1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
ME5 ME5 '"5-CHLORO-N-((1R,2S)-2-(4-(2-OXOPYRI' non-polymer 50 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_ME5
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
ME5 CL1 CL CL 0.000 0.000 0.000 0.000
ME5 C5 C CR5 0.000 -1.102 -1.298 -0.193
ME5 C4 C CR15 0.000 -0.813 -2.635 -0.355
ME5 H4 H H 0.000 0.193 -3.037 -0.381
ME5 C2 C CR15 0.000 -1.990 -3.427 -0.485
ME5 H2 H H 0.000 -2.004 -4.501 -0.622
ME5 S1 S S2 0.000 -2.788 -1.001 -0.197
ME5 C3 C CR5 0.000 -3.080 -2.647 -0.413
ME5 C1 C C 0.000 -4.496 -3.085 -0.506
ME5 O3 O O 0.000 -4.748 -4.279 -0.645
ME5 N1 N NH1 0.000 -5.457 -2.084 -0.403
ME5 HN1 H H 0.000 -5.149 -1.128 -0.290
ME5 C19 C CH1 0.000 -6.874 -2.353 -0.449
ME5 H19 H H 0.000 -7.070 -3.236 -1.073
ME5 C8 C CH2 0.000 -7.643 -1.150 -0.987
ME5 H82 H H 0.000 -8.617 -1.440 -1.386
ME5 H81 H H 0.000 -7.077 -0.623 -1.759
ME5 C13 C CH1 0.000 -7.499 -2.538 0.937
ME5 H13 H H 0.000 -8.493 -2.988 0.810
ME5 C12 C CH2 0.000 -7.679 -1.114 1.463
ME5 H121 H H 0.000 -6.807 -0.789 2.033
ME5 H122 H H 0.000 -8.572 -1.032 2.086
ME5 C10 C CH2 0.000 -7.837 -0.232 0.222
ME5 H102 H H 0.000 -7.084 0.558 0.205
ME5 H101 H H 0.000 -8.833 0.215 0.184
ME5 N4 N NH1 0.000 -6.735 -3.373 1.820
ME5 HN4 H H 0.000 -6.027 -2.947 2.401
ME5 C17 C C 0.000 -6.934 -4.743 1.904
ME5 O2 O O 0.000 -7.761 -5.375 1.252
ME5 C7 C CR6 0.000 -6.081 -5.462 2.886
ME5 C44 C CR16 0.000 -4.848 -4.935 3.210
ME5 H44 H H 0.000 -4.507 -4.013 2.755
ME5 C14 C CR16 0.000 -4.049 -5.610 4.132
ME5 H14 H H 0.000 -3.077 -5.213 4.399
ME5 C16 C CR6 0.000 -4.501 -6.796 4.711
ME5 C18 C CR16 0.000 -5.751 -7.308 4.366
ME5 H18 H H 0.000 -6.102 -8.228 4.816
ME5 C22 C CR16 0.000 -6.550 -6.634 3.442
ME5 H22 H H 0.000 -7.523 -7.024 3.167
ME5 N2 N NR6 0.000 -3.669 -7.497 5.671
ME5 C21 C CR6 0.000 -2.787 -6.766 6.508
ME5 O1 O O 0.000 -2.684 -5.541 6.580
ME5 C24 C CR16 0.000 -1.934 -7.569 7.438
ME5 H24 H H 0.000 -1.209 -7.069 8.068
ME5 C26 C CR16 0.000 -2.057 -8.897 7.497
ME5 H26 H H 0.000 -1.444 -9.464 8.186
ME5 C23 C CR16 0.000 -2.995 -9.578 6.656
ME5 H23 H H 0.000 -3.095 -10.655 6.717
ME5 C15 C CR16 0.000 -3.746 -8.886 5.794
ME5 H15 H H 0.000 -4.444 -9.424 5.165
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
ME5 CL1 n/a C5 START
ME5 C5 CL1 S1 .
ME5 C4 C5 C2 .
ME5 H4 C4 . .
ME5 C2 C4 H2 .
ME5 H2 C2 . .
ME5 S1 C5 C3 .
ME5 C3 S1 C1 .
ME5 C1 C3 N1 .
ME5 O3 C1 . .
ME5 N1 C1 C19 .
ME5 HN1 N1 . .
ME5 C19 N1 C13 .
ME5 H19 C19 . .
ME5 C8 C19 H81 .
ME5 H82 C8 . .
