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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
OIO OIO '8-(1H-imidazol-1-yl)octanoic acid ' non-polymer 32 15 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_OIO
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
OIO O10 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
OIO C8 C C 0.000 -1.173 -0.435 0.004
OIO O9 O OC -0.500 -1.383 -1.669 0.019
OIO C7 C CH2 0.000 -2.334 0.526 -0.007
OIO H7 H H 0.000 -2.285 1.145 -0.905
OIO H7A H H 0.000 -2.285 1.165 0.877
OIO C6 C CH2 0.000 -3.646 -0.260 0.002
OIO H6 H H 0.000 -3.693 -0.879 0.900
OIO H6A H H 0.000 -3.693 -0.900 -0.882
OIO C5 C CH2 0.000 -4.825 0.716 -0.009
OIO H5 H H 0.000 -4.775 1.335 -0.908
OIO H5A H H 0.000 -4.776 1.356 0.875
OIO C4 C CH2 0.000 -6.138 -0.070 -0.001
OIO H4 H H 0.000 -6.185 -0.689 0.898
OIO H4A H H 0.000 -6.185 -0.709 -0.885
OIO C3 C CH2 0.000 -7.315 0.907 -0.012
OIO H3 H H 0.000 -7.266 1.526 -0.910
OIO H3A H H 0.000 -7.267 1.546 0.873
OIO C2 C CH2 0.000 -8.629 0.121 -0.004
OIO H2 H H 0.000 -8.676 -0.499 0.894
OIO H2A H H 0.000 -8.675 -0.518 -0.889
OIO C1 C CH2 0.000 -9.807 1.097 -0.015
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OIO H1A H H 0.000 -9.758 1.737 0.868
OIO N11 N NR5 0.000 -11.065 0.345 -0.007
OIO C15 C CR15 0.000 -11.752 -0.055 1.084
OIO H15 H H 0.000 -11.464 0.126 2.112
OIO N14 N NRD5 0.000 -12.820 -0.694 0.695
OIO C13 C CR15 0.000 -12.847 -0.734 -0.646
OIO H13 H H 0.000 -13.612 -1.202 -1.254
OIO C12 C CR15 0.000 -11.758 -0.090 -1.104
OIO H12 H H 0.000 -11.483 0.057 -2.141
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
OIO O10 n/a C8 START
OIO C8 O10 C7 .
OIO O9 C8 . .
OIO C7 C8 C6 .
OIO H7 C7 . .
OIO H7A C7 . .
OIO C6 C7 C5 .
OIO H6 C6 . .
OIO H6A C6 . .
OIO C5 C6 C4 .
OIO H5 C5 . .
OIO H5A C5 . .
OIO C4 C5 C3 .
OIO H4 C4 . .
OIO H4A C4 . .
OIO C3 C4 C2 .
OIO H3 C3 . .
OIO H3A C3 . .
OIO C2 C3 C1 .
OIO H2 C2 . .
OIO H2A C2 . .
OIO C1 C2 N11 .
OIO H1 C1 . .
OIO H1A C1 . .
OIO N11 C1 C15 .
OIO C15 N11 N14 .
OIO H15 C15 . .
OIO N14 C15 C13 .
OIO C13 N14 C12 .
OIO H13 C13 . .
OIO C12 C13 H12 .
