1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PII PII '"2-[(HYDROXY{[(2R,3R,5S,6R)-2,3,4,5,' non-polymer 136 56 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PII
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PII OC6 O O -0.500 0.000 0.000 0.000
PII CO6 C C 0.000 -0.823 -0.526 0.782
PII CL1 C CH2 0.000 -0.617 -0.427 2.271
PII HL11 H H 0.000 -0.530 -1.430 2.693
PII HL12 H H 0.000 -1.470 0.084 2.722
PII CL2 C CH2 0.000 0.662 0.361 2.557
PII HL21 H H 0.000 0.574 1.364 2.133
PII HL22 H H 0.000 1.513 -0.151 2.103
PII CL3 C CH2 0.000 0.872 0.462 4.070
PII HL31 H H 0.000 0.959 -0.541 4.492
PII HL32 H H 0.000 0.019 0.974 4.521
PII CL4 C CH2 0.000 2.151 1.251 4.356
PII HL41 H H 0.000 2.063 2.253 3.932
PII HL42 H H 0.000 3.003 0.739 3.903
PII CL5 C CH2 0.000 2.360 1.351 5.868
PII HL51 H H 0.000 2.447 0.348 6.291
PII HL52 H H 0.000 1.508 1.863 6.320
PII CL6 C CH2 0.000 3.640 2.140 6.155
PII HL61 H H 0.000 3.551 3.142 5.730
PII HL62 H H 0.000 4.491 1.628 5.701
PII CL7 C CH2 0.000 3.850 2.241 7.666
PII HL71 H H 0.000 3.937 1.237 8.089
PII HL72 H H 0.000 2.997 2.752 8.118
PII CL8 C CH2 0.000 5.129 3.029 7.953
PII HL81 H H 0.000 5.041 4.032 7.529
PII HL82 H H 0.000 5.981 2.517 7.499
PII CL9 C CH2 0.000 5.338 3.129 9.465
PII HL91 H H 0.000 5.426 2.125 9.887
PII HL92 H H 0.000 4.485 3.639 9.918
PII CLA C CH2 0.000 6.617 3.918 9.752
PII HR H H 0.000 6.529 4.920 9.328
PII HS H H 0.000 7.469 3.407 9.298
PII CLB C CH2 0.000 6.826 4.019 11.264
PII HT H H 0.000 6.913 3.015 11.687
PII HU H H 0.000 5.974 4.530 11.716
PII CLC C CH2 0.000 8.107 4.807 11.551
PII HV H H 0.000 8.019 5.810 11.126
PII HW H H 0.000 8.958 4.295 11.097
PII CLD C CH2 0.000 8.316 4.908 13.063
PII HX1 H H 0.000 8.403 3.905 13.486
PII HX2 H H 0.000 7.463 5.419 13.515
PII CLE C CH2 0.000 9.595 5.696 13.349
PII HY1 H H 0.000 9.507 6.699 12.925
PII HY2 H H 0.000 10.446 5.184 12.896
PII CLF C CH3 0.000 9.804 5.797 14.862
PII HZ3 H H 0.000 8.978 6.294 15.304
PII HZ2 H H 0.000 9.890 4.824 15.276
PII HZ1 H H 0.000 10.690 6.343 15.064
PII O26 O O2 -0.500 -1.817 -1.134 0.327
PII C25 C CH2 0.000 -2.089 -1.275 -1.141
PII H251 H H 0.000 -1.236 -1.786 -1.593
PII H252 H H 0.000 -2.176 -0.271 -1.564
PII C24 C CH1 0.000 -3.368 -2.063 -1.427
PII H24 H H 0.000 -3.253 -3.078 -1.021
PII C21 C CH2 0.000 -3.576 -2.163 -2.940
PII H211 H H 0.000 -4.488 -2.727 -3.144
PII H212 H H 0.000 -2.724 -2.676 -3.391
PII O12 O O2 0.000 -3.692 -0.851 -3.493
PII P1 P P 0.000 -3.909 -1.031 -5.078
PII O11 O OP -0.500 -5.144 -1.815 -5.321
PII O13 O OP -0.500 -2.747 -1.747 -5.658
PII OI1 O O2 0.000 -4.048 0.415 -5.769
PII CI1 C CH1 0.000 -4.237 0.189 -7.167
PII HI1 H H 0.000 -4.234 -0.892 -7.367
PII CI6 C CH1 0.000 -3.105 0.856 -7.950
PII HI6 H H 0.000 -3.250 0.682 -9.025
PII OI6 O OH1 0.000 -1.854 0.301 -7.543
PII HE H H 0.000 -1.139 0.722 -8.039
PII CI5 C CH1 0.000 -3.109 2.360 -7.672
PII HI5 H H 0.000 -2.963 2.534 -6.596