ME5 H81 C8 . .
ME5 C13 C19 N4 .
ME5 H13 C13 . .
ME5 C12 C13 C10 .
ME5 H121 C12 . .
ME5 H122 C12 . .
ME5 C10 C12 H101 .
ME5 H102 C10 . .
ME5 H101 C10 . .
ME5 N4 C13 C17 .
ME5 HN4 N4 . .
ME5 C17 N4 C7 .
ME5 O2 C17 . .
ME5 C7 C17 C44 .
ME5 C44 C7 C14 .
ME5 H44 C44 . .
ME5 C14 C44 C16 .
ME5 H14 C14 . .
ME5 C16 C14 N2 .
ME5 C18 C16 C22 .
ME5 H18 C18 . .
ME5 C22 C18 H22 .
ME5 H22 C22 . .
ME5 N2 C16 C21 .
ME5 C21 N2 C24 .
ME5 O1 C21 . .
ME5 C24 C21 C26 .
ME5 H24 C24 . .
ME5 C26 C24 C23 .
ME5 H26 C26 . .
ME5 C23 C26 C15 .
ME5 H23 C23 . .
ME5 C15 C23 H15 .
ME5 H15 C15 . END
ME5 C2 C3 . ADD
ME5 C7 C22 . ADD
ME5 C8 C10 . ADD
ME5 C15 N2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
ME5 O3 C1 double 1.220 0.020
ME5 N1 C1 single 1.330 0.020
ME5 C1 C3 single 1.490 0.020
ME5 C2 C3 double 1.387 0.020
ME5 C2 C4 single 1.380 0.020
ME5 H2 C2 single 1.083 0.020
ME5 C3 S1 single 1.745 0.020
ME5 C44 C7 double 1.390 0.020
ME5 C7 C22 single 1.390 0.020
ME5 C7 C17 single 1.500 0.020
ME5 C8 C19 single 1.524 0.020
ME5 C8 C10 single 1.524 0.020
ME5 H81 C8 single 1.092 0.020
ME5 H82 C8 single 1.092 0.020
ME5 C10 C12 single 1.524 0.020
ME5 H101 C10 single 1.092 0.020
ME5 H102 C10 single 1.092 0.020
ME5 C12 C13 single 1.524 0.020
ME5 H121 C12 single 1.092 0.020
ME5 H122 C12 single 1.092 0.020
ME5 N4 C13 single 1.450 0.020
ME5 C13 C19 single 1.524 0.020
ME5 H13 C13 single 1.099 0.020
ME5 C16 C14 double 1.390 0.020
ME5 C14 C44 single 1.390 0.020
ME5 H14 C14 single 1.083 0.020
ME5 C15 C23 double 1.390 0.020
ME5 C15 N2 single 1.337 0.020
ME5 H15 C15 single 1.083 0.020
ME5 N2 C16 single 1.410 0.020
ME5 C18 C16 single 1.390 0.020
ME5 C19 N1 single 1.450 0.020
ME5 H19 C19 single 1.099 0.020
ME5 C24 C21 single 1.390 0.020
ME5 O1 C21 double 1.250 0.020
ME5 C21 N2 single 1.410 0.020
ME5 C22 C18 double 1.390 0.020
ME5 H22 C22 single 1.083 0.020
ME5 C26 C24 double 1.390 0.020
ME5 H24 C24 single 1.083 0.020
ME5 O2 C17 double 1.220 0.020
ME5 C17 N4 single 1.330 0.020
ME5 H44 C44 single 1.083 0.020
ME5 H18 C18 single 1.083 0.020
ME5 C23 C26 single 1.390 0.020
ME5 H23 C23 single 1.083 0.020
ME5 H26 C26 single 1.083 0.020
ME5 HN4 N4 single 1.010 0.020
ME5 HN1 N1 single 1.010 0.020
ME5 C4 C5 double 1.387 0.020
ME5 H4 C4 single 1.083 0.020
ME5 S1 C5 single 1.745 0.020
ME5 C5 CL1 single 1.845 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
ME5 CL1 C5 C4 108.000 3.000
ME5 CL1 C5 S1 108.000 3.000
ME5 C4 C5 S1 108.000 3.000
ME5 C5 C4 H4 126.000 3.000
ME5 C5 C4 C2 108.000 3.000
ME5 H4 C4 C2 126.000 3.000
