1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
OXT OXT '. ' non-polymer 124 76 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_OXT
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
OXT O3B O OP -0.666 0.000 0.000 0.000
OXT PB P P 0.000 -0.606 -0.229 1.368
OXT O1B O OP -0.666 -1.289 0.974 1.981
OXT O2B O OP -0.666 -1.490 -1.440 1.166
OXT O3A O O2 0.000 0.627 -0.815 2.230
OXT PA P P 0.000 2.013 -0.129 2.703
OXT O1A O OP -0.500 2.870 0.341 1.588
OXT O2A O OP -0.500 2.635 -1.170 3.555
OXT O76 O O2 0.000 1.563 1.027 3.739
OXT C76 C CH2 0.000 0.739 0.698 4.851
OXT H761 H H 0.000 1.249 -0.038 5.476
OXT H762 H H 0.000 -0.204 0.279 4.493
OXT C66 C CH2 0.000 0.459 1.965 5.673
OXT H661 H H 0.000 1.423 2.353 6.011
OXT H662 H H 0.000 -0.135 1.666 6.539
OXT C56 C CR5 0.000 -0.259 3.014 4.920
OXT C47 C CR5 0.000 0.231 4.046 4.157
OXT CM4 C CH3 0.000 1.627 4.410 3.868
OXT HM43 H H 0.000 1.678 4.843 2.907
OXT HM42 H H 0.000 1.960 5.102 4.593
OXT HM41 H H 0.000 2.224 3.539 3.902
OXT N43 N NR5 1.000 -0.772 4.817 3.614
OXT C71 C CH2 0.000 -0.514 5.965 2.776
OXT H711 H H 0.000 0.434 6.421 3.069
OXT H712 H H 0.000 -1.320 6.692 2.900
OXT C51 C CR6 0.000 -0.442 5.535 1.336
OXT C61 C CR16 0.000 -0.614 4.216 1.003
OXT H61 H H 0.000 -0.802 3.504 1.796
OXT N11 N NRD6 0.000 -0.561 3.765 -0.267
OXT C21 C CR6 0.000 -0.325 4.709 -1.197
OXT CM2 C CH3 0.000 -0.259 4.248 -2.614
OXT HM23 H H 0.000 0.416 3.436 -2.686
OXT HM22 H H 0.000 -1.221 3.939 -2.926
OXT HM21 H H 0.000 0.075 5.044 -3.226
OXT N31 N NRD6 0.000 -0.141 6.027 -0.984
OXT C41 C CR6 0.000 -0.207 6.409 0.308
OXT N41 N NH2 0.000 -0.022 7.782 0.606
OXT H412 H H 0.000 -0.665 8.278 1.226
OXT H411 H H 0.000 0.758 8.308 0.208
OXT S16 S S2 0.000 -1.979 3.053 4.924
OXT C42 C CR5 0.000 -1.964 4.419 3.927
OXT C40 C CH1 0.000 -3.242 5.077 3.471
OXT H40 H H 0.000 -2.988 5.923 2.817
OXT O41 O OH1 0.000 -3.890 5.580 4.638
OXT H41 H H 0.000 -3.831 6.545 4.647
OXT S15 S S2 0.000 -4.342 3.944 2.560
OXT C25 C CH2 0.000 -5.712 5.086 2.204
OXT H251 H H 0.000 -5.314 5.922 1.625
OXT H252 H H 0.000 -6.100 5.457 3.156
OXT C35 C CH2 0.000 -6.834 4.414 1.424
OXT H351 H H 0.000 -6.424 4.098 0.463
OXT H352 H H 0.000 -7.614 5.160 1.259
OXT N44 N NH1 0.000 -7.394 3.273 2.110
OXT H44 H H 0.000 -6.990 2.363 1.943
OXT C54 C C 0.000 -8.465 3.373 2.987
OXT O54 O O 0.000 -9.047 4.414 3.278
OXT C64 C CH2 0.000 -8.845 2.020 3.559
OXT H641 H H 0.000 -7.973 1.618 4.079
OXT H642 H H 0.000 -9.105 1.364 2.726
OXT C74 C CH2 0.000 -10.019 2.105 4.526
OXT H741 H H 0.000 -10.891 2.500 3.999
OXT H742 H H 0.000 -9.760 2.773 5.350
OXT N84 N NH1 0.000 -10.322 0.791 5.045
OXT H84 H H 0.000 -10.987 0.217 4.547
OXT C94 C C 0.000 -9.742 0.283 6.196
OXT O94 O O 0.000 -8.922 0.877 6.893
OXT C30 C CH1 0.000 -10.207 -1.137 6.515
OXT H30 H H 0.000 -11.227 -1.270 6.129
OXT O30 O OH1 0.000 -10.237 -1.242 7.936
OXT HB H H 0.000 -9.437 -0.843 8.304
