1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
OL2 OL2 '4-[3-amino-6-(3,4,5-trimethoxyphenyl' non-polymer 53 31 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_OL2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
OL2 O31 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
OL2 C29 C C 0.000 -0.959 0.613 0.518
OL2 O30 O OC -0.500 -0.772 1.723 1.064
OL2 C28 C CR6 0.000 -2.312 0.029 0.484
OL2 C04 C CR6 0.000 -3.390 0.715 1.064
OL2 O03 O O2 0.000 -3.190 1.918 1.658
OL2 C02 C CH2 0.000 -4.336 2.561 2.221
OL2 H021 H H 0.000 -4.770 1.921 2.991
OL2 H022 H H 0.000 -5.076 2.737 1.437
OL2 C01 C CH3 0.000 -3.918 3.897 2.840
OL2 H013 H H 0.000 -4.766 4.377 3.259
OL2 H012 H H 0.000 -3.200 3.728 3.602
OL2 H011 H H 0.000 -3.497 4.520 2.093
OL2 C27 C CR16 0.000 -2.522 -1.214 -0.122
OL2 H27 H H 0.000 -1.689 -1.749 -0.561
OL2 C26 C CR16 0.000 -3.775 -1.755 -0.160
OL2 H26 H H 0.000 -3.933 -2.716 -0.635
OL2 C06 C CR6 0.000 -4.854 -1.075 0.411
OL2 C05 C CR16 0.000 -4.657 0.162 1.022
OL2 H05 H H 0.000 -5.494 0.688 1.464
OL2 C07 C CR6 0.000 -6.211 -1.669 0.365
OL2 C24 C CR6 0.000 -6.391 -3.032 0.650
OL2 N25 N NH2 0.000 -5.301 -3.826 0.975
OL2 H252 H H 0.000 -5.401 -4.834 1.055
OL2 H251 H H 0.000 -4.389 -3.409 1.137
OL2 N23 N NRD6 0.000 -7.609 -3.560 0.613
OL2 C22 C CR16 0.000 -8.647 -2.808 0.297
OL2 H22 H H 0.000 -9.638 -3.243 0.262
OL2 C09 C CR6 0.000 -8.471 -1.455 0.009
OL2 N08 N NRD6 0.000 -7.256 -0.917 0.049
OL2 C10 C CR6 0.000 -9.641 -0.614 -0.344
OL2 C21 C CR16 0.000 -9.457 0.713 -0.730
OL2 H21 H H 0.000 -8.459 1.132 -0.767
OL2 C18 C CR6 0.000 -10.549 1.493 -1.064
OL2 O19 O O2 0.000 -10.370 2.786 -1.446
OL2 C20 C CH3 0.000 -9.025 3.271 -1.484
OL2 H203 H H 0.000 -8.460 2.692 -2.168
OL2 H202 H H 0.000 -9.022 4.284 -1.793
OL2 H201 H H 0.000 -8.594 3.196 -0.519
OL2 C15 C CR6 0.000 -11.831 0.958 -1.006
OL2 O16 O O2 0.000 -12.905 1.729 -1.329
OL2 C17 C CH3 0.000 -13.516 2.468 -0.270
OL2 H173 H H 0.000 -12.807 3.132 0.153
OL2 H172 H H 0.000 -14.334 3.022 -0.652
OL2 H171 H H 0.000 -13.861 1.799 0.475
OL2 C12 C CR6 0.000 -12.018 -0.364 -0.616
OL2 C11 C CR16 0.000 -10.927 -1.149 -0.286
OL2 H11 H H 0.000 -11.072 -2.179 0.016
OL2 O13 O O2 0.000 -13.273 -0.886 -0.559
OL2 C14 C CH3 0.000 -13.390 -2.250 -0.150
OL2 H143 H H 0.000 -14.411 -2.532 -0.146
OL2 H142 H H 0.000 -12.856 -2.869 -0.824
OL2 H141 H H 0.000 -12.990 -2.363 0.825
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
OL2 O31 n/a C29 START
OL2 C29 O31 C28 .
OL2 O30 C29 . .
OL2 C28 C29 C27 .
OL2 C04 C28 O03 .
OL2 O03 C04 C02 .
OL2 C02 O03 C01 .
OL2 H021 C02 . .
OL2 H022 C02 . .
OL2 C01 C02 H011 .
OL2 H013 C01 . .
OL2 H012 C01 . .
OL2 H011 C01 . .
OL2 C27 C28 C26 .
OL2 H27 C27 . .
OL2 C26 C27 C06 .
OL2 H26 C26 . .
OL2 C06 C26 C07 .
OL2 C05 C06 H05 .
OL2 H05 C05 . .
OL2 C07 C06 C24 .
OL2 C24 C07 N23 .
OL2 N25 C24 H251 .
OL2 H252 N25 . .
OL2 H251 N25 . .
OL2 N23 C24 C22 .
OL2 C22 N23 C09 .
OL2 H22 C22 . .
OL2 C09 C22 C10 .
OL2 N08 C09 . .
OL2 C10 C09 C21 .
OL2 C21 C10 C18 .
OL2 H21 C21 . .
OL2 C18 C21 C15 .
OL2 O19 C18 C20 .
OL2 C20 O19 H201 .
OL2 H203 C20 . .
OL2 H202 C20 . .
OL2 H201 C20 . .
OL2 C15 C18 C12 .
OL2 O16 C15 C17 .
OL2 C17 O16 H171 .
OL2 H173 C17 . .
OL2 H172 C17 . .
OL2 H171 C17 . .
OL2 C12 C15 O13 .
OL2 C11 C12 H11 .
OL2 H11 C11 . .
OL2 O13 C12 C14 .
OL2 C14 O13 H141 .
OL2 H143 C14 . .