ME5 C4 C2 H2 126.000 3.000
ME5 C4 C2 C3 108.000 3.000
ME5 H2 C2 C3 126.000 3.000
ME5 C5 S1 C3 90.092 3.000
ME5 S1 C3 C1 108.000 3.000
ME5 S1 C3 C2 108.000 3.000
ME5 C1 C3 C2 126.000 3.000
ME5 C3 C1 O3 120.500 3.000
ME5 C3 C1 N1 120.000 3.000
ME5 O3 C1 N1 123.000 3.000
ME5 C1 N1 HN1 120.000 3.000
ME5 C1 N1 C19 121.500 3.000
ME5 HN1 N1 C19 118.500 3.000
ME5 N1 C19 H19 108.550 3.000
ME5 N1 C19 C8 110.000 3.000
ME5 N1 C19 C13 110.000 3.000
ME5 H19 C19 C8 108.340 3.000
ME5 H19 C19 C13 108.340 3.000
ME5 C8 C19 C13 111.000 3.000
ME5 C19 C8 H82 109.470 3.000
ME5 C19 C8 H81 109.470 3.000
ME5 C19 C8 C10 111.000 3.000
ME5 H82 C8 H81 107.900 3.000
ME5 H82 C8 C10 109.470 3.000
ME5 H81 C8 C10 109.470 3.000
ME5 C19 C13 H13 108.340 3.000
ME5 C19 C13 C12 111.000 3.000
ME5 C19 C13 N4 110.000 3.000
ME5 H13 C13 C12 108.340 3.000
ME5 H13 C13 N4 108.550 3.000
ME5 C12 C13 N4 110.000 3.000
ME5 C13 C12 H121 109.470 3.000
ME5 C13 C12 H122 109.470 3.000
ME5 C13 C12 C10 111.000 3.000
ME5 H121 C12 H122 107.900 3.000
ME5 H121 C12 C10 109.470 3.000
ME5 H122 C12 C10 109.470 3.000
ME5 C12 C10 H102 109.470 3.000
ME5 C12 C10 H101 109.470 3.000
ME5 C12 C10 C8 111.000 3.000
ME5 H102 C10 H101 107.900 3.000
ME5 H102 C10 C8 109.470 3.000
ME5 H101 C10 C8 109.470 3.000
ME5 C13 N4 HN4 118.500 3.000
ME5 C13 N4 C17 121.500 3.000
ME5 HN4 N4 C17 120.000 3.000
ME5 N4 C17 O2 123.000 3.000
ME5 N4 C17 C7 120.000 3.000
ME5 O2 C17 C7 120.500 3.000
ME5 C17 C7 C44 120.000 3.000
ME5 C17 C7 C22 120.000 3.000
ME5 C44 C7 C22 120.000 3.000
ME5 C7 C44 H44 120.000 3.000
ME5 C7 C44 C14 120.000 3.000
ME5 H44 C44 C14 120.000 3.000
ME5 C44 C14 H14 120.000 3.000
ME5 C44 C14 C16 120.000 3.000
ME5 H14 C14 C16 120.000 3.000
ME5 C14 C16 C18 120.000 3.000
ME5 C14 C16 N2 120.000 3.000
ME5 C18 C16 N2 120.000 3.000
ME5 C16 C18 H18 120.000 3.000
ME5 C16 C18 C22 120.000 3.000
ME5 H18 C18 C22 120.000 3.000
ME5 C18 C22 H22 120.000 3.000
ME5 C18 C22 C7 120.000 3.000
ME5 H22 C22 C7 120.000 3.000
ME5 C16 N2 C21 120.000 3.000
ME5 C16 N2 C15 120.000 3.000
ME5 C21 N2 C15 120.000 3.000
ME5 N2 C21 O1 120.000 3.000
ME5 N2 C21 C24 120.000 3.000
ME5 O1 C21 C24 120.000 3.000
ME5 C21 C24 H24 120.000 3.000
ME5 C21 C24 C26 120.000 3.000
ME5 H24 C24 C26 120.000 3.000
ME5 C24 C26 H26 120.000 3.000
ME5 C24 C26 C23 120.000 3.000
ME5 H26 C26 C23 120.000 3.000
ME5 C26 C23 H23 120.000 3.000
ME5 C26 C23 C15 120.000 3.000
ME5 H23 C23 C15 120.000 3.000
ME5 C23 C15 H15 120.000 3.000
ME5 C23 C15 N2 120.000 3.000
ME5 H15 C15 N2 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