OXT C31 C CT 0.000 -9.298 -2.255 5.925
OXT C33 C CH3 0.000 -9.887 -3.630 6.326
OXT H333 H H 0.000 -10.841 -3.754 5.880
OXT H332 H H 0.000 -9.244 -4.406 5.994
OXT H331 H H 0.000 -9.985 -3.684 7.380
OXT C34 C CH3 0.000 -7.873 -2.175 6.509
OXT H343 H H 0.000 -7.392 -1.297 6.158
OXT H342 H H 0.000 -7.922 -2.148 7.568
OXT H341 H H 0.000 -7.315 -3.024 6.206
OXT C32 C CH2 0.000 -9.236 -2.170 4.381
OXT H321 H H 0.000 -8.838 -1.192 4.102
OXT H322 H H 0.000 -10.248 -2.276 3.985
OXT O63 O O2 0.000 -8.405 -3.194 3.844
OXT P23 P P 0.000 -8.218 -3.266 2.242
OXT O43 O OP -0.500 -7.166 -4.292 2.041
OXT O53 O OP -0.500 -9.452 -3.469 1.446
OXT O33 O O2 0.000 -7.442 -1.875 1.962
OXT P13 P P 0.000 -6.791 -1.278 0.608
OXT O13 O OP -0.500 -6.358 0.085 1.001
OXT O23 O OP -0.500 -5.718 -2.114 0.017
OXT "O5'" O O2 0.000 -8.080 -1.043 -0.341
OXT "C5'" C CH2 0.000 -9.167 -0.259 0.120
OXT "H5'1" H H 0.000 -8.821 0.753 0.345
OXT "H5'2" H H 0.000 -9.586 -0.707 1.023
OXT "C4'" C CH1 0.000 -10.231 -0.203 -0.961
OXT "H4'" H H 0.000 -9.797 0.215 -1.880
OXT "C3'" C CH1 0.000 -11.453 0.607 -0.566
OXT "H3'" H H 0.000 -11.713 0.394 0.480
OXT "O3'" O O2 0.000 -11.248 1.994 -0.730
OXT "P3'" P P 0.000 -12.494 2.984 -0.464
OXT O91 O OP -0.666 -12.744 2.809 1.018
OXT O81 O OP -0.666 -11.882 4.366 -0.552
OXT O71 O OP -0.666 -13.700 2.754 -1.347
OXT "O4'" O O2 0.000 -10.726 -1.526 -1.226
OXT "C1'" C CH1 0.000 -12.109 -1.423 -1.625
OXT "H1'" H H 0.000 -12.192 -1.710 -2.683
OXT "C2'" C CH1 0.000 -12.524 0.042 -1.481
OXT "H2'" H H 0.000 -13.520 0.128 -1.024
OXT "O2'" O OH1 0.000 -12.492 0.668 -2.762
OXT HA H H 0.000 -12.903 0.086 -3.415
OXT N92 N NR5 0.000 -12.917 -2.344 -0.823
OXT C82 C CR15 0.000 -12.696 -2.682 0.487
OXT H82 H H 0.000 -11.879 -2.293 1.082
OXT N72 N NRD5 0.000 -13.592 -3.535 0.938
OXT C52 C CR56 0.000 -14.431 -3.760 -0.125
OXT C77 C CR56 0.000 -14.028 -3.028 -1.231
OXT C62 C CR6 0.000 -15.561 -4.558 -0.275
OXT N62 N NH2 0.000 -16.039 -5.333 0.794
OXT H622 H H 0.000 -16.944 -5.135 1.220
OXT H621 H H 0.000 -15.491 -6.109 1.164
OXT N12 N NRD6 0.000 -16.198 -4.577 -1.471
OXT C22 C CR16 0.000 -15.690 -3.809 -2.464
OXT H22 H H 0.000 -16.223 -3.849 -3.406
OXT N32 N NRD6 0.000 -14.608 -3.000 -2.440
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
OXT O3B n/a PB START
OXT PB O3B O3A .
OXT O1B PB . .
OXT O2B PB . .
OXT O3A PB PA .
OXT PA O3A O76 .
OXT O1A PA . .
OXT O2A PA . .
OXT O76 PA C76 .
OXT C76 O76 C66 .
OXT H761 C76 . .
OXT H762 C76 . .
OXT C66 C76 C56 .
OXT H661 C66 . .
OXT H662 C66 . .
OXT C56 C66 S16 .
OXT C47 C56 N43 .
OXT CM4 C47 HM41 .
OXT HM43 CM4 . .
OXT HM42 CM4 . .
OXT HM41 CM4 . .
OXT N43 C47 C71 .
OXT C71 N43 C51 .
OXT H711 C71 . .
OXT H712 C71 . .
OXT C51 C71 C61 .
OXT C61 C51 N11 .
OXT H61 C61 . .
OXT N11 C61 C21 .
OXT C21 N11 N31 .
OXT CM2 C21 HM21 .
OXT HM23 CM2 . .
OXT HM22 CM2 . .
OXT HM21 CM2 . .
OXT N31 C21 C41 .
