1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
|
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
MET MET 'METHIONINE ' L-peptide 17 8 .
#
data_comp_MET
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
MET N N NH1 -0.204
MET H H HNH1 0.204
MET CA C CH1 0.058
MET HA H HCH1 0.046
MET CB C CH2 -0.076
MET HB3 H HCH2 0.038
MET HB2 H HCH2 0.038
MET CG C CH2 -0.024
MET HG3 H HCH2 0.041
MET HG2 H HCH2 0.041
MET SD S S -0.058
MET CE C CH3 -0.150
MET HE1 H HCH3 0.050
MET HE2 H HCH3 0.050
MET HE3 H HCH3 0.050
MET C C C 0.318
MET O O O -0.422
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
MET N n/a CA START
MET H N . .
MET CA N C .
MET HA CA . .
MET CB CA CG .
MET HB3 CB . .
MET HB2 CB . .
MET CG CB SD .
MET HG3 CG . .
MET HG2 CG . .
MET SD CG CE .
MET CE SD HE3 .
MET HE1 CE . .
MET HE2 CE . .
MET HE3 CE . .
MET C CA . END
MET O C . .
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
MET N H single 0.860 0.020
MET N CA single 1.458 0.019
MET CA HA single 0.980 0.020
MET CA CB single 1.530 0.020
MET CB HB3 single 0.970 0.020
MET CB HB2 single 0.970 0.020
MET CB CG single 1.520 0.020
MET CG HG3 single 0.970 0.020
MET CG HG2 single 0.970 0.020
MET CG SD single 1.803 0.020
MET SD CE single 1.791 0.020
MET CE HE1 single 0.960 0.020
MET CE HE2 single 0.960 0.020
MET CE HE3 single 0.960 0.020
MET CA C single 1.525 0.020
MET C O deloc 1.231 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
MET H N CA 114.000 3.000
MET HA CA CB 109.000 3.000
MET CB CA C 110.100 1.900
MET HA CA C 110.000 3.000
MET N CA HA 110.000 3.000
MET N CA CB 110.500 1.700
MET HB3 CB HB2 110.000 3.000
MET HB2 CB CG 108.000 3.000
MET HB3 CB CG 108.000 3.000
MET CA CB HB3 109.000 3.000
MET CA CB HB2 109.000 3.000
MET CA CB CG 114.100 2.000
MET HG3 CG HG2 110.000 3.000
MET HG2 CG SD 108.000 3.000
MET HG3 CG SD 108.000 3.000
MET CB CG HG3 109.000 3.000
MET CB CG HG2 109.000 3.000
MET CB CG SD 112.700 3.000
MET CG SD CE 100.900 2.200
MET HE1 CE HE2 110.000 3.000
MET HE2 CE HE3 110.000 3.000
MET HE1 CE HE3 110.000 3.000
MET SD CE HE1 109.000 3.000
MET SD CE HE2 109.000 3.000
MET SD CE HE3 109.000 3.000
MET N CA C 111.200 2.800
MET CA C O 120.800 1.700
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
MET chi1 N CA CB CG 180.000 15.000 3
MET chi2 CA CB CG SD 180.000 15.000 3
MET chi3 CB CG SD CE 180.000 15.000 3
MET hh CG SD CE HE3 60.000 30.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
MET chir_01 CA N CB C negativ
|