ME5 CONST_1 CL1 C5 C4 C2 180.000 0.000 0
ME5 CONST_2 C5 C4 C2 C3 0.000 0.000 0
ME5 CONST_3 C4 C2 C3 S1 0.000 0.000 0
ME5 CONST_4 CL1 C5 S1 C3 180.000 0.000 0
ME5 CONST_5 C5 S1 C3 C1 180.000 0.000 0
ME5 var_1 S1 C3 C1 N1 -0.116 20.000 1
ME5 CONST_6 C3 C1 N1 C19 180.000 0.000 0
ME5 var_2 C1 N1 C19 C13 93.607 20.000 3
ME5 var_3 N1 C19 C8 C10 -90.000 20.000 3
ME5 var_4 C19 C8 C10 C12 -30.000 20.000 3
ME5 var_5 N1 C19 C13 N4 -30.000 20.000 3
ME5 var_6 C19 C13 C12 C10 30.000 20.000 3
ME5 var_7 C13 C12 C10 C8 0.000 20.000 3
ME5 var_8 C19 C13 N4 C17 -91.004 20.000 3
ME5 CONST_7 C13 N4 C17 C7 180.000 0.000 0
ME5 var_9 N4 C17 C7 C44 -27.022 20.000 1
ME5 CONST_8 C17 C7 C22 C18 180.000 0.000 0
ME5 CONST_9 C17 C7 C44 C14 180.000 0.000 0
ME5 CONST_10 C7 C44 C14 C16 0.000 0.000 0
ME5 CONST_11 C44 C14 C16 N2 180.000 0.000 0
ME5 CONST_12 C14 C16 C18 C22 0.000 0.000 0
ME5 CONST_13 C16 C18 C22 C7 0.000 0.000 0
ME5 CONST_14 C14 C16 N2 C21 0.000 0.000 0
ME5 CONST_15 C16 N2 C21 C24 180.000 0.000 0
ME5 CONST_16 N2 C21 C24 C26 0.000 0.000 0
ME5 CONST_17 C21 C24 C26 C23 0.000 0.000 0
ME5 CONST_18 C24 C26 C23 C15 0.000 0.000 0
ME5 CONST_19 C26 C23 C15 N2 0.000 0.000 0
ME5 CONST_20 C23 C15 N2 C16 180.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
ME5 chir_01 C13 C12 C19 N4 negativ
ME5 chir_02 C19 C8 C13 N1 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
ME5 plan-1 C1 0.020
ME5 plan-1 C3 0.020
ME5 plan-1 N1 0.020
ME5 plan-1 O3 0.020
ME5 plan-1 HN1 0.020
ME5 plan-2 C2 0.020
ME5 plan-2 C3 0.020
ME5 plan-2 C4 0.020
ME5 plan-2 H2 0.020
ME5 plan-2 S1 0.020
ME5 plan-2 C5 0.020
ME5 plan-2 C1 0.020
ME5 plan-2 H4 0.020
ME5 plan-2 CL1 0.020
ME5 plan-3 C7 0.020
ME5 plan-3 C22 0.020
ME5 plan-3 C17 0.020
ME5 plan-3 C44 0.020
ME5 plan-3 C14 0.020
ME5 plan-3 C16 0.020
ME5 plan-3 C18 0.020
ME5 plan-3 H14 0.020
ME5 plan-3 N2 0.020
ME5 plan-3 H22 0.020
ME5 plan-3 H44 0.020
ME5 plan-3 H18 0.020
ME5 plan-4 C15 0.020
ME5 plan-4 N2 0.020
ME5 plan-4 C23 0.020
ME5 plan-4 H15 0.020
ME5 plan-4 C21 0.020
ME5 plan-4 C24 0.020
ME5 plan-4 C26 0.020
ME5 plan-4 O1 0.020
ME5 plan-4 H24 0.020
ME5 plan-4 C16 0.020
ME5 plan-4 H23 0.020
ME5 plan-4 H26 0.020
ME5 plan-5 C17 0.020
ME5 plan-5 C7 0.020
ME5 plan-5 N4 0.020
ME5 plan-5 O2 0.020
ME5 plan-5 HN4 0.020
ME5 plan-6 N4 0.020
ME5 plan-6 C13 0.020
ME5 plan-6 C17 0.020
ME5 plan-6 HN4 0.020
ME5 plan-7 N1 0.020
ME5 plan-7 C1 0.020
ME5 plan-7 C19 0.020
ME5 plan-7 HN1 0.020
# ------------------------------------------------------
|