OXT C41 N31 N41 .
OXT N41 C41 H411 .
OXT H412 N41 . .
OXT H411 N41 . .
OXT S16 C56 C42 .
OXT C42 S16 C40 .
OXT C40 C42 S15 .
OXT H40 C40 . .
OXT O41 C40 H41 .
OXT H41 O41 . .
OXT S15 C40 C25 .
OXT C25 S15 C35 .
OXT H251 C25 . .
OXT H252 C25 . .
OXT C35 C25 N44 .
OXT H351 C35 . .
OXT H352 C35 . .
OXT N44 C35 C54 .
OXT H44 N44 . .
OXT C54 N44 C64 .
OXT O54 C54 . .
OXT C64 C54 C74 .
OXT H641 C64 . .
OXT H642 C64 . .
OXT C74 C64 N84 .
OXT H741 C74 . .
OXT H742 C74 . .
OXT N84 C74 C94 .
OXT H84 N84 . .
OXT C94 N84 C30 .
OXT O94 C94 . .
OXT C30 C94 C31 .
OXT H30 C30 . .
OXT O30 C30 HB .
OXT HB O30 . .
OXT C31 C30 C32 .
OXT C33 C31 H331 .
OXT H333 C33 . .
OXT H332 C33 . .
OXT H331 C33 . .
OXT C34 C31 H341 .
OXT H343 C34 . .
OXT H342 C34 . .
OXT H341 C34 . .
OXT C32 C31 O63 .
OXT H321 C32 . .
OXT H322 C32 . .
OXT O63 C32 P23 .
OXT P23 O63 O33 .
OXT O43 P23 . .
OXT O53 P23 . .
OXT O33 P23 P13 .
OXT P13 O33 "O5'" .
OXT O13 P13 . .
OXT O23 P13 . .
OXT "O5'" P13 "C5'" .
OXT "C5'" "O5'" "C4'" .
OXT "H5'1" "C5'" . .
OXT "H5'2" "C5'" . .
OXT "C4'" "C5'" "O4'" .
OXT "H4'" "C4'" . .
OXT "C3'" "C4'" "O3'" .
OXT "H3'" "C3'" . .
OXT "O3'" "C3'" "P3'" .
OXT "P3'" "O3'" O71 .
OXT O91 "P3'" . .
OXT O81 "P3'" . .
OXT O71 "P3'" . .
OXT "O4'" "C4'" "C1'" .
OXT "C1'" "O4'" N92 .
OXT "H1'" "C1'" . .
OXT "C2'" "C1'" "O2'" .
OXT "H2'" "C2'" . .
OXT "O2'" "C2'" HA .
OXT HA "O2'" . .
OXT N92 "C1'" C82 .
OXT C82 N92 N72 .
OXT H82 C82 . .
OXT N72 C82 C52 .
OXT C52 N72 C62 .
OXT C77 C52 . .
OXT C62 C52 N12 .
OXT N62 C62 H621 .
OXT H622 N62 . .
OXT H621 N62 . .
OXT N12 C62 C22 .
OXT C22 N12 N32 .
OXT H22 C22 . .
OXT N32 C22 . END
OXT "C3'" "C2'" . ADD
OXT N92 C77 . ADD
OXT C77 N32 . ADD
OXT C42 N43 . ADD
OXT C51 C41 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
OXT "H5'2" "C5'" single 1.092 0.020
OXT H321 C32 single 1.092 0.020
OXT H322 C32 single 1.092 0.020
OXT H331 C33 single 1.059 0.020
OXT H332 C33 single 1.059 0.020
OXT H333 C33 single 1.059 0.020
OXT H341 C34 single 1.059 0.020
OXT H342 C34 single 1.059 0.020
OXT H343 C34 single 1.059 0.020
OXT H30 C30 single 1.099 0.020
OXT HB O30 single 0.967 0.020
OXT H84 N84 single 1.010 0.020
OXT H741 C74 single 1.092 0.020
OXT H742 C74 single 1.092 0.020
OXT H641 C64 single 1.092 0.020
OXT H642 C64 single 1.092 0.020
OXT H44 N44 single 1.010 0.020
OXT H351 C35 single 1.092 0.020
OXT H352 C35 single 1.092 0.020
OXT H251 C25 single 1.092 0.020
OXT H252 C25 single 1.092 0.020
OXT H40 C40 single 1.099 0.020
OXT H41 O41 single 0.967 0.020
OXT H711 C71 single 1.092 0.020
OXT H712 C71 single 1.092 0.020
OXT H61 C61 single 1.083 0.020
OXT H411 N41 single 1.010 0.020
OXT H412 N41 single 1.010 0.020
OXT HM21 CM2 single 1.059 0.020
OXT HM22 CM2 single 1.059 0.020
OXT HM23 CM2 single 1.059 0.020
OXT HM41 CM4 single 1.059 0.020
OXT HM42 CM4 single 1.059 0.020
OXT HM43 CM4 single 1.059 0.020
OXT H661 C66 single 1.092 0.020
OXT H662 C66 single 1.092 0.020
OXT H761 C76 single 1.092 0.020
OXT H762 C76 single 1.092 0.020
