1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
OHT OHT '4-HYDROXYTAMOXIFEN ' non-polymer 58 29 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_OHT
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
OHT O4 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
OHT HO4 H H 0.000 0.243 0.547 -0.759
OHT C4 C CR6 0.000 -1.349 0.030 0.167
OHT C3 C CR16 0.000 -2.147 -0.908 -0.473
OHT H3 H H 0.000 -1.694 -1.662 -1.105
OHT C2 C CR16 0.000 -3.515 -0.881 -0.306
OHT H2 H H 0.000 -4.136 -1.614 -0.805
OHT C5 C CR16 0.000 -1.924 0.999 0.978
OHT H5 H H 0.000 -1.297 1.726 1.480
OHT C6 C CR16 0.000 -3.292 1.037 1.144
OHT H6 H H 0.000 -3.741 1.800 1.768
OHT C1 C CR6 0.000 -4.098 0.092 0.508
OHT C7 C C 0.000 -5.565 0.125 0.689
OHT C8 C C 0.000 -6.098 -0.012 1.928
OHT C11 C CR6 0.000 -7.556 0.021 2.109
OHT C12 C CR16 0.000 -8.286 1.156 1.739
OHT H12 H H 0.000 -7.777 2.016 1.322
OHT C13 C CR16 0.000 -9.653 1.176 1.906
OHT H13 H H 0.000 -10.220 2.051 1.611
OHT C14 C CR16 0.000 -10.305 0.083 2.450
OHT H14 H H 0.000 -11.379 0.108 2.584
OHT C15 C CR16 0.000 -9.591 -1.040 2.823
OHT H15 H H 0.000 -10.108 -1.892 3.247
OHT C16 C CR16 0.000 -8.222 -1.079 2.658
OHT H16 H H 0.000 -7.665 -1.960 2.953
OHT C9 C CH2 0.000 -5.195 -0.199 3.120
OHT H91 H H 0.000 -5.800 -0.291 4.024
OHT H92 H H 0.000 -4.532 0.664 3.214
OHT C10 C CH3 0.000 -4.360 -1.468 2.933
OHT H103 H H 0.000 -3.723 -1.602 3.770
OHT H102 H H 0.000 -5.001 -2.307 2.843
OHT H101 H H 0.000 -3.771 -1.381 2.055
OHT C17 C CR6 0.000 -6.452 0.310 -0.481
OHT C22 C CR16 0.000 -7.388 -0.669 -0.809
OHT H22 H H 0.000 -7.466 -1.567 -0.209
OHT C21 C CR16 0.000 -8.216 -0.492 -1.897
OHT H21 H H 0.000 -8.948 -1.250 -2.148
OHT C20 C CR6 0.000 -8.111 0.655 -2.672
OHT C19 C CR16 0.000 -7.175 1.629 -2.352
OHT H19 H H 0.000 -7.095 2.523 -2.959
OHT C18 C CR16 0.000 -6.348 1.461 -1.262
OHT H18 H H 0.000 -5.618 2.222 -1.012
OHT O20 O O2 0.000 -8.924 0.823 -3.747
OHT C23 C CH2 0.000 -9.764 -0.330 -3.814
OHT H231 H H 0.000 -10.347 -0.409 -2.894
OHT H232 H H 0.000 -9.147 -1.223 -3.931
OHT C24 C CH2 0.000 -10.710 -0.203 -5.010
OHT H241 H H 0.000 -11.276 0.727 -4.927
OHT H242 H H 0.000 -11.400 -1.049 -5.018
OHT N24 N NT 0.000 -9.929 -0.193 -6.254
OHT C26 C CH3 0.000 -10.858 0.166 -7.333
OHT H263 H H 0.000 -11.675 -0.508 -7.336
OHT H262 H H 0.000 -11.215 1.151 -7.179
OHT H261 H H 0.000 -10.355 0.114 -8.264
OHT C25 C CH3 0.000 -9.512 -1.580 -6.501
OHT H253 H H 0.000 -8.924 -1.923 -5.690
OHT H252 H H 0.000 -10.369 -2.195 -6.600
OHT H251 H H 0.000 -8.942 -1.624 -7.393
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
OHT O4 n/a C4 START
OHT HO4 O4 . .
OHT C4 O4 C5 .
OHT C3 C4 C2 .
OHT H3 C3 . .
OHT C2 C3 H2 .
OHT H2 C2 . .
OHT C5 C4 C6 .
OHT H5 C5 . .
OHT C6 C5 C1 .
OHT H6 C6 . .