PII OI5 O OH1 0.000 -2.051 2.983 -8.403
PII HD H H 0.000 -2.055 3.933 -8.227
PII CI4 C CH1 0.000 -4.450 2.956 -8.107
PII HI4 H H 0.000 -4.596 2.782 -9.182
PII OI4 O OH1 0.000 -4.454 4.360 -7.847
PII HC H H 0.000 -3.737 4.781 -8.342
PII CI3 C CH1 0.000 -5.582 2.289 -7.324
PII HI3 H H 0.000 -5.436 2.463 -6.249
PII OI3 O OH1 0.000 -6.834 2.846 -7.731
PII HB H H 0.000 -6.835 3.796 -7.555
PII CI2 C CH1 0.000 -5.578 0.784 -7.603
PII HI2 H H 0.000 -6.392 0.305 -7.040
PII OI2 O OH1 0.000 -5.767 0.558 -9.001
PII HA H H 0.000 -6.615 0.934 -9.276
PII O29 O O2 -0.500 -4.572 -1.430 -0.798
PII CO9 C C 0.000 -5.561 -2.088 -0.406
PII OC9 O O -0.500 -5.574 -3.332 -0.533
PII CR1 C CH2 0.000 -6.737 -1.381 0.218
PII HR11 H H 0.000 -7.157 -0.672 -0.498
PII HR12 H H 0.000 -6.407 -0.844 1.110
PII CR2 C CH2 0.000 -7.802 -2.409 0.605
PII HR21 H H 0.000 -7.380 -3.118 1.320
PII HR22 H H 0.000 -8.130 -2.946 -0.287
PII CR3 C CH2 0.000 -8.996 -1.692 1.239
PII HR31 H H 0.000 -9.416 -0.983 0.522
PII HR32 H H 0.000 -8.666 -1.154 2.130
PII CR4 C CH2 0.000 -10.062 -2.719 1.626
PII HR41 H H 0.000 -9.639 -3.428 2.342
PII HR42 H H 0.000 -10.390 -3.256 0.734
PII CR5 C CH2 0.000 -11.255 -2.002 2.260
PII HR51 H H 0.000 -11.675 -1.293 1.544
PII HR52 H H 0.000 -10.924 -1.465 3.151
PII CR6 C CH2 0.000 -12.320 -3.030 2.648
PII HR61 H H 0.000 -11.898 -3.738 3.364
PII HR62 H H 0.000 -12.648 -3.567 1.756
PII CR7 C CH2 0.000 -13.514 -2.314 3.280
PII HR71 H H 0.000 -13.933 -1.605 2.563
PII HR72 H H 0.000 -13.184 -1.776 4.172
PII CR8 C CH2 0.000 -14.579 -3.340 3.668
PII HR81 H H 0.000 -14.157 -4.049 4.383
PII HR82 H H 0.000 -14.908 -3.877 2.776
PII CR9 C CH2 0.000 -15.772 -2.624 4.302
PII HR91 H H 0.000 -16.192 -1.915 3.586
PII HR92 H H 0.000 -15.441 -2.087 5.193
PII CRA C CH2 0.000 -16.838 -3.650 4.690
PII "HC'" H H 0.000 -16.416 -4.359 5.405
PII HF H H 0.000 -17.166 -4.188 3.797
PII CRB C CH2 0.000 -18.032 -2.933 5.323
PII HG H H 0.000 -18.452 -2.225 4.607
PII HG1 H H 0.000 -17.702 -2.396 6.215
PII CRC C CH2 0.000 -19.097 -3.962 5.711
PII HH H H 0.000 -18.675 -4.671 6.427
PII HH1 H H 0.000 -19.426 -4.499 4.819
PII CRD C CH2 0.000 -20.291 -3.244 6.345
PII HI H H 0.000 -20.711 -2.535 5.628
PII HJ H H 0.000 -19.960 -2.706 7.236
PII CRE C CH2 0.000 -21.356 -4.271 6.733
PII HK H H 0.000 -20.933 -4.980 7.448
PII HL H H 0.000 -21.684 -4.809 5.840
PII CRF C CH2 0.000 -22.550 -3.554 7.366
PII HM H H 0.000 -22.970 -2.845 6.650
PII HN H H 0.000 -22.220 -3.017 8.257
PII CRG C CH3 0.000 -23.615 -4.582 7.754
PII HQ H H 0.000 -23.937 -5.106 6.890
PII HP H H 0.000 -23.210 -5.271 8.450
PII HO H H 0.000 -24.444 -4.088 8.193
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PII OC6 n/a CO6 START
PII CO6 OC6 O26 .
PII CL1 CO6 CL2 .
PII HL11 CL1 . .
PII HL12 CL1 . .
PII CL2 CL1 CL3 .
PII HL21 CL2 . .
PII HL22 CL2 . .
PII CL3 CL2 CL4 .
PII HL31 CL3 . .
PII HL32 CL3 . .
PII CL4 CL3 CL5 .