OXT O71 "P3'" deloc 1.510 0.020
OXT O81 "P3'" deloc 1.510 0.020
OXT O91 "P3'" deloc 1.510 0.020
OXT "P3'" "O3'" single 1.610 0.020
OXT "O3'" "C3'" single 1.426 0.020
OXT "C3'" "C2'" single 1.524 0.020
OXT "O2'" "C2'" single 1.432 0.020
OXT "C2'" "C1'" single 1.524 0.020
OXT N92 "C1'" single 1.485 0.020
OXT N92 C77 single 1.337 0.020
OXT C77 N32 single 1.355 0.020
OXT N32 C22 double 1.337 0.020
OXT C22 N12 single 1.337 0.020
OXT N12 C62 double 1.350 0.020
OXT N62 C62 single 1.355 0.020
OXT C77 C52 double 1.490 0.020
OXT C62 C52 single 1.490 0.020
OXT C52 N72 single 1.350 0.020
OXT C82 N92 single 1.337 0.020
OXT N72 C82 double 1.350 0.020
OXT "C1'" "O4'" single 1.426 0.020
OXT "C3'" "C4'" single 1.524 0.020
OXT "O4'" "C4'" single 1.426 0.020
OXT "C4'" "C5'" single 1.524 0.020
OXT "C5'" "O5'" single 1.426 0.020
OXT "O5'" P13 single 1.610 0.020
OXT O13 P13 deloc 1.510 0.020
OXT O23 P13 deloc 1.510 0.020
OXT P13 O33 single 1.610 0.020
OXT O33 P23 single 1.610 0.020
OXT O43 P23 deloc 1.510 0.020
OXT O53 P23 deloc 1.510 0.020
OXT P23 O63 single 1.610 0.020
OXT O63 C32 single 1.426 0.020
OXT C32 C31 single 1.524 0.020
OXT C33 C31 single 1.524 0.020
OXT C34 C31 single 1.524 0.020
OXT C31 C30 single 1.524 0.020
OXT O30 C30 single 1.432 0.020
OXT C30 C94 single 1.500 0.020
OXT O94 C94 double 1.220 0.020
OXT C94 N84 single 1.330 0.020
OXT N84 C74 single 1.450 0.020
OXT C74 C64 single 1.524 0.020
OXT C64 C54 single 1.510 0.020
OXT O54 C54 double 1.220 0.020
OXT C54 N44 single 1.330 0.020
OXT N44 C35 single 1.450 0.020
OXT C35 C25 single 1.524 0.020
OXT C25 S15 single 1.762 0.020
OXT S15 C40 single 1.765 0.020
OXT O41 C40 single 1.432 0.020
OXT C40 C42 single 1.480 0.020
OXT C42 N43 double 1.337 0.020
OXT C71 N43 single 1.462 0.020
OXT C51 C71 single 1.511 0.020
OXT C51 C41 single 1.487 0.020
OXT N41 C41 single 1.355 0.020
OXT C41 N31 double 1.350 0.020
OXT N31 C21 single 1.350 0.020
OXT CM2 C21 single 1.506 0.020
OXT C21 N11 double 1.350 0.020
OXT C61 C51 double 1.390 0.020
OXT N11 C61 single 1.337 0.020
OXT N43 C47 single 1.337 0.020
OXT CM4 C47 single 1.506 0.020
OXT C42 S16 single 1.745 0.020
OXT C47 C56 double 1.490 0.020
OXT S16 C56 single 1.745 0.020
OXT C56 C66 single 1.510 0.020
OXT C66 C76 single 1.524 0.020
OXT C76 O76 single 1.426 0.020
OXT O76 PA single 1.610 0.020
OXT O1A PA deloc 1.510 0.020
OXT O2A PA deloc 1.510 0.020
OXT PA O3A single 1.610 0.020
OXT O3A PB single 1.610 0.020
OXT O1B PB deloc 1.510 0.020
OXT O2B PB deloc 1.510 0.020
OXT PB O3B deloc 1.510 0.020
OXT "H3'" "C3'" single 1.099 0.020
OXT "H2'" "C2'" single 1.099 0.020
OXT "H4'" "C4'" single 1.099 0.020
OXT HA "O2'" single 0.967 0.020
OXT "H1'" "C1'" single 1.099 0.020
OXT H82 C82 single 1.083 0.020
OXT H22 C22 single 1.083 0.020
OXT H621 N62 single 1.010 0.020
OXT H622 N62 single 1.010 0.020
OXT "H5'1" "C5'" single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
OXT O3B PB O1B 119.900 3.000
OXT O3B PB O2B 119.900 3.000
OXT O3B PB O3A 108.200 3.000