OHT C1 C6 C7 .
OHT C7 C1 C17 .
OHT C8 C7 C9 .
OHT C11 C8 C12 .
OHT C12 C11 C13 .
OHT H12 C12 . .
OHT C13 C12 C14 .
OHT H13 C13 . .
OHT C14 C13 C15 .
OHT H14 C14 . .
OHT C15 C14 C16 .
OHT H15 C15 . .
OHT C16 C15 H16 .
OHT H16 C16 . .
OHT C9 C8 C10 .
OHT H91 C9 . .
OHT H92 C9 . .
OHT C10 C9 H101 .
OHT H103 C10 . .
OHT H102 C10 . .
OHT H101 C10 . .
OHT C17 C7 C22 .
OHT C22 C17 C21 .
OHT H22 C22 . .
OHT C21 C22 C20 .
OHT H21 C21 . .
OHT C20 C21 O20 .
OHT C19 C20 C18 .
OHT H19 C19 . .
OHT C18 C19 H18 .
OHT H18 C18 . .
OHT O20 C20 C23 .
OHT C23 O20 C24 .
OHT H231 C23 . .
OHT H232 C23 . .
OHT C24 C23 N24 .
OHT H241 C24 . .
OHT H242 C24 . .
OHT N24 C24 C25 .
OHT C26 N24 H261 .
OHT H263 C26 . .
OHT H262 C26 . .
OHT H261 C26 . .
OHT C25 N24 H251 .
OHT H253 C25 . .
OHT H252 C25 . .
OHT H251 C25 . END
OHT C11 C16 . ADD
OHT C1 C2 . ADD
OHT C17 C18 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
OHT C10 C9 single 1.513 0.020
OHT H101 C10 single 1.059 0.020
OHT H102 C10 single 1.059 0.020
OHT H103 C10 single 1.059 0.020
OHT C9 C8 single 1.510 0.020
OHT H91 C9 single 1.092 0.020
OHT H92 C9 single 1.092 0.020
OHT C11 C8 single 1.500 0.020
OHT C8 C7 double 1.330 0.020
OHT C11 C16 single 1.390 0.020
OHT C12 C11 double 1.390 0.020
OHT C16 C15 double 1.390 0.020
OHT H16 C16 single 1.083 0.020
OHT C15 C14 single 1.390 0.020
OHT H15 C15 single 1.083 0.020
OHT C14 C13 double 1.390 0.020
OHT H14 C14 single 1.083 0.020
OHT C13 C12 single 1.390 0.020
OHT H13 C13 single 1.083 0.020
OHT H12 C12 single 1.083 0.020
OHT C7 C1 single 1.500 0.020
OHT C17 C7 single 1.500 0.020
OHT C1 C2 single 1.390 0.020
OHT C1 C6 double 1.390 0.020
OHT C2 C3 double 1.390 0.020
OHT H2 C2 single 1.083 0.020
OHT C3 C4 single 1.390 0.020
OHT H3 C3 single 1.083 0.020
OHT C4 O4 single 1.362 0.020
OHT C5 C4 double 1.390 0.020
OHT HO4 O4 single 0.967 0.020
OHT C6 C5 single 1.390 0.020
OHT H5 C5 single 1.083 0.020
OHT H6 C6 single 1.083 0.020
OHT C17 C18 double 1.390 0.020
OHT C22 C17 single 1.390 0.020
OHT C18 C19 single 1.390 0.020
OHT H18 C18 single 1.083 0.020
OHT C19 C20 double 1.390 0.020
OHT H19 C19 single 1.083 0.020
OHT O20 C20 single 1.370 0.020
OHT C20 C21 single 1.390 0.020
OHT C23 O20 single 1.426 0.020
OHT C24 C23 single 1.524 0.020
OHT H231 C23 single 1.092 0.020
OHT H232 C23 single 1.092 0.020
OHT N24 C24 single 1.469 0.020
OHT H241 C24 single 1.092 0.020
OHT H242 C24 single 1.092 0.020
OHT C25 N24 single 1.469 0.020
OHT C26 N24 single 1.469 0.020
OHT H251 C25 single 1.059 0.020
OHT H252 C25 single 1.059 0.020
OHT H253 C25 single 1.059 0.020
OHT H261 C26 single 1.059 0.020
OHT H262 C26 single 1.059 0.020
OHT H263 C26 single 1.059 0.020
OHT C21 C22 double 1.390 0.020
OHT H21 C21 single 1.083 0.020
