1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
MES MES '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' non-polymer 25 12 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_MES
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
MES O3S O OS -1.000 0.000 0.000 0.000
MES S S ST 0.000 -1.306 -0.521 0.374
MES O1S O OS 0.000 -1.381 -1.935 0.041
MES O2S O OS 0.000 -1.512 -0.343 1.803
MES C8 C CH2 0.000 -2.592 0.378 -0.535
MES H81 H H 0.000 -2.439 0.246 -1.608
MES H82 H H 0.000 -2.537 1.440 -0.288
MES C7 C CH2 0.000 -3.968 -0.167 -0.144
MES H71 H H 0.000 -4.119 -0.036 0.929
MES H72 H H 0.000 -4.022 -1.229 -0.391
MES N4 N NT1 1.000 -5.011 0.561 -0.880
MES HN4 H H 0.000 -4.820 0.507 -1.893
MES C3 C CH2 0.000 -6.322 -0.037 -0.594
MES H31 H H 0.000 -6.498 -0.033 0.483
MES H32 H H 0.000 -6.342 -1.065 -0.961
MES C2 C CH2 0.000 -7.412 0.777 -1.294
MES H22 H H 0.000 -8.384 0.317 -1.104
MES H21 H H 0.000 -7.220 0.788 -2.369
MES C5 C CH2 0.000 -5.020 1.969 -0.455
MES H51 H H 0.000 -4.069 2.436 -0.720
MES H52 H H 0.000 -5.162 2.024 0.626
MES C6 C CH2 0.000 -6.163 2.702 -1.160
MES H62 H H 0.000 -6.026 2.628 -2.240
MES H61 H H 0.000 -6.153 3.753 -0.864
MES O1 O O2 0.000 -7.411 2.114 -0.795
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
MES O3S n/a S START
MES S O3S C8 .
MES O1S S . .
MES O2S S . .
MES C8 S C7 .
MES H81 C8 . .
MES H82 C8 . .
MES C7 C8 N4 .
MES H71 C7 . .
MES H72 C7 . .
MES N4 C7 C5 .
MES HN4 N4 . .
MES C3 N4 C2 .
MES H31 C3 . .
MES H32 C3 . .
MES C2 C3 H21 .
MES H22 C2 . .
MES H21 C2 . .
MES C5 N4 C6 .
MES H51 C5 . .
MES H52 C5 . .
MES C6 C5 O1 .
MES H62 C6 . .
MES H61 C6 . .
MES O1 C6 . END
MES O1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
MES O1 C2 single 1.426 0.020
MES O1 C6 single 1.426 0.020
MES C2 C3 single 1.524 0.020
MES H21 C2 single 1.092 0.020
MES H22 C2 single 1.092 0.020
MES C3 N4 single 1.472 0.020
MES H31 C3 single 1.092 0.020
MES H32 C3 single 1.092 0.020
MES C5 N4 single 1.472 0.020
MES N4 C7 single 1.472 0.020
MES HN4 N4 single 1.033 0.020
MES C6 C5 single 1.524 0.020
MES H51 C5 single 1.092 0.020
MES H52 C5 single 1.092 0.020
MES H61 C6 single 1.092 0.020
MES H62 C6 single 1.092 0.020
MES C7 C8 single 1.524 0.020
MES H71 C7 single 1.092 0.020
MES H72 C7 single 1.092 0.020
MES C8 S single 1.662 0.020
MES H81 C8 single 1.092 0.020
MES H82 C8 single 1.092 0.020
MES O1S S deloc 1.480 0.020
MES O2S S deloc 1.480 0.020
MES S O3S deloc 1.480 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
MES O3S S O1S 109.500 3.000
MES O3S S O2S 109.500 3.000
MES O3S S C8 109.500 3.000
MES O1S S O2S 109.500 3.000
MES O1S S C8 109.500 3.000
MES O2S S C8 109.500 3.000
MES S C8 H81 109.500 3.000
MES S C8 H82 109.500 3.000
MES S C8 C7 109.500 3.000
MES H81 C8 H82 107.900 3.000
MES H81 C8 C7 109.470 3.000
MES H82 C8 C7 109.470 3.000
MES C8 C7 H71 109.470 3.000
MES C8 C7 H72 109.470 3.000
MES C8 C7 N4 109.500 3.000
MES H71 C7 H72 107.900 3.000
MES H71 C7 N4 109.500 3.000
MES H72 C7 N4 109.500 3.000
MES C7 N4 HN4 109.500 3.000
MES C7 N4 C3 109.500 3.000
MES C7 N4 C5 109.500 3.000
MES HN4 N4 C3 109.500 3.000
MES HN4 N4 C5 109.500 3.000
MES C3 N4 C5 109.500 3.000
MES N4 C3 H31 109.500 3.000
MES N4 C3 H32 109.500 3.000
MES N4 C3 C2 109.500 3.000
MES H31 C3 H32 107.900 3.000
MES H31 C3 C2 109.470 3.000
MES H32 C3 C2 109.470 3.000
MES C3 C2 H22 109.470 3.000
MES C3 C2 H21 109.470 3.000
MES C3 C2 O1 109.470 3.000
MES H22 C2 H21 107.900 3.000
MES H22 C2 O1 109.470 3.000
MES H21 C2 O1 109.470 3.000
MES N4 C5 H51 109.500 3.000
MES N4 C5 H52 109.500 3.000
MES N4 C5 C6 109.500 3.000
MES H51 C5 H52 107.900 3.000
MES H51 C5 C6 109.470 3.000
MES H52 C5 C6 109.470 3.000
MES C5 C6 H62 109.470 3.000
MES C5 C6 H61 109.470 3.000
MES C5 C6 O1 109.470 3.000
MES H62 C6 H61 107.900 3.000
MES H62 C6 O1 109.470 3.000
MES H61 C6 O1 109.470 3.000
MES C6 O1 C2 111.800 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
MES var_1 O3S S C8 C7 -179.985 20.000 1
MES var_2 S C8 C7 N4 179.982 20.000 3
MES var_3 C8 C7 N4 C5 -65.146 20.000 1
MES var_4 C7 N4 C3 C2 180.000 20.000 1
MES var_5 N4 C3 C2 O1 -60.000 20.000 3
MES var_6 C7 N4 C5 C6 180.000 20.000 1
MES var_7 N4 C5 C6 O1 60.000 20.000 3
MES var_8 C5 C6 O1 C2 -60.000 20.000 1
MES var_9 C6 O1 C2 C3 60.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
MES chir_01 N4 C3 C5 C7 negativ
MES chir_02 S C8 O1S O2S positiv
# ------------------------------------------------------
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