OL2 H142 C14 . .
OL2 H141 C14 . END
OL2 C04 C05 . ADD
OL2 C07 N08 . ADD
OL2 C10 C11 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
OL2 C01 C02 single 1.513 0.020
OL2 C02 O03 single 1.426 0.020
OL2 O03 C04 single 1.370 0.020
OL2 C04 C05 single 1.390 0.020
OL2 C04 C28 double 1.487 0.020
OL2 C05 C06 double 1.390 0.020
OL2 C07 C06 single 1.487 0.020
OL2 C06 C26 single 1.390 0.020
OL2 C07 N08 double 1.350 0.020
OL2 C24 C07 single 1.487 0.020
OL2 N08 C09 single 1.350 0.020
OL2 C10 C09 single 1.487 0.020
OL2 C09 C22 double 1.390 0.020
OL2 C10 C11 single 1.390 0.020
OL2 C21 C10 double 1.390 0.020
OL2 C11 C12 double 1.390 0.020
OL2 O13 C12 single 1.370 0.020
OL2 C12 C15 single 1.487 0.020
OL2 C14 O13 single 1.426 0.020
OL2 O16 C15 single 1.370 0.020
OL2 C15 C18 double 1.487 0.020
OL2 C17 O16 single 1.426 0.020
OL2 O19 C18 single 1.370 0.020
OL2 C18 C21 single 1.390 0.020
OL2 C20 O19 single 1.426 0.020
OL2 C22 N23 single 1.337 0.020
OL2 N23 C24 double 1.350 0.020
OL2 N25 C24 single 1.355 0.020
OL2 C26 C27 double 1.390 0.020
OL2 C27 C28 single 1.390 0.020
OL2 C28 C29 single 1.500 0.020
OL2 O30 C29 deloc 1.250 0.020
OL2 C29 O31 deloc 1.250 0.020
OL2 H011 C01 single 1.059 0.020
OL2 H012 C01 single 1.059 0.020
OL2 H013 C01 single 1.059 0.020
OL2 H021 C02 single 1.092 0.020
OL2 H022 C02 single 1.092 0.020
OL2 H05 C05 single 1.083 0.020
OL2 H26 C26 single 1.083 0.020
OL2 H22 C22 single 1.083 0.020
OL2 H11 C11 single 1.083 0.020
OL2 H21 C21 single 1.083 0.020
OL2 H141 C14 single 1.059 0.020
OL2 H142 C14 single 1.059 0.020
OL2 H143 C14 single 1.059 0.020
OL2 H171 C17 single 1.059 0.020
OL2 H172 C17 single 1.059 0.020
OL2 H173 C17 single 1.059 0.020
OL2 H201 C20 single 1.059 0.020
OL2 H202 C20 single 1.059 0.020
OL2 H203 C20 single 1.059 0.020
OL2 H251 N25 single 1.010 0.020
OL2 H252 N25 single 1.010 0.020
OL2 H27 C27 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
OL2 O31 C29 O30 123.000 3.000
OL2 O31 C29 C28 120.000 3.000
OL2 O30 C29 C28 120.000 3.000
OL2 C29 C28 C04 120.000 3.000
OL2 C29 C28 C27 120.000 3.000
OL2 C04 C28 C27 120.000 3.000
OL2 C28 C04 O03 120.000 3.000
OL2 C28 C04 C05 120.000 3.000
OL2 O03 C04 C05 120.000 3.000
OL2 C04 O03 C02 120.000 3.000
OL2 O03 C02 H021 109.470 3.000
OL2 O03 C02 H022 109.470 3.000
OL2 O03 C02 C01 109.470 3.000
OL2 H021 C02 H022 107.900 3.000
OL2 H021 C02 C01 109.470 3.000
OL2 H022 C02 C01 109.470 3.000
OL2 C02 C01 H013 109.470 3.000
OL2 C02 C01 H012 109.470 3.000
OL2 C02 C01 H011 109.470 3.000
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OL2 H013 C01 H011 109.470 3.000
OL2 H012 C01 H011 109.470 3.000
OL2 C28 C27 H27 120.000 3.000
OL2 C28 C27 C26 120.000 3.000
OL2 H27 C27 C26 120.000 3.000
OL2 C27 C26 H26 120.000 3.000
OL2 C27 C26 C06 120.000 3.000
OL2 H26 C26 C06 120.000 3.000
OL2 C26 C06 C05 120.000 3.000
OL2 C26 C06 C07 120.000 3.000
OL2 C05 C06 C07 120.000 3.000
OL2 C06 C05 H05 120.000 3.000
OL2 C06 C05 C04 120.000 3.000
OL2 H05 C05 C04 120.000 3.000
OL2 C06 C07 C24 120.000 3.000
OL2 C06 C07 N08 120.000 3.000
OL2 C24 C07 N08 120.000 3.000
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OL2 C24 N25 H252 120.000 3.000
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OL2 C22 C09 C10 120.000 3.000
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OL2 C18 O19 C20 120.000 3.000
OL2 O19 C20 H203 109.470 3.000
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OL2 O19 C20 H201 109.470 3.000
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OL2 H203 C20 H201 109.470 3.000
OL2 H202 C20 H201 109.470 3.000
OL2 C18 C15 O16 120.000 3.000
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OL2 C15 O16 C17 120.000 3.000
OL2 O16 C17 H173 109.470 3.000
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OL2 O16 C17 H171 109.470 3.000
OL2 H173 C17 H172 109.470 3.000
OL2 H173 C17 H171 109.470 3.000
OL2 H172 C17 H171 109.470 3.000
OL2 C15 C12 C11 120.000 3.000
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OL2 C12 C11 C10 120.000 3.000
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OL2 C12 O13 C14 120.000 3.000
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