PII HL41 CL4 . .
PII HL42 CL4 . .
PII CL5 CL4 CL6 .
PII HL51 CL5 . .
PII HL52 CL5 . .
PII CL6 CL5 CL7 .
PII HL61 CL6 . .
PII HL62 CL6 . .
PII CL7 CL6 CL8 .
PII HL71 CL7 . .
PII HL72 CL7 . .
PII CL8 CL7 CL9 .
PII HL81 CL8 . .
PII HL82 CL8 . .
PII CL9 CL8 CLA .
PII HL91 CL9 . .
PII HL92 CL9 . .
PII CLA CL9 CLB .
PII HR CLA . .
PII HS CLA . .
PII CLB CLA CLC .
PII HT CLB . .
PII HU CLB . .
PII CLC CLB CLD .
PII HV CLC . .
PII HW CLC . .
PII CLD CLC CLE .
PII HX1 CLD . .
PII HX2 CLD . .
PII CLE CLD CLF .
PII HY1 CLE . .
PII HY2 CLE . .
PII CLF CLE HZ1 .
PII HZ3 CLF . .
PII HZ2 CLF . .
PII HZ1 CLF . .
PII O26 CO6 C25 .
PII C25 O26 C24 .
PII H251 C25 . .
PII H252 C25 . .
PII C24 C25 O29 .
PII H24 C24 . .
PII C21 C24 O12 .
PII H211 C21 . .
PII H212 C21 . .
PII O12 C21 P1 .
PII P1 O12 OI1 .
PII O11 P1 . .
PII O13 P1 . .
PII OI1 P1 CI1 .
PII CI1 OI1 CI6 .
PII HI1 CI1 . .
PII CI6 CI1 CI5 .
PII HI6 CI6 . .
PII OI6 CI6 HE .
PII HE OI6 . .
PII CI5 CI6 CI4 .
PII HI5 CI5 . .
PII OI5 CI5 HD .
PII HD OI5 . .
PII CI4 CI5 CI3 .
PII HI4 CI4 . .
PII OI4 CI4 HC .
PII HC OI4 . .
PII CI3 CI4 CI2 .
PII HI3 CI3 . .
PII OI3 CI3 HB .
PII HB OI3 . .
PII CI2 CI3 OI2 .
PII HI2 CI2 . .
PII OI2 CI2 HA .
PII HA OI2 . .
PII O29 C24 CO9 .
PII CO9 O29 CR1 .
PII OC9 CO9 . .
PII CR1 CO9 CR2 .
PII HR11 CR1 . .
PII HR12 CR1 . .
PII CR2 CR1 CR3 .
PII HR21 CR2 . .
PII HR22 CR2 . .
PII CR3 CR2 CR4 .
PII HR31 CR3 . .
PII HR32 CR3 . .
PII CR4 CR3 CR5 .
PII HR41 CR4 . .
PII HR42 CR4 . .
PII CR5 CR4 CR6 .
PII HR51 CR5 . .
PII HR52 CR5 . .
PII CR6 CR5 CR7 .
PII HR61 CR6 . .
PII HR62 CR6 . .
PII CR7 CR6 CR8 .
PII HR71 CR7 . .
PII HR72 CR7 . .
PII CR8 CR7 CR9 .
PII HR81 CR8 . .
PII HR82 CR8 . .
PII CR9 CR8 CRA .
PII HR91 CR9 . .
PII HR92 CR9 . .
PII CRA CR9 CRB .
PII "HC'" CRA . .
PII HF CRA . .
PII CRB CRA CRC .
PII HG CRB . .
PII HG1 CRB . .
PII CRC CRB CRD .
PII HH CRC . .
PII HH1 CRC . .
PII CRD CRC CRE .
PII HI CRD . .
PII HJ CRD . .
PII CRE CRD CRF .
PII HK CRE . .
PII HL CRE . .
PII CRF CRE CRG .
PII HM CRF . .
PII HN CRF . .
PII CRG CRF HO .
PII HQ CRG . .
PII HP CRG . .
