020
MA5 H421 C42 single 1.092 0.020
MA5 H422 C42 single 1.092 0.020
MA5 C32 C22 single 1.524 0.020
MA5 H321 C32 single 1.092 0.020
MA5 H322 C32 single 1.092 0.020
MA5 C22 C12 single 1.524 0.020
MA5 H221 C22 single 1.092 0.020
MA5 H222 C22 single 1.092 0.020
MA5 C12 C62 single 1.524 0.020
MA5 H121 C12 single 1.092 0.020
MA5 H122 C12 single 1.092 0.020
MA5 C62 C52 single 1.524 0.020
MA5 H621 C62 single 1.092 0.020
MA5 H622 C62 single 1.092 0.020
MA5 C52 C61 single 1.524 0.020
MA5 H52 C52 single 1.099 0.020
MA5 C61 C11 single 1.524 0.020
MA5 H611 C61 single 1.092 0.020
MA5 H612 C61 single 1.092 0.020
MA5 C11 O10 single 1.426 0.020
MA5 H111 C11 single 1.092 0.020
MA5 H112 C11 single 1.092 0.020
MA5 O10 C10 single 1.426 0.020
MA5 C10 C20 single 1.524 0.020
MA5 C10 O50 single 1.426 0.020
MA5 H10 C10 single 1.099 0.020
MA5 O20 C20 single 1.432 0.020
MA5 C20 C30 single 1.524 0.020
MA5 H20 C20 single 1.099 0.020
MA5 H3 O20 single 0.967 0.020
MA5 O30 C30 single 1.432 0.020
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MA5 H30 C30 single 1.099 0.020
MA5 H2 O30 single 0.967 0.020
MA5 O50 C50 single 1.426 0.020
MA5 C60 C50 single 1.524 0.020
MA5 C50 C40 single 1.524 0.020
MA5 H50 C50 single 1.099 0.020
MA5 O60 C60 single 1.432 0.020
MA5 H601 C60 single 1.092 0.020
MA5 H602 C60 single 1.092 0.020
MA5 H60 O60 single 0.967 0.020
MA5 C40 O1 single 1.426 0.020
MA5 H40 C40 single 1.099 0.020
MA5 O1 C1 single 1.426 0.020
MA5 C1 O5 single 1.426 0.020
MA5 C1 C2 single 1.524 0.020
MA5 H1 C1 single 1.099 0.020
MA5 O5 C5 single 1.426 0.020
MA5 C6 C5 single 1.524 0.020
MA5 C5 C4 single 1.524 0.020
MA5 H5 C5 single 1.099 0.020
MA5 O6 C6 single 1.432 0.020
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MA5 H62 C6 single 1.092 0.020
MA5 HO6 O6 single 0.967 0.020
MA5 O4 C4 single 1.432 0.020
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MA5 H7 C4 single 1.099 0.020
MA5 HO4 O4 single 0.967 0.020
MA5 O3 C3 single 1.432 0.020
MA5 C3 C2 single 1.524 0.020
MA5 H6 C3 single 1.099 0.020
MA5 HO3 O3 single 0.967 0.020
MA5 C2 O2 single 1.432 0.020
MA5 H4 C2 single 1.099 0.020
MA5 HO2 O2 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
MA5 HO2 O2 C2 109.470 3.000
MA5 O2 C2 H4 109.470 3.000
MA5 O2 C2 C3 109.470 3.000
MA5 O2 C2 C1 109.470 3.000
MA5 H4 C2 C3 108.340 3.000
MA5 H4 C2 C1 108.340 3.000
MA5 C3 C2 C1 111.000 3.000
MA5 C2 C3 H6 108.340 3.000
MA5 C2 C3 O3 109.470 3.000
MA5 C2 C3 C4 111.000 3.000
MA5 H6 C3 O3 109.470 3.000
MA5 H6 C3 C4 108.340 3.000
MA5 O3 C3 C4 109.470 3.000
MA5 C3 O3 HO3 109.470 3.000
MA5 C3 C4 H7 108.340 3.000
MA5 C3 C4 O4 109.470 3.000
MA5 C3 C4 C5 111.000 3.000
MA5 H7 C4 O4 109.470 3.000
MA5 H7 C4 C5 108.340 3.000
MA5 O4 C4 C5 109.470 3.000
MA5 C4 O4 HO4 109.470 3.000
MA5 C4 C5 H5 108.340 3.000
MA5 C4 C5 C6 111.000 3.000
MA5 C4 C5 O5 109.470 3.000
MA5 H5 C5 C6 108.340 3.000
MA5 H5 C5 O5 109.470 3.000
MA5 C6 C5 O5 109.470 3.000
MA5 C5 C6 H61 109.470 3.000
MA5 C5 C6 H62 109.470 3.000
MA5 C5 C6 O6 109.470 3.000
MA5 H61 C6 H62 107.900 3.000
MA5 H61 C6 O6 109.470 3.000
MA5 H62 C6 O6 109.470 3.000
MA5 C6 O6 HO6 109.470 3.000
MA5 C5 O5 C1 111.800 3.000
MA5 C2 C1 H1 108.340 3.000
MA5 C2 C1 O1 109.470 3.000
MA5 C2 C1 O5 109.470 3.000
MA5 H1 C1 O1 109.470 3.000
MA5 H1 C1 O5 109.470 3.000
MA5 O1 C1 O5 109.470 3.000
MA5 C1 O1 C40 111.800 3.000
MA5 O1 C40 H40 109.470 3.000
MA5 O1 C40 C30 109.470 3.000
MA5 O1 C40 C50 109.470 3.000
MA5 H40 C40 C30 108.340 3.000
MA5 H40 C40 C50 108.340 3.000
MA5 C30 C40 C50 111.000 3.000
MA5 C40 C30 H30 108.340 3.000
MA5 C40 C30 O30 109.470 3.000
MA5 C40 C30 C20 111.000 3.000
MA5 H30 C30 O30 109.470 3.000
MA5 H30 C30 C20 108.340 3.000
MA5 O30 C30 C20 109.470 3.000
MA5 C30 O30 H2 109.470 3.000
MA5 C30 C20 H20 108.340 3.000
MA5 C30 C20 O20 109.470 3.000
MA5 C30 C20 C10 111.000 3.000
MA5 H20 C20 O20 109.470 3.000
MA5 H20 C20 C10 108.340 3.000
MA5 O20 C20 C10 109.470 3.000
MA5 C20 O20 H3 109.470 3.000
MA5 C40 C50 H50 108.340 3.000
MA5 C40 C50 C60 111.000 3.000
MA5 C40 C50 O50 109.470 3.000
MA5 H50 C50 C60 108.340 3.000
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MA5 H52 C52 C62 108.340 3.000
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loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
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_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
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_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
MA5 chir_01 C52 C42 C62 C61 negativ
MA5 chir_02 C10 O10 C20 O50 negativ
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MA5 chir_06 C40 C30 C50 O1 negativ
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MA5 chir_10 C3 C4 O3 C2 positiv
MA5 chir_11 C2 C1 C3 O2 negativ
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