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413
|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PLO PLO '(3BETA)-3-HYDROXYPREGN-5-EN-20-ONE ' non-polymer 55 23 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PLO
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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PLO C14 C CH1 0.000 -4.054 -0.999 0.296
PLO H14 H H 0.000 -4.419 -2.035 0.334
PLO C8 C CH1 0.000 -5.188 -0.053 -0.055
PLO H8 H H 0.000 -4.812 0.976 -0.141
PLO C7 C CH2 0.000 -6.274 -0.133 1.023
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PLO C12 C CH2 0.000 -3.515 -1.410 -2.102
PLO H121 H H 0.000 -3.817 -2.450 -1.966
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PLO H112 H H 0.000 -4.393 0.442 -2.735
PLO C9 C CH1 0.000 -5.778 -0.515 -1.393
PLO H9 H H 0.000 -6.179 -1.529 -1.255
PLO C10 C CT 0.000 -6.925 0.390 -1.809
PLO C1 C CH2 0.000 -7.837 -0.329 -2.808
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PLO H11 H H 0.000 -7.260 -0.612 -3.691
PLO C19 C CH3 0.000 -6.302 1.593 -2.518
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PLO H192 H H 0.000 -5.849 1.277 -3.422
PLO H191 H H 0.000 -7.054 2.307 -2.733
PLO C5 C C 0.000 -7.747 0.895 -0.662
PLO C4 C CH2 0.000 -8.982 1.722 -0.984
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PLO H42 H H 0.000 -9.563 1.892 -0.075
PLO C3 C CH1 0.000 -9.830 0.948 -1.996
PLO H3 H H 0.000 -10.197 0.021 -1.534
PLO O3 O OH1 0.000 -10.940 1.750 -2.400
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PLO C2 C CH2 0.000 -8.977 0.606 -3.219
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PLO H21 H H 0.000 -9.600 0.114 -3.968
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PLO O20 n/a C20 START
PLO C20 O20 C17 .
PLO C21 C20 H211 .
PLO H213 C21 . .
PLO H212 C21 . .
PLO H211 C21 . .
PLO C17 C20 C13 .
PLO H17 C17 . .
PLO C16 C17 C15 .
PLO H161 C16 . .
PLO H162 C16 . .
PLO C15 C16 C14 .
PLO H151 C15 . .
PLO H152 C15 . .
PLO C14 C15 C8 .
PLO H14 C14 . .
PLO C8 C14 C7 .
PLO H8 C8 . .
PLO C7 C8 C6 .
PLO H71 C7 . .
PLO H72 C7 . .
PLO C6 C7 H6 .
PLO H6 C6 . .
PLO C13 C17 C12 .
PLO C18 C13 H181 .
PLO H183 C18 . .
PLO H182 C18 . .
PLO H181 C18 . .
PLO C12 C13 C11 .
PLO H121 C12 . .
PLO H122 C12 . .
PLO C11 C12 C9 .
PLO H111 C11 . .
PLO H112 C11 . .
PLO C9 C11 C10 .
PLO H9 C9 . .
PLO C10 C9 C5 .
PLO C1 C10 H11 .
PLO H12 C1 . .
PLO H11 C1 . .
PLO C19 C10 H191 .
PLO H193 C19 . .
PLO H192 C19 . .
PLO H191 C19 . .
PLO C5 C10 C4 .
PLO C4 C5 C3 .
PLO H41 C4 . .
PLO H42 C4 . .
PLO C3 C4 C2 .
PLO H3 C3 . .
PLO O3 C3 HO3 .
PLO HO3 O3 . .
PLO C2 C3 H21 .
PLO H22 C2 . .
