1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
O15 O15 '(E)-2-(4-carbamimidoylbenzylideneami' non-polymer 32 18 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_O15
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
O15 O3 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
O15 C8 C C 0.000 -0.468 -1.160 -0.001
O15 O2 O OC -0.500 0.304 -2.145 -0.002
O15 C7 C CT 0.000 -1.960 -1.373 -0.002
O15 C9 C CH3 0.000 -2.362 -2.159 1.247
O15 H9B H H 0.000 -1.872 -3.098 1.248
O15 H9A H H 0.000 -2.083 -1.616 2.113
O15 H9 H H 0.000 -3.411 -2.309 1.249
O15 C10 C CH3 0.000 -2.362 -2.157 -1.251
O15 H10B H H 0.000 -1.873 -3.096 -1.252
O15 H10A H H 0.000 -3.411 -2.306 -1.252
O15 H10 H H 0.000 -2.083 -1.613 -2.116
O15 O1 O O2 0.000 -2.621 -0.105 -0.001
O15 N2 N N 0.000 -4.034 -0.193 0.000
O15 C6 C C1 0.000 -4.748 0.885 0.001
O15 H6 H H 0.000 -4.269 1.849 0.002
O15 C5 C CR6 0.000 -6.222 0.793 0.000
O15 C4 C CR16 0.000 -6.995 1.957 0.001
O15 H4 H H 0.000 -6.513 2.927 0.002
O15 C3 C CR16 0.000 -8.368 1.871 0.001
O15 H3 H H 0.000 -8.967 2.774 0.002
O15 C11 C CR16 0.000 -6.844 -0.457 -0.001
O15 H11 H H 0.000 -6.245 -1.360 -0.007
O15 C12 C CR16 0.000 -8.218 -0.542 0.005
O15 H12 H H 0.000 -8.701 -1.512 0.014
O15 C2 C CR6 0.000 -8.989 0.622 0.000
O15 C1 C C 0.000 -10.467 0.529 0.002
O15 N3 N N 0.000 -11.187 1.615 -0.003
O15 HN3 H H 0.000 -12.147 1.569 -0.002
O15 N1 N NH2 0.000 -11.081 -0.704 0.001
O15 HN1A H H 0.000 -12.097 -0.781 0.002
O15 HN1 H H 0.000 -10.531 -1.561 -0.001
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
O15 O3 n/a C8 START
O15 C8 O3 C7 .
O15 O2 C8 . .
O15 C7 C8 O1 .
O15 C9 C7 H9 .
O15 H9B C9 . .
O15 H9A C9 . .
O15 H9 C9 . .
O15 C10 C7 H10 .
O15 H10B C10 . .
O15 H10A C10 . .
O15 H10 C10 . .
O15 O1 C7 N2 .
O15 N2 O1 C6 .
O15 C6 N2 C5 .
O15 H6 C6 . .
O15 C5 C6 C11 .
O15 C4 C5 C3 .
O15 H4 C4 . .
O15 C3 C4 H3 .
O15 H3 C3 . .
O15 C11 C5 C12 .
O15 H11 C11 . .
O15 C12 C11 C2 .
O15 H12 C12 . .
O15 C2 C12 C1 .
O15 C1 C2 N1 .
O15 N3 C1 HN3 .
O15 HN3 N3 . .
O15 N1 C1 HN1 .
O15 HN1A N1 . .