OXT O1B PB O2B 119.900 3.000
OXT O1B PB O3A 108.200 3.000
OXT O2B PB O3A 108.200 3.000
OXT PB O3A PA 120.500 3.000
OXT O3A PA O1A 108.200 3.000
OXT O3A PA O2A 108.200 3.000
OXT O3A PA O76 102.600 3.000
OXT O1A PA O2A 119.900 3.000
OXT O1A PA O76 108.200 3.000
OXT O2A PA O76 108.200 3.000
OXT PA O76 C76 120.500 3.000
OXT O76 C76 H761 109.470 3.000
OXT O76 C76 H762 109.470 3.000
OXT O76 C76 C66 109.470 3.000
OXT H761 C76 H762 107.900 3.000
OXT H761 C76 C66 109.470 3.000
OXT H762 C76 C66 109.470 3.000
OXT C76 C66 H661 109.470 3.000
OXT C76 C66 H662 109.470 3.000
OXT C76 C66 C56 109.470 3.000
OXT H661 C66 H662 107.900 3.000
OXT H661 C66 C56 109.470 3.000
OXT H662 C66 C56 109.470 3.000
OXT C66 C56 C47 126.000 3.000
OXT C66 C56 S16 108.000 3.000
OXT C47 C56 S16 108.000 3.000
OXT C56 C47 CM4 126.000 3.000
OXT C56 C47 N43 108.000 3.000
OXT CM4 C47 N43 126.000 3.000
OXT C47 CM4 HM43 109.470 3.000
OXT C47 CM4 HM42 109.470 3.000
OXT C47 CM4 HM41 109.470 3.000
OXT HM43 CM4 HM42 109.470 3.000
OXT HM43 CM4 HM41 109.470 3.000
OXT HM42 CM4 HM41 109.470 3.000
OXT C47 N43 C71 126.000 3.000
OXT C47 N43 C42 108.000 3.000
OXT C71 N43 C42 126.000 3.000
OXT N43 C71 H711 109.500 3.000
OXT N43 C71 H712 109.500 3.000
OXT N43 C71 C51 109.500 3.000
OXT H711 C71 H712 107.900 3.000
OXT H711 C71 C51 109.470 3.000
OXT H712 C71 C51 109.470 3.000
OXT C71 C51 C61 120.000 3.000
OXT C71 C51 C41 120.000 3.000
OXT C61 C51 C41 120.000 3.000
OXT C51 C61 H61 120.000 3.000
OXT C51 C61 N11 120.000 3.000
OXT H61 C61 N11 120.000 3.000
OXT C61 N11 C21 120.000 3.000
OXT N11 C21 CM2 120.000 3.000
OXT N11 C21 N31 120.000 3.000
OXT CM2 C21 N31 120.000 3.000
OXT C21 CM2 HM23 109.470 3.000
OXT C21 CM2 HM22 109.470 3.000
OXT C21 CM2 HM21 109.470 3.000
OXT HM23 CM2 HM22 109.470 3.000
OXT HM23 CM2 HM21 109.470 3.000
OXT HM22 CM2 HM21 109.470 3.000
OXT C21 N31 C41 120.000 3.000
OXT N31 C41 N41 120.000 3.000
OXT N31 C41 C51 120.000 3.000
OXT N41 C41 C51 120.000 3.000
OXT C41 N41 H412 120.000 3.000
OXT C41 N41 H411 120.000 3.000
OXT H412 N41 H411 120.000 3.000
OXT C56 S16 C42 90.471 3.000
OXT S16 C42 C40 108.000 3.000
OXT S16 C42 N43 108.000 3.000
OXT C40 C42 N43 126.000 3.000
OXT C42 C40 H40 109.470 3.000
OXT C42 C40 O41 109.500 3.000
OXT C42 C40 S15 109.500 3.000
OXT H40 C40 O41 109.470 3.000
OXT H40 C40 S15 109.500 3.000
OXT O41 C40 S15 109.500 3.000
OXT C40 O41 H41 109.470 3.000
OXT C40 S15 C25 99.319 3.000
OXT S15 C25 H251 109.500 3.000
OXT S15 C25 H252 109.500 3.000
OXT S15 C25 C35 109.500 3.000
OXT H251 C25 H252 107.900 3.000
OXT H251 C25 C35 109.470 3.000
OXT H252 C25 C35 109.470 3.000
OXT C25 C35 H351 109.470 3.000
OXT C25 C35 H352 109.470 3.000
OXT C25 C35 N44 112.000 3.000
OXT H351 C35 H352 107.900 3.000
OXT H351 C35 N44 109.470 3.000
OXT H352 C35 N44 109.470 3.000
OXT C35 N44 H44 118.500 3.000
OXT C35 N44 C54 121.500 3.000
OXT H44 N44 C54 120.000 3.000
OXT N44 C54 O54 123.000 3.000
OXT N44 C54 C64 116.500 3.000
OXT O54 C54 C64 120.500 3.000