OIO H12 C12 . END
OIO N11 C12 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
OIO C1 C2 single 1.524 0.020
OIO N11 C1 single 1.462 0.020
OIO H1 C1 single 1.092 0.020
OIO H1A C1 single 1.092 0.020
OIO C2 C3 single 1.524 0.020
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OIO H2A C2 single 1.092 0.020
OIO C3 C4 single 1.524 0.020
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OIO H3A C3 single 1.092 0.020
OIO C4 C5 single 1.524 0.020
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OIO H4A C4 single 1.092 0.020
OIO C5 C6 single 1.524 0.020
OIO H5 C5 single 1.092 0.020
OIO H5A C5 single 1.092 0.020
OIO C6 C7 single 1.524 0.020
OIO H6 C6 single 1.092 0.020
OIO H6A C6 single 1.092 0.020
OIO C7 C8 single 1.510 0.020
OIO H7 C7 single 1.092 0.020
OIO H7A C7 single 1.092 0.020
OIO O9 C8 deloc 1.250 0.020
OIO C8 O10 deloc 1.250 0.020
OIO C15 N11 single 1.337 0.020
OIO N11 C12 single 1.337 0.020
OIO C12 C13 double 1.380 0.020
OIO H12 C12 single 1.083 0.020
OIO C13 N14 single 1.350 0.020
OIO H13 C13 single 1.083 0.020
OIO N14 C15 double 1.350 0.020
OIO H15 C15 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
OIO O10 C8 O9 123.000 3.000
OIO O10 C8 C7 118.500 3.000
OIO O9 C8 C7 118.500 3.000
OIO C8 C7 H7 109.470 3.000
OIO C8 C7 H7A 109.470 3.000
OIO C8 C7 C6 109.470 3.000
OIO H7 C7 H7A 107.900 3.000
OIO H7 C7 C6 109.470 3.000
OIO H7A C7 C6 109.470 3.000
OIO C7 C6 H6 109.470 3.000
OIO C7 C6 H6A 109.470 3.000
OIO C7 C6 C5 111.000 3.000
OIO H6 C6 H6A 107.900 3.000
OIO H6 C6 C5 109.470 3.000
OIO H6A C6 C5 109.470 3.000
OIO C6 C5 H5 109.470 3.000
OIO C6 C5 H5A 109.470 3.000
OIO C6 C5 C4 111.000 3.000
OIO H5 C5 H5A 107.900 3.000
OIO H5 C5 C4 109.470 3.000
OIO H5A C5 C4 109.470 3.000
OIO C5 C4 H4 109.470 3.000
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OIO C5 C4 C3 111.000 3.000
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OIO H4 C4 C3 109.470 3.000
OIO H4A C4 C3 109.470 3.000
OIO C4 C3 H3 109.470 3.000
OIO C4 C3 H3A 109.470 3.000
OIO C4 C3 C2 111.000 3.000
OIO H3 C3 H3A 107.900 3.000
OIO H3 C3 C2 109.470 3.000
OIO H3A C3 C2 109.470 3.000
OIO C3 C2 H2 109.470 3.000
OIO C3 C2 H2A 109.470 3.000
OIO C3 C2 C1 111.000 3.000
OIO H2 C2 H2A 107.900 3.000
OIO H2 C2 C1 109.470 3.000
OIO H2A C2 C1 109.470 3.000
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OIO C2 C1 H1A 109.470 3.000
OIO C2 C1 N11 109.500 3.000
OIO H1 C1 H1A 107.900 3.000
OIO H1 C1 N11 109.500 3.000
OIO H1A C1 N11 109.500 3.000
OIO C1 N11 C15 126.000 3.000
OIO C1 N11 C12 126.000 3.000
OIO C15 N11 C12 108.000 3.000
OIO N11 C15 H15 126.000 3.000
OIO N11 C15 N14 108.000 3.000
OIO H15 C15 N14 126.000 3.000
OIO C15 N14 C13 108.000 3.000
OIO N14 C13 H13 126.000 3.000
OIO N14 C13 C12 108.000 3.000
OIO H13 C13 C12 126.000 3.000
OIO C13 C12 H12 126.000 3.000
OIO C13 C12 N11 108.000 3.000
OIO H12 C12 N11 126.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
OIO var_1 O10 C8 C7 C6 -179.985 20.000 3
OIO var_2 C8 C7 C6 C5 179.993 20.000 3
OIO var_3 C7 C6 C5 C4 180.000 20.000 3
OIO var_4 C6 C5 C4 C3 180.000 20.000 3
OIO var_5 C5 C4 C3 C2 179.960 20.000 3
OIO var_6 C4 C3 C2 C1 180.000 20.000 3
OIO var_7 C3 C2 C1 N11 -179.944 20.000 3
OIO var_8 C2 C1 N11 C15 89.927 20.000 1
OIO CONST_1 C1 N11 C12 C13 180.000 0.000 0
OIO CONST_2 C1 N11 C15 N14 180.000 0.000 0
OIO CONST_3 N11 C15 N14 C13 0.000 0.000 0
OIO CONST_4 C15 N14 C13 C12 0.000 0.000 0
OIO CONST_5 N14 C13 C12 N11 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
OIO plan-1 C8 0.020
OIO plan-1 C7 0.020
OIO plan-1 O9 0.020
OIO plan-1 O10 0.020
OIO plan-2 N11 0.020
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OIO plan-2 H12 0.020
OIO plan-2 H13 0.020
OIO plan-2 H15 0.020
# ------------------------------------------------------
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