PII HO CRG . END
PII CI1 CI2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PII OI1 P1 single 1.610 0.020
PII CI1 OI1 single 1.426 0.020
PII O11 P1 deloc 1.510 0.020
PII O13 P1 deloc 1.510 0.020
PII P1 O12 single 1.610 0.020
PII O12 C21 single 1.426 0.020
PII C21 C24 single 1.524 0.020
PII H211 C21 single 1.092 0.020
PII H212 C21 single 1.092 0.020
PII O29 C24 single 1.426 0.020
PII C24 C25 single 1.524 0.020
PII H24 C24 single 1.099 0.020
PII CO9 O29 deloc 1.454 0.020
PII C25 O26 single 1.426 0.020
PII H251 C25 single 1.092 0.020
PII H252 C25 single 1.092 0.020
PII O26 CO6 deloc 1.454 0.020
PII OC9 CO9 deloc 1.220 0.020
PII CR1 CO9 single 1.510 0.020
PII CO6 OC6 deloc 1.220 0.020
PII CL1 CO6 single 1.510 0.020
PII CR2 CR1 single 1.524 0.020
PII HR11 CR1 single 1.092 0.020
PII HR12 CR1 single 1.092 0.020
PII CR3 CR2 single 1.524 0.020
PII HR21 CR2 single 1.092 0.020
PII HR22 CR2 single 1.092 0.020
PII CL2 CL1 single 1.524 0.020
PII HL11 CL1 single 1.092 0.020
PII HL12 CL1 single 1.092 0.020
PII CL3 CL2 single 1.524 0.020
PII HL21 CL2 single 1.092 0.020
PII HL22 CL2 single 1.092 0.020
PII CR4 CR3 single 1.524 0.020
PII HR31 CR3 single 1.092 0.020
PII HR32 CR3 single 1.092 0.020
PII CR5 CR4 single 1.524 0.020
PII HR41 CR4 single 1.092 0.020
PII HR42 CR4 single 1.092 0.020
PII CR6 CR5 single 1.524 0.020
PII HR51 CR5 single 1.092 0.020
PII HR52 CR5 single 1.092 0.020
PII CR7 CR6 single 1.524 0.020
PII HR61 CR6 single 1.092 0.020
PII HR62 CR6 single 1.092 0.020
PII CR8 CR7 single 1.524 0.020
PII HR71 CR7 single 1.092 0.020
PII HR72 CR7 single 1.092 0.020
PII CR9 CR8 single 1.524 0.020
PII HR81 CR8 single 1.092 0.020
PII HR82 CR8 single 1.092 0.020
PII CRA CR9 single 1.524 0.020
PII HR91 CR9 single 1.092 0.020
PII HR92 CR9 single 1.092 0.020
PII CRB CRA single 1.524 0.020
PII "HC'" CRA single 1.092 0.020
PII HF CRA single 1.092 0.020
PII CRC CRB single 1.524 0.020
PII HG CRB single 1.092 0.020
PII HG1 CRB single 1.092 0.020
PII CRD CRC single 1.524 0.020
PII HH CRC single 1.092 0.020
PII HH1 CRC single 1.092 0.020
PII CRE CRD single 1.524 0.020
PII HI CRD single 1.092 0.020
PII HJ CRD single 1.092 0.020
PII CRF CRE single 1.524 0.020
PII HK CRE single 1.092 0.020
PII HL CRE single 1.092 0.020
PII CRG CRF single 1.513 0.020
PII HM CRF single 1.092 0.020
PII HN CRF single 1.092 0.020
PII HO CRG single 1.059 0.020
PII HP CRG single 1.059 0.020
PII HQ CRG single 1.059 0.020
PII CL4 CL3 single 1.524 0.020
PII HL31 CL3 single 1.092 0.020
PII HL32 CL3 single 1.092 0.020
PII CL5 CL4 single 1.524 0.020
PII HL41 CL4 single 1.092 0.020
PII HL42 CL4 single 1.092 0.020
PII CL6 CL5 single 1.524 0.020
PII HL51 CL5 single 1.092 0.020
PII HL52 CL5 single 1.092 0.020
PII CL7 CL6 single 1.524 0.020
PII HL61 CL6 single 1.092 0.020
PII HL62 CL6 single 1.092 0.020
PII CL8 CL7 single 1.524 0.020
PII HL71 CL7 single 1.092 0.020
PII HL72 CL7 single 1.092 0.020
PII CL9 CL8 single 1.524 0.020
PII HL81 CL8 single 1.092 0.020
PII HL82 CL8 single 1.092 0.020
PII CLA CL9 single 1.524 0.020