OXT C54 C64 H641 109.470 3.000
OXT C54 C64 H642 109.470 3.000
OXT C54 C64 C74 109.470 3.000
OXT H641 C64 H642 107.900 3.000
OXT H641 C64 C74 109.470 3.000
OXT H642 C64 C74 109.470 3.000
OXT C64 C74 H741 109.470 3.000
OXT C64 C74 H742 109.470 3.000
OXT C64 C74 N84 112.000 3.000
OXT H741 C74 H742 107.900 3.000
OXT H741 C74 N84 109.470 3.000
OXT H742 C74 N84 109.470 3.000
OXT C74 N84 H84 118.500 3.000
OXT C74 N84 C94 121.500 3.000
OXT H84 N84 C94 120.000 3.000
OXT N84 C94 O94 123.000 3.000
OXT N84 C94 C30 116.500 3.000
OXT O94 C94 C30 120.500 3.000
OXT C94 C30 H30 108.810 3.000
OXT C94 C30 O30 109.470 3.000
OXT C94 C30 C31 109.470 3.000
OXT H30 C30 O30 109.470 3.000
OXT H30 C30 C31 108.340 3.000
OXT O30 C30 C31 109.470 3.000
OXT C30 O30 HB 109.470 3.000
OXT C30 C31 C33 111.000 3.000
OXT C30 C31 C34 111.000 3.000
OXT C30 C31 C32 111.000 3.000
OXT C33 C31 C34 111.000 3.000
OXT C33 C31 C32 111.000 3.000
OXT C34 C31 C32 111.000 3.000
OXT C31 C33 H333 109.470 3.000
OXT C31 C33 H332 109.470 3.000
OXT C31 C33 H331 109.470 3.000
OXT H333 C33 H332 109.470 3.000
OXT H333 C33 H331 109.470 3.000
OXT H332 C33 H331 109.470 3.000
OXT C31 C34 H343 109.470 3.000
OXT C31 C34 H342 109.470 3.000
OXT C31 C34 H341 109.470 3.000
OXT H343 C34 H342 109.470 3.000
OXT H343 C34 H341 109.470 3.000
OXT H342 C34 H341 109.470 3.000
OXT C31 C32 H321 109.470 3.000
OXT C31 C32 H322 109.470 3.000
OXT C31 C32 O63 109.500 3.000
OXT H321 C32 H322 107.900 3.000
OXT H321 C32 O63 109.470 3.000
OXT H322 C32 O63 109.470 3.000
OXT C32 O63 P23 120.500 3.000
OXT O63 P23 O43 108.200 3.000
OXT O63 P23 O53 108.200 3.000
OXT O63 P23 O33 102.600 3.000
OXT O43 P23 O53 119.900 3.000
OXT O43 P23 O33 108.200 3.000
OXT O53 P23 O33 108.200 3.000
OXT P23 O33 P13 120.500 3.000
OXT O33 P13 O13 108.200 3.000
OXT O33 P13 O23 108.200 3.000
OXT O33 P13 "O5'" 102.600 3.000
OXT O13 P13 O23 119.900 3.000
OXT O13 P13 "O5'" 108.200 3.000
OXT O23 P13 "O5'" 108.200 3.000
OXT P13 "O5'" "C5'" 120.500 3.000
OXT "O5'" "C5'" "H5'1" 109.470 3.000
OXT "O5'" "C5'" "H5'2" 109.470 3.000
OXT "O5'" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
OXT "H5'1" "C5'" "H5'2" 107.900 3.000
OXT "H5'1" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
OXT "H5'2" "C5'" "C4'" 109.470 3.000
OXT "C5'" "C4'" "H4'" 108.340 3.000
OXT "C5'" "C4'" "C3'" 111.000 3.000
OXT "C5'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
OXT "H4'" "C4'" "C3'" 108.340 3.000
OXT "H4'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
OXT "C3'" "C4'" "O4'" 109.470 3.000
OXT "C4'" "C3'" "H3'" 108.340 3.000
OXT "C4'" "C3'" "O3'" 109.470 3.000
OXT "C4'" "C3'" "C2'" 111.000 3.000
OXT "H3'" "C3'" "O3'" 109.470 3.000
OXT "H3'" "C3'" "C2'" 108.340 3.000
OXT "O3'" "C3'" "C2'" 109.470 3.000
OXT "C3'" "O3'" "P3'" 120.500 3.000
OXT "O3'" "P3'" O91 108.200 3.000
OXT "O3'" "P3'" O81 108.200 3.000
OXT "O3'" "P3'" O71 108.200 3.000
OXT O91 "P3'" O81 119.900 3.000
OXT O91 "P3'" O71 119.900 3.000
OXT O81 "P3'" O71 119.900 3.000
OXT "C4'" "O4'" "C1'" 111.800 3.000
