1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
O8A O8A 'N-cyclopropyl-5-[2-methyl-5-(trifluo' non-polymer 40 26 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_O8A
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
O8A F3 F F 0.000 0.000 0.000 0.000
O8A C8 C CT 0.000 -1.383 0.146 -0.146
O8A F1 F F 0.000 -1.822 1.228 0.625
O8A F2 F F 0.000 -1.688 0.379 -1.492
O8A O1 O O2 0.000 -2.038 -1.046 0.292
O8A C5 C CR6 0.000 -3.396 -1.069 0.215
O8A C6 C CR16 0.000 -4.086 -2.195 0.617
O8A H6 H H 0.000 -3.549 -3.058 0.989
O8A C1 C CR56 0.000 -5.481 -2.215 0.543
O8A C4 C CR16 0.000 -4.080 0.041 -0.274
O8A H4 H H 0.000 -3.528 0.917 -0.590
O8A C3 C CR16 0.000 -5.455 0.030 -0.358
O8A H3 H H 0.000 -5.982 0.896 -0.740
O8A C2 C CR56 0.000 -6.164 -1.091 0.049
O8A N2 N NR5 0.000 -7.511 -1.414 0.092
O8A C7 C CR5 0.000 -7.606 -2.678 0.594
O8A C9 C CH3 0.000 -8.896 -3.425 0.813
O8A H9B H H 0.000 -9.613 -3.108 0.101
O8A H9A H H 0.000 -8.726 -4.465 0.702
O8A H9 H H 0.000 -9.258 -3.229 1.789
O8A N1 N NRD5 0.000 -6.420 -3.145 0.857
O8A C10 C CR5 0.000 -8.569 -0.599 -0.301
O8A C13 C CR15 0.000 -9.394 -0.864 -1.333
O8A H13 H H 0.000 -9.292 -1.751 -1.947
O8A C12 C CR15 0.000 -10.371 0.074 -1.548
O8A H12 H H 0.000 -11.106 -0.004 -2.339
O8A C11 C CR5 0.000 -10.326 1.117 -0.664
O8A S1 S S2 0.000 -8.995 0.868 0.456
O8A C14 C C 0.000 -11.242 2.258 -0.653
O8A O2 O O 0.000 -12.133 2.331 -1.479
O8A N3 N NH1 0.000 -11.097 3.228 0.271
O8A HN3 H H 0.000 -10.357 3.167 0.956
O8A C15 C CH1 0.000 -12.013 4.370 0.283
O8A H15 H H 0.000 -12.888 4.306 -0.379
O8A C17 C CH2 0.000 -11.407 5.761 0.485
O8A H17 H H 0.000 -11.881 6.701 0.197
O8A H17A H H 0.000 -10.390 5.959 0.830
O8A C16 C CH2 0.000 -12.210 5.105 1.610
O8A H16A H H 0.000 -13.277 5.255 1.790
O8A H16 H H 0.000 -11.785 4.512 2.423
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
O8A F3 n/a C8 START
O8A C8 F3 O1 .
O8A F1 C8 . .
O8A F2 C8 . .
O8A O1 C8 C5 .
O8A C5 O1 C4 .
O8A C6 C5 C1 .
O8A H6 C6 . .
O8A C1 C6 . .
O8A C4 C5 C3 .
O8A H4 C4 . .
O8A C3 C4 C2 .
O8A H3 C3 . .
O8A C2 C3 N2 .
O8A N2 C2 C10 .
O8A C7 N2 N1 .
O8A C9 C7 H9 .
O8A H9B C9 . .
O8A H9A C9 . .
O8A H9 C9 . .
O8A N1 C7 . .
O8A C10 N2 C13 .
O8A C13 C10 C12 .
O8A H13 C13 . .
O8A C12 C13 C11 .
O8A H12 C12 . .
O8A C11 C12 C14 .
O8A S1 C11 . .
O8A C14 C11 N3 .
O8A O2 C14 . .
O8A N3 C14 C15 .
O8A HN3 N3 . .
O8A C15 N3 C17 .
O8A H15 C15 . .
O8A C17 C15 C16 .
O8A H17 C17 . .
O8A H17A C17 . .
O8A C16 C17 H16 .
O8A H16A C16 . .