OHT H22 C22 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
OHT HO4 O4 C4 109.470 3.000
OHT O4 C4 C3 120.000 3.000
OHT O4 C4 C5 120.000 3.000
OHT C3 C4 C5 120.000 3.000
OHT C4 C3 H3 120.000 3.000
OHT C4 C3 C2 120.000 3.000
OHT H3 C3 C2 120.000 3.000
OHT C3 C2 H2 120.000 3.000
OHT C3 C2 C1 120.000 3.000
OHT H2 C2 C1 120.000 3.000
OHT C4 C5 H5 120.000 3.000
OHT C4 C5 C6 120.000 3.000
OHT H5 C5 C6 120.000 3.000
OHT C5 C6 H6 120.000 3.000
OHT C5 C6 C1 120.000 3.000
OHT H6 C6 C1 120.000 3.000
OHT C6 C1 C7 120.000 3.000
OHT C6 C1 C2 120.000 3.000
OHT C7 C1 C2 120.000 3.000
OHT C1 C7 C8 120.000 3.000
OHT C1 C7 C17 120.000 3.000
OHT C8 C7 C17 120.000 3.000
OHT C7 C8 C11 120.000 3.000
OHT C7 C8 C9 120.000 3.000
OHT C11 C8 C9 120.000 3.000
OHT C8 C11 C12 120.000 3.000
OHT C8 C11 C16 120.000 3.000
OHT C12 C11 C16 120.000 3.000
OHT C11 C12 H12 120.000 3.000
OHT C11 C12 C13 120.000 3.000
OHT H12 C12 C13 120.000 3.000
OHT C12 C13 H13 120.000 3.000
OHT C12 C13 C14 120.000 3.000
OHT H13 C13 C14 120.000 3.000
OHT C13 C14 H14 120.000 3.000
OHT C13 C14 C15 120.000 3.000
OHT H14 C14 C15 120.000 3.000
OHT C14 C15 H15 120.000 3.000
OHT C14 C15 C16 120.000 3.000
OHT H15 C15 C16 120.000 3.000
OHT C15 C16 H16 120.000 3.000
OHT C15 C16 C11 120.000 3.000
OHT H16 C16 C11 120.000 3.000
OHT C8 C9 H91 109.470 3.000
OHT C8 C9 H92 109.470 3.000
OHT C8 C9 C10 109.500 3.000
OHT H91 C9 H92 107.900 3.000
OHT H91 C9 C10 109.470 3.000
OHT H92 C9 C10 109.470 3.000
OHT C9 C10 H103 109.470 3.000
OHT C9 C10 H102 109.470 3.000
OHT C9 C10 H101 109.470 3.000
OHT H103 C10 H102 109.470 3.000
OHT H103 C10 H101 109.470 3.000
OHT H102 C10 H101 109.470 3.000
OHT C7 C17 C22 120.000 3.000
OHT C7 C17 C18 120.000 3.000
OHT C22 C17 C18 120.000 3.000
OHT C17 C22 H22 120.000 3.000
OHT C17 C22 C21 120.000 3.000
OHT H22 C22 C21 120.000 3.000
OHT C22 C21 H21 120.000 3.000
OHT C22 C21 C20 120.000 3.000
OHT H21 C21 C20 120.000 3.000
OHT C21 C20 C19 120.000 3.000
OHT C21 C20 O20 120.000 3.000
OHT C19 C20 O20 120.000 3.000
OHT C20 C19 H19 120.000 3.000
OHT C20 C19 C18 120.000 3.000
OHT H19 C19 C18 120.000 3.000
OHT C19 C18 H18 120.000 3.000
OHT C19 C18 C17 120.000 3.000
OHT H18 C18 C17 120.000 3.000
OHT C20 O20 C23 120.000 3.000
OHT O20 C23 H231 109.470 3.000
OHT O20 C23 H232 109.470 3.000
OHT O20 C23 C24 109.470 3.000
OHT H231 C23 H232 107.900 3.000
OHT H231 C23 C24 109.470 3.000
OHT H232 C23 C24 109.470 3.000
OHT C23 C24 H241 109.470 3.000
OHT C23 C24 H242 109.470 3.000
OHT C23 C24 N24 109.470 3.000
OHT H241 C24 H242 107.900 3.000
OHT H241 C24 N24 109.470 3.000
OHT H242 C24 N24 109.470 3.000
OHT C24 N24 C26 109.470 3.000
OHT C24 N24 C25 109.470 3.000
OHT C26 N24 C25 109.470 3.000
OHT N24 C26 H263 109.470 3.000
OHT N24 C26 H262 109.470 3.000
