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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
ODI ODI 'OCTANE-1,8-DIOL ' non-polymer 28 10 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_ODI
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
ODI OAB O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
ODI HAB H H 0.000 0.741 -0.621 0.000
ODI CAD C CH2 0.000 -1.229 -0.728 0.000
ODI HAD1 H H 0.000 -1.279 -1.357 0.891
ODI HAD2 H H 0.000 -1.279 -1.357 -0.891
ODI CAF C CH2 0.000 -2.403 0.254 0.000
ODI HAF1 H H 0.000 -2.351 0.883 -0.891
ODI HAF2 H H 0.000 -2.351 0.883 0.891
ODI CAH C CH2 0.000 -3.720 -0.526 0.000
ODI HAH1 H H 0.000 -3.770 -1.155 0.891
ODI HAH2 H H 0.000 -3.770 -1.155 -0.891
ODI CAJ C CH2 0.000 -4.893 0.457 0.000
ODI HAJ1 H H 0.000 -4.841 1.085 -0.891
ODI HAJ2 H H 0.000 -4.841 1.085 0.891
ODI CAI C CH2 0.000 -6.210 -0.324 0.000
ODI HAI1 H H 0.000 -6.261 -0.953 0.891
ODI HAI2 H H 0.000 -6.261 -0.953 -0.891
ODI CAG C CH2 0.000 -7.384 0.659 0.000
ODI HAG1 H H 0.000 -7.332 1.288 -0.891
ODI HAG2 H H 0.000 -7.332 1.288 0.891
ODI CAE C CH2 0.000 -8.700 -0.121 0.000
ODI HAE1 H H 0.000 -8.750 -0.750 0.891
ODI HAE2 H H 0.000 -8.750 -0.750 -0.891
ODI CAC C CH2 0.000 -9.875 0.861 0.000
ODI HAC1 H H 0.000 -9.823 1.490 -0.891
ODI HAC2 H H 0.000 -9.823 1.490 0.891
ODI OAA O OH1 0.000 -11.104 0.133 0.000
ODI HAA H H 0.000 -11.845 0.754 0.000
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
ODI OAB n/a CAD START
ODI HAB OAB . .
ODI CAD OAB CAF .
ODI HAD1 CAD . .
ODI HAD2 CAD . .
ODI CAF CAD CAH .
ODI HAF1 CAF . .
ODI HAF2 CAF . .
ODI CAH CAF CAJ .
ODI HAH1 CAH . .
ODI HAH2 CAH . .
ODI CAJ CAH CAI .
ODI HAJ1 CAJ . .
ODI HAJ2 CAJ . .
ODI CAI CAJ CAG .
ODI HAI1 CAI . .
ODI HAI2 CAI . .
ODI CAG CAI CAE .
ODI HAG1 CAG . .
ODI HAG2 CAG . .
ODI CAE CAG CAC .
ODI HAE1 CAE . .
ODI HAE2 CAE . .
ODI CAC CAE OAA .
ODI HAC1 CAC . .
ODI HAC2 CAC . .
ODI OAA CAC HAA .