O8A H16 C16 . END
O8A C1 N1 . ADD
O8A C1 C2 . ADD
O8A S1 C10 . ADD
O8A C15 C16 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
O8A C1 N1 single 1.350 0.020
O8A C1 C2 double 1.490 0.020
O8A C1 C6 single 1.390 0.020
O8A F1 C8 single 1.320 0.020
O8A N1 C7 double 1.350 0.020
O8A C5 O1 single 1.370 0.020
O8A O1 C8 single 1.426 0.020
O8A S1 C10 single 1.745 0.020
O8A S1 C11 single 1.745 0.020
O8A N2 C2 single 1.337 0.020
O8A C2 C3 single 1.390 0.020
O8A F2 C8 single 1.320 0.020
O8A C7 N2 single 1.337 0.020
O8A C10 N2 single 1.337 0.020
O8A O2 C14 double 1.220 0.020
O8A C3 C4 double 1.390 0.020
O8A C8 F3 single 1.320 0.020
O8A N3 C14 single 1.330 0.020
O8A C15 N3 single 1.450 0.020
O8A C4 C5 single 1.390 0.020
O8A C6 C5 double 1.390 0.020
O8A C9 C7 single 1.506 0.020
O8A C13 C10 double 1.387 0.020
O8A C11 C12 double 1.387 0.020
O8A C14 C11 single 1.490 0.020
O8A C12 C13 single 1.380 0.020
O8A C15 C16 single 1.524 0.020
O8A C17 C15 single 1.524 0.020
O8A C16 C17 single 1.524 0.020
O8A H3 C3 single 1.083 0.020
O8A HN3 N3 single 1.010 0.020
O8A H4 C4 single 1.083 0.020
O8A H6 C6 single 1.083 0.020
O8A H9 C9 single 1.059 0.020
O8A H9A C9 single 1.059 0.020
O8A H9B C9 single 1.059 0.020
O8A H12 C12 single 1.083 0.020
O8A H13 C13 single 1.083 0.020
O8A H15 C15 single 1.099 0.020
O8A H16 C16 single 1.092 0.020
O8A H16A C16 single 1.092 0.020
O8A H17 C17 single 1.092 0.020
O8A H17A C17 single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
O8A F3 C8 F1 109.470 3.000
O8A F3 C8 F2 109.470 3.000
O8A F3 C8 O1 109.500 3.000
O8A F1 C8 F2 109.470 3.000
O8A F1 C8 O1 109.500 3.000
O8A F2 C8 O1 109.500 3.000
O8A C8 O1 C5 120.000 3.000
O8A O1 C5 C6 120.000 3.000
O8A O1 C5 C4 120.000 3.000
O8A C6 C5 C4 120.000 3.000
O8A C5 C6 H6 120.000 3.000
O8A C5 C6 C1 120.000 3.000
O8A H6 C6 C1 120.000 3.000
O8A C6 C1 N1 132.000 3.000
O8A C6 C1 C2 120.000 3.000
O8A N1 C1 C2 108.000 3.000
O8A C5 C4 H4 120.000 3.000
O8A C5 C4 C3 120.000 3.000
O8A H4 C4 C3 120.000 3.000
O8A C4 C3 H3 120.000 3.000
O8A C4 C3 C2 120.000 3.000
O8A H3 C3 C2 120.000 3.000
O8A C3 C2 N2 132.000 3.000
O8A C3 C2 C1 120.000 3.000
O8A N2 C2 C1 108.000 3.000
O8A C2 N2 C7 108.000 3.000
O8A C2 N2 C10 108.000 3.000
O8A C7 N2 C10 108.000 3.000
O8A N2 C7 C9 126.000 3.000
O8A N2 C7 N1 108.000 3.000
O8A C9 C7 N1 126.000 3.000
O8A C7 C9 H9B 109.470 3.000
O8A C7 C9 H9A 109.470 3.000
O8A C7 C9 H9 109.470 3.000
O8A H9B C9 H9A 109.470 3.000
O8A H9B C9 H9 109.470 3.000
O8A H9A C9 H9 109.470 3.000
O8A C7 N1 C1 108.000 3.000
O8A N2 C10 C13 108.000 3.000
O8A N2 C10 S1 108.000 3.000
O8A C13 C10 S1 108.000 3.000
O8A C10 C13 H13 126.000 3.000
O8A C10 C13 C12 108.000 3.000
O8A H13 C13 C12 126.000 3.000
O8A C13 C12 H12 126.000 3.000
O8A C13 C12 C11 108.000 3.000
O8A H12 C12 C11 126.000 3.000
O8A C12 C11 S1 108.000 3.000
