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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PDV PDV 'Divanadate ion ' non-polymer 10 9 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PDV
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PDV O2 O O -1.000 0.000 0.000 0.000
PDV V1 V V 0.000 -1.326 1.264 -0.130
PDV O3 O O2 0.000 -2.647 0.831 -1.338
PDV O1 O O -1.000 -0.683 2.973 -0.316
PDV O4 O O2 0.000 -2.636 1.098 1.154
PDV V2 V V 0.000 -3.543 -0.037 0.019
PDV O7 O O -1.000 -2.779 -1.500 0.833
PDV O5 O O -1.000 -4.393 -1.123 -1.197
PDV O6 O OH1 0.000 -5.157 0.609 0.616
PDV HO6 H H 0.000 -5.128 1.278 1.273
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PDV O2 n/a V1 START
PDV V1 O2 O4 .
PDV O3 V1 . .
PDV O1 V1 . .
PDV O4 V1 V2 .
PDV V2 O4 O6 .
PDV O7 V2 . .
PDV O5 V2 . .
PDV O6 V2 HO6 .
PDV HO6 O6 . END
PDV V2 O3 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PDV O7 V2 single 1.910 0.020
PDV O5 V2 single 1.910 0.020
PDV O6 V2 single 2.105 0.020
PDV V2 O3 single 2.004 0.020
PDV V2 O4 single 2.004 0.020
PDV O3 V1 single 2.004 0.020
PDV O4 V1 single 2.004 0.020
PDV O1 V1 single 1.910 0.020
PDV V1 O2 single 1.910 0.020
PDV HO6 O6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PDV O2 V1 O3 113.748 3.000
PDV O2 V1 O1 113.265 3.000
PDV O2 V1 O4 113.736 3.000
PDV O3 V1 O1 113.790 3.000
PDV O3 V1 O4 85.773 3.000
PDV O1 V1 O4 113.787 3.000
PDV V1 O3 V2 120.000 3.000
PDV V1 O4 V2 120.000 3.000
PDV O4 V2 O7 90.000 3.000
PDV O4 V2 O5 180.000 3.000
PDV O4 V2 O6 90.000 3.000
PDV O4 V2 O3 90.000 3.000
PDV O7 V2 O5 90.000 3.000
PDV O7 V2 O6 120.000 3.000
PDV O5 V2 O6 90.000 3.000
PDV O7 V2 O3 120.000 3.000
PDV O5 V2 O3 90.000 3.000
PDV O6 V2 O3 120.000 3.000
PDV V2 O6 HO6 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PDV var_1 O2 V1 O3 V2 89.015 20.000 1
PDV var_2 O2 V1 O4 V2 -89.037 20.000 1
PDV var_3 V1 O4 V2 O3 0.000 20.000 1
PDV var_4 V1 O3 V2 O4 0.000 20.000 1
PDV var_5 HO6 O6 V2 O4 0.000 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
_chem_comp_chir.atom_id_4
_chem_comp_chir.atom_id_5
_chem_comp_chir.atom_id_6
_chem_comp_chir.atom_id_7
_chem_comp_chir.atom_id_8
PDV chir_01 V2 O4 O5 O7 cross3
O3 O6 . . .
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