1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
O60 O60 'decane-1,10-diyl disulfamate ' non-polymer 44 20 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_O60
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
O60 O6 O OS 0.000 0.000 0.000 0.000
O60 S2 S ST 0.000 -1.108 0.876 0.161
O60 O5 O OS 0.000 -1.365 1.973 -0.704
O60 N2 N NH2 0.000 -0.989 1.503 1.690
O60 HN2A H H 0.000 -0.221 2.123 1.942
O60 HN2 H H 0.000 -1.681 1.278 2.403
O60 O4 O O2 0.000 -2.354 0.003 0.129
O60 C10 C CH2 0.000 -3.578 0.738 0.085
O60 H10 H H 0.000 -3.597 1.360 -0.812
O60 H10A H H 0.000 -3.652 1.375 0.969
O60 C9 C CH2 0.000 -4.758 -0.236 0.056
O60 H9 H H 0.000 -4.738 -0.858 0.954
O60 H9A H H 0.000 -4.683 -0.873 -0.828
O60 C8 C CH2 0.000 -6.069 0.552 0.009
O60 H8 H H 0.000 -6.087 1.175 -0.888
O60 H8A H H 0.000 -6.143 1.188 0.894
O60 C7 C CH2 0.000 -7.249 -0.422 -0.020
O60 H7 H H 0.000 -7.229 -1.045 0.876
O60 H7A H H 0.000 -7.173 -1.058 -0.905
O60 C6 C CH2 0.000 -8.560 0.366 -0.067
O60 H6 H H 0.000 -8.578 0.989 -0.963
O60 H6A H H 0.000 -8.633 1.002 0.818
O60 C5 C CH2 0.000 -9.738 -0.608 -0.096
O60 H5 H H 0.000 -9.718 -1.231 0.800
O60 H5A H H 0.000 -9.663 -1.244 -0.981
O60 C4 C CH2 0.000 -11.049 0.180 -0.143
O60 H4 H H 0.000 -11.068 0.803 -1.039
O60 H4A H H 0.000 -11.123 0.816 0.742
O60 C3 C CH2 0.000 -12.229 -0.794 -0.172
O60 H3 H H 0.000 -12.208 -1.417 0.725
O60 H3A H H 0.000 -12.153 -1.430 -1.057
O60 C2 C CH2 0.000 -13.540 -0.007 -0.218
O60 H2 H H 0.000 -13.558 0.616 -1.115
O60 H2A H H 0.000 -13.613 0.629 0.667
O60 C1 C CH2 0.000 -14.720 -0.980 -0.248
O60 H1 H H 0.000 -14.699 -1.603 0.649
O60 H1A H H 0.000 -14.644 -1.616 -1.133
O60 O3 O O2 0.000 -15.943 -0.245 -0.292
O60 S1 S ST 0.000 -17.190 -1.118 -0.324
O60 O1 O OS 0.000 -16.881 -2.227 -1.156
O60 O2 O OS 0.000 -18.285 -0.245 -0.568
O60 N1 N NH2 0.000 -17.404 -1.723 1.202
O60 HN1A H H 0.000 -18.187 -2.340 1.414
O60 HN1 H H 0.000 -16.757 -1.488 1.953
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
O60 O6 n/a S2 START
O60 S2 O6 O4 .
O60 O5 S2 . .
O60 N2 S2 HN2 .
O60 HN2A N2 . .
O60 HN2 N2 . .
O60 O4 S2 C10 .
O60 C10 O4 C9 .
O60 H10 C10 . .
O60 H10A C10 . .
O60 C9 C10 C8 .
O60 H9 C9 . .
O60 H9A C9 . .
O60 C8 C9 C7 .
O60 H8 C8 . .
O60 H8A C8 . .
O60 C7 C8 C6 .
O60 H7 C7 . .
O60 H7A C7 . .
O60 C6 C7 C5 .
O60 H6 C6 . .
O60 H6A C6 . .
O60 C5 C6 C4 .
O60 H5 C5 . .
O60 H5A C5 . .
O60 C4 C5 C3 .
O60 H4 C4 . .
O60 H4A C4 . .
