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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PCA PCA 'PYROGLUTAMIC ACID ' peptide 15 9 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PCA
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PCA C C C 0.000 -0.971 -0.248 -0.749
PCA O O OC -0.500 -0.854 -1.093 -1.664
PCA CA C CH1 0.000 -2.280 0.468 -0.550
PCA HA H H 0.000 -2.105 1.476 -0.148
PCA CB C CH2 0.000 -3.190 -0.335 0.405
PCA HB2 H H 0.000 -3.159 0.028 1.435
PCA HB3 H H 0.000 -2.985 -1.408 0.392
PCA CG C CH2 0.000 -4.590 -0.069 -0.195
PCA HG2 H H 0.000 -5.085 0.779 0.281
PCA HG3 H H 0.000 -5.235 -0.948 -0.133
PCA CD C C 0.000 -4.316 0.254 -1.646
PCA OE O O 0.000 -5.149 0.253 -2.528
PCA N N NH1 0.000 -3.013 0.549 -1.817
PCA H H H 0.000 -2.595 0.794 -2.703
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PCA N n/a CA START
PCA H N . .
PCA CA N C .
PCA HA CA . .
PCA CB CA CG .
PCA HB3 CB . .
PCA HB2 CB . .
PCA CG CB CD .
PCA HG3 CG . .
PCA HG2 CG . .
PCA CD CG OE .
PCA OE CD . .
PCA C CA . END
PCA O C . .
PCA CD N . ADD
#PCA OXT n/a C START
#PCA C OXT CA .
#PCA O C . .
#PCA CA C CB .
#PCA HA CA . .
#PCA CB CA CG .
#PCA HB2 CB . .
#PCA HB3 CB . .
#PCA CG CB CD .
#PCA HG2 CG . .
#PCA HG3 CG . .
#PCA CD CG N .
#PCA OE CD . .
#PCA N CD H .
#PCA H N . END
#PCA N CA . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PCA N CA single 1.450 0.020
PCA N CD single 1.330 0.020
PCA H N single 1.010 0.020
PCA CB CA single 1.524 0.020
PCA CA C single 1.500 0.020
PCA HA CA single 1.099 0.020
PCA CG CB single 1.524 0.020
PCA HB2 CB single 1.092 0.020
PCA HB3 CB single 1.092 0.020
PCA CD CG single 1.510 0.020
PCA HG2 CG single 1.092 0.020
PCA HG3 CG single 1.092 0.020
PCA OE CD double 1.220 0.020
PCA O C deloc 1.250 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PCA O C CA 118.500 3.000
PCA C CA HA 108.810 3.000
PCA C CA CB 109.470 3.000
PCA C CA N 111.600 3.000
PCA HA CA CB 108.340 3.000
PCA HA CA N 108.550 3.000
PCA CB CA N 110.000 3.000
PCA CA CB HB2 109.470 3.000
PCA CA CB HB3 109.470 3.000
PCA CA CB CG 111.000 3.000
PCA HB2 CB HB3 107.900 3.000
PCA HB2 CB CG 109.470 3.000
PCA HB3 CB CG 109.470 3.000
PCA CB CG HG2 109.470 3.000
PCA CB CG HG3 109.470 3.000
PCA CB CG CD 109.470 3.000
PCA HG2 CG HG3 107.900 3.000
PCA HG2 CG CD 109.470 3.000
PCA HG3 CG CD 109.470 3.000
PCA CG CD OE 120.500 3.000
PCA CG CD N 116.500 3.000
PCA OE CD N 123.000 3.000
PCA CD N H 120.000 3.000
PCA CD N CA 121.500 3.000
PCA H N CA 118.500 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PCA var_2 C CA CB CG -150.000 20.000 3
PCA var_3 CA CB CG CD 30.000 20.000 3
PCA var_4 CB CG CD N -30.000 20.000 3
PCA CONST_1 CG CD N CA 0.000 0.000 0
PCA var_5 CD N CA C 150.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
PCA chir_01 CA N CB C negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PCA plan-1 N 0.020
PCA plan-1 CA 0.020
PCA plan-1 CD 0.020
PCA plan-1 H 0.020
PCA plan-2 CD 0.020
PCA plan-2 N 0.020
PCA plan-2 CG 0.020
PCA plan-2 OE 0.020
PCA plan-2 H 0.020
PCA plan-3 C 0.020
PCA plan-3 CA 0.020
PCA plan-3 O 0.020
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