PII HL91 CL9 single 1.092 0.020
PII HL92 CL9 single 1.092 0.020
PII CLB CLA single 1.524 0.020
PII HR CLA single 1.092 0.020
PII HS CLA single 1.092 0.020
PII CLC CLB single 1.524 0.020
PII HT CLB single 1.092 0.020
PII HU CLB single 1.092 0.020
PII CLD CLC single 1.524 0.020
PII HV CLC single 1.092 0.020
PII HW CLC single 1.092 0.020
PII CLE CLD single 1.524 0.020
PII HX1 CLD single 1.092 0.020
PII HX2 CLD single 1.092 0.020
PII CLF CLE single 1.513 0.020
PII HY1 CLE single 1.092 0.020
PII HY2 CLE single 1.092 0.020
PII HZ1 CLF single 1.059 0.020
PII HZ2 CLF single 1.059 0.020
PII HZ3 CLF single 1.059 0.020
PII CI1 CI2 single 1.524 0.020
PII CI6 CI1 single 1.524 0.020
PII HI1 CI1 single 1.099 0.020
PII CI2 CI3 single 1.524 0.020
PII OI2 CI2 single 1.432 0.020
PII HI2 CI2 single 1.099 0.020
PII CI3 CI4 single 1.524 0.020
PII OI3 CI3 single 1.432 0.020
PII HI3 CI3 single 1.099 0.020
PII CI4 CI5 single 1.524 0.020
PII OI4 CI4 single 1.432 0.020
PII HI4 CI4 single 1.099 0.020
PII CI5 CI6 single 1.524 0.020
PII OI5 CI5 single 1.432 0.020
PII HI5 CI5 single 1.099 0.020
PII OI6 CI6 single 1.432 0.020
PII HI6 CI6 single 1.099 0.020
PII HA OI2 single 0.967 0.020
PII HB OI3 single 0.967 0.020
PII HC OI4 single 0.967 0.020
PII HD OI5 single 0.967 0.020
PII HE OI6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PII OC6 CO6 CL1 120.500 3.000
PII OC6 CO6 O26 119.000 3.000
PII CL1 CO6 O26 120.000 3.000
PII CO6 CL1 HL11 109.470 3.000
PII CO6 CL1 HL12 109.470 3.000
PII CO6 CL1 CL2 109.470 3.000
PII HL11 CL1 HL12 107.900 3.000
PII HL11 CL1 CL2 109.470 3.000
PII HL12 CL1 CL2 109.470 3.000
PII CL1 CL2 HL21 109.470 3.000
PII CL1 CL2 HL22 109.470 3.000
PII CL1 CL2 CL3 111.000 3.000
PII HL21 CL2 HL22 107.900 3.000
PII HL21 CL2 CL3 109.470 3.000
PII HL22 CL2 CL3 109.470 3.000
PII CL2 CL3 HL31 109.470 3.000
PII CL2 CL3 HL32 109.470 3.000
PII CL2 CL3 CL4 111.000 3.000
PII HL31 CL3 HL32 107.900 3.000
PII HL31 CL3 CL4 109.470 3.000
PII HL32 CL3 CL4 109.470 3.000
PII CL3 CL4 HL41 109.470 3.000
PII CL3 CL4 HL42 109.470 3.000
PII CL3 CL4 CL5 111.000 3.000
PII HL41 CL4 HL42 107.900 3.000
PII HL41 CL4 CL5 109.470 3.000
PII HL42 CL4 CL5 109.470 3.000
PII CL4 CL5 HL51 109.470 3.000
PII CL4 CL5 HL52 109.470 3.000
PII CL4 CL5 CL6 111.000 3.000
PII HL51 CL5 HL52 107.900 3.000
PII HL51 CL5 CL6 109.470 3.000
PII HL52 CL5 CL6 109.470 3.000
PII CL5 CL6 HL61 109.470 3.000
PII CL5 CL6 HL62 109.470 3.000
PII CL5 CL6 CL7 111.000 3.000
PII HL61 CL6 HL62 107.900 3.000
PII HL61 CL6 CL7 109.470 3.000
PII HL62 CL6 CL7 109.470 3.000
PII CL6 CL7 HL71 109.470 3.000
PII CL6 CL7 HL72 109.470 3.000
PII CL6 CL7 CL8 111.000 3.000
PII HL71 CL7 HL72 107.900 3.000
PII HL71 CL7 CL8 109.470 3.000
PII HL72 CL7 CL8 109.470 3.000
PII CL7 CL8 HL81 109.470 3.000
PII CL7 CL8 HL82 109.470 3.000
PII CL7 CL8 CL9 111.000 3.000
PII HL81 CL8 HL82 107.900 3.000
PII HL81 CL8 CL9 109.470 3.000
PII HL82 CL8 CL9 109.470 3.000
PII CL8 CL9 HL91 109.470 3.000
PII CL8 CL9 HL92 109.470 3.000
PII CL8 CL9 CLA 111.000 3.000
PII HL91 CL9 HL92 107.900 3.000