OXT "O4'" "C1'" "H1'" 109.470 3.000
OXT "O4'" "C1'" "C2'" 109.470 3.000
OXT "O4'" "C1'" N92 109.470 3.000
OXT "H1'" "C1'" "C2'" 108.340 3.000
OXT "H1'" "C1'" N92 109.470 3.000
OXT "C2'" "C1'" N92 109.470 3.000
OXT "C1'" "C2'" "H2'" 108.340 3.000
OXT "C1'" "C2'" "O2'" 109.470 3.000
OXT "C1'" "C2'" "C3'" 111.000 3.000
OXT "H2'" "C2'" "O2'" 109.470 3.000
OXT "H2'" "C2'" "C3'" 108.340 3.000
OXT "O2'" "C2'" "C3'" 109.470 3.000
OXT "C2'" "O2'" HA 109.470 3.000
OXT "C1'" N92 C82 126.000 3.000
OXT "C1'" N92 C77 126.000 3.000
OXT C82 N92 C77 108.000 3.000
OXT N92 C82 H82 126.000 3.000
OXT N92 C82 N72 108.000 3.000
OXT H82 C82 N72 126.000 3.000
OXT C82 N72 C52 108.000 3.000
OXT N72 C52 C77 108.000 3.000
OXT N72 C52 C62 132.000 3.000
OXT C77 C52 C62 120.000 3.000
OXT C52 C77 N92 108.000 3.000
OXT C52 C77 N32 120.000 3.000
OXT N92 C77 N32 132.000 3.000
OXT C52 C62 N62 120.000 3.000
OXT C52 C62 N12 120.000 3.000
OXT N62 C62 N12 120.000 3.000
OXT C62 N62 H622 120.000 3.000
OXT C62 N62 H621 120.000 3.000
OXT H622 N62 H621 120.000 3.000
OXT C62 N12 C22 120.000 3.000
OXT N12 C22 H22 120.000 3.000
OXT N12 C22 N32 120.000 3.000
OXT H22 C22 N32 120.000 3.000
OXT C22 N32 C77 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
OXT var_1 O3B PB O3A PA 66.323 20.000 1
OXT var_2 PB O3A PA O76 66.124 20.000 1
OXT var_3 O3A PA O76 C76 54.129 20.000 1
OXT var_4 PA O76 C76 C66 179.990 20.000 1
OXT var_5 O76 C76 C66 C56 61.317 20.000 3
OXT var_6 C76 C66 C56 S16 90.097 20.000 2
OXT CONST_1 C66 C56 C47 N43 180.000 0.000 0
OXT var_7 C56 C47 CM4 HM41 28.642 20.000 1
OXT CONST_2 C56 C47 N43 C71 180.000 0.000 0
OXT var_8 C47 N43 C71 C51 89.955 20.000 1
OXT var_9 N43 C71 C51 C61 0.043 20.000 2
OXT CONST_3 C71 C51 C41 N31 180.000 0.000 0
OXT CONST_4 C71 C51 C61 N11 180.000 0.000 0
OXT CONST_5 C51 C61 N11 C21 0.000 0.000 0
OXT CONST_6 C61 N11 C21 N31 0.000 0.000 0
OXT var_10 N11 C21 CM2 HM21 -171.378 20.000 1
OXT CONST_7 N11 C21 N31 C41 0.000 0.000 0
OXT CONST_8 C21 N31 C41 N41 180.000 0.000 0
OXT CONST_9 N31 C41 N41 H411 -47.886 0.000 0
OXT CONST_10 C66 C56 S16 C42 180.000 0.000 0
OXT CONST_11 C56 S16 C42 C40 180.000 0.000 0
OXT CONST_12 S16 C42 N43 C47 0.000 0.000 0
OXT var_11 S16 C42 C40 S15 -57.851 20.000 1
OXT var_12 C42 C40 O41 H41 108.347 20.000 1
OXT var_13 C42 C40 S15 C25 -179.983 20.000 1
OXT var_14 C40 S15 C25 C35 -179.944 20.000 1
OXT var_15 S15 C25 C35 N44 58.519 20.000 3
OXT var_16 C25 C35 N44 C54 90.022 20.000 3
OXT CONST_13 C35 N44 C54 C64 180.000 0.000 0
OXT var_17 N44 C54 C64 C74 -179.989 20.000 3
OXT var_18 C54 C64 C74 N84 -179.372 20.000 3
OXT var_19 C64 C74 N84 C94 89.930 20.000 3
OXT CONST_14 C74 N84 C94 C30 180.000 0.000 0
OXT var_20 N84 C94 C30 C31 92.331 20.000 3
OXT var_21 C94 C30 O30 HB -44.156 20.000 1
OXT var_22 C94 C30 C31 C32 -60.351 20.000 1
OXT var_23 C30 C31 C33 H331 -55.838 20.000 1
OXT var_24 C30 C31 C34 H341 171.733 20.000 1
OXT var_25 C30 C31 C32 O63 179.996 20.000 1
OXT var_26 C31 C32 O63 P23 179.977 20.000 1