O60 C3 C4 C2 .
O60 H3 C3 . .
O60 H3A C3 . .
O60 C2 C3 C1 .
O60 H2 C2 . .
O60 H2A C2 . .
O60 C1 C2 O3 .
O60 H1 C1 . .
O60 H1A C1 . .
O60 O3 C1 S1 .
O60 S1 O3 N1 .
O60 O1 S1 . .
O60 O2 S1 . .
O60 N1 S1 HN1 .
O60 HN1A N1 . .
O60 HN1 N1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
O60 C1 C2 single 1.524 0.020
O60 O3 C1 single 1.426 0.020
O60 N1 S1 single 1.600 0.020
O60 O1 S1 double 1.436 0.020
O60 O2 S1 double 1.436 0.020
O60 S1 O3 single 1.535 0.020
O60 C2 C3 single 1.524 0.020
O60 N2 S2 single 1.600 0.020
O60 O4 S2 single 1.535 0.020
O60 O5 S2 double 1.436 0.020
O60 S2 O6 double 1.436 0.020
O60 C3 C4 single 1.524 0.020
O60 C4 C5 single 1.524 0.020
O60 C10 O4 single 1.426 0.020
O60 C5 C6 single 1.524 0.020
O60 C6 C7 single 1.524 0.020
O60 C7 C8 single 1.524 0.020
O60 C8 C9 single 1.524 0.020
O60 C9 C10 single 1.524 0.020
O60 H1 C1 single 1.092 0.020
O60 H1A C1 single 1.092 0.020
O60 HN1 N1 single 1.010 0.020
O60 HN1A N1 single 1.010 0.020
O60 H2 C2 single 1.092 0.020
O60 H2A C2 single 1.092 0.020
O60 HN2 N2 single 1.010 0.020
O60 HN2A N2 single 1.010 0.020
O60 H3 C3 single 1.092 0.020
O60 H3A C3 single 1.092 0.020
O60 H4 C4 single 1.092 0.020
O60 H4A C4 single 1.092 0.020
O60 H5 C5 single 1.092 0.020
O60 H5A C5 single 1.092 0.020
O60 H6 C6 single 1.092 0.020
O60 H6A C6 single 1.092 0.020
O60 H7 C7 single 1.092 0.020
O60 H7A C7 single 1.092 0.020
O60 H8 C8 single 1.092 0.020
O60 H8A C8 single 1.092 0.020
O60 H9 C9 single 1.092 0.020
O60 H9A C9 single 1.092 0.020
O60 H10 C10 single 1.092 0.020
O60 H10A C10 single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
O60 O6 S2 O5 109.500 3.000
O60 O6 S2 N2 109.500 3.000
O60 O6 S2 O4 109.500 3.000
O60 O5 S2 N2 109.500 3.000
O60 O5 S2 O4 109.500 3.000
O60 N2 S2 O4 109.500 3.000
O60 S2 N2 HN2A 120.000 3.000
O60 S2 N2 HN2 120.000 3.000
O60 HN2A N2 HN2 120.000 3.000
O60 S2 O4 C10 120.000 3.000
O60 O4 C10 H10 109.470 3.000
O60 O4 C10 H10A 109.470 3.000
O60 O4 C10 C9 109.470 3.000
O60 H10 C10 H10A 107.900 3.000
O60 H10 C10 C9 109.470 3.000
O60 H10A C10 C9 109.470 3.000
O60 C10 C9 H9 109.470 3.000
O60 C10 C9 H9A 109.470 3.000
O60 C10 C9 C8 111.000 3.000
O60 H9 C9 H9A 107.900 3.000
O60 H9 C9 C8 109.470 3.000
O60 H9A C9 C8 109.470 3.000
O60 C9 C8 H8 109.470 3.000
O60 C9 C8 H8A 109.470 3.000
O60 C9 C8 C7 111.000 3.000
O60 H8 C8 H8A 107.900 3.000
O60 H8 C8 C7 109.470 3.000
O60 H8A C8 C7 109.470 3.000
O60 C8 C7 H7 109.470 3.000
O60 C8 C7 H7A 109.470 3.000
O60 C8 C7 C6 111.000 3.000
