1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PRZ PRZ '2-ISOBUTYL-3-METHOXYPYRAZINE ' non-polymer 26 12 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PRZ
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PRZ C31 C CH3 0.000 0.000 0.000 0.000
PRZ H313 H H 0.000 0.846 -0.060 -0.634
PRZ H312 H H 0.000 -0.090 0.987 0.375
PRZ H311 H H 0.000 0.117 -0.675 0.808
PRZ O31 O O2 0.000 -1.175 -0.339 -0.739
PRZ C3 C CR6 0.000 -2.219 -0.245 0.121
PRZ N4 N NRD6 0.000 -2.012 0.109 1.382
PRZ C5 C CR16 0.000 -3.032 0.199 2.217
PRZ H5 H H 0.000 -2.863 0.488 3.247
PRZ C6 C CR16 0.000 -4.314 -0.073 1.778
PRZ H6 H H 0.000 -5.148 0.004 2.465
PRZ N1 N NRD6 0.000 -4.524 -0.428 0.522
PRZ C2 C CR6 0.000 -3.510 -0.515 -0.318
PRZ C21 C CH2 0.000 -3.751 -0.919 -1.750
PRZ H212 H H 0.000 -4.618 -1.581 -1.799
PRZ H211 H H 0.000 -2.872 -1.442 -2.133
PRZ C22 C CH1 0.000 -4.012 0.329 -2.594
PRZ H22 H H 0.000 -3.139 0.995 -2.542
PRZ C24 C CH3 0.000 -5.243 1.060 -2.057
PRZ H241 H H 0.000 -5.075 1.345 -1.051
PRZ H242 H H 0.000 -5.424 1.924 -2.642
PRZ H243 H H 0.000 -6.085 0.419 -2.106
PRZ C23 C CH3 0.000 -4.256 -0.080 -4.049
PRZ H231 H H 0.000 -3.403 -0.586 -4.423
PRZ H232 H H 0.000 -5.097 -0.722 -4.101
PRZ H233 H H 0.000 -4.437 0.785 -4.634
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PRZ C31 n/a O31 START
PRZ H313 C31 . .
PRZ H312 C31 . .
PRZ H311 C31 . .
PRZ O31 C31 C3 .
PRZ C3 O31 C2 .
PRZ N4 C3 C5 .
PRZ C5 N4 C6 .
PRZ H5 C5 . .
PRZ C6 C5 N1 .
PRZ H6 C6 . .
PRZ N1 C6 . .
PRZ C2 C3 C21 .
PRZ C21 C2 C22 .
PRZ H212 C21 . .
PRZ H211 C21 . .
PRZ C22 C21 C23 .
PRZ H22 C22 . .
PRZ C24 C22 H243 .
PRZ H241 C24 . .
PRZ H242 C24 . .
PRZ H243 C24 . .
PRZ C23 C22 H233 .
PRZ H231 C23 . .
PRZ H232 C23 . .