ODI HAA OAA . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
ODI OAA CAC single 1.432 0.020
ODI HAA OAA single 0.967 0.020
ODI CAC CAE single 1.524 0.020
ODI HAC1 CAC single 1.092 0.020
ODI HAC2 CAC single 1.092 0.020
ODI CAE CAG single 1.524 0.020
ODI HAE1 CAE single 1.092 0.020
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ODI CAG CAI single 1.524 0.020
ODI HAG1 CAG single 1.092 0.020
ODI HAG2 CAG single 1.092 0.020
ODI CAI CAJ single 1.524 0.020
ODI HAI1 CAI single 1.092 0.020
ODI HAI2 CAI single 1.092 0.020
ODI CAJ CAH single 1.524 0.020
ODI HAJ1 CAJ single 1.092 0.020
ODI HAJ2 CAJ single 1.092 0.020
ODI CAH CAF single 1.524 0.020
ODI HAH1 CAH single 1.092 0.020
ODI HAH2 CAH single 1.092 0.020
ODI CAF CAD single 1.524 0.020
ODI HAF1 CAF single 1.092 0.020
ODI HAF2 CAF single 1.092 0.020
ODI CAD OAB single 1.432 0.020
ODI HAD1 CAD single 1.092 0.020
ODI HAD2 CAD single 1.092 0.020
ODI HAB OAB single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
ODI HAB OAB CAD 109.470 3.000
ODI OAB CAD HAD1 109.470 3.000
ODI OAB CAD HAD2 109.470 3.000
ODI OAB CAD CAF 109.470 3.000
ODI HAD1 CAD HAD2 107.900 3.000
ODI HAD1 CAD CAF 109.470 3.000
ODI HAD2 CAD CAF 109.470 3.000
ODI CAD CAF HAF1 109.470 3.000
ODI CAD CAF HAF2 109.470 3.000
ODI CAD CAF CAH 111.000 3.000
ODI HAF1 CAF HAF2 107.900 3.000
ODI HAF1 CAF CAH 109.470 3.000
ODI HAF2 CAF CAH 109.470 3.000
ODI CAF CAH HAH1 109.470 3.000
ODI CAF CAH HAH2 109.470 3.000
ODI CAF CAH CAJ 111.000 3.000
ODI HAH1 CAH HAH2 107.900 3.000
ODI HAH1 CAH CAJ 109.470 3.000
ODI HAH2 CAH CAJ 109.470 3.000
ODI CAH CAJ HAJ1 109.470 3.000
ODI CAH CAJ HAJ2 109.470 3.000
ODI CAH CAJ CAI 111.000 3.000
ODI HAJ1 CAJ HAJ2 107.900 3.000
ODI HAJ1 CAJ CAI 109.470 3.000
ODI HAJ2 CAJ CAI 109.470 3.000
ODI CAJ CAI HAI1 109.470 3.000
ODI CAJ CAI HAI2 109.470 3.000
ODI CAJ CAI CAG 111.000 3.000
ODI HAI1 CAI HAI2 107.900 3.000
ODI HAI1 CAI CAG 109.470 3.000
ODI HAI2 CAI CAG 109.470 3.000
ODI CAI CAG HAG1 109.470 3.000
ODI CAI CAG HAG2 109.470 3.000
ODI CAI CAG CAE 111.000 3.000
ODI HAG1 CAG HAG2 107.900 3.000
ODI HAG1 CAG CAE 109.470 3.000
ODI HAG2 CAG CAE 109.470 3.000
ODI CAG CAE HAE1 109.470 3.000
ODI CAG CAE HAE2 109.470 3.000
ODI CAG CAE CAC 111.000 3.000
ODI HAE1 CAE HAE2 107.900 3.000
ODI HAE1 CAE CAC 109.470 3.000
ODI HAE2 CAE CAC 109.470 3.000
ODI CAE CAC HAC1 109.470 3.000
ODI CAE CAC HAC2 109.470 3.000
ODI CAE CAC OAA 109.470 3.000
ODI HAC1 CAC HAC2 107.900 3.000
ODI HAC1 CAC OAA 109.470 3.000
ODI HAC2 CAC OAA 109.470 3.000
ODI CAC OAA HAA 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
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_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
ODI var_1 HAB OAB CAD CAF 180.000 20.000 1
ODI var_2 OAB CAD CAF CAH 180.000 20.000 3
ODI var_3 CAD CAF CAH CAJ 180.000 20.000 3
ODI var_4 CAF CAH CAJ CAI 180.000 20.000 3
ODI var_5 CAH CAJ CAI CAG 180.000 20.000 3
ODI var_6 CAJ CAI CAG CAE 180.000 20.000 3
ODI var_7 CAI CAG CAE CAC 180.000 20.000 3
ODI var_8 CAG CAE CAC OAA 180.000 20.000 3
ODI var_9 CAE CAC OAA HAA 180.000 20.000 1
# ------------------------------------------------------
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