O8A C12 C11 C14 126.000 3.000
O8A S1 C11 C14 108.000 3.000
O8A C11 S1 C10 91.621 3.000
O8A C11 C14 O2 120.500 3.000
O8A C11 C14 N3 120.000 3.000
O8A O2 C14 N3 123.000 3.000
O8A C14 N3 HN3 120.000 3.000
O8A C14 N3 C15 121.500 3.000
O8A HN3 N3 C15 118.500 3.000
O8A N3 C15 H15 108.550 3.000
O8A N3 C15 C17 110.000 3.000
O8A N3 C15 C16 110.000 3.000
O8A H15 C15 C17 108.340 3.000
O8A H15 C15 C16 108.340 3.000
O8A C17 C15 C16 60.000 3.000
O8A C15 C17 H17 109.470 3.000
O8A C15 C17 H17A 109.470 3.000
O8A C15 C17 C16 60.000 3.000
O8A H17 C17 H17A 107.900 3.000
O8A H17 C17 C16 109.470 3.000
O8A H17A C17 C16 109.470 3.000
O8A C17 C16 H16A 109.470 3.000
O8A C17 C16 H16 109.470 3.000
O8A C17 C16 C15 60.000 3.000
O8A H16A C16 H16 107.900 3.000
O8A H16A C16 C15 109.470 3.000
O8A H16 C16 C15 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
O8A var_1 F3 C8 O1 C5 -179.974 20.000 1
O8A var_2 C8 O1 C5 C4 -0.023 20.000 1
O8A CONST_1 O1 C5 C6 C1 180.000 0.000 0
O8A CONST_2 C5 C6 C1 N1 180.000 0.000 0
O8A CONST_3 C6 C1 N1 C7 180.000 0.000 0
O8A CONST_4 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
O8A CONST_5 O1 C5 C4 C3 180.000 0.000 0
O8A CONST_6 C5 C4 C3 C2 0.000 0.000 0
O8A CONST_7 C4 C3 C2 N2 180.000 0.000 0
O8A CONST_8 C3 C2 N2 C10 0.000 0.000 0
O8A CONST_9 C2 N2 C7 N1 0.000 0.000 0
O8A var_3 N2 C7 C9 H9 -90.015 20.000 1
O8A CONST_10 N2 C7 N1 C1 0.000 0.000 0
O8A var_4 C2 N2 C10 C13 115.006 20.000 1
O8A CONST_11 N2 C10 C13 C12 180.000 0.000 0
O8A CONST_12 C10 C13 C12 C11 0.000 0.000 0
O8A CONST_13 C13 C12 C11 C14 180.000 0.000 0
O8A CONST_14 C12 C11 S1 C10 0.000 0.000 0
O8A CONST_15 C11 S1 C10 N2 180.000 0.000 0
O8A var_5 C12 C11 C14 N3 179.965 20.000 1
O8A CONST_16 C11 C14 N3 C15 180.000 0.000 0
O8A var_6 C14 N3 C15 C17 -136.383 20.000 3
O8A var_7 N3 C15 C16 C17 107.501 20.000 3
O8A var_8 N3 C15 C17 C16 -107.509 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
O8A chir_01 C8 F1 O1 F2 negativ
O8A chir_02 C15 N3 C16 C17 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
O8A plan-1 C1 0.020
O8A plan-1 N1 0.020
O8A plan-1 C2 0.020
O8A plan-1 C6 0.020
O8A plan-1 C3 0.020
O8A plan-1 C4 0.020
O8A plan-1 C5 0.020
O8A plan-1 C7 0.020
O8A plan-1 N2 0.020
O8A plan-1 C10 0.020
O8A plan-1 H3 0.020
O8A plan-1 H4 0.020
O8A plan-1 O1 0.020
O8A plan-1 H6 0.020
O8A plan-1 C9 0.020
O8A plan-2 N3 0.020
O8A plan-2 C14 0.020
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O8A plan-2 HN3 0.020
O8A plan-3 C10 0.020
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O8A plan-3 N2 0.020
O8A plan-3 C13 0.020
O8A plan-3 C11 0.020
O8A plan-3 C12 0.020
O8A plan-3 C14 0.020
O8A plan-3 H12 0.020
O8A plan-3 H13 0.020
O8A plan-4 C14 0.020
O8A plan-4 O2 0.020
O8A plan-4 N3 0.020
O8A plan-4 C11 0.020
O8A plan-4 HN3 0.020
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