OXT var_27 C32 O63 P23 O33 65.207 20.000 1
OXT var_28 O63 P23 O33 P13 174.029 20.000 1
OXT var_29 P23 O33 P13 "O5'" 65.702 20.000 1
OXT var_30 O33 P13 "O5'" "C5'" 54.622 20.000 1
OXT var_31 P13 "O5'" "C5'" "C4'" 179.990 20.000 1
OXT var_32 "O5'" "C5'" "C4'" "O4'" 62.110 20.000 3
OXT var_33 "C5'" "C4'" "C3'" "O3'" 90.000 20.000 3
OXT var_34 "C4'" "C3'" "C2'" "C1'" 30.000 20.000 3
OXT var_35 "C4'" "C3'" "O3'" "P3'" 175.247 20.000 1
OXT var_36 "C3'" "O3'" "P3'" O71 -60.002 20.000 1
OXT var_37 "C5'" "C4'" "O4'" "C1'" 150.000 20.000 1
OXT var_38 "C4'" "O4'" "C1'" N92 -120.000 20.000 1
OXT var_39 "O4'" "C1'" "C2'" "O2'" 90.000 20.000 3
OXT var_40 "C1'" "C2'" "O2'" HA 44.569 20.000 1
OXT var_41 "O4'" "C1'" N92 C82 33.816 20.000 1
OXT CONST_15 "C1'" N92 C77 C52 180.000 0.000 0
OXT CONST_16 "C1'" N92 C82 N72 180.000 0.000 0
OXT CONST_17 N92 C82 N72 C52 0.000 0.000 0
OXT CONST_18 C82 N72 C52 C62 180.000 0.000 0
OXT CONST_19 N72 C52 C77 N92 0.000 0.000 0
OXT CONST_20 C52 C77 N32 C22 0.000 0.000 0
OXT CONST_21 N72 C52 C62 N12 180.000 0.000 0
OXT CONST_22 C52 C62 N62 H621 -65.867 0.000 0
OXT CONST_23 C52 C62 N12 C22 0.000 0.000 0
OXT CONST_24 C62 N12 C22 N32 0.000 0.000 0
OXT CONST_25 N12 C22 N32 C77 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
OXT chir_01 "C3'" "O3'" "C2'" "C4'" negativ
OXT chir_02 "C2'" "C3'" "O2'" "C1'" negativ
OXT chir_03 "C1'" "C2'" N92 "O4'" positiv
OXT chir_04 "C4'" "C3'" "O4'" "C5'" positiv
OXT chir_05 C31 C32 C33 C34 negativ
OXT chir_06 C30 C31 O30 C94 negativ
OXT chir_07 C40 S15 O41 C42 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
OXT plan-1 N92 0.020
OXT plan-1 "C1'" 0.020
OXT plan-1 C77 0.020
OXT plan-1 C82 0.020
OXT plan-1 N72 0.020
OXT plan-1 N32 0.020
OXT plan-1 C52 0.020
OXT plan-1 C22 0.020
OXT plan-1 N12 0.020
OXT plan-1 C62 0.020
OXT plan-1 H22 0.020
OXT plan-1 N62 0.020
OXT plan-1 H82 0.020
OXT plan-1 H622 0.020
OXT plan-1 H621 0.020
OXT plan-2 N62 0.020
OXT plan-2 C62 0.020
OXT plan-2 H621 0.020
OXT plan-2 H622 0.020
OXT plan-3 C94 0.020
OXT plan-3 C30 0.020
OXT plan-3 O94 0.020
OXT plan-3 N84 0.020
OXT plan-3 H84 0.020
OXT plan-4 N84 0.020
OXT plan-4 C94 0.020
OXT plan-4 C74 0.020
OXT plan-4 H84 0.020
OXT plan-5 C54 0.020
OXT plan-5 C64 0.020
OXT plan-5 O54 0.020
OXT plan-5 N44 0.020
OXT plan-5 H44 0.020
OXT plan-6 N44 0.020
OXT plan-6 C54 0.020
OXT plan-6 C35 0.020
OXT plan-6 H44 0.020
OXT plan-7 C42 0.020
OXT plan-7 C40 0.020
OXT plan-7 N43 0.020
OXT plan-7 S16 0.020
OXT plan-7 C47 0.020
OXT plan-7 C56 0.020
OXT plan-7 C71 0.020
OXT plan-7 CM4 0.020
OXT plan-7 C66 0.020
OXT plan-8 C51 0.020
OXT plan-8 C71 0.020
OXT plan-8 C41 0.020
OXT plan-8 C61 0.020
OXT plan-8 N31 0.020
OXT plan-8 C21 0.020
OXT plan-8 N11 0.020
OXT plan-8 N41 0.020
OXT plan-8 CM2 0.020
OXT plan-8 H61 0.020
OXT plan-8 H412 0.020
OXT plan-8 H411 0.020
OXT plan-9 N41 0.020
OXT plan-9 C41 0.020
OXT plan-9 H411 0.020
OXT plan-9 H412 0.020
# ------------------------------------------------------
|