PII HL91 CL9 CLA 109.470 3.000
PII HL92 CL9 CLA 109.470 3.000
PII CL9 CLA HR 109.470 3.000
PII CL9 CLA HS 109.470 3.000
PII CL9 CLA CLB 111.000 3.000
PII HR CLA HS 107.900 3.000
PII HR CLA CLB 109.470 3.000
PII HS CLA CLB 109.470 3.000
PII CLA CLB HT 109.470 3.000
PII CLA CLB HU 109.470 3.000
PII CLA CLB CLC 111.000 3.000
PII HT CLB HU 107.900 3.000
PII HT CLB CLC 109.470 3.000
PII HU CLB CLC 109.470 3.000
PII CLB CLC HV 109.470 3.000
PII CLB CLC HW 109.470 3.000
PII CLB CLC CLD 111.000 3.000
PII HV CLC HW 107.900 3.000
PII HV CLC CLD 109.470 3.000
PII HW CLC CLD 109.470 3.000
PII CLC CLD HX1 109.470 3.000
PII CLC CLD HX2 109.470 3.000
PII CLC CLD CLE 111.000 3.000
PII HX1 CLD HX2 107.900 3.000
PII HX1 CLD CLE 109.470 3.000
PII HX2 CLD CLE 109.470 3.000
PII CLD CLE HY1 109.470 3.000
PII CLD CLE HY2 109.470 3.000
PII CLD CLE CLF 111.000 3.000
PII HY1 CLE HY2 107.900 3.000
PII HY1 CLE CLF 109.470 3.000
PII HY2 CLE CLF 109.470 3.000
PII CLE CLF HZ3 109.470 3.000
PII CLE CLF HZ2 109.470 3.000
PII CLE CLF HZ1 109.470 3.000
PII HZ3 CLF HZ2 109.470 3.000
PII HZ3 CLF HZ1 109.470 3.000
PII HZ2 CLF HZ1 109.470 3.000
PII CO6 O26 C25 120.000 3.000
PII O26 C25 H251 109.470 3.000
PII O26 C25 H252 109.470 3.000
PII O26 C25 C24 109.470 3.000
PII H251 C25 H252 107.900 3.000
PII H251 C25 C24 109.470 3.000
PII H252 C25 C24 109.470 3.000
PII C25 C24 H24 108.340 3.000
PII C25 C24 C21 109.470 3.000
PII C25 C24 O29 109.470 3.000
PII H24 C24 C21 108.340 3.000
PII H24 C24 O29 109.470 3.000
PII C21 C24 O29 109.470 3.000
PII C24 C21 H211 109.470 3.000
PII C24 C21 H212 109.470 3.000
PII C24 C21 O12 109.470 3.000
PII H211 C21 H212 107.900 3.000
PII H211 C21 O12 109.470 3.000
PII H212 C21 O12 109.470 3.000
PII C21 O12 P1 120.500 3.000
PII O12 P1 O11 108.200 3.000
PII O12 P1 O13 108.200 3.000
PII O12 P1 OI1 102.600 3.000
PII O11 P1 O13 119.900 3.000
PII O11 P1 OI1 108.200 3.000
PII O13 P1 OI1 108.200 3.000
PII P1 OI1 CI1 120.500 3.000
PII OI1 CI1 HI1 109.470 3.000
PII OI1 CI1 CI6 109.470 3.000
PII OI1 CI1 CI2 109.470 3.000
PII HI1 CI1 CI6 108.340 3.000
PII HI1 CI1 CI2 108.340 3.000
PII CI6 CI1 CI2 111.000 3.000
PII CI1 CI6 HI6 108.340 3.000
PII CI1 CI6 OI6 109.470 3.000
PII CI1 CI6 CI5 111.000 3.000
PII HI6 CI6 OI6 109.470 3.000
PII HI6 CI6 CI5 108.340 3.000
PII OI6 CI6 CI5 109.470 3.000
PII CI6 OI6 HE 109.470 3.000
PII CI6 CI5 HI5 108.340 3.000
PII CI6 CI5 OI5 109.470 3.000
PII CI6 CI5 CI4 111.000 3.000
PII HI5 CI5 OI5 109.470 3.000
PII HI5 CI5 CI4 108.340 3.000
PII OI5 CI5 CI4 109.470 3.000
PII CI5 OI5 HD 109.470 3.000
PII CI5 CI4 HI4 108.340 3.000
PII CI5 CI4 OI4 109.470 3.000
PII CI5 CI4 CI3 111.000 3.000
PII HI4 CI4 OI4 109.470 3.000
PII HI4 CI4 CI3 108.340 3.000
PII OI4 CI4 CI3 109.470 3.000
PII CI4 OI4 HC 109.470 3.000
PII CI4 CI3 HI3 108.340 3.000
PII CI4 CI3 OI3 109.470 3.000
PII CI4 CI3 CI2 111.000 3.000
PII HI3 CI3 OI3 109.470 3.000
PII HI3 CI3 CI2 108.340 3.000
PII OI3 CI3 CI2 109.470 3.000
PII CI3 OI3 HB 109.470 3.000
PII CI3 CI2 HI2 108.340 3.000
PII CI3 CI2 OI2 109.470 3.000
PII CI3 CI2 CI1 111.000 3.000