PRZ H233 C23 . END
PRZ N1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PRZ N1 C2 double 1.350 0.020
PRZ N1 C6 single 1.337 0.020
PRZ C2 C3 single 1.487 0.020
PRZ C21 C2 single 1.511 0.020
PRZ N4 C3 double 1.350 0.020
PRZ C3 O31 single 1.370 0.020
PRZ C5 N4 single 1.337 0.020
PRZ C6 C5 double 1.390 0.020
PRZ H5 C5 single 1.083 0.020
PRZ H6 C6 single 1.083 0.020
PRZ C22 C21 single 1.524 0.020
PRZ H212 C21 single 1.092 0.020
PRZ H211 C21 single 1.092 0.020
PRZ C23 C22 single 1.524 0.020
PRZ C24 C22 single 1.524 0.020
PRZ H22 C22 single 1.099 0.020
PRZ H233 C23 single 1.059 0.020
PRZ H232 C23 single 1.059 0.020
PRZ H231 C23 single 1.059 0.020
PRZ H243 C24 single 1.059 0.020
PRZ H242 C24 single 1.059 0.020
PRZ H241 C24 single 1.059 0.020
PRZ O31 C31 single 1.426 0.020
PRZ H313 C31 single 1.059 0.020
PRZ H312 C31 single 1.059 0.020
PRZ H311 C31 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PRZ H313 C31 H312 109.470 3.000
PRZ H313 C31 H311 109.470 3.000
PRZ H312 C31 H311 109.470 3.000
PRZ H313 C31 O31 109.470 3.000
PRZ H312 C31 O31 109.470 3.000
PRZ H311 C31 O31 109.470 3.000
PRZ C31 O31 C3 120.000 3.000
PRZ O31 C3 N4 120.000 3.000
PRZ O31 C3 C2 120.000 3.000
PRZ N4 C3 C2 120.000 3.000
PRZ C3 N4 C5 120.000 3.000
PRZ N4 C5 H5 120.000 3.000
PRZ N4 C5 C6 120.000 3.000
PRZ H5 C5 C6 120.000 3.000
PRZ C5 C6 H6 120.000 3.000
PRZ C5 C6 N1 120.000 3.000
PRZ H6 C6 N1 120.000 3.000
PRZ C6 N1 C2 120.000 3.000
PRZ C3 C2 C21 120.000 3.000
PRZ C3 C2 N1 120.000 3.000
PRZ C21 C2 N1 120.000 3.000
PRZ C2 C21 H212 109.470 3.000
PRZ C2 C21 H211 109.470 3.000
PRZ C2 C21 C22 109.470 3.000
PRZ H212 C21 H211 107.900 3.000
PRZ H212 C21 C22 109.470 3.000
PRZ H211 C21 C22 109.470 3.000
PRZ C21 C22 H22 108.340 3.000
PRZ C21 C22 C24 111.000 3.000
PRZ C21 C22 C23 111.000 3.000
PRZ H22 C22 C24 108.340 3.000
PRZ H22 C22 C23 108.340 3.000
PRZ C24 C22 C23 111.000 3.000
PRZ C22 C24 H241 109.470 3.000
PRZ C22 C24 H242 109.470 3.000
PRZ C22 C24 H243 109.470 3.000
PRZ H241 C24 H242 109.470 3.000
PRZ H241 C24 H243 109.470 3.000
PRZ H242 C24 H243 109.470 3.000
PRZ C22 C23 H231 109.470 3.000
PRZ C22 C23 H232 109.470 3.000
PRZ C22 C23 H233 109.470 3.000
PRZ H231 C23 H232 109.470 3.000
PRZ H231 C23 H233 109.470 3.000
PRZ H232 C23 H233 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PRZ var_1 H311 C31 O31 C3 60.004 20.000 1
PRZ var_2 C31 O31 C3 C2 179.757 20.000 1
PRZ CONST_1 O31 C3 N4 C5 180.000 0.000 0
PRZ CONST_2 C3 N4 C5 C6 0.000 0.000 0
PRZ CONST_3 N4 C5 C6 N1 0.000 0.000 0
PRZ CONST_4 C5 C6 N1 C2 0.000 0.000 0
PRZ CONST_5 C6 N1 C2 C3 0.000 0.000 0
PRZ CONST_6 O31 C3 C2 C21 0.000 0.000 0
PRZ var_3 C3 C2 C21 C22 -90.526 20.000 2
PRZ var_4 C2 C21 C22 C23 179.937 20.000 3
PRZ var_5 C21 C22 C24 H243 -59.990 20.000 3
PRZ var_6 C21 C22 C23 H233 179.994 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
PRZ chir_01 C22 C21 C23 C24 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PRZ plan-1 N1 0.020
PRZ plan-1 C2 0.020
PRZ plan-1 C6 0.020
PRZ plan-1 C3 0.020
PRZ plan-1 N4 0.020
PRZ plan-1 C5 0.020
PRZ plan-1 C21 0.020
PRZ plan-1 O31 0.020
PRZ plan-1 H5 0.020
PRZ plan-1 H6 0.020
# ------------------------------------------------------
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