OHT N24 C26 H261 109.470 3.000
OHT H263 C26 H262 109.470 3.000
OHT H263 C26 H261 109.470 3.000
OHT H262 C26 H261 109.470 3.000
OHT N24 C25 H253 109.470 3.000
OHT N24 C25 H252 109.470 3.000
OHT N24 C25 H251 109.470 3.000
OHT H253 C25 H252 109.470 3.000
OHT H253 C25 H251 109.470 3.000
OHT H252 C25 H251 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
OHT var_1 HO4 O4 C4 C5 -90.130 20.000 1
OHT CONST_1 O4 C4 C3 C2 180.000 0.000 0
OHT CONST_2 C4 C3 C2 C1 0.000 0.000 0
OHT CONST_3 O4 C4 C5 C6 180.000 0.000 0
OHT CONST_4 C4 C5 C6 C1 0.000 0.000 0
OHT CONST_5 C5 C6 C1 C7 180.000 0.000 0
OHT CONST_6 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
OHT var_2 C6 C1 C7 C17 119.677 20.000 1
OHT CONST_7 C1 C7 C8 C9 -0.062 0.000 0
OHT var_3 C7 C8 C11 C12 -60.363 20.000 1
OHT CONST_8 C8 C11 C16 C15 180.000 0.000 0
OHT CONST_9 C8 C11 C12 C13 180.000 0.000 0
OHT CONST_10 C11 C12 C13 C14 0.000 0.000 0
OHT CONST_11 C12 C13 C14 C15 0.000 0.000 0
OHT CONST_12 C13 C14 C15 C16 0.000 0.000 0
OHT CONST_13 C14 C15 C16 C11 0.000 0.000 0
OHT var_4 C7 C8 C9 C10 -59.919 20.000 3
OHT var_5 C8 C9 C10 H101 59.960 20.000 3
OHT var_6 C1 C7 C17 C22 119.705 20.000 1
OHT CONST_14 C7 C17 C18 C19 180.000 0.000 0
OHT CONST_15 C7 C17 C22 C21 180.000 0.000 0
OHT CONST_16 C17 C22 C21 C20 0.000 0.000 0
OHT CONST_17 C22 C21 C20 O20 180.000 0.000 0
OHT CONST_18 C21 C20 C19 C18 0.000 0.000 0
OHT CONST_19 C20 C19 C18 C17 0.000 0.000 0
OHT var_7 C21 C20 O20 C23 0.143 20.000 1
OHT var_8 C20 O20 C23 C24 179.979 20.000 1
OHT var_9 O20 C23 C24 N24 64.042 20.000 3
OHT var_10 C23 C24 N24 C25 76.016 20.000 1
OHT var_11 C24 N24 C26 H261 -175.766 20.000 1
OHT var_12 C24 N24 C25 H251 -179.967 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
OHT chir_01 N24 C24 C25 C26 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
OHT plan-1 C8 0.020
OHT plan-1 C9 0.020
OHT plan-1 C11 0.020
OHT plan-1 C7 0.020
OHT plan-1 C1 0.020
OHT plan-1 C17 0.020
OHT plan-2 C11 0.020
OHT plan-2 C8 0.020
OHT plan-2 C16 0.020
OHT plan-2 C12 0.020
OHT plan-2 C15 0.020
OHT plan-2 C14 0.020
OHT plan-2 C13 0.020
OHT plan-2 H16 0.020
OHT plan-2 H15 0.020
OHT plan-2 H14 0.020
OHT plan-2 H13 0.020
OHT plan-2 H12 0.020
OHT plan-3 C1 0.020
OHT plan-3 C7 0.020
OHT plan-3 C2 0.020
OHT plan-3 C6 0.020
OHT plan-3 C3 0.020
OHT plan-3 C4 0.020
OHT plan-3 C5 0.020
OHT plan-3 H2 0.020
OHT plan-3 H3 0.020
OHT plan-3 O4 0.020
OHT plan-3 H5 0.020
OHT plan-3 H6 0.020
OHT plan-4 C17 0.020
OHT plan-4 C7 0.020
OHT plan-4 C18 0.020
OHT plan-4 C22 0.020
OHT plan-4 C19 0.020
OHT plan-4 C20 0.020
OHT plan-4 C21 0.020
OHT plan-4 H18 0.020
OHT plan-4 H19 0.020
OHT plan-4 O20 0.020
OHT plan-4 H21 0.020
OHT plan-4 H22 0.020
# ------------------------------------------------------
|