PII HI2 CI2 OI2 109.470 3.000
PII HI2 CI2 CI1 108.340 3.000
PII OI2 CI2 CI1 109.470 3.000
PII CI2 OI2 HA 109.470 3.000
PII C24 O29 CO9 111.800 3.000
PII O29 CO9 OC9 119.000 3.000
PII O29 CO9 CR1 120.000 3.000
PII OC9 CO9 CR1 120.500 3.000
PII CO9 CR1 HR11 109.470 3.000
PII CO9 CR1 HR12 109.470 3.000
PII CO9 CR1 CR2 109.470 3.000
PII HR11 CR1 HR12 107.900 3.000
PII HR11 CR1 CR2 109.470 3.000
PII HR12 CR1 CR2 109.470 3.000
PII CR1 CR2 HR21 109.470 3.000
PII CR1 CR2 HR22 109.470 3.000
PII CR1 CR2 CR3 111.000 3.000
PII HR21 CR2 HR22 107.900 3.000
PII HR21 CR2 CR3 109.470 3.000
PII HR22 CR2 CR3 109.470 3.000
PII CR2 CR3 HR31 109.470 3.000
PII CR2 CR3 HR32 109.470 3.000
PII CR2 CR3 CR4 111.000 3.000
PII HR31 CR3 HR32 107.900 3.000
PII HR31 CR3 CR4 109.470 3.000
PII HR32 CR3 CR4 109.470 3.000
PII CR3 CR4 HR41 109.470 3.000
PII CR3 CR4 HR42 109.470 3.000
PII CR3 CR4 CR5 111.000 3.000
PII HR41 CR4 HR42 107.900 3.000
PII HR41 CR4 CR5 109.470 3.000
PII HR42 CR4 CR5 109.470 3.000
PII CR4 CR5 HR51 109.470 3.000
PII CR4 CR5 HR52 109.470 3.000
PII CR4 CR5 CR6 111.000 3.000
PII HR51 CR5 HR52 107.900 3.000
PII HR51 CR5 CR6 109.470 3.000
PII HR52 CR5 CR6 109.470 3.000
PII CR5 CR6 HR61 109.470 3.000
PII CR5 CR6 HR62 109.470 3.000
PII CR5 CR6 CR7 111.000 3.000
PII HR61 CR6 HR62 107.900 3.000
PII HR61 CR6 CR7 109.470 3.000
PII HR62 CR6 CR7 109.470 3.000
PII CR6 CR7 HR71 109.470 3.000
PII CR6 CR7 HR72 109.470 3.000
PII CR6 CR7 CR8 111.000 3.000
PII HR71 CR7 HR72 107.900 3.000
PII HR71 CR7 CR8 109.470 3.000
PII HR72 CR7 CR8 109.470 3.000
PII CR7 CR8 HR81 109.470 3.000
PII CR7 CR8 HR82 109.470 3.000
PII CR7 CR8 CR9 111.000 3.000
PII HR81 CR8 HR82 107.900 3.000
PII HR81 CR8 CR9 109.470 3.000
PII HR82 CR8 CR9 109.470 3.000
PII CR8 CR9 HR91 109.470 3.000
PII CR8 CR9 HR92 109.470 3.000
PII CR8 CR9 CRA 111.000 3.000
PII HR91 CR9 HR92 107.900 3.000
PII HR91 CR9 CRA 109.470 3.000
PII HR92 CR9 CRA 109.470 3.000
PII CR9 CRA "HC'" 109.470 3.000
PII CR9 CRA HF 109.470 3.000
PII CR9 CRA CRB 111.000 3.000
PII "HC'" CRA HF 107.900 3.000
PII "HC'" CRA CRB 109.470 3.000
PII HF CRA CRB 109.470 3.000
PII CRA CRB HG 109.470 3.000
PII CRA CRB HG1 109.470 3.000
PII CRA CRB CRC 111.000 3.000
PII HG CRB HG1 107.900 3.000
PII HG CRB CRC 109.470 3.000
PII HG1 CRB CRC 109.470 3.000
PII CRB CRC HH 109.470 3.000
PII CRB CRC HH1 109.470 3.000
PII CRB CRC CRD 111.000 3.000
PII HH CRC HH1 107.900 3.000
PII HH CRC CRD 109.470 3.000
PII HH1 CRC CRD 109.470 3.000
PII CRC CRD HI 109.470 3.000
PII CRC CRD HJ 109.470 3.000
PII CRC CRD CRE 111.000 3.000
PII HI CRD HJ 107.900 3.000
PII HI CRD CRE 109.470 3.000
PII HJ CRD CRE 109.470 3.000
PII CRD CRE HK 109.470 3.000
PII CRD CRE HL 109.470 3.000
PII CRD CRE CRF 111.000 3.000
PII HK CRE HL 107.900 3.000
PII HK CRE CRF 109.470 3.000
PII HL CRE CRF 109.470 3.000
PII CRE CRF HM 109.470 3.000
PII CRE CRF HN 109.470 3.000
PII CRE CRF CRG 111.000 3.000
PII HM CRF HN 107.900 3.000
PII HM CRF CRG 109.470 3.000
PII HN CRF CRG 109.470 3.000
PII CRF CRG HQ 109.470 3.000