O60 H7 C7 H7A 107.900 3.000
O60 H7 C7 C6 109.470 3.000
O60 H7A C7 C6 109.470 3.000
O60 C7 C6 H6 109.470 3.000
O60 C7 C6 H6A 109.470 3.000
O60 C7 C6 C5 111.000 3.000
O60 H6 C6 H6A 107.900 3.000
O60 H6 C6 C5 109.470 3.000
O60 H6A C6 C5 109.470 3.000
O60 C6 C5 H5 109.470 3.000
O60 C6 C5 H5A 109.470 3.000
O60 C6 C5 C4 111.000 3.000
O60 H5 C5 H5A 107.900 3.000
O60 H5 C5 C4 109.470 3.000
O60 H5A C5 C4 109.470 3.000
O60 C5 C4 H4 109.470 3.000
O60 C5 C4 H4A 109.470 3.000
O60 C5 C4 C3 111.000 3.000
O60 H4 C4 H4A 107.900 3.000
O60 H4 C4 C3 109.470 3.000
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O60 C4 C3 H3 109.470 3.000
O60 C4 C3 H3A 109.470 3.000
O60 C4 C3 C2 111.000 3.000
O60 H3 C3 H3A 107.900 3.000
O60 H3 C3 C2 109.470 3.000
O60 H3A C3 C2 109.470 3.000
O60 C3 C2 H2 109.470 3.000
O60 C3 C2 H2A 109.470 3.000
O60 C3 C2 C1 111.000 3.000
O60 H2 C2 H2A 107.900 3.000
O60 H2 C2 C1 109.470 3.000
O60 H2A C2 C1 109.470 3.000
O60 C2 C1 H1 109.470 3.000
O60 C2 C1 H1A 109.470 3.000
O60 C2 C1 O3 109.470 3.000
O60 H1 C1 H1A 107.900 3.000
O60 H1 C1 O3 109.470 3.000
O60 H1A C1 O3 109.470 3.000
O60 C1 O3 S1 120.000 3.000
O60 O3 S1 O1 109.500 3.000
O60 O3 S1 O2 109.500 3.000
O60 O3 S1 N1 109.500 3.000
O60 O1 S1 O2 109.500 3.000
O60 O1 S1 N1 109.500 3.000
O60 O2 S1 N1 109.500 3.000
O60 S1 N1 HN1A 120.000 3.000
O60 S1 N1 HN1 120.000 3.000
O60 HN1A N1 HN1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
O60 var_1 O6 S2 N2 HN2 -113.549 20.000 1
O60 var_2 O6 S2 O4 C10 -171.464 20.000 1
O60 var_3 S2 O4 C10 C9 -179.970 20.000 1
O60 var_4 O4 C10 C9 C8 -179.989 20.000 3
O60 var_5 C10 C9 C8 C7 179.960 20.000 3
O60 var_6 C9 C8 C7 C6 179.960 20.000 3
O60 var_7 C8 C7 C6 C5 180.000 20.000 3
O60 var_8 C7 C6 C5 C4 180.000 20.000 3
O60 var_9 C6 C5 C4 C3 180.000 20.000 3
O60 var_10 C5 C4 C3 C2 -180.000 20.000 3
O60 var_11 C4 C3 C2 C1 -180.000 20.000 3
O60 var_12 C3 C2 C1 O3 -179.972 20.000 3
O60 var_13 C2 C1 O3 S1 -179.991 20.000 1
O60 var_14 C1 O3 S1 N1 74.982 20.000 1
O60 var_15 O3 S1 N1 HN1 0.008 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
O60 chir_01 S1 N1 O1 O2 negativ
O60 chir_02 S2 N2 O4 O5 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
O60 plan-1 N1 0.020
O60 plan-1 S1 0.020
O60 plan-1 HN1 0.020
O60 plan-1 HN1A 0.020
O60 plan-2 N2 0.020
O60 plan-2 S2 0.020
O60 plan-2 HN2 0.020
O60 plan-2 HN2A 0.020
# ------------------------------------------------------
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