O15 HN1 N1 . END
O15 C2 C3 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
O15 C10 C7 single 1.524 0.020
O15 O2 C8 deloc 1.250 0.020
O15 O1 C7 single 1.426 0.020
O15 N2 O1 single 1.255 0.020
O15 C7 C8 single 1.507 0.020
O15 C9 C7 single 1.524 0.020
O15 C6 N2 double 1.260 0.020
O15 C5 C6 single 1.480 0.020
O15 C8 O3 deloc 1.250 0.020
O15 C11 C5 double 1.390 0.020
O15 C12 C11 single 1.390 0.020
O15 C4 C5 single 1.390 0.020
O15 C2 C12 double 1.390 0.020
O15 C3 C4 double 1.390 0.020
O15 C2 C3 single 1.390 0.020
O15 C1 C2 single 1.500 0.020
O15 N3 C1 double 1.260 0.020
O15 N1 C1 single 1.332 0.020
O15 HN1 N1 single 1.010 0.020
O15 HN1A N1 single 1.010 0.020
O15 H3 C3 single 1.083 0.020
O15 HN3 N3 single 0.954 0.020
O15 H4 C4 single 1.083 0.020
O15 H6 C6 single 1.077 0.020
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O15 H9A C9 single 1.059 0.020
O15 H9B C9 single 1.059 0.020
O15 H10 C10 single 1.059 0.020
O15 H10A C10 single 1.059 0.020
O15 H10B C10 single 1.059 0.020
O15 H11 C11 single 1.083 0.020
O15 H12 C12 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
O15 O3 C8 O2 123.000 3.000
O15 O3 C8 C7 118.500 3.000
O15 O2 C8 C7 118.500 3.000
O15 C8 C7 C9 109.470 3.000
O15 C8 C7 C10 109.470 3.000
O15 C8 C7 O1 109.470 3.000
O15 C9 C7 C10 111.000 3.000
O15 C9 C7 O1 109.470 3.000
O15 C10 C7 O1 109.470 3.000
O15 C7 C9 H9B 109.470 3.000
O15 C7 C9 H9A 109.470 3.000
O15 C7 C9 H9 109.470 3.000
O15 H9B C9 H9A 109.470 3.000
O15 H9B C9 H9 109.470 3.000
O15 H9A C9 H9 109.470 3.000
O15 C7 C10 H10B 109.470 3.000
O15 C7 C10 H10A 109.470 3.000
O15 C7 C10 H10 109.470 3.000
O15 H10B C10 H10A 109.470 3.000
O15 H10B C10 H10 109.470 3.000
O15 H10A C10 H10 109.470 3.000
O15 C7 O1 N2 120.000 3.000
O15 O1 N2 C6 120.000 3.000
O15 N2 C6 H6 120.000 3.000
O15 N2 C6 C5 120.000 3.000
O15 H6 C6 C5 120.000 3.000
O15 C6 C5 C4 120.000 3.000
O15 C6 C5 C11 120.000 3.000
O15 C4 C5 C11 120.000 3.000
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O15 C5 C4 C3 120.000 3.000
O15 H4 C4 C3 120.000 3.000
O15 C4 C3 H3 120.000 3.000
O15 C4 C3 C2 120.000 3.000
O15 H3 C3 C2 120.000 3.000
O15 C5 C11 H11 120.000 3.000
O15 C5 C11 C12 120.000 3.000
O15 H11 C11 C12 120.000 3.000
O15 C11 C12 H12 120.000 3.000
O15 C11 C12 C2 120.000 3.000
O15 H12 C12 C2 120.000 3.000
O15 C12 C2 C1 120.000 3.000
O15 C12 C2 C3 120.000 3.000
O15 C1 C2 C3 120.000 3.000
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O15 C2 C1 N1 120.000 3.000
O15 N3 C1 N1 120.000 3.000
O15 C1 N3 HN3 120.000 3.000
O15 C1 N1 HN1A 120.000 3.000
O15 C1 N1 HN1 120.000 3.000
O15 HN1A N1 HN1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
O15 var_1 O3 C8 C7 O1 -0.025 20.000 1
O15 var_2 C8 C7 C9 H9 179.987 20.000 1
O15 var_3 C8 C7 C10 H10 -59.981 20.000 1
O15 var_4 C8 C7 O1 N2 -179.963 20.000 1
O15 var_5 C7 O1 N2 C6 179.993 20.000 1
O15 CONST_1 O1 N2 C6 C5 179.955 0.000 0
O15 var_6 N2 C6 C5 C11 0.049 20.000 1
O15 CONST_2 C6 C5 C4 C3 180.000 0.000 0
O15 CONST_3 C5 C4 C3 C2 0.000 0.000 0
O15 CONST_4 C6 C5 C11 C12 180.000 0.000 0
O15 CONST_5 C5 C11 C12 C2 0.000 0.000 0
O15 CONST_6 C11 C12 C2 C1 180.000 0.000 0
O15 CONST_7 C12 C2 C3 C4 0.000 0.000 0
O15 var_7 C12 C2 C1 N1 -0.330 20.000 1
O15 CONST_8 C2 C1 N3 HN3 180.000 0.000 0
O15 CONST_9 C2 C1 N1 HN1 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
O15 chir_01 C7 O1 C8 C9 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
O15 plan-1 C1 0.020
O15 plan-1 N1 0.020
O15 plan-1 C2 0.020
O15 plan-1 N3 0.020
O15 plan-1 HN3 0.020
O15 plan-1 HN1A 0.020
O15 plan-1 HN1 0.020
O15 plan-2 N1 0.020
O15 plan-2 C1 0.020
O15 plan-2 HN1 0.020
O15 plan-2 HN1A 0.020
O15 plan-3 C2 0.020
O15 plan-3 C1 0.020
O15 plan-3 C3 0.020
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O15 plan-3 H3 0.020
O15 plan-3 H4 0.020
O15 plan-3 C6 0.020
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O15 plan-3 H6 0.020
O15 plan-4 N2 0.020
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O15 plan-5 O3 0.020
O15 plan-5 C7 0.020
# ------------------------------------------------------
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