PII CRF CRG HP 109.470 3.000
PII CRF CRG HO 109.470 3.000
PII HQ CRG HP 109.470 3.000
PII HQ CRG HO 109.470 3.000
PII HP CRG HO 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PII var_1 OC6 CO6 CL1 CL2 0.026 20.000 3
PII var_2 CO6 CL1 CL2 CL3 179.992 20.000 3
PII var_3 CL1 CL2 CL3 CL4 180.000 20.000 3
PII var_4 CL2 CL3 CL4 CL5 179.990 20.000 3
PII var_5 CL3 CL4 CL5 CL6 180.000 20.000 3
PII var_6 CL4 CL5 CL6 CL7 -179.986 20.000 3
PII var_7 CL5 CL6 CL7 CL8 180.000 20.000 3
PII var_8 CL6 CL7 CL8 CL9 -179.975 20.000 3
PII var_9 CL7 CL8 CL9 CLA -179.962 20.000 3
PII var_10 CL8 CL9 CLA CLB 179.962 20.000 3
PII var_11 CL9 CLA CLB CLC 179.951 20.000 3
PII var_12 CLA CLB CLC CLD 180.000 20.000 3
PII var_13 CLB CLC CLD CLE -179.990 20.000 3
PII var_14 CLC CLD CLE CLF 180.000 20.000 3
PII var_15 CLD CLE CLF HZ1 -179.998 20.000 3
PII var_16 OC6 CO6 O26 C25 -0.045 20.000 1
PII var_17 CO6 O26 C25 C24 -179.968 20.000 1
PII var_18 O26 C25 C24 O29 58.365 20.000 3
PII var_19 C25 C24 C21 O12 -60.039 20.000 3
PII var_20 C24 C21 O12 P1 -179.952 20.000 1
PII var_21 C21 O12 P1 OI1 -179.984 20.000 1
PII var_22 O12 P1 OI1 CI1 179.999 20.000 1
PII var_23 P1 OI1 CI1 CI6 -120.020 20.000 1
PII var_24 OI1 CI1 CI2 CI3 60.000 20.000 3
PII var_25 OI1 CI1 CI6 CI5 -60.000 20.000 3
PII var_26 CI1 CI6 OI6 HE 179.944 20.000 1
PII var_27 CI1 CI6 CI5 CI4 -60.000 20.000 3
PII var_28 CI6 CI5 OI5 HD -179.999 20.000 1
PII var_29 CI6 CI5 CI4 CI3 60.000 20.000 3
PII var_30 CI5 CI4 OI4 HC 59.957 20.000 1
PII var_31 CI5 CI4 CI3 CI2 -60.000 20.000 3
PII var_32 CI4 CI3 OI3 HB -59.949 20.000 1
PII var_33 CI4 CI3 CI2 OI2 -60.000 20.000 3
PII var_34 CI3 CI2 OI2 HA -60.024 20.000 1
PII var_35 C25 C24 O29 CO9 -149.396 20.000 1
PII var_36 C24 O29 CO9 CR1 -179.996 20.000 1
PII var_37 O29 CO9 CR1 CR2 179.938 20.000 3
PII var_38 CO9 CR1 CR2 CR3 -179.997 20.000 3
PII var_39 CR1 CR2 CR3 CR4 -179.969 20.000 3
PII var_40 CR2 CR3 CR4 CR5 179.977 20.000 3
PII var_41 CR3 CR4 CR5 CR6 180.000 20.000 3
PII var_42 CR4 CR5 CR6 CR7 -179.954 20.000 3
PII var_43 CR5 CR6 CR7 CR8 179.992 20.000 3
PII var_44 CR6 CR7 CR8 CR9 179.946 20.000 3
PII var_45 CR7 CR8 CR9 CRA 180.000 20.000 3
PII var_46 CR8 CR9 CRA CRB -179.968 20.000 3
PII var_47 CR9 CRA CRB CRC -179.983 20.000 3
PII var_48 CRA CRB CRC CRD 179.985 20.000 3
PII var_49 CRB CRC CRD CRE 179.992 20.000 3
PII var_50 CRC CRD CRE CRF -179.985 20.000 3
PII var_51 CRD CRE CRF CRG -180.000 20.000 3
PII var_52 CRE CRF CRG HO -179.971 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
PII chir_01 C24 C21 O29 C25 positiv
PII chir_02 CI1 OI1 CI2 CI6 negativ
PII chir_03 CI2 CI1 CI3 OI2 negativ
PII chir_04 CI3 CI2 CI4 OI3 negativ
PII chir_05 CI4 CI3 CI5 OI4 positiv
PII chir_06 CI5 CI4 CI6 OI5 negativ
PII chir_07 CI6 CI1 CI5 OI6 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PII plan-1 CO9 0.020
PII plan-1 O29 0.020
PII plan-1 OC9 0.020
PII plan-1 CR1 0.020
PII plan-2 CO6 0.020
PII plan-2 O26 0.020
PII plan-2 OC6 0.020
PII plan-2 CL1 0.020
# ------------------------------------------------------
|