PLO H21 C2 . END
PLO C1 C2 . ADD
PLO C5 C6 . ADD
PLO C8 C9 . ADD
PLO C13 C14 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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PLO C4 C5 single 1.510 0.020
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PLO C5 C10 single 1.507 0.020
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PLO H6 C6 single 1.077 0.020
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PLO H9 C9 single 1.099 0.020
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loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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PLO H8 C8 C9 108.340 3.000
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PLO H182 C18 H181 109.470 3.000
PLO C13 C12 H121 109.470 3.000
PLO C13 C12 H122 109.470 3.000
PLO C13 C12 C11 111.000 3.000
PLO H121 C12 H122 107.900 3.000
PLO H121 C12 C11 109.470 3.000
PLO H122 C12 C11 109.470 3.000
PLO C12 C11 H111 109.470 3.000
PLO C12 C11 H112 109.470 3.000
PLO C12 C11 C9 111.000 3.000
PLO H111 C11 H112 107.900 3.000
PLO H111 C11 C9 109.470 3.000
PLO H112 C11 C9 109.470 3.000
PLO C11 C9 H9 108.340 3.000
PLO C11 C9 C10 111.000 3.000
PLO C11 C9 C8 111.000 3.000
PLO H9 C9 C10 108.340 3.000
PLO H9 C9 C8 108.340 3.000
PLO C10 C9 C8 111.000 3.000
PLO C9 C10 C1 111.000 3.000
PLO C9 C10 C19 111.000 3.000
PLO C9 C10 C5 109.470 3.000
PLO C1 C10 C19 111.000 3.000
PLO C1 C10 C5 109.470 3.000
PLO C19 C10 C5 109.470 3.000
PLO C10 C1 H12 109.470 3.000
PLO C10 C1 H11 109.470 3.000
PLO C10 C1 C2 111.000 3.000
PLO H12 C1 H11 107.900 3.000
PLO H12 C1 C2 109.470 3.000
PLO H11 C1 C2 109.470 3.000
PLO C10 C19 H193 109.470 3.000
PLO C10 C19 H192 109.470 3.000
PLO C10 C19 H191 109.470 3.000
PLO H193 C19 H192 109.470 3.000
PLO H193 C19 H191 109.470 3.000
PLO H192 C19 H191 109.470 3.000
PLO C10 C5 C4 120.000 3.000
PLO C10 C5 C6 120.000 3.000
PLO C4 C5 C6 120.000 3.000
PLO C5 C4 H41 109.470 3.000
PLO C5 C4 H42 109.470 3.000
PLO C5 C4 C3 109.470 3.000
PLO H41 C4 H42 107.900 3.000
PLO H41 C4 C3 109.470 3.000
PLO H42 C4 C3 109.470 3.000
PLO C4 C3 H3 108.340 3.000
PLO C4 C3 O3 109.470 3.000
PLO C4 C3 C2 109.470 3.000
PLO H3 C3 O3 109.470 3.000
PLO H3 C3 C2 108.340 3.000
PLO O3 C3 C2 109.470 3.000
PLO C3 O3 HO3 109.470 3.000
PLO C3 C2 H22 109.470 3.000
PLO C3 C2 H21 109.470 3.000
PLO C3 C2 C1 111.000 3.000
PLO H22 C2 H21 107.900 3.000
PLO H22 C2 C1 109.470 3.000
PLO H21 C2 C1 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PLO var_1 O20 C20 C21 H211 0.030 20.000 1
PLO var_2 O20 C20 C17 C13 89.816 20.000 3
PLO var_3 C20 C17 C16 C15 120.000 20.000 3
PLO var_4 C17 C16 C15 C14 30.000 20.000 3
PLO var_5 C16 C15 C14 C8 -150.000 20.000 3
PLO var_6 C15 C14 C8 C7 -60.000 20.000 3
PLO var_7 C14 C8 C9 C11 -60.000 20.000 3
PLO var_8 C14 C8 C7 C6 180.000 20.000 3
PLO var_9 C8 C7 C6 C5 30.000 20.000 1
PLO var_10 C20 C17 C13 C12 90.000 20.000 1
PLO var_11 C17 C13 C14 C15 30.000 20.000 1
PLO var_12 C17 C13 C18 H181 -174.627 20.000 1
PLO var_13 C17 C13 C12 C11 180.000 20.000 1
PLO var_14 C13 C12 C11 C9 -60.000 20.000 3
PLO var_15 C12 C11 C9 C10 180.000 20.000 3
PLO var_16 C11 C9 C10 C5 -150.000 20.000 1
PLO var_17 C9 C10 C1 C2 180.000 20.000 1
PLO var_18 C10 C1 C2 C3 -60.000 20.000 3
PLO var_19 C9 C10 C19 H191 -173.736 20.000 1
PLO var_20 C9 C10 C5 C4 180.000 20.000 1
PLO var_21 C10 C5 C6 C7 0.000 20.000 1
PLO var_22 C10 C5 C4 C3 60.000 20.000 3
PLO var_23 C5 C4 C3 C2 -60.000 20.000 3
PLO var_24 C4 C3 O3 HO3 -60.025 20.000 1
PLO var_25 C4 C3 C2 C1 60.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
PLO chir_01 C3 C2 O3 C4 positiv
PLO chir_02 C8 C7 C9 C14 positiv
PLO chir_03 C9 C8 C10 C11 negativ
PLO chir_04 C10 C1 C5 C9 negativ
PLO chir_05 C13 C12 C14 C17 negativ
PLO chir_06 C14 C8 C13 C15 negativ
PLO chir_07 C17 C13 C16 C20 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PLO plan-1 C5 0.020
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PLO plan-1 C6 0.020
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PLO plan-3 C20 0.020
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PLO plan-